Protein
- Genbank accession
- XOA00280.1 [GenBank]
- Protein name
- long-tail fiber proximal subunit protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9331
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6568
- Protein sequence
-
MADQFKPAFRATSGLDAAGEKVVNVAKADFGTLTDGVNVDFFIEENTLQQYDSTRGYRQNFAVIYDNRVWVSNQDIPAPAGAFAELRWKAVRTDPKWVEIKQPVYQLKSGDYVTVNSEQSPCNMSLPSSPQDGDTIVIKDIGNNAGYNEMKVRATNQSIVRFGQQVTETLLTKPLSYNILIFSNRLWNFYQTAQEERGIRVEPLVEFKAQAGDSIFRRYTSANPVTILLPKYANQGDIIKSVDIDGLGPMYHLIIKSSDPTIGIDSPGVLQKEYRTSGDGLLTYVAADRVWKTWDGDIRTRLRIVRDNVKLMPNESITVFGDNNMVSQTINIELPTDVSIGDTIKIALNYLRKQQTVILKTTGGDKIATDIKLLQFPKRSEYPPDATWVTVSQLEFNGDINYTPVIEFSYTEEAGAGVWIVQQNVPTVERVDSKDNNTRKRLGVISLASQTEANVDFENAPIKESAITPETLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETNQGTDDSTIITPLKLTARKASETLTGIAKLVSTVGTAPGVDRPTLGTNVYNSANNIDIVTPMSLSQLKGTYTEQGLWIGAIESEVIAGVMNNGFPNGVVTPEMLHKKTSTDSRIGLIQIAKQTEVDAGTDYTKAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQAELDGGTDDVRISTPLKIKTHFADTTRREVTAASGLEVTGTVWDKISFNIKPSAEAQRGTSRLATQGEVDTGTDDATIVTPLKLQRKKATEGTEGIIQVATQAEVIAGTNGLKAVPPVHLKYIAQTEKTWEATAARRGFVKLTENTLTFKGDAVNGSGRLLPDGSANLPALDGLMKDGFAVSPYEMNRALQYFLPANAKAVDTDKLDGLDSLQFIRRDVDQSVEGKLTLTKETILTAPLTSSTYASFAGTLSAKDIATEGPIIILNGTNRWNIRALNNATTLTFGNTANVLTINSATGNVAAQNNLSAGAEVSATTKYNLNSRTVIETTAGTPNATLAVGDNAQNLVLKTLDAGNIVANGGGAYKVLTEKNAKEIVDRDFVKKEGDTMGGKLNINAPVLPKITEAQALAPLNTNNFGFWTADITTPTEYQKLPGYAVPVMEIIDGSSTGHVDHYDYVKAPGVMTGTGTSLTSMTRTWTPRPQSIQDNHNANTIWISVWDLARNKWGEWGRVYTNQAPPTAAEIGAVSSSGSAFNNLTIRDWLQVGQVRIEPDPDTRSVKFTWVDIP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1257 AA molecular weight: 136711,01660 Da isoelectric point: 5,37352 aromaticity: 0,06762 hydropathy: -0,32355
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Klebsiella phage vB_KM5a1-KLB31 [NCBI] |
3145205 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOA00280.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP582757.1
[NCBI]
CDS location
range 156272 -> 160045
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAATTTAAACCTGCATTCCGTGCCACGTCTGGTCTCGATGCAGCAGGCGAAAAGGTTGTCAACGTTGCCAAAGCCGACTTCGGTACATTAACTGACGGTGTTAACGTTGACTTTTTCATCGAAGAAAACACTCTTCAACAGTATGATTCGACTCGTGGTTATCGCCAGAACTTCGCAGTTATCTATGATAACCGTGTTTGGGTCTCTAACCAGGATATCCCTGCACCTGCTGGCGCATTCGCAGAACTTCGTTGGAAAGCAGTTCGTACCGATCCAAAATGGGTCGAAATCAAACAACCTGTTTACCAACTCAAATCAGGTGATTATGTAACTGTTAACTCAGAACAATCACCGTGCAATATGTCTTTACCATCGTCTCCACAGGATGGCGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGTAATAATGCCGGTTATAACGAAATGAAAGTACGTGCGACTAACCAATCAATTGTTCGTTTTGGTCAGCAAGTAACTGAAACTCTTTTAACCAAGCCACTGAGCTATAATATTCTTATTTTTAGTAATCGTCTGTGGAACTTCTACCAGACTGCTCAGGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCTTTAGTAGAATTCAAGGCTCAAGCCGGTGATTCAATTTTCCGTCGTTATACTTCGGCAAACCCGGTTACTATTCTTCTGCCAAAATACGCTAACCAAGGCGACATCATTAAGTCTGTTGATATTGACGGCTTAGGTCCGATGTACCACCTGATTATTAAATCAAGTGACCCAACCATTGGTATCGATTCTCCTGGTGTTTTACAGAAAGAATATCGTACGAGTGGTGATGGCCTGCTTACTTATGTTGCAGCCGATCGTGTCTGGAAAACTTGGGACGGTGATATTCGTACACGTCTTCGTATTGTTCGTGATAACGTTAAGCTTATGCCTAATGAAAGTATCACGGTATTCGGCGACAACAATATGGTTTCTCAGACAATCAATATTGAACTGCCTACTGATGTTTCTATCGGTGACACAATCAAGATTGCTCTGAACTATCTTCGTAAACAACAGACTGTTATTCTTAAAACGACTGGTGGTGATAAGATTGCGACTGATATTAAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCTGATGCTACTTGGGTCACTGTGTCTCAGTTAGAATTTAATGGTGATATTAACTACACCCCGGTAATTGAGTTTAGTTATACGGAAGAGGCTGGTGCAGGTGTTTGGATTGTTCAACAGAACGTTCCAACCGTCGAACGTGTCGATTCTAAAGATAATAACACTCGTAAACGTCTTGGTGTTATCTCACTGGCAAGCCAGACTGAAGCGAACGTTGATTTTGAAAATGCTCCTATTAAAGAATCAGCTATTACTCCTGAAACATTAGCTAATCGCGTGGCGACCGAGTCTCGTCGTGGTATTGCACGTATTGCTACAACTGCACAAGTTAACCAAGATACTACATTTGCTTTCCAGGACGATTTAATTATCTCTCCTAAGAAATTAAATGAACGTACTGCTACTGAAACTCGTCGTGGTTTAGCTGAAATTGCAACTCAAACTGAAACCAACCAAGGAACAGATGATAGTACCATTATAACGCCGTTGAAGTTGACAGCACGCAAGGCATCTGAAACTTTAACAGGTATCGCTAAGCTGGTATCGACTGTAGGCACCGCACCAGGTGTAGATCGTCCAACTCTTGGTACTAACGTGTATAACAGTGCTAATAATATTGATATCGTGACTCCTATGTCATTGTCTCAATTAAAAGGTACTTATACCGAACAGGGTCTTTGGATTGGTGCAATTGAATCTGAAGTCATCGCTGGTGTAATGAACAACGGTTTCCCGAACGGTGTTGTTACTCCTGAAATGCTTCATAAGAAAACCTCTACTGATTCTCGTATTGGTCTGATTCAAATTGCTAAACAGACTGAAGTAGATGCCGGTACTGATTACACTAAAGCTGTTACTCCTAAAACTCTGAATGACCGTAAGGCTTCCGAGACTTTAACGGGTATTGCCGAAATTGCAACCCAGGCGGAGCTAGATGGCGGCACAGATGATGTACGTATTTCTACTCCTTTGAAAATTAAAACCCACTTCGCTGATACTACGCGTCGTGAAGTGACTGCTGCGTCTGGTCTCGAAGTTACCGGTACGGTATGGGACAAAATAAGTTTCAACATCAAACCTTCTGCTGAAGCACAACGCGGTACTTCCCGTCTTGCAACACAAGGCGAAGTTGATACTGGCACAGATGATGCGACAATTGTTACACCACTTAAGTTACAGCGTAAAAAAGCCACTGAAGGTACCGAAGGTATTATTCAGGTTGCTACTCAGGCAGAAGTTATTGCTGGGACTAATGGCTTAAAAGCTGTTCCACCTGTTCATTTGAAATATATTGCACAGACGGAAAAAACTTGGGAAGCTACTGCAGCTCGTCGTGGTTTCGTTAAATTAACTGAAAATACCTTGACGTTTAAAGGTGATGCAGTTAATGGTTCTGGTCGTTTACTGCCAGATGGAAGTGCAAACCTCCCGGCTCTTGATGGTTTAATGAAAGATGGATTTGCCGTATCTCCATATGAGATGAACCGTGCACTTCAGTATTTCTTACCAGCAAATGCTAAAGCTGTTGACACCGATAAATTAGATGGCCTGGATTCACTTCAGTTCATTCGTCGTGATGTCGACCAATCGGTTGAAGGTAAACTCACTTTAACTAAAGAAACGATCCTGACGGCGCCTCTGACATCCAGCACTTATGCTTCATTCGCTGGTACACTGAGTGCTAAAGACATCGCAACTGAAGGACCTATTATTATTCTTAATGGTACTAACCGTTGGAATATAAGAGCTCTTAATAACGCGACAACTCTTACTTTTGGTAATACAGCTAACGTACTGACCATTAATAGTGCGACTGGTAACGTTGCTGCTCAGAATAACCTTTCTGCTGGTGCTGAAGTTAGCGCTACCACTAAGTATAATCTGAACAGTCGAACTGTTATTGAGACCACAGCAGGAACTCCTAATGCAACATTAGCAGTCGGTGATAATGCTCAAAACCTGGTTCTGAAAACTTTAGATGCCGGTAATATCGTTGCAAATGGCGGTGGTGCATATAAAGTATTGACCGAGAAGAATGCTAAAGAAATCGTTGACCGTGACTTCGTCAAGAAAGAAGGCGATACGATGGGTGGCAAACTGAACATCAATGCTCCTGTTCTGCCTAAAATCACTGAAGCGCAAGCATTGGCTCCTTTGAATACGAATAACTTCGGTTTCTGGACTGCGGATATAACAACTCCGACTGAATATCAGAAGCTTCCAGGTTATGCTGTTCCTGTGATGGAAATAATCGATGGTTCTTCAACCGGCCATGTCGATCATTATGATTACGTTAAGGCTCCAGGTGTAATGACCGGTACTGGTACTTCATTGACCAGTATGACTCGTACTTGGACTCCACGTCCTCAGTCTATTCAAGATAACCATAATGCTAACACCATTTGGATTTCTGTTTGGGACTTGGCTCGTAATAAATGGGGTGAATGGGGACGTGTGTATACGAATCAGGCTCCACCAACTGCTGCTGAAATTGGTGCTGTGTCTTCTTCAGGTTCTGCATTTAATAACCTGACTATTCGTGATTGGTTGCAAGTTGGCCAAGTACGTATTGAGCCGGACCCAGACACTCGTTCAGTTAAATTCACTTGGGTAGACATTCCGTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.