Protein

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Genbank accession
WYC18131.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,79
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDENDAVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKINSGSTLVLEMGVGSNDVYIKNLRGTGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAATPRWVKVATIKHPGEASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNNLDNWVEWRRIGSPNKGNVPEYYVVKNDAATNSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATAPSGSILVSMKQIFDSIAKPDFSYTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRNVGEGTGNLLENGAYGLGGNGGKSINDITSNADMLTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSGLAAGNVNYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGPGTASVYVNAGSGNAHVWFRTNANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDYSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITTGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPSGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGATVAMLKVTPEGYVQFGYQPTVSTPAPSKYLLVKSSGLEVEGDLVFNQTYRGTEDAVDISDKTIDLNSLIIKRTDPGTRRLYKCVSSGGGNNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNGNVEGVYVRYGQNGSWAAWREVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQSVKFGGLVVNGVGTSDPTITFKNGAMVREAQGGSLGALILSASSTAAAAAKYIAFRPYGDASNSEVRVKAYGNNETVLEWAQGPGVRSNSSGAFVIYAKTGQALHLRPNGDNSNRATVIDQNGKMTVSGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDFGLVKKNGMPGKMAIGKSNSFTVMVSTNTNNKINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNAQVNRQLTVSSSATVNGIINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDRVASAISSAGDTYLPLAGGTVTGRLTITGDQLKTTSLWVTGDAAVNGVLTVDGKARFNQEFSVSTSVNVQNDGNSHVFFRKANGTEKGLIWADDPGNVSIRAGGVSGPVWNFWNSGSCQFPGAISNFNGVNSTTNYPGGGNGAYLNTAGLVSRFSNGAYVSLYFQEYVGNYHQAILNVNGYGQDNNFFFRAGGDFICQRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNAVIALLVESVKELKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1508 AA
molecular weight: 159284,82790 Da
isoelectric point:7,54386
aromaticity:0,07294
hydropathy:-0,33269

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–621
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_1159
STR
451–1119
DC_1159 IPR030392
IPR030392
CHP
1415–1470
IPR030392 Coil
WYC18131.1
1 1508
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-621 | STR 622-1119 | RBD 1129-1508
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WYC18131.1
1 1508
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1092 1092 0,1080
Central domain 1093 1291 200 0,3828
C-terminal 1292 1508 216 0,8571
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1092
Central
1093-1291
C-terminal
1292-1508

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_KpnM-YP11
[NCBI] 		3135196 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WYC18131.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP531540.1 [NCBI]
CDS location
range 67508 -> 72034
strand -
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCTTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTATACTAAAGATGAAAATGATGCCGTAGTACAGCTCGCCGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACCTCCGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTAACTATTTCTCCGAATAAAGCAATTAGTTTTGAAACTACTGATTTGAGCGGTGAAATAACTCGTCACATCGTTGGCAAATGTGCTACTAATGATGGCTGGTACATTGGTGCCGGCGGTACAAGCAACAGTGGTATTCTTGAAATCGGTACTATTGATGATGGCGCTGAAACTATTCAATTCGTACAACGCGGTGCAGGCAACGTTGAAGCCCGAAAATTGGTCTTGCTTGACGGCTCGGGTAATACGACTCTTCCTGGCGATTTAAGATTATCTACCAATAAGACTGTTAAAATTAACAGTGGAAGCACTCTTGTTCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCTGAGAGGAACCGGTGTTCTTCAATTAACCAATGACAGTAATCTGACATTCAGAAATTCACAGGTATATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTAACAAATGTAGAAAACAATCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACTGCTGCAACTCCGCGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACATCCAGGAGAGGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGCATTGATTCTGGGCACGGAAGACATTATGTTGATTTTATCACGTTATCTGGTCGCAATTTAACGTCCTGGAGCACCAACAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAAATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATATGGCAATGGCCTTTATGTTACAGTGCTAAACACGGCTGGATACAACGGTCAAGACAGCGGTAAAGTAATTATCTACGAAACTGGCCAAGATACTGGTGCTACTGCACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTCGATAGTATCGCAAAACCAGATTTCAGTTATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGCGGTGGTACAGGTGCTACTAATGTAGGAGATGCCAGAAACAACTTAGGTTTAGGTACTGCTGCTGTGCGTAATGTCGGTGAAGGCACTGGTAACCTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGCGGTAATGGTGGTAAATCTATCAATGACATTACCTCTAATGCGGATATGTTGACCCGTTTAAAAGCATATGGTGGTACTTTCTGGCGCGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCATGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGCGACACCATGTCAGCCATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGGTCTTGCTGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCAACTAAGGCTGACGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTCAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGCGATTTAACTGTTCCTAATTTACATGCTTCCGGCCCGGGTACTGCATCAGTATATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCGACGCCTAATACTGCTGACTTAGGACAAATTAATATTCGCGCAAAAACTACTGGAGGTACTTCTGCTGGTGATTATAGTTTCCGTTCTGATGGTCGTCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAATGATATCACCACTGGCGATAATAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAATCCTAGTGGAACATTTGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGACAAGTACAGCAGATTAACCCTTGCACGTAAAGTTGGTAGCGGTGCTACCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAACCTACAGTTTCTACCCCGGCTCCTAGCAAGTACCTCCTGGTTAAATCCAGCGGTCTTGAGGTAGAAGGGGATTTAGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGCACTGAAGATGCAGTTGATATTTCTGATAAAACTATTGACCTTAATAGTCTTATCATTAAAAGAACCGACCCTGGTACTCGTCGGTTGTATAAATGTGTATCATCTGGTGGCGGAAACAATATATCGAACAAACCTACCTCTGATGGAAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTACGCAAGGTTTCTGATACCGATTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGTAATGTTGAAGGCGTATATGTTCGATACGGGCAAAACGGTTCATGGGCTGCATGGAGAGAGGTTGTTGCAGGGGTTCAACCAATCAACTTGGGCGGTACCGGAGCAACTTCTGTGGCTGCTGCTCGTAATAACCTCGGTGTTGGTGAAGGACAGAGTGTGAAGTTCGGCGGGTTAGTTGTTAATGGCGTCGGAACAAGTGATCCAACTATCACATTTAAAAATGGGGCTATGGTTCGTGAAGCCCAAGGTGGTAGTCTCGGCGCGTTAATCCTGTCGGCTTCTTCTACAGCCGCTGCAGCCGCAAAATATATCGCTTTCCGTCCTTATGGCGATGCGTCTAATTCTGAGGTTAGAGTCAAAGCCTATGGTAATAATGAGACGGTGCTTGAGTGGGCTCAAGGTCCTGGCGTCCGTTCAAATTCATCTGGCGCTTTTGTTATCTACGCAAAAACAGGTCAGGCACTCCATTTAAGACCAAACGGTGATAATTCTAACAGAGCCACAGTTATTGACCAAAATGGTAAAATGACAGTAAGTGGTGAGTTCGAGGCCCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACTTGAACGTTTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGCAAAAACTCCGACTTCGGGTTGGTCAAGAAAAATGGCATGCCAGGAAAAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTATCAACCAATACCAATAACAAAATTAATCCTGCTGATACGTTTAACGATATATTCAAGGTAGATGCAGACGGAAACCAAACCGTTTACGGAAATGCCCAAGTTAACAGACAGTTAACTGTTTCTAGTTCAGCAACTGTTAATGGTATTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAGGGTTGCTTCTGCTATTAGTAGTGCTGGTGATACTTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGGCGGTTAACAATTACAGGCGATCAGTTAAAAACTACATCACTTTGGGTCACTGGCGATGCTGCTGTTAACGGTGTTTTAACGGTTGATGGAAAAGCTAGATTTAATCAAGAATTTAGTGTATCCACTTCAGTTAACGTCCAGAACGATGGTAACAGCCATGTGTTCTTCCGTAAAGCAAACGGTACAGAAAAAGGACTTATTTGGGCCGATGACCCTGGTAATGTTAGTATAAGAGCAGGCGGCGTTTCCGGTCCGGTATGGAACTTCTGGAACAGTGGTTCTTGCCAATTCCCAGGGGCTATTAGTAACTTTAATGGTGTTAATAGTACTACTAATTATCCTGGTGGCGGAAATGGTGCGTATTTAAATACCGCAGGATTAGTATCTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGTTTCCTTATACTTCCAAGAATATGTAGGAAATTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGCTATGGTCAAGATAATAATTTCTTCTTCCGTGCCGGTGGGGATTTTATCTGCCAACGCAATGGCTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCCTTGGAAAAAGTAGAAACTTTATCTGGTAATACTTATGAGCTTCATAACACTTCTGGCGGTACTACTCGCTCTGCGGGGTTAATCGCACAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACACAAGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACGCTGTTATCGCTTTACTTGTAGAATCAGTTAAAGAACTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f182e103c5a7018c4caf4d3a2b0c06e8081b3d0ab32d16c3ab7590e51c8d650d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6918
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50