Protein

Genbank accession
WRN92396.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9258

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9587

Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNVTIDGTLRVNGPINNFGNFSTSGQITAGSSISAQVFRALQGSFYTRASAGETANAHLWFENADGTERGVIYARPQTTTAGEIRLRVRQGTGSTTNSEFYFRSINGGEFQANRILASDALVTKRIAVDTVIHDAKTFGQYDSHSLVNYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDASTGLSYKKTGVYDLVASGLSVASITPDSFRSTRKALFGRSEDQGGTWLLPGQNAALLSVRTEVDQNNNGDGQTHIGYNSNGKFYHYFRGRGRMAIGMAEGLIVEPGILDIKTSSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNSDGTNASLIFKAASGIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVAVKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFNGQVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMVTVDNDSKVMVMTTNSRISPNFRMQIGQSSYIDVECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGVSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNIRIGTDGNITGGTGNFANLNTTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPNGYAIMEGQTFDKSAYPKLAIAYPSGVIPDMRGQTIKGKPSGRAVLSAEADGVKAHNHSASASNTDLGTKTTSSFDYGTKTTSSFDYGTKTSNTTGNHSHTVSGTTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHTWSGTTSTTGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHTHTVAIGSHGHTITVNSTGNTENTVKNIAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1075 AA
molecular weight: 113535,06440 Da
isoelectric point:8,89562
aromaticity:0,07907
hydropathy:-0,35033

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage vb_GEC_SH_GT
[NCBI] 		3110530 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WRN92396.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR887633.1 [NCBI]
CDS location
range 11850 -> 15077
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGACTTAAGCATTTCCGCTGGTGGTAATATCAGTGGAAATGTAACTATTGATGGAACTTTACGCGTCAATGGACCAATAAACAATTTTGGAAATTTTTCCACAAGTGGCCAGATTACCGCTGGTAGTAGTATTTCAGCTCAAGTTTTTAGAGCATTGCAAGGTTCGTTTTATACAAGAGCTTCAGCCGGTGAAACAGCAAATGCCCATTTATGGTTTGAAAATGCCGATGGCACTGAACGTGGCGTTATATATGCTCGTCCTCAAACTACAACTGCCGGTGAAATACGCCTTAGGGTTAGACAAGGAACAGGAAGCACTACCAATAGTGAATTCTATTTCCGCTCTATAAATGGAGGCGAATTTCAGGCTAACCGTATTTTAGCTTCGGATGCATTAGTAACAAAACGCATTGCGGTTGATACTGTTATTCACGATGCCAAAACGTTTGGACAATATGATTCTCACTCTTTGGTCAACTATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAACAAACGGAATCAATTACCTTCGCAAATTCCGTGCTAAATCTGGTGGTACAATTTATCATGAATTAGCTTCTGCGCAAACCGGAAAAAGTGATGAACTTTCTTGGTGGACTGGTAATACAGCGGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGATCTTTAGTATTACGACGTTCACTTGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATCAATAACTACGGTTCCACTGGAGCAATGGGTGAATGTTATATAGTTATTGGTGATGCATCAACAGGTTTATCATACAAAAAAACTGGGGTATATGACTTAGTTGCTAGTGGTCTTTCTGTAGCATCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGCATTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGTGGTACGTGGCTTCTTCCTGGTCAGAACGCAGCTCTTCTTTCAGTTCGTACTGAAGTTGACCAAAATAATAACGGAGATGGTCAGACACATATTGGCTATAATAGTAATGGTAAATTTTATCATTATTTTAGAGGCAGAGGAAGAATGGCCATTGGAATGGCCGAAGGACTTATTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAAAACTAGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATAGTGATGGAACTAACGCTTCTCTAATTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGTACTAAACAGATACTTTGGGAAGGTGGTACTCGTGCTGGGCAGAATAAGAGCTATGTAGCTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGATGGGCAAGGATATTATTTTTATTCACAGCGTGTGGCTCCAAGTGGCTCTGAAACTACTGGGCCTGTTGTAACCCAGTTCAATGGACAAGTTAATGCTAGAGGAAGTATTATTACTGACGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACTATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAGGTAAAAATTGGTGGAACGGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGCCGTTCAGAAGCGTCATTACATATTATCCCTACTCCTAAAGATGCCGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCACTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCCGTTACATTAGGTGATGATGGCGCAGGCGGTAATATGGTGACGGTTGATAATGATTCTAAAGTTATGGTAATGACGACTAATAGCCGTATTAGTCCTAACTTCCGTATGCAAATTGGACAGTCGTCTTATATTGATGTGGAATGTACTGATGCTGTGAGACCTGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCACAGAATAACGAAAACGTTCGCGCTCCGTTCTATATGAATATTGATAGAACAGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTTCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCATGAAGGCGGTGACGGCGTTTCTACTGGTGCTATTATAAAGGATCTTGGATGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTATTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGAAATATTAGAATAGGTACTGATGGTAATATTACTGGCGGAACTGGTAACTTTGCTAACTTGAACACAACTATCGAATCATTAAAAACCGATATTGTTTCAAGTTATCCTATTGGAGCTCCTATTCCATGGCCTACAGATACTCCTCCTAATGGTTACGCTATTATGGAAGGACAGACTTTTGATAAGTCTGCATACCCAAAATTGGCTATAGCTTACCCATCTGGAGTAATTCCTGATATGCGCGGGCAAACTATCAAAGGTAAACCAAGCGGTCGTGCTGTGTTAAGTGCAGAAGCTGATGGTGTTAAGGCTCATAACCATAGTGCTTCAGCATCTAATACTGATTTAGGTACTAAAACTACATCAAGCTTTGATTATGGCACTAAGACGACAAGTAGCTTTGATTATGGCACTAAGACTAGCAATACCACAGGTAACCACTCTCATACTGTAAGCGGTACTACGAGTTCTGCTGGTGCACACCAACATGCGCGCTCAGGTCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAACGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCTCATACTCATACTTGGTCTGGTACTACAAGCACTACAGGTAACCATGCTCACACAGTAGGTATTGGTGCTCATACCCATACTGTAGGTATCGGTGCTCATACCCACACGGTAGCAATTGGCTCGCATGGTCATACTATCACTGTAAATAGTACAGGTAATACAGAAAACACGGTTAAAAACATTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.