Protein

Genbank accession
WRN92393.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9240

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9257

Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRAVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAIVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTTIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELKLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAADEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLELAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNAGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTGEFGGSLAANRTFTIRNTGAPTSIVFEKGPASGANPAQSMSIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDDTSHHFYSQRNKDGNIAFNINGTVMPININASGLMNVNGTATFGRSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDASNTYFLLTAAGDQTGGFNGLRPLLINNQSGQITIGEGLIIAKGVTINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140294,94800 Da
isoelectric point:5,44730
aromaticity:0,07525
hydropathy:-0,32483

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage vb_GEC_SH_GT
[NCBI] 		3110530 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WRN92393.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR887633.1 [NCBI]
CDS location
range 6120 -> 9989
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTGCCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCCGGTGAAGCAATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGAAATGACATCACGTTTACTTTACCATCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTACAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTATAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCCAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCGCGTTTACGTATCATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAGCTCAGACAATTGAGCTTAAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGATGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTTACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTGGAACTTGCTTACATAGAAGATTCTGATGGAAAATATTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACTGAAACTCGCAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGACACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAGCAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAGGAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATGCAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTCGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTCGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAGCCATTAGAATCATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCGGTAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTGACACAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGGTGAATTTGGTGGTTCATTGGCCGCTAATAGAACATTTACCATCCGTAATACAGGAGCCCCGACCAGTATCGTTTTCGAAAAAGGTCCTGCATCCGGGGCAAATCCTGCACAGTCAATGAGTATTCGTGTATGGGGTAACCAATTTGGCGGCGGTAGTGATACGACCCGTTCGACAGTGTTTGAAGTTGGCGATGACACATCTCATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGACGGTAATATAGCGTTTAACATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTGAATGGCACTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTTAGAGCAATAAACGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCCTCTAATACCTATTTTTTGCTCACTGCAGCCGGTGATCAGACTGGTGGTTTTAATGGATTACGCCCATTATTAATTAATAATCAATCCGGTCAGATTACAATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGTTACTATAAATTCAGGCGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACGCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.