Protein
- Genbank accession
- XCO40471.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9079
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6868
- Protein sequence
-
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGDFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEIQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQNTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMLTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQSGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEVQVRTSGNGFLVYDSIDKIWRIFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGADNNTVKTINVTLPTDVAVGDTVTIAMNYMRKGQTVVIKASGGDTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLGLAYIEDKASGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESNPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVNQSTTASYLDNVIVTPKKLNERAATETRRGLAEIASNAKMDAGTDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVVQLVKTGGAPNTTTDRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPEALHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNDRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSTVMVNPKLLFDKFANTDRIQVNTSSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGTDAKKIVTAATLHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLSDRIVPPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWTFSQDTSFSNNISVQNIIYANGGEVKISPTADTGNVHVRFQNRDRSERGIIYAEPQTASAGTLKIRVKNGTGTTATSQTYVFGGNGTLEVPNEVSTKTLRSSGNAIVGGTVMVKDVQMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVKKAGDTMTGNLNINGSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPGNPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1281 AA molecular weight: 138546,42110 Da isoelectric point: 8,08074 aromaticity: 0,07182 hydropathy: -0,33802
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XCO40471.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP889492.1
[NCBI]
CDS location
range 51901 -> 55746
strand +
strand +
CDS
ATGAGCGATTTACTGAAACAACATTTCCGTGCAACGAACGGCTTGGACGCAGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTAGCTGACCGCAACGTTAAAACCGACGGCGTCTCCGTCGAGTACGTTATTCAAGAAAACACTATCCAAAAATATGACCCGACGCGTGGGTATCTCACTGATTTTGCTGTGACTTATGGACGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAGCCTGCTGGAGATTTTAACCAGGCGAATTGGACTTCTTTACGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACCGTCCGTAAAGGAGAGTTTGAAATTCAATCTGGTCAGTTCATCAACGTTGACTCTAACGCTGCAGGTAATGCTACATTACTGCTTCCGTTAGCACCAGATGAAGGCGATACTATCGTAGTTCGTGATATTGGCGGGCGTCCTGGCTATAACGGAATCTTAATTAAAGCACAAAATACTGGTGCGTCTATCGTATTTGGTGAATCGCGTCTGCGTGAGGTAAGACTTACACGTCCGTATTCACAAATTATGCTTACGTTTAGTAATGGTGCATGGCGTGCAAGTTTAACCGATTTTGGCGATACTGCTAAAATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCAACTCAGGTACAGTCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTTATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGACGGTACATCGCCAATTAACCATATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCAATTGGGACTCCTGGACAAACAGAGGTTCAAGTACGTACTTCGGGTAATGGGTTTTTGGTATATGACTCGATTGACAAAATCTGGCGTATTTTTGAAAATGATTTACGCACCCGAGTAAGAATAATTACTTCTGACGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGCGCAGATAACAATACCGTTAAAACAATTAACGTTACTTTGCCTACAGACGTAGCTGTTGGGGATACTGTCACAATCGCAATGAATTATATGCGTAAAGGACAGACTGTAGTAATTAAAGCTTCTGGTGGTGATACAATCGCGAGTAATTTGAATTTACTGCAATTTCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTGCAATCAAGCTCAATTACCTTTAACGGAACTACATCGTATGTTCCTGTTCTTGGGCTTGCATATATTGAAGATAAAGCATCCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACCGTAGAACGAGTTGATGCTAAAGACAATACAACTAGAGCTCGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACACAGGCTCAAGCTAATGCGGAGTCAAATCCAGAAAAAGAATTAGCAATTACGCCAGAAACCTTAAATGGACGTCGTTCTACTGAAACCCAAACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCCAGCGAAGTTAATCAGTCAACAACTGCTTCTTACTTGGATAATGTAATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAACGAAAGAGCTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTTTAGCTGAAATTGCGTCTAATGCTAAAATGGATGCAGGAACAGACGATTTTACAATTGTTACTCCTAAGAAGTTGCTTTATCGTACTACATCAGATTCACGATTAGGTGTTGTTCAGTTAGTAAAAACTGGTGGTGCTCCTAACACAACTACTGATCGTTCTTCTGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCAGTTACTCCAAAAACTCTTCGTGAGTATAAAGCTACTGTAAATCAGTCAGGAATAGTTTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCAGCTTCTTCAAATATTCCTACAGTTGTTACACCGGAAGCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGACGGAGCAATTGGATTAATCCAAATAGCTACACAGACGGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACAGCAACTAACGATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTACAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACTGATCGTATCCAAGTTAATACTAGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACCACTCTTGCTACTGCTGCTGAGGTTAGAACCGGCACCGACGCCAAGAAAATAGTTACTGCTGCCACGCTACATGCTAAAACAGCAACTGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACACAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTAAGTGATAGAATTGTTCCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTGAGGCTATCTACAGGCGATGGAACGTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACCCCAGACAAATATGCTCGCCGTGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGACATTTAGTCAGGATACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTCCAGAATATTATATATGCTAATGGTGGTGAAGTTAAAATTTCTCCAACTGCTGACACCGGAAACGTGCATGTTCGTTTTCAAAATAGAGATAGAAGCGAGCGTGGTATAATTTATGCTGAGCCGCAAACTGCTTCAGCTGGAACTTTAAAAATTCGTGTCAAAAACGGAACTGGAACTACTGCTACAAGTCAAACTTATGTATTTGGCGGTAACGGTACGTTAGAAGTTCCTAACGAAGTGTCAACTAAAACTCTGAGGTCTTCTGGAAATGCAATAGTTGGCGGAACTGTTATGGTTAAGGACGTTCAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTATGCAAGATTAGCTGATGGCCGTTATGTCAAGAAAGCTGGTGATACCATGACCGGCAATCTTAACATAAATGGTTCGGCTATCGTCATTACGGGTTCTGAATCCTGGTATGTGCCAACGAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATAAAAGATGCTACTAAATTGAAAGGTCTTCGTGGTTATATGGTTCCGATCAGAACACCGATTGACCCGGGTAATCCAAGCACTTTAGTAGTAACCGGATATGAAGAAAAAACTGCAGCTGGTGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAGCTTTGGACGCCTTATCCTCCAACAACCGAAACTGCCGATAAGCGTTTCGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGAGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCGAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTCCTGGAATGGATTAAGCTTGGTCCAGTTAAAATCTGGCCAGACCGTCCAAATCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.