Protein
- Genbank accession
- XFC50288.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9237
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6642
- Protein sequence
-
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGDFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEIQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQDTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMFTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQSGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEIQVRTSGNGFLVYDAIDKIWRIFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGTDNSTVKTINVTLPTDVAVGDTVKIAMNYMRKGQTVVIKASDGDTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLELAYIEDKASGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESSPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVNQATTASYLDNVIVTPKKLNERAATETRRGLAEIASNAKMDAGTDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVIQLVKTGGAPNTTADRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPEALHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNDRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSTVMVNPKLLFDKFANTDRIQVNTGSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGSDAKKIVTAATLHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLSDRIVSPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWSFSQDTSFSNNISVQNIIYANGGEVKISPTADTGNVHVRFQNRDGSERGIIYAEPQTASAGTLKIRVKNGTGTTATSQTYVFGGNGTLEVPNEVSTKTLRSSGNAIVGGTVMVKDVQMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVKKAGGTMTGNLNINSSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPGNPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1281 AA molecular weight: 138485,33150 Da isoelectric point: 7,17771 aromaticity: 0,07260 hydropathy: -0,33130
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XFC50288.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ182780.1
[NCBI]
CDS location
range 88487 -> 92332
strand +
strand +
CDS
ATGAGCGATTTACTGAAACAACATTTCCGTGCAACAAACGGTTTGGATGCCGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTTGCTGACCGCAACGTTAAAACCGACGGCGTCTCCGTCGAGTACGTTATTCAAGAAAATACTATCCAAAAATATGACCCGACGCGTGGGTATCTCACTGATTTTGCTGTGACTTATGGACGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAGCCTGCCGGAGATTTTAACCAGGCCAATTGGACTTCTTTGCGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACCGTCCGTAAAGGAGAGTTTGAAATTCAATCAGGCCAGTTCATCAACGTTGACTCGAACGCTGCCGGTAATGCTACGCTGTTGTTACCTTTAGCACCAGACGAAGGTGATACCATTGTAGTTCGTGATATCGGTGGACGCCCTGGATATAACGGAATTCTTATTAAAGCACAAGATACTGGTGCATCTATTGTCTTCGGCGAATCACGCTTACGTGAAGTAAGACTTACTCGTCCGTATTCGCAAATTATGTTTACGTTTAGTAACGGTGCATGGCGTGCGAGTTTAACCGATTTTGGCGATACTGCCAAGATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCAACCCAGGTTCAGTCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTCATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGATGGTACATCGCCGATTAACCACATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCGATTGGGACTCCCGGACAAACGGAAATTCAAGTACGTACTTCAGGTAATGGATTTTTGGTGTATGACGCTATTGACAAAATATGGCGTATCTTTGAAAATGATTTGCGTACACGTGTAAGAATAATTACTTCTGACGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGTACTGACAATAGTACAGTTAAAACAATTAACGTTACTTTACCTACTGACGTAGCTGTTGGGGATACTGTCAAAATCGCAATGAATTATATGCGTAAAGGACAGACCGTAGTAATTAAAGCTTCTGATGGTGATACCATCGCTAGCAATTTGAATTTACTGCAATTTCCAAAACGCTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTTCAATCAAGCTCGATTACCTTTAACGGAACTACGTCATATGTTCCTGTTCTTGAGCTTGCATATATTGAAGATAAAGCATCCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACTGTAGAACGTGTTGATGCTAAAGACAATACAACCAGAGCCCGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACACAAGCTCAAGCTAACGCGGAGTCAAGTCCGGAAAAAGAATTAGCAATTACGCCAGAAACCTTAAACGGACGTCGTTCTACTGAAACTCAGACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCTAGCGAAGTTAATCAGGCAACAACTGCCTCTTACTTGGATAACGTAATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAACGAAAGAGCTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTTTAGCTGAAATTGCGTCTAACGCTAAAATGGATGCAGGAACAGATGATTTTACGATTGTTACTCCTAAGAAGTTGCTTTATCGTACTACATCAGATTCACGATTAGGTGTTATTCAATTAGTAAAAACTGGTGGTGCTCCTAACACAACTGCTGATCGTTCTTCTGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCGGTTACTCCAAAAACTCTTCGTGAGTATAAAGCTACTGTAAATCAGTCAGGAATAGTTTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCGGCTTCTTCAAATATTCCTACAGTCGTTACACCAGAAGCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGACGGAGCGATTGGATTAATCCAAATAGCTACACAGACAGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACTGCAACTAACGATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTACAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACTGATCGTATCCAAGTTAATACTGGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACTACTCTTGCAACTGCTGCTGAGGTTAGAACCGGCAGCGACGCCAAGAAAATAGTTACTGCTGCCACGTTGCACGCGAAAACAGCAACCGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACGCAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTAAGTGATAGAATTGTTTCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTGAGGCTATCTACAGGCGATGGAACGTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACACCAGACAAATATGCTCGTCGCGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGTCATTTAGTCAGGACACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTCCAGAATATTATATATGCTAATGGTGGCGAAGTTAAAATTTCTCCAACAGCTGATACTGGAAATGTGCATGTTCGTTTTCAAAATAGAGACGGAAGCGAGCGTGGTATAATTTATGCTGAGCCTCAAACAGCTTCAGCCGGAACTTTAAAAATTCGTGTCAAAAACGGAACTGGAACTACTGCTACAAGTCAAACTTATGTATTTGGCGGTAACGGTACGTTAGAAGTTCCTAACGAAGTGTCAACTAAAACTCTGAGGTCTTCTGGAAATGCAATAGTTGGCGGAACTGTTATGGTTAAGGACGTTCAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTACGCAAGATTAGCTGATGGCCGTTATGTCAAGAAAGCTGGTGGTACAATGACCGGCAATCTTAACATAAATAGTTCGGCTATCGTCATTACAGGTTCTGAATCCTGGTATGTGCCAACGAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATTAAAGACGCTACTAAGTTAAAAGGCCTTCGTGGTTATATGGTTCCGATCAGAACACCGATTGACCCGGGTAATCCAAGCACTTTAGTAGTAACCGGATATGAAGAAAAGACTGCCGCCGGTGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAACTTTGGACTCCTTATCCTCCGACAACCGAAACTGCTGATAAGCGTTTTGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGAGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCGAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTACTGGAATGGATTAAGCTTGGTCCAGTTAAAATCTGGCCAGACCGTCCAAACCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.