Protein

Genbank accession
XEO41140.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9186

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,6635

Protein sequence
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGDFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEIQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQDTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMLTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQSGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEIQVRTSGSGFLVYDAIDKIWRVFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGADNSTVKTINITLPTDVAVGDTVKIAMNYMRKGQTVVIKASDGDTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLGLAYIEEKATGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESNPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVNQATTASYLDNVIVTPKKLNERAATETRRGLAEIASNAKMDAGTDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVIQLVKTGGAPNTTNDRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPEALHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNDRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSTVMVNPKLLFDKFANTGRIQVNTSSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGTDAKKIVTAATLHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLSDRIVSPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWTFSQDTSFSNNISVQNVIYANGGEVKISPTADTGIVHVRFQNRDGSERGIIYAEPQTASAGNLKIRVKNGTGATAASQTYTFGGNGTLGVPNEVSTITLRSSGNTIVGGTVMVKDVKMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVKKAGDTMTGNLNISGSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPANPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1281 AA
molecular weight: 138318,29870 Da
isoelectric point:8,07694
aromaticity:0,07182
hydropathy:-0,31561

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Raoultella phage vB_Ro_M12a
[NCBI] 		3243423 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEO41140.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ181262.1 [NCBI]
CDS location
range 3325 -> 7170
strand +
CDS
ATGAGCGATTTATTGAAACAACATTTCCGTGCAACTAACGGTTTGGATGCCGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTCGCTGACCGCAACGTTAAAACCGATGGCGTCTCCGTCGAGTACGTCATTCAAGAAAACACCATCCAAAAATATGATCCTACTCGTGGATATCTCACTGACTTTGCTGTGACTTATGGCCGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAGCCTGCTGGAGATTTTAACCAGGCGAATTGGACTTCTTTACGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACTGTCCGTAAAGGAGAGTTTGAAATTCAATCAGGACAGTTCATCAACGTTGACTCGAACGCTGCCGGTAATGCTACGCTGTTGTTACCTTTAGCACCAGACGAAGGTGATACCATTGTAGTTCGTGATATCGGTGGACGCCCTGGATATAACGGAATTCTTATTAAAGCACAAGATACTGGTGCATCTATTGTCTTCGGCGAATCACGCTTACGTGAAGTAAGACTTACTCGTCCGTATTCACAAATTATGCTTACGTTTAGTAACGGTGCATGGCGTGCTAGTTTAACAGATTTTGGCGATACTGCTAAAATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCAACCCAGGTTCAGTCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTTATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGATGGTACATCGCCGATTAACCATATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCAATTGGGACTCCTGGACAAACGGAAATTCAAGTACGTACTTCAGGTAGTGGATTTTTGGTGTATGACGCTATTGACAAAATATGGCGCGTCTTTGAAAATGATTTACGTACACGTGTAAGAATAATTACTTCTGACGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGCGCAGATAATAGTACAGTTAAAACAATTAACATTACTTTACCTACTGACGTAGCTGTTGGGGATACTGTCAAAATCGCAATGAATTATATGCGCAAAGGACAGACTGTAGTAATTAAAGCTTCTGATGGTGATACTATCGCTAGCAATTTGAATTTACTGCAATTTCCAAAACGCTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTTCAATCAAGCTCAATTACCTTTAACGGAACTACATCGTATGTTCCTGTTCTTGGGCTTGCATATATTGAAGAAAAAGCAACCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACCGTAGAACGTGTTGATGCTAAAGACAATACTACCAGAGCACGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACACAGGCTCAAGCTAACGCGGAGTCAAATCCAGAAAAAGAATTAGCAATTACGCCAGAAACCTTAAACGGACGTCGTTCTACTGAAACTCAGACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCCAGTGAAGTTAATCAGGCAACAACTGCTTCTTACTTGGATAATGTAATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAACGAAAGAGCTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTTTAGCTGAAATTGCGTCTAATGCTAAAATGGATGCAGGAACAGACGATTTTACAATTGTTACTCCTAAGAAGTTACTTTATCGTACTACATCGGATTCACGATTAGGTGTTATTCAATTAGTAAAAACTGGTGGTGCTCCTAACACAACTAACGATCGTTCTTCTGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCAGTTACTCCAAAAACTCTTCGTGAGTATAAAGCTACTGTAAATCAGTCAGGAATAGTTTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCTGCTTCTTCAAATATTCCTACGGTTGTTACACCGGAAGCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGACGGAGCAATTGGATTAATCCAAATAGCTACACAAACTGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACAGCAACTAACGATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTACAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACTGGTCGTATCCAAGTTAATACTAGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACCACTCTTGCTACTGCTGCTGAGGTTAGAACTGGAACCGACGCCAAGAAAATAGTTACTGCTGCCACGCTACATGCTAAAACAGCAACCGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACACAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTAAGTGATAGAATTGTTTCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTGAGGCTATCTACAGGCGATGGAACGTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACACCAGACAAATATGCTCGTCGCGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGACATTTAGTCAGGACACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTCCAGAATGTTATATATGCTAATGGTGGTGAAGTTAAAATTTCTCCAACTGCTGACACTGGAATTGTGCATGTTCGTTTTCAAAATAGAGACGGAAGCGAGCGTGGTATAATTTATGCAGAACCTCAAACGGCTTCAGCTGGAAATTTAAAAATTCGTGTCAAAAATGGAACTGGAGCTACTGCTGCAAGCCAAACTTACACATTTGGTGGAAACGGCACCTTAGGCGTTCCTAATGAAGTATCAACTATAACTTTGAGGTCTTCTGGAAATACAATAGTCGGCGGAACTGTAATGGTTAAGGACGTTAAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTACGCAAGATTAGCTGATGGCCGTTATGTCAAGAAAGCTGGTGATACAATGACCGGCAATCTTAACATAAGCGGTTCTGCTATCGTTATCACAGGTTCTGAATCGTGGTATGTACCAACAAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATCAAAGACGCTACTAAATTGAAAGGTCTTCGCGGTTATATGGTTCCAATCAGAACACCGATTGACCCTGCTAATCCAAGCACATTAGTAGTGACTGGGTATGAAGAAAAAACTGCAGCTGGTGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAGCTTTGGACGCCTTATCCTCCAACAACCGAAACTGCTGATAAGCGTTTTGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGAGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCGAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTCCTGGAATGGATTAAGCTTGGCCCAGTTAAAATCTGGCCAGATCGTCCAAACCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.