Protein

Genbank accession
XOD41096.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9225

Protein sequence
MAQAPKLAFRATEGLDAANEKIINVQKTTHPTATDKSTMNDGVSVDFFVEYNGIQQFDATRTYPKNMSVIYERRPYYAKNDITTAGPFKASDWQALRVDPTWISQVSQGAQEIFLEAGQYVITVSSYAEYTFKLPTDPVVGDTIVVKDGTGSVGQFSTKFNSSKPIRPNGQPSTSEPEITTYYLTHPLATAVFIYTSTNGWDLQILDAGKNAKGAQSNAPTSLYAMQAGQTWYRRTATGPIFMKLPKYANNGDTVHVYDIDKANVTNPTTFSTEGGATIDGKPSPFKPTTISDGMFVYDAVANNWVVYDSDIRGRMNIIGSNTNLLANNSYMLNAQAATNVDMILPTNAGIGDIITVSLKTLRRGQTARIKTEKTGTNIIVNGFEIITKYSSQGTNLNTAFKRVTELTYAGTTSYLPVVQFAHLGNGEWFLFESTNNIERVDPDNRGRIGVAPLATVAEAQAMTGHNREAIITPETLAQRTATDDRTGIAALANLGDAQKDGTTGLDHTKIVTVQRMDNRFATEARRGVAEIATQAEANGATDDERIITAKKLDTRKATPTQSGIAFTVNPGGTPATTRPGNGTGVFDMNDVAKIVTPKVLADYKATENQLGTVFLASESEVKGGNTAPSQGPIVVTPEMLGKRIALETNHGLIAIANQAETDAGVDDTKAVTPKKLNERRGSETLSGVSRFATKAEFEAGTKEIPLNAAVAANVKGQLAVSPEKVKDFFTATRSSVDTASGLTQGGNIWSRLDLGIVVPTESQRGTPRIATQLEVNAGTVNDVFVSPVKFINTRATYDQVGTTKFAADTVMRAKISDNDAVSVAKLVNAFEDYSEYTANDVKRGTIRNVKDIEAFTGDNISGSSKPFTDYLHNGTAISPRSMIYALRNYLPLNATAQNSLQLGGVNASSWMRRDIAQTVTGSMTFVPSQTFNDTVSVAGRFTNTGTSYFNSVTTDGSDTPQVSLGDGARLTSAVIRFNAGRVGIRNNWQLIAGGNSDWIGSDEFSISTVDTKRKVLTMKLDGSVSTLNTLSVGTNLTVAGTIAVNGVQLASRQDTNTLRIGTTDVNTKFYTKDASYNGLVMAKQGGGPDAIILNTQNFTQHADGTYVKRTGGVDSHMTGPLVYSQGGATSTDINGSAGVYTWLTEIADTKKPSDYPNGNWSMSITTKAIYDTYPNGSTVSEPAPRPGVGTLVQFGLSNTRIVQHWYLKDTSIWYTRSGSGTGSEFTPWARVYTTANPPVAEEIAGVMQEGKETDFLRVKQYIDIGNVRIRANDATRTVEFEWIGQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1286 AA
molecular weight: 138519,90060 Da
isoelectric point:6,24254
aromaticity:0,07932
hydropathy:-0,34184

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Serratia phage WSPA
[NCBI]
3384840 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD41096.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ600363.1 [NCBI]
CDS location
range 130097 -> 133957
strand -
CDS
ATGGCCCAGGCACCAAAATTAGCATTCAGAGCTACAGAAGGGCTCGATGCTGCAAATGAAAAAATTATAAATGTACAGAAAACCACGCACCCGACGGCGACAGACAAGTCAACCATGAATGATGGGGTCTCTGTAGATTTCTTCGTAGAGTATAACGGCATTCAGCAGTTCGACGCAACTCGTACATATCCAAAAAATATGTCAGTGATTTATGAACGTCGTCCTTATTATGCCAAAAACGATATTACGACTGCAGGCCCGTTCAAGGCATCTGACTGGCAGGCATTACGTGTTGACCCAACTTGGATCTCTCAAGTTTCTCAGGGTGCACAAGAAATTTTCTTAGAAGCAGGCCAATATGTAATCACTGTTTCTTCGTATGCTGAATACACCTTTAAATTGCCTACTGATCCGGTTGTCGGCGATACCATCGTAGTTAAAGATGGTACTGGTTCTGTTGGACAGTTTAGCACTAAATTTAACTCGAGCAAACCGATTCGTCCTAATGGCCAGCCAAGCACAAGTGAACCAGAAATCACTACATATTATCTGACTCACCCATTAGCAACAGCTGTGTTTATCTACACTAGCACGAATGGTTGGGATCTCCAGATTTTAGATGCTGGTAAAAATGCTAAAGGTGCTCAGTCTAACGCACCAACTAGCTTATATGCTATGCAGGCAGGCCAGACTTGGTATCGTAGAACTGCAACTGGACCTATTTTCATGAAACTGCCTAAGTACGCTAATAACGGCGACACGGTTCATGTTTATGATATCGATAAGGCTAACGTTACAAACCCTACTACTTTCAGTACTGAAGGTGGCGCGACAATTGATGGTAAACCAAGTCCGTTTAAACCGACTACAATCAGTGACGGCATGTTTGTGTATGATGCTGTAGCGAATAACTGGGTCGTTTATGATTCTGATATTCGTGGTCGTATGAACATCATTGGATCTAATACTAATCTGTTGGCTAACAACTCATATATGTTGAATGCTCAAGCAGCAACCAACGTAGATATGATTTTGCCTACTAACGCAGGTATTGGTGACATCATCACTGTTTCTCTGAAGACTTTACGTCGCGGTCAAACCGCTCGTATCAAAACAGAGAAAACAGGTACAAATATTATTGTAAACGGTTTTGAGATCATCACTAAGTATAGCTCTCAAGGCACAAATCTTAACACGGCATTCAAACGTGTTACTGAATTAACTTATGCCGGTACTACTTCGTATTTGCCTGTTGTTCAGTTTGCTCACTTAGGTAATGGCGAATGGTTCTTGTTCGAAAGTACTAATAACATCGAACGTGTTGATCCAGATAACCGTGGTCGTATTGGTGTTGCTCCTCTGGCTACTGTCGCAGAAGCTCAGGCGATGACAGGCCATAACAGGGAAGCTATCATTACCCCTGAGACTTTAGCTCAACGTACTGCTACAGATGATCGTACTGGTATCGCAGCTTTGGCCAATTTAGGTGATGCTCAGAAAGACGGCACTACTGGATTAGATCATACTAAGATCGTAACTGTTCAACGTATGGATAACCGTTTTGCTACTGAGGCTCGTCGTGGTGTTGCCGAAATTGCAACTCAGGCGGAAGCTAATGGCGCAACTGATGATGAACGTATTATCACAGCCAAAAAATTAGACACTCGTAAGGCGACTCCTACGCAATCAGGCATTGCATTCACTGTTAACCCAGGTGGCACTCCAGCGACAACTCGCCCTGGCAATGGTACTGGTGTGTTCGACATGAATGATGTTGCTAAAATCGTAACACCAAAAGTGTTAGCCGATTATAAAGCAACAGAGAACCAATTGGGTACTGTTTTCCTGGCGTCCGAATCTGAAGTTAAAGGTGGTAACACGGCTCCTTCTCAAGGCCCAATTGTTGTTACTCCTGAAATGCTTGGTAAACGTATTGCATTAGAAACTAACCATGGTTTAATTGCGATCGCTAACCAGGCCGAAACTGATGCTGGTGTGGATGATACTAAAGCTGTAACGCCTAAAAAACTTAATGAGCGTCGTGGTTCTGAAACTTTGAGTGGCGTTTCAAGATTTGCTACTAAAGCTGAATTCGAAGCTGGTACTAAAGAAATTCCTCTGAATGCTGCTGTAGCTGCTAACGTTAAAGGTCAATTGGCTGTATCGCCTGAAAAAGTTAAAGACTTCTTTACGGCAACTCGTAGCTCTGTTGATACTGCTTCAGGTTTAACTCAAGGTGGAAATATCTGGTCTAGACTAGATTTAGGTATTGTTGTTCCTACTGAATCTCAGCGTGGTACTCCAAGAATTGCTACCCAGCTTGAAGTTAATGCAGGTACAGTTAACGATGTATTTGTGAGTCCAGTTAAGTTCATTAATACTCGAGCTACTTATGATCAAGTAGGTACTACTAAGTTTGCAGCCGACACTGTAATGAGAGCTAAAATCTCAGATAACGATGCCGTTTCTGTTGCTAAATTAGTCAATGCCTTCGAGGATTATAGCGAATACACAGCTAATGATGTTAAACGAGGAACAATTCGTAACGTCAAAGATATTGAAGCATTTACTGGTGATAACATTTCTGGCTCTTCTAAGCCATTTACTGATTATCTTCACAACGGTACTGCAATTAGTCCACGTAGCATGATTTATGCATTACGTAACTATTTGCCACTGAATGCTACGGCTCAGAACTCATTACAGTTAGGTGGTGTCAATGCTTCTAGTTGGATGCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTAACAGGTTCAATGACCTTTGTTCCGTCCCAAACATTCAATGATACCGTTTCTGTTGCTGGCAGATTCACTAATACCGGAACTAGTTATTTCAACTCAGTAACAACTGATGGTTCTGATACTCCACAAGTATCTTTAGGTGATGGCGCTAGATTAACTTCTGCTGTTATTCGTTTTAATGCTGGTAGGGTAGGTATTCGTAACAACTGGCAGCTTATTGCCGGTGGGAATAGTGATTGGATTGGTTCAGACGAATTCTCAATATCTACTGTTGATACTAAACGTAAAGTATTGACTATGAAGTTGGATGGATCTGTTAGTACTTTAAACACATTAAGTGTTGGCACTAATTTAACTGTTGCTGGAACTATTGCAGTTAATGGTGTTCAATTAGCATCTAGACAAGATACTAACACACTTCGTATTGGTACTACTGATGTTAATACTAAGTTCTATACCAAAGACGCTAGCTATAATGGTTTAGTAATGGCTAAACAAGGTGGTGGTCCAGATGCTATTATTCTGAACACCCAAAACTTCACTCAGCATGCTGACGGTACTTATGTCAAACGCACTGGTGGTGTTGATAGCCATATGACAGGACCATTGGTTTATTCTCAAGGCGGAGCTACTAGTACTGATATCAATGGTTCAGCTGGTGTTTATACTTGGTTGACTGAAATTGCAGATACTAAGAAACCTTCTGATTATCCAAATGGCAACTGGTCTATGAGTATTACGACTAAAGCCATTTATGACACTTATCCTAATGGATCTACAGTGAGTGAACCGGCGCCTCGTCCTGGTGTTGGTACTTTAGTTCAATTTGGGTTATCAAATACTCGTATTGTTCAACACTGGTATTTGAAAGATACTTCAATTTGGTATACTCGTTCTGGTTCAGGTACTGGATCAGAGTTTACGCCTTGGGCTCGTGTTTATACTACTGCAAACCCACCTGTTGCAGAGGAAATTGCTGGTGTTATGCAAGAAGGTAAGGAAACCGATTTCTTGCGTGTTAAACAGTATATAGATATTGGTAACGTGCGTATCCGTGCAAATGATGCAACTCGTACCGTAGAGTTTGAATGGATCGGTCAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.