Protein
- Genbank accession
- XLQ29670.1 [GenBank]
- Protein name
- long-tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9258
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9289
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGSFNRIRWKALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPTSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVFIFNNRLWQMYVADYSREAVVVTPASFYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDSEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGISEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATPAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATQLIFEKGPQTGTNPTQTMTVKVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIIRNDGSVTNFMLTASGNQTGGFNGLRPLSINNQSGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGVKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1289 AA molecular weight: 140315,91150 Da isoelectric point: 5,66829 aromaticity: 0,07370 hydropathy: -0,33716
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Escherichia phage Ec_YwIITB1 [NCBI] |
3366621 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLQ29670.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ356294.1
[NCBI]
CDS location
range 152186 -> 156055
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCAGCGGGAAGTTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCGTCAGGACCTTATCAATTAAAGTCAGGTGAATCAATTTCAGTTAATACTGCAGCAGGAAATGATATCACATTTACTTTGCCAACTTCTCCAATTGATGGAGATACTATCGTTCTTCAAGATATTGGTGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATAGTTTTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGTAGTTGTGACTCCAGCAAGTTTCTATCAAGCGCAATCAAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCAGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTCACGACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAGTGAAAAATTATGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAAACGATTGAGCTTCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATTGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTTGAAAGAGTCGATTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCCCAAGCTAACGTTGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTAAATCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTCGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAAACATTATCGGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCCTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAATGTTTATAATAAAAATACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCACTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACACCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGCGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGCGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATATCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACCGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCCACTCCAGCCATAAGAGGATTTGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCTACGCAGGACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCCCAGACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCAAACAAACGAACCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCAGCAAATAGTACACTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCAATTAATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCGACTCAAACAATGACTGTAAAAGTGTGGGGAAATCAATTTAGCGGAGAGTCAGACACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACTTCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGTAATAAAGCTGGTAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTGAATGCTTCAGGAACATTGAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAATGGAAATTACGGTTTCATTATTCGTAATGACGGGTCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCAGGCAATCAAACTGGTGGATTTAATGGATTGCGTCCATTGTCCATTAATAATCAATCTGGGCAGGTCACAATTGGTGAAAGCTTGATCATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGGGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTGTTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTTACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAAAAAACTAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCTTCGGATATAGGAGCAATTCCATCTGATAATGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.