Protein

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Genbank accession
QJA42508.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDINAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETDAGIDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQTETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGVLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGSWDSQATNFAPIFSEINSTVDASYHPIVKQRLGQGTFSLGTLNDGSGDFKIHHISSASGALKSSYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLGTSGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1350 AA
molecular weight: 146182,03830 Da
isoelectric point:5,69324
aromaticity:0,08074
hydropathy:-0,31889

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1144–1177
IPR048391 IPR048391
QJA42508.1
1 1350
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1143 | ATT 1144-1177 | STR 1178-1236 | ATT 1237-1298 | STR 1299-1332 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540
[NCBI] 		2719567 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJA42508.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT150133 [NCBI]
CDS location
range 27695 -> 31747
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCAATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCTGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAACTGGCTTCTGGTGAATATATTGCAGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCGGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACAGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCCCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCCCAGACTCAAGCAAACGTTGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTGGCAATTACTCCGCAGACTTTAGCTAATCGTGTGGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGTCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTGATGCTGGTATAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCGCGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGTCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCTGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAAACAGAGACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACCGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCGACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACCAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAATTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTCAACTCAGGTACAGGCCTTTATGAGAACGATGATACTGTTCTGAACGCAGCGAACTATCCTAAAACGGGTTATGCGGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGAGACGTCGATCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACCCTGACCAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACCGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTGGAAGTAACAGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAGTCTGGCGCAGGTTCTTGGGATTCTCAGGCAACTAATTTTGCACCTATTTTCTCTGAGATAAATTCTACTGTTGATGCTAGTTATCACCCTATTGTTAAGCAACGATTAGGGCAGGGTACTTTCTCTTTAGGTACTTTAAATGACGGTTCCGGCGATTTTAAAATCCATCATATTAGCAGTGCTTCTGGTGCTTTAAAATCTTCCTACTGGACCTTTAATACGACCGGTGATTTTGCTGTTAATAGTGGTTCTATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACCACACTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCGTTGCAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGTTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCCCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTTGATATCAATGATTCGGCCACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACGAAACGCCAGGTTAATATCGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACAGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCGGTACGTCAGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACCCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGATTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9ce475b149b0f68e18da85ef42af2483348074ea82ed0c7029bee8b7310f5a5e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5322
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50