Protein

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Genbank accession
QBX17123.1 [GenBank]
Protein name
hyaluronidase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MLFLLDANVRTVKWNGIPLHEASSAIVKEETNGDFYLTVRYPITDSGIYQLIKEDMLIKSPVPVLGAQLFRIKKPIENDDSMDITAYHVSDDIMKRSITPVSVVGQGCAMALSQMVQNAKTGLGDFSFTSDIMDSRTFNTTETETLYSVLMDGKHSIVGTWEGELVRDNFALSIKRSRGADRGVVITTHKNLKSYQRTKNSQGVVTRIHARSTFKPDGAEDEVTLRVSVDSPLINSYPYINEKEYENNNAETVEDLRKWAEAKFTNEGIDKVSDAIEIEAYELDGQVVNLGDTVNLKSRKHSADLYKKAIAYEFNALTEEYISITFDDKPGVGGSGVSSGLSNVADAILVASATAQDVAVQRAVKNANAAFDAEFGKTKTKINDDIEIAKAKVESFKSELSNRMDNQLLPLATEAKNLASQAQADLTRKEIELRAELNRQVTSTEAVKISLTNLSHNMDIIKQKALNDLRDAETRLKEADSVQQLATKRVEDKLTGLSTKLESFSVGGYNYVIDGGEPKELMANFYGKTYDINPQLLERTSQATLSFSYEAESTSRLEVRLYKKMHTGDTSKITIIVMPNFDLSPGKGFISQSFDLGGVMPDPRNQAWLVMRGTNANPLTLSKVKLERGTVATDWNNRDETLKASFAEYKQTVDENLANLRTSTETLAGQLTSAESSIRQTSESFSNRLVSLETYKDSEPNRASRYFEASKSETAKQLSALRTEVNGSYVDKSTYEENARGLIRRFESLSSGTQNYALGTERDVYLNVSGTTVYDLYSFGTTLAVKGIEMGDTVTIAFNYFADSRTAFGSYELELYGHAGKIERVGEVQRTISNRGTYTASFVANNANFRANSLKIRFTDSQLKFRVTTLRVTKGTIPADWSPSPDDLKAYSDTKLEQTANEIKASVTSLDHKTLKQTDITMTSEGIVLRAGKTSNDVARAIGSYFKVTPDAIALFSSLIKVSGNMLVDGSVTSRKLVTGAVETGHVKAGAITGVLLAAEAVTAEKLKVDQAFFNKLMANDAYLKQLFAKSAFITQVQSVTISASQISGGVIKALNNAMEIQMNSGQILYYTDQAALKRVLSGYPTQFVKFATGTVSGKGNAGVTVIGSNRYGTESTNDGGFVGVRAWNGSNIDSLDLVGDEIRLASSAFDNSDGWDVRTLDSGLKITPHNRAAERNSRIEVGDVWILKGNGSYSSLRDILNSFNENFSKGPNADSYTYYPSGF
Physico‐chemical
properties
protein length:1224 AA
molecular weight: 134331,93810 Da
isoelectric point:5,72973
aromaticity:0,07925
hydropathy:-0,36364

Domains

Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–737
DC_1353
IPR007119
Unmapped
28–327
IPR007119 Coil Coil DC_0171
IPR010572
ENZ
98–327
IPR010572
QBX17123.1
1 1224
Architecture
STR
RBD
STR 1-737 | RBD 738-1218 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage Javan33
[NCBI] 		2548109 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Streptococcus agalactiae
[NCBI] 		1311 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX17123.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448731 [NCBI]
CDS location
range 28487 -> 32161
strand +
CDS
TTGCTCTTTTTACTTGATGCAAATGTAAGAACGGTCAAATGGAATGGCATTCCACTACATGAAGCCAGCTCTGCCATTGTCAAAGAAGAAACCAACGGTGATTTCTACCTGACTGTTCGCTATCCTATCACGGATTCAGGTATCTATCAGCTTATCAAAGAGGATATGCTGATTAAGTCGCCTGTGCCTGTGCTGGGCGCTCAGCTGTTCCGTATCAAGAAGCCTATTGAGAATGACGACAGCATGGACATCACTGCCTATCATGTCTCTGATGACATCATGAAGCGGTCTATCACTCCTGTGAGTGTGGTTGGTCAAGGCTGTGCTATGGCACTGTCTCAGATGGTTCAAAATGCTAAGACTGGGCTAGGTGATTTCTCCTTTACCAGCGATATTATGGACAGCCGAACCTTTAACACGACTGAAACGGAAACGCTCTACTCTGTCCTTATGGACGGTAAACACAGTATTGTTGGAACGTGGGAAGGTGAGCTTGTCCGTGATAACTTTGCCTTATCTATCAAACGTAGCCGTGGGGCTGATCGTGGTGTTGTCATCACAACACACAAGAACCTCAAATCCTATCAACGAACCAAGAACTCTCAGGGTGTTGTCACAAGGATTCATGCACGGTCAACCTTCAAACCTGATGGAGCTGAAGATGAAGTGACGCTCAGAGTGTCTGTTGACAGTCCACTAATAAACTCTTATCCCTACATCAATGAGAAAGAGTATGAGAACAACAACGCTGAAACCGTTGAAGACCTTAGAAAGTGGGCTGAGGCTAAGTTTACAAATGAGGGCATTGATAAGGTTTCTGATGCCATTGAGATTGAAGCCTATGAGCTTGACGGTCAAGTTGTAAATCTGGGCGACACGGTTAACCTCAAGAGTAGAAAGCACAGTGCTGACCTCTACAAGAAGGCCATTGCCTACGAGTTTAACGCTTTAACGGAAGAGTATATCTCCATAACTTTTGATGATAAGCCAGGAGTTGGTGGTTCTGGGGTGTCAAGTGGCTTGTCTAATGTTGCTGATGCTATACTTGTAGCAAGTGCCACAGCTCAGGACGTTGCTGTTCAAAGGGCTGTGAAAAATGCTAACGCTGCCTTTGATGCAGAGTTTGGTAAAACAAAAACAAAAATTAATGATGATATCGAAATCGCAAAAGCCAAAGTAGAAAGCTTTAAATCGGAACTATCTAATCGCATGGATAATCAGCTTCTTCCCCTTGCGACAGAAGCTAAGAATTTAGCCAGTCAGGCACAAGCAGACTTGACCAGAAAAGAAATAGAGCTTAGAGCTGAATTAAATAGACAAGTCACAAGCACAGAAGCTGTAAAAATCTCTCTAACAAATCTTAGTCACAATATGGATATCATTAAGCAAAAAGCCCTAAACGACCTTAGAGACGCAGAGACAAGGCTAAAGGAAGCTGATAGCGTCCAACAACTTGCGACAAAGCGGGTTGAGGATAAACTGACAGGACTTAGCACGAAACTGGAGTCATTCTCTGTTGGTGGCTATAATTATGTCATTGACGGCGGAGAACCTAAAGAACTAATGGCTAACTTCTATGGTAAGACCTATGATATTAATCCCCAACTACTCGAACGAACTAGTCAAGCGACCTTGAGTTTTAGCTATGAAGCAGAATCAACTAGTCGTTTAGAAGTTAGACTTTATAAAAAGATGCACACCGGGGACACTAGTAAGATTACAATTATTGTCATGCCTAACTTTGACTTATCTCCAGGGAAAGGCTTTATCTCTCAGAGCTTTGATTTAGGTGGTGTTATGCCTGACCCTAGAAACCAAGCCTGGCTTGTGATGCGGGGGACAAATGCTAACCCCTTGACGCTCTCGAAAGTTAAGCTGGAACGTGGTACCGTTGCTACAGACTGGAATAATCGCGATGAAACCTTAAAAGCTAGCTTCGCCGAATACAAGCAGACCGTTGATGAAAACTTAGCCAACCTTAGAACAAGTACGGAAACCTTGGCAGGTCAACTGACAAGTGCTGAGTCTAGCATTAGGCAGACGTCGGAATCCTTTAGCAATCGTTTAGTTAGTCTTGAGACCTATAAAGATAGTGAACCAAATCGAGCTAGTCGTTACTTTGAAGCAAGCAAGTCTGAAACCGCTAAGCAGCTATCAGCCTTACGAACAGAGGTTAATGGCTCTTATGTGGATAAGTCAACCTATGAGGAAAATGCAAGAGGTTTGATAAGACGCTTTGAAAGTCTGTCATCAGGGACACAGAACTATGCTTTGGGGACTGAAAGAGATGTCTATCTAAACGTTTCAGGGACTACCGTCTATGACCTTTATAGCTTCGGTACTACCTTAGCCGTAAAAGGGATTGAAATGGGAGATACTGTAACTATTGCATTTAACTATTTTGCGGATAGTCGGACGGCTTTTGGTTCTTATGAACTGGAGCTATACGGACATGCAGGCAAAATCGAACGGGTTGGTGAGGTACAGAGAACGATATCAAATCGTGGTACCTATACCGCATCTTTTGTGGCAAACAATGCCAATTTCAGGGCAAACTCCCTTAAAATTAGATTTACGGATAGCCAACTTAAGTTTAGAGTGACAACACTTCGTGTGACTAAGGGGACAATTCCTGCGGACTGGAGTCCATCTCCAGATGACCTGAAAGCCTACTCAGATACTAAGCTTGAACAGACAGCTAATGAGATTAAAGCTAGTGTAACAAGTCTTGATCATAAAACTCTTAAGCAAACTGATATTACTATGACTTCTGAAGGGATTGTCCTGAGAGCAGGCAAGACGAGTAATGATGTGGCAAGAGCTATTGGCTCTTACTTTAAGGTCACTCCTGATGCTATAGCTCTGTTTAGCTCACTGATAAAAGTTAGCGGGAACATGTTGGTTGATGGTTCTGTAACTAGTCGTAAGTTGGTAACAGGCGCTGTCGAAACGGGACATGTTAAGGCTGGAGCAATCACAGGAGTGCTTTTAGCAGCTGAAGCTGTAACGGCAGAAAAACTTAAAGTCGACCAAGCTTTCTTTAACAAGTTGATGGCCAACGATGCCTACTTGAAGCAACTATTTGCCAAGTCAGCCTTCATCACTCAGGTTCAATCCGTGACAATATCTGCCAGTCAGATTTCGGGCGGTGTTATTAAAGCTTTGAATAATGCCATGGAAATCCAGATGAACAGTGGTCAGATACTTTACTACACTGACCAAGCTGCACTGAAACGGGTTTTGAGTGGCTATCCTACTCAGTTTGTTAAGTTCGCAACTGGTACAGTATCTGGTAAAGGAAATGCTGGTGTTACGGTCATTGGTTCTAACCGCTACGGTACAGAATCAACCAATGATGGTGGATTTGTTGGAGTCCGTGCATGGAACGGCTCAAACATTGACTCACTTGACTTAGTTGGTGATGAAATCCGATTAGCAAGCTCTGCCTTTGACAATTCAGATGGTTGGGATGTTCGGACACTTGATTCAGGCTTGAAAATCACACCACACAATAGGGCTGCTGAACGCAATAGCCGAATTGAGGTTGGTGATGTCTGGATTTTAAAAGGAAATGGATCCTATTCTTCTCTCAGAGATATTTTGAACTCATTCAATGAGAACTTCTCAAAAGGCCCAAATGCTGACTCTTACACTTACTACCCTTCAGGGTTCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cb55dea38ec2cffa7bdba5c9c6567b28a43738f241265e47e55c3ae4cb94754a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3044
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50