Protein
- Genbank accession
- XLQ29186.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9332
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,8623
- Protein sequence
-
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDDTRAYTKDFIVLYDNRFYQALSDIPAPAGPFSLAKWKATRTDAEWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGTDINFTLPKNPLNGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAEAQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSKMVFIFSNRLWQTYVSDYERNAVTVTPAKPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVDLDKLNPLYHTIVKTYDDTTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLRPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQDETNAGIDDTTIITPKKLDARQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATVRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQTGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISSPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQDEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIVFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTVFEAGDETGYHFYSQRASDNKVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITSGATITTGGLTVNNRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTIRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1277 AA molecular weight: 138612,22660 Da isoelectric point: 5,09291 aromaticity: 0,07596 hydropathy: -0,34283
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Escherichia phage CAU_ECP01 [NCBI] |
3384776 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLQ29186.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ572755.1
[NCBI]
CDS location
range 161439 -> 165272
strand -
strand -
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGATACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAGCGATATTCCAGCTCCGGCAGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGAATGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATTGCGGTTGATACTTCAGCTGGCACTGATATTAATTTCACTTTGCCTAAAAATCCTTTAAATGGCGATACAGTTATTTTGTCTGATATTGGCGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGAGGCTCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATGGTCTTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAACGTATGTTTCTGATTACGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCTAAGCCATATCAGGCGCAACCTAACGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGCAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTTGATTTAGACAAATTAAACCCGTTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGATACAACTTCTATACGAGAAGCCGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCGGAAGCATTCTTTGTTTATGATTCTGCTAATAGCTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACGCCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGTGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGCTGGAATTTAATGGCGATACTTCGTATGTACCTGTACTTGAGTTAGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACTGTAACCGTCGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACAACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCGCAAGCAAATGTCGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTTGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGATGAAACTAATGCTGGCATAGATGATACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGCCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCGGCTACTGTTCGTGGTAATGCTGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCCTACTCAACAGGGCGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGTGAATCACAAACCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTGACCCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGACGATACTCGTATCTCGTCTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACTCAGGCAGAATCTAATGCCGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAACTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTGATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGGATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCTATTACATTCGTTGGTGACGATACTCAAGGTAGTACCCAGGACCTGAATCTTTACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCCGTAGATAGTAATCTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGTCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGTTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCCGAAATAGTTTTCACTAAAGGAACTCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGTGATACAGTATTTGAAGCGGGTGACGAAACTGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTTCTGATAATAAAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGCATTGTTTCTACAAATGGATTAAACGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACCGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAATGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATCACGATTAACAATGCCACAGGCCTAGTTCGTCTTGACAACGGTGTTCAAATCACAAGTGGTGCAACAATAACTACCGGTGGGTTAACTGTAAATAACAGGATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCCACGGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTTGGTAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGTATTCGTTATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCGTCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTATTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACAGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.