Protein

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Genbank accession
YP_010664868.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein and host specificity
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,73
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MKKGGYKMLLTIHDANLQKVAFIDNEKQGTLNYYDDTWTRSLATGSSTFEFTVFKKAVKSDLPLAKAYHHLNEHAFVSFKYKGKSFVFNIIIVEENEQTIKCYCENLNLELINELANPYKSNKAMTFKEYCEAMDLLNYTHLSIGINEISDYKRTLEWEGQETKLARLLSLAKRFDAEIEFDTQLNADSTIKKFSVNVYHENDDNHQGVGRVRNDVIVKYGKNIHSITRKVDKTGIFNTIRPTGKMPTVEEELSGDKGSKSETVKNADGSTTKTTISTASDGTKSKTIVHTKVTKLADKTRITTTTTTRSDGSIEQTVTTSKKGGASTSETKVLKKPNPKEKTNTTEDVLTIEGLDEWEVKNEKGIVEFYQRGQALYAPISMQLYPSTFTHSTGELDQWTRKDFHFETDEPNELRRLGYLKLKKYCYPAITYEVDGFVDADIGDTVKVHDDGFAPLLMIQARVTDQKISFTNPVRNKTIFDNFKALENKLSADIQSAFERLFEAAKPYTIKLSTDNGVIFKNQIGQSLVTPTLYKGGKPVVVGVTWRWALDGEVTTGMTYLVRGSNVTDTVTLTVAAYIGNKEVAVDEISLVNVADGKLGTPGTPGRDGRTPYVHTAWANNATGTDGFSLDSSINKLYIGIYTDFEPNDSTDPKKYKWAKVKGDKGEKGDKGEPGQRGLDGLQGARGEQGLPGRNGADGRTQYTHIAYSNSADGTKDFSVSASDRAYIGMYVDFNSADSNTPSDYNWTLVKGADGANGVAGKAGTDGRTPYLHIAYATSNNGSQGFSTTDSTNKTYIGTYTDYTQADSTDYRVYKWTLIKGADGTGISNVTNYYLATTVSTGITRTSAGWTTTPQPITSDKRYLWNYRVELYTNGTSKTTEPTVIGVHGEKGERGLQGLQGLQGARGEQGIPGPRGADGRTQYTHMAYADNATGGGFSQTNTDKAFVGVYIDFNPTDSRNPADYRWTRWKGRDGANGVAGRAGADGRTPYLHIAYATSNNGSQGFSTTDSTNKTYIGTYTDYTQADSTDPKKYKWAKVKGDKGEKGDKGERGLQGLQGLQGARGEQGIPGPRGADGRTQYTHMAYADNATGGGFSQTNTDKAFVGVYIDFNPTDSRNPADYRWTRWKGRDGANGVAGRAGADGRTSYFHIAYAASADGSREFSLEDNRQQYMGYYSDFTAADSRDRTKYKWFDRLANVQVGSQNLLRNTATLPIKNGLDGTWRSTSGGNGVAEPVTLDKYPVPGILKGVRVKNNTNGGNKDLSQIINLVIGQRYTISCWARVSSTSDRSTVNLLVRSWTVNDTNRILFKDISNKTWVKYSLSFTADAEKNSIQFGQNGPGNIEICGMKLELGNVATDWSLSVEDIQSQLDGKADQKLTQQQLTALTEKAQLHDAELKAKATMEQLSDLEKAYNAFVKSNADSRKKSESDLVEAGRRIDLLTTQFGGLAELKTFIDTYMKSTNEGLIIGKNDASSTIKVSSDRISMFSAGKEVMYISQGVINIDNGIFTASIQIGRFRTEQYHLNKDVNVIRYIGG
Physico‐chemical
properties
protein length:1535 AA
molecular weight: 169032,75050 Da
isoelectric point:8,41933
aromaticity:0,09446
hydropathy:-0,64052

Domains

Domains [InterPro]
DC_0002
STR
1–684
DC_0002 DC_1328 DC_0921
IPR050149
Unmapped
598–1143
IPR050149 G3DSA:2.60.120.260 Coil
DC_1151
STR
677–833
DC_1151 G3DSA:1.20.5.320 DC_1328 IPR008979
YP_010664868.1
1 1535
Architecture
STR
STR 1-1534 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Streptococcus phage IPP39
[NCBI] 		1916178 Uroviricota > Caudoviricetes > Paclarkvirus >
Host Streptococcus pneumoniae
[NCBI] 		1313 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010664868.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070926.1 [NCBI]
CDS location
range 29045 -> 33652
strand +
CDS
TTGAAGAAAGGTGGATATAAGATGCTTTTGACAATCCATGATGCAAATTTACAAAAGGTAGCATTTATTGATAACGAAAAACAAGGTACGTTAAATTATTACGATGATACTTGGACAAGAAGTCTTGCAACAGGTTCGTCAACGTTTGAGTTTACGGTATTTAAAAAGGCTGTAAAGTCTGATTTACCTCTTGCTAAAGCCTATCATCATTTGAATGAGCATGCATTTGTCTCATTTAAGTACAAGGGTAAAAGCTTTGTGTTTAATATCATTATTGTTGAAGAAAATGAGCAGACAATCAAATGTTATTGTGAAAATCTCAATCTTGAGTTAATCAATGAGCTTGCGAACCCTTATAAATCTAACAAAGCGATGACTTTCAAAGAGTATTGTGAGGCGATGGATCTTTTAAATTATACTCACCTTTCTATTGGTATCAATGAAATATCAGATTATAAGCGTACTCTGGAATGGGAGGGGCAAGAAACCAAACTAGCCCGTCTATTAAGCCTAGCCAAACGATTTGATGCTGAGATTGAATTTGATACACAGTTAAATGCTGATAGCACTATCAAAAAGTTTAGTGTTAATGTTTATCATGAAAACGATGACAACCATCAAGGGGTGGGACGTGTAAGAAATGATGTCATTGTTAAATACGGAAAAAACATCCACTCTATTACAAGAAAAGTGGATAAGACTGGTATTTTCAATACAATCAGACCGACTGGTAAAATGCCAACGGTTGAAGAAGAACTGAGCGGAGATAAGGGCTCCAAAAGCGAAACTGTAAAAAATGCAGATGGTTCAACGACGAAAACCACAATCTCTACAGCCTCAGATGGGACTAAGAGCAAAACTATTGTCCACACTAAAGTTACAAAGTTAGCGGACAAGACACGGATCACAACGACCACAACGACTCGTTCTGATGGTTCCATAGAACAAACTGTTACAACCAGCAAAAAAGGCGGAGCATCAACGTCTGAAACAAAAGTCTTGAAAAAACCAAATCCAAAAGAAAAAACAAATACAACTGAGGATGTTTTGACGATTGAGGGATTGGATGAATGGGAAGTAAAGAACGAGAAAGGGATAGTTGAATTTTATCAAAGAGGGCAAGCACTGTATGCGCCTATTTCAATGCAACTATATCCCTCAACCTTTACTCATTCAACAGGGGAGCTTGACCAGTGGACAAGAAAAGATTTTCATTTTGAAACAGATGAGCCAAACGAGTTAAGACGTTTAGGTTATCTCAAATTGAAAAAGTATTGTTATCCAGCTATCACTTATGAAGTTGATGGCTTTGTCGATGCTGATATTGGAGATACTGTTAAAGTCCATGATGACGGTTTTGCCCCTCTATTGATGATTCAAGCACGGGTTACTGATCAAAAAATCAGTTTCACAAATCCAGTGAGAAATAAGACAATATTTGACAATTTCAAGGCACTTGAAAACAAACTATCAGCTGATATCCAGTCAGCCTTTGAGAGATTGTTTGAAGCTGCTAAACCATATACTATCAAATTATCAACGGACAATGGTGTTATCTTTAAAAATCAGATCGGCCAGAGTCTAGTAACCCCAACCTTATACAAGGGAGGAAAACCAGTCGTTGTTGGTGTTACTTGGCGATGGGCACTTGATGGAGAAGTAACAACAGGGATGACTTACTTAGTTAGAGGCTCAAATGTAACTGATACAGTTACTCTGACAGTTGCAGCTTACATTGGAAATAAAGAGGTTGCTGTTGATGAGATATCGCTTGTTAATGTTGCTGATGGAAAACTTGGTACACCTGGAACTCCAGGGCGAGATGGCCGTACTCCTTATGTCCATACAGCATGGGCTAATAATGCAACAGGAACAGATGGATTTAGTCTTGATAGCTCAATCAATAAACTCTATATTGGTATTTATACAGACTTTGAACCAAACGATAGCACAGACCCTAAAAAATACAAGTGGGCTAAAGTAAAAGGAGACAAGGGAGAAAAAGGAGATAAAGGAGAACCGGGACAACGTGGTTTAGATGGCTTGCAAGGTGCAAGAGGTGAACAAGGATTACCTGGTCGCAATGGTGCAGATGGCCGTACTCAATACACTCACATAGCTTACAGCAATAGCGCTGATGGAACTAAGGATTTTTCTGTAAGCGCCTCTGATAGAGCTTATATCGGTATGTATGTTGATTTTAATAGTGCTGATAGTAATACTCCATCTGATTACAATTGGACACTTGTAAAAGGAGCTGATGGCGCAAACGGCGTGGCAGGTAAGGCTGGTACAGATGGTAGGACACCATACTTACATATAGCTTACGCCACATCAAATAATGGATCACAAGGTTTTTCAACTACTGACAGTACAAATAAAACGTATATCGGAACATACACAGATTACACTCAGGCAGATAGCACAGATTACAGAGTGTATAAGTGGACGTTGATAAAAGGGGCAGATGGTACTGGTATTTCTAATGTAACTAATTATTATTTAGCTACTACAGTCTCAACAGGTATCACAAGAACAAGCGCAGGGTGGACAACTACGCCACAGCCTATCACATCAGACAAGCGTTATTTATGGAATTATCGAGTTGAGCTATACACAAACGGTACAAGTAAGACAACAGAGCCTACTGTTATTGGTGTGCACGGGGAAAAAGGAGAACGTGGATTACAAGGTTTACAAGGCTTGCAAGGCGCACGAGGTGAACAAGGTATTCCTGGACCTAGAGGGGCAGATGGTCGTACACAATATACTCACATGGCCTATGCCGATAACGCAACAGGTGGTGGATTCAGTCAAACAAACACTGACAAAGCCTTTGTTGGGGTGTACATTGACTTTAATCCAACAGACAGCAGAAATCCTGCTGATTATCGCTGGACAAGATGGAAAGGTCGTGATGGCGCAAATGGCGTGGCAGGTAGGGCTGGTGCAGATGGTAGGACACCATACTTACATATAGCTTACGCCACATCAAATAACGGCTCACAAGGCTTCTCAACTACTGACAGTACAAATAAAACGTATATCGGAACATACACAGATTACACTCAGGCAGATAGCACAGACCCTAAAAAATACAAGTGGGCTAAAGTAAAAGGGGACAAGGGAGAAAAAGGCGATAAAGGAGAACGTGGATTACAAGGTTTACAAGGCTTGCAAGGCGCACGAGGTGAACAAGGTATTCCTGGACCTAGAGGGGCAGATGGTCGTACACAATATACTCACATGGCCTATGCCGATAACGCAACAGGTGGTGGATTCAGTCAAACAAACACTGACAAAGCCTTTGTTGGGGTGTACATTGACTTTAATCCAACAGACAGCAGAAATCCTGCTGATTATCGCTGGACAAGATGGAAAGGTCGTGATGGCGCAAATGGCGTGGCAGGTAGGGCTGGTGCAGATGGTAGGACATCCTATTTCCATATAGCATACGCAGCAAGTGCAGACGGATCACGCGAATTTAGTTTAGAGGATAATCGCCAGCAATATATGGGCTATTATTCCGATTTTACCGCAGCAGATAGTAGAGATCGAACTAAGTATAAATGGTTTGACCGACTAGCTAATGTTCAAGTGGGTTCCCAGAACTTGCTTAGAAATACTGCAACTCTTCCTATTAAAAATGGATTAGACGGTACCTGGCGGAGTACGTCAGGTGGTAACGGAGTAGCGGAACCTGTTACCTTGGATAAATATCCTGTACCTGGAATCCTAAAAGGTGTTCGAGTTAAAAACAACACCAACGGGGGTAATAAGGACCTTAGCCAGATTATTAACTTAGTTATAGGTCAACGTTATACAATATCCTGCTGGGCTCGTGTAAGCTCTACAAGTGATCGATCTACTGTGAACCTACTAGTAAGGTCCTGGACAGTGAACGATACTAATAGGATACTTTTTAAGGATATAAGTAATAAGACTTGGGTTAAGTACAGTCTTTCCTTCACTGCGGACGCTGAGAAAAATTCAATTCAGTTCGGTCAAAACGGACCAGGTAATATTGAAATCTGTGGAATGAAATTAGAACTCGGTAATGTAGCCACTGATTGGTCCTTATCCGTAGAAGACATTCAATCTCAGTTAGACGGAAAAGCTGACCAAAAGCTAACTCAACAACAATTGACGGCCCTAACTGAAAAGGCTCAGTTACACGACGCAGAGTTGAAAGCTAAGGCTACGATGGAACAATTAAGTGATTTAGAAAAAGCATATAATGCCTTTGTGAAATCAAATGCAGATAGTCGAAAAAAATCTGAGTCTGATTTAGTTGAAGCAGGTAGAAGAATTGATTTGCTGACGACACAATTTGGAGGATTAGCAGAGCTTAAAACATTCATTGATACTTACATGAAAAGCACAAATGAGGGCTTGATTATAGGTAAGAATGATGCAAGCTCTACTATTAAGGTATCAAGTGATAGAATATCCATGTTTTCTGCAGGTAAGGAAGTTATGTACATTTCGCAAGGTGTAATAAATATTGATAATGGTATTTTTACTGCATCAATTCAAATTGGACGTTTTAGAACAGAACAGTATCATCTTAACAAAGATGTGAATGTCATACGATATATAGGAGGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a16bc2849924431eac739fcfd49fd3ac01e740a072492ad6b50be47d76c1b6da
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7806
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50