Protein
- Genbank accession
- XOD41096.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9225
- Protein sequence
-
MAQAPKLAFRATEGLDAANEKIINVQKTTHPTATDKSTMNDGVSVDFFVEYNGIQQFDATRTYPKNMSVIYERRPYYAKNDITTAGPFKASDWQALRVDPTWISQVSQGAQEIFLEAGQYVITVSSYAEYTFKLPTDPVVGDTIVVKDGTGSVGQFSTKFNSSKPIRPNGQPSTSEPEITTYYLTHPLATAVFIYTSTNGWDLQILDAGKNAKGAQSNAPTSLYAMQAGQTWYRRTATGPIFMKLPKYANNGDTVHVYDIDKANVTNPTTFSTEGGATIDGKPSPFKPTTISDGMFVYDAVANNWVVYDSDIRGRMNIIGSNTNLLANNSYMLNAQAATNVDMILPTNAGIGDIITVSLKTLRRGQTARIKTEKTGTNIIVNGFEIITKYSSQGTNLNTAFKRVTELTYAGTTSYLPVVQFAHLGNGEWFLFESTNNIERVDPDNRGRIGVAPLATVAEAQAMTGHNREAIITPETLAQRTATDDRTGIAALANLGDAQKDGTTGLDHTKIVTVQRMDNRFATEARRGVAEIATQAEANGATDDERIITAKKLDTRKATPTQSGIAFTVNPGGTPATTRPGNGTGVFDMNDVAKIVTPKVLADYKATENQLGTVFLASESEVKGGNTAPSQGPIVVTPEMLGKRIALETNHGLIAIANQAETDAGVDDTKAVTPKKLNERRGSETLSGVSRFATKAEFEAGTKEIPLNAAVAANVKGQLAVSPEKVKDFFTATRSSVDTASGLTQGGNIWSRLDLGIVVPTESQRGTPRIATQLEVNAGTVNDVFVSPVKFINTRATYDQVGTTKFAADTVMRAKISDNDAVSVAKLVNAFEDYSEYTANDVKRGTIRNVKDIEAFTGDNISGSSKPFTDYLHNGTAISPRSMIYALRNYLPLNATAQNSLQLGGVNASSWMRRDIAQTVTGSMTFVPSQTFNDTVSVAGRFTNTGTSYFNSVTTDGSDTPQVSLGDGARLTSAVIRFNAGRVGIRNNWQLIAGGNSDWIGSDEFSISTVDTKRKVLTMKLDGSVSTLNTLSVGTNLTVAGTIAVNGVQLASRQDTNTLRIGTTDVNTKFYTKDASYNGLVMAKQGGGPDAIILNTQNFTQHADGTYVKRTGGVDSHMTGPLVYSQGGATSTDINGSAGVYTWLTEIADTKKPSDYPNGNWSMSITTKAIYDTYPNGSTVSEPAPRPGVGTLVQFGLSNTRIVQHWYLKDTSIWYTRSGSGTGSEFTPWARVYTTANPPVAEEIAGVMQEGKETDFLRVKQYIDIGNVRIRANDATRTVEFEWIGQ
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1286 AA molecular weight: 138519,90060 Da isoelectric point: 6,24254 aromaticity: 0,07932 hydropathy: -0,34184
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Serratia phage WSPA [NCBI] |
3384840 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD41096.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ600363.1
[NCBI]
CDS location
range 130097 -> 133957
strand -
strand -
CDS
ATGGCCCAGGCACCAAAATTAGCATTCAGAGCTACAGAAGGGCTCGATGCTGCAAATGAAAAAATTATAAATGTACAGAAAACCACGCACCCGACGGCGACAGACAAGTCAACCATGAATGATGGGGTCTCTGTAGATTTCTTCGTAGAGTATAACGGCATTCAGCAGTTCGACGCAACTCGTACATATCCAAAAAATATGTCAGTGATTTATGAACGTCGTCCTTATTATGCCAAAAACGATATTACGACTGCAGGCCCGTTCAAGGCATCTGACTGGCAGGCATTACGTGTTGACCCAACTTGGATCTCTCAAGTTTCTCAGGGTGCACAAGAAATTTTCTTAGAAGCAGGCCAATATGTAATCACTGTTTCTTCGTATGCTGAATACACCTTTAAATTGCCTACTGATCCGGTTGTCGGCGATACCATCGTAGTTAAAGATGGTACTGGTTCTGTTGGACAGTTTAGCACTAAATTTAACTCGAGCAAACCGATTCGTCCTAATGGCCAGCCAAGCACAAGTGAACCAGAAATCACTACATATTATCTGACTCACCCATTAGCAACAGCTGTGTTTATCTACACTAGCACGAATGGTTGGGATCTCCAGATTTTAGATGCTGGTAAAAATGCTAAAGGTGCTCAGTCTAACGCACCAACTAGCTTATATGCTATGCAGGCAGGCCAGACTTGGTATCGTAGAACTGCAACTGGACCTATTTTCATGAAACTGCCTAAGTACGCTAATAACGGCGACACGGTTCATGTTTATGATATCGATAAGGCTAACGTTACAAACCCTACTACTTTCAGTACTGAAGGTGGCGCGACAATTGATGGTAAACCAAGTCCGTTTAAACCGACTACAATCAGTGACGGCATGTTTGTGTATGATGCTGTAGCGAATAACTGGGTCGTTTATGATTCTGATATTCGTGGTCGTATGAACATCATTGGATCTAATACTAATCTGTTGGCTAACAACTCATATATGTTGAATGCTCAAGCAGCAACCAACGTAGATATGATTTTGCCTACTAACGCAGGTATTGGTGACATCATCACTGTTTCTCTGAAGACTTTACGTCGCGGTCAAACCGCTCGTATCAAAACAGAGAAAACAGGTACAAATATTATTGTAAACGGTTTTGAGATCATCACTAAGTATAGCTCTCAAGGCACAAATCTTAACACGGCATTCAAACGTGTTACTGAATTAACTTATGCCGGTACTACTTCGTATTTGCCTGTTGTTCAGTTTGCTCACTTAGGTAATGGCGAATGGTTCTTGTTCGAAAGTACTAATAACATCGAACGTGTTGATCCAGATAACCGTGGTCGTATTGGTGTTGCTCCTCTGGCTACTGTCGCAGAAGCTCAGGCGATGACAGGCCATAACAGGGAAGCTATCATTACCCCTGAGACTTTAGCTCAACGTACTGCTACAGATGATCGTACTGGTATCGCAGCTTTGGCCAATTTAGGTGATGCTCAGAAAGACGGCACTACTGGATTAGATCATACTAAGATCGTAACTGTTCAACGTATGGATAACCGTTTTGCTACTGAGGCTCGTCGTGGTGTTGCCGAAATTGCAACTCAGGCGGAAGCTAATGGCGCAACTGATGATGAACGTATTATCACAGCCAAAAAATTAGACACTCGTAAGGCGACTCCTACGCAATCAGGCATTGCATTCACTGTTAACCCAGGTGGCACTCCAGCGACAACTCGCCCTGGCAATGGTACTGGTGTGTTCGACATGAATGATGTTGCTAAAATCGTAACACCAAAAGTGTTAGCCGATTATAAAGCAACAGAGAACCAATTGGGTACTGTTTTCCTGGCGTCCGAATCTGAAGTTAAAGGTGGTAACACGGCTCCTTCTCAAGGCCCAATTGTTGTTACTCCTGAAATGCTTGGTAAACGTATTGCATTAGAAACTAACCATGGTTTAATTGCGATCGCTAACCAGGCCGAAACTGATGCTGGTGTGGATGATACTAAAGCTGTAACGCCTAAAAAACTTAATGAGCGTCGTGGTTCTGAAACTTTGAGTGGCGTTTCAAGATTTGCTACTAAAGCTGAATTCGAAGCTGGTACTAAAGAAATTCCTCTGAATGCTGCTGTAGCTGCTAACGTTAAAGGTCAATTGGCTGTATCGCCTGAAAAAGTTAAAGACTTCTTTACGGCAACTCGTAGCTCTGTTGATACTGCTTCAGGTTTAACTCAAGGTGGAAATATCTGGTCTAGACTAGATTTAGGTATTGTTGTTCCTACTGAATCTCAGCGTGGTACTCCAAGAATTGCTACCCAGCTTGAAGTTAATGCAGGTACAGTTAACGATGTATTTGTGAGTCCAGTTAAGTTCATTAATACTCGAGCTACTTATGATCAAGTAGGTACTACTAAGTTTGCAGCCGACACTGTAATGAGAGCTAAAATCTCAGATAACGATGCCGTTTCTGTTGCTAAATTAGTCAATGCCTTCGAGGATTATAGCGAATACACAGCTAATGATGTTAAACGAGGAACAATTCGTAACGTCAAAGATATTGAAGCATTTACTGGTGATAACATTTCTGGCTCTTCTAAGCCATTTACTGATTATCTTCACAACGGTACTGCAATTAGTCCACGTAGCATGATTTATGCATTACGTAACTATTTGCCACTGAATGCTACGGCTCAGAACTCATTACAGTTAGGTGGTGTCAATGCTTCTAGTTGGATGCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTAACAGGTTCAATGACCTTTGTTCCGTCCCAAACATTCAATGATACCGTTTCTGTTGCTGGCAGATTCACTAATACCGGAACTAGTTATTTCAACTCAGTAACAACTGATGGTTCTGATACTCCACAAGTATCTTTAGGTGATGGCGCTAGATTAACTTCTGCTGTTATTCGTTTTAATGCTGGTAGGGTAGGTATTCGTAACAACTGGCAGCTTATTGCCGGTGGGAATAGTGATTGGATTGGTTCAGACGAATTCTCAATATCTACTGTTGATACTAAACGTAAAGTATTGACTATGAAGTTGGATGGATCTGTTAGTACTTTAAACACATTAAGTGTTGGCACTAATTTAACTGTTGCTGGAACTATTGCAGTTAATGGTGTTCAATTAGCATCTAGACAAGATACTAACACACTTCGTATTGGTACTACTGATGTTAATACTAAGTTCTATACCAAAGACGCTAGCTATAATGGTTTAGTAATGGCTAAACAAGGTGGTGGTCCAGATGCTATTATTCTGAACACCCAAAACTTCACTCAGCATGCTGACGGTACTTATGTCAAACGCACTGGTGGTGTTGATAGCCATATGACAGGACCATTGGTTTATTCTCAAGGCGGAGCTACTAGTACTGATATCAATGGTTCAGCTGGTGTTTATACTTGGTTGACTGAAATTGCAGATACTAAGAAACCTTCTGATTATCCAAATGGCAACTGGTCTATGAGTATTACGACTAAAGCCATTTATGACACTTATCCTAATGGATCTACAGTGAGTGAACCGGCGCCTCGTCCTGGTGTTGGTACTTTAGTTCAATTTGGGTTATCAAATACTCGTATTGTTCAACACTGGTATTTGAAAGATACTTCAATTTGGTATACTCGTTCTGGTTCAGGTACTGGATCAGAGTTTACGCCTTGGGCTCGTGTTTATACTACTGCAAACCCACCTGTTGCAGAGGAAATTGCTGGTGTTATGCAAGAAGGTAAGGAAACCGATTTCTTGCGTGTTAAACAGTATATAGATATTGGTAACGTGCGTATCCGTGCAAATGATGCAACTCGTACCGTAGAGTTTGAATGGATCGGTCAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.