Protein

Genbank accession
YP_009619179.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHTNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSLGTLVSEGSMKIHYIDETGTSKYWTFRRDGGFVVDSGSLTVTAGNISASGNINSASGVVSAPQINTKTIVLDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKSDEISWWTGNTAVNKQMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENVNNYGSAGAMGEKYIVLGDASTGLAYKKTGVYDLVGSGLSVASITPDSFRSTRKAIFGRSEDQGGTWLLPGQNAALLSVRTDIDQNNNGDGQTHIGYNSNSKFYHYFRGRGRMAVGMAEGLIVEPGILDIKTGSNTVSIRADGGISSTQRLSLQNGIFLSSDGNNNGISFKASSSIDGTKTLNWDAGTRAGQNKNTVILKAWGNSFNTSGGTDRHTVFEVSDSQGYYFYAQRTTPASGQTVGPINFKFNGTVETGHINGLGNITLSGAVIADSANIKGPLKISNANTADAFRIWNAEYGAIFRRSETSLHIIPTLKDAGENGGISNLRPLSIDLSNGFVQMHHSLSVGNTVRTNGLFAVDTSAALVAINSHSRVNANFRMQLGQSSYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGSSTGVVIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNIRIGTDGNITGGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQATSTVSITVTGGNGFNSGSFNQCAISEIVLRTGNNNPKGLNAVLYRRGLNSFRDIAWVNTSGDTYDIYVNMGTYANQLIFNYSSVDNATVQIIGAFSSAQNPVDALPETYVKGQVADVLTNLVDSGKTKRFVAESEIAINNQTGLRITSNGDKSGSNSVLFRNDGSAFYILLTDKNAADGNTTATEGDWNGKRPFQINMTSGEVTFGNNINIYGNGSITWTKAGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADDTNYIAYFEKTPGGANRFVVNGATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQNGDGLLDIYANGVQTFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLTGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1287 AA
molecular weight: 137914,28620 Da
isoelectric point:8,37775
aromaticity:0,08780
hydropathy:-0,33994

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage Sf24
[NCBI] 		2024309 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009619179.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_042078 [NCBI]
CDS location
range 79418 -> 83281
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGCCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTACTCTTTTTACTAAAGATGACTCGGGAAATATTATTGATTTAAGCATTTCTGCCGGTGGTAACATTAGTGGAAATATTACTCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTTAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAGTATATTGAATTCTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGTGCTTGGGCAAATCAGCACACAAATAAAGCTCCAATTTTCACCGATTTGAGTTCAACTACTTCAACTTCTGAATATCATCCGCTAATTAAACAACGTTATAAAGATGGAACGTTTTCATTAGGGACTTTAGTTTCTGAAGGCTCAATGAAGATACACTATATCGATGAAACTGGCACTTCAAAATATTGGACTTTCCGACGTGATGGTGGTTTTGTTGTTGATAGTGGTAGTTTAACTGTTACTGCTGGAAACATATCTGCTTCAGGCAATATTAATTCGGCATCAGGGGTTGTTTCAGCTCCTCAAATTAATACAAAAACCATTGTTTTAGATACAAAAGCATTTGGACAATATGATTCGCAGTCATTAGTTCAGTATGTTTATCCTGGCACAGGTGAAACAAACGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGCGCAAAATCAGGTGGTACAATTTATCATGAAATAGCTTCAGCTCAAACTGGAAAAAGCGATGAAATTTCGTGGTGGACTGGAAATACAGCCGTTAATAAACAAATGGGTCTTCGTAATGATGGTGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACTACAGATGAAAACGTAAATAACTATGGATCTGCTGGAGCAATGGGAGAAAAATACATTGTTCTTGGAGATGCGTCAACTGGACTAGCTTATAAAAAGACAGGAGTTTATGACTTAGTTGGTAGTGGTTTATCTGTTGCTTCTATCACTCCCGACAGTTTCCGTAGTACGCGTAAAGCAATTTTTGGACGTTCTGAAGACCAAGGCGGTACATGGCTTCTTCCTGGTCAAAACGCTGCTCTTCTTTCAGTTCGTACAGATATTGATCAAAATAATAACGGTGATGGTCAAACTCATATTGGATATAATAGTAACAGCAAGTTTTATCATTATTTTAGAGGCAGAGGCCGAATGGCTGTTGGAATGGCTGAAGGTCTTATTGTTGAGCCTGGAATTTTAGATATTAAAACTGGTTCAAATACTGTTTCTATTAGAGCTGATGGCGGAATTTCATCTACTCAGCGTCTTTCATTGCAGAATGGTATATTTTTATCTTCTGATGGAAATAACAACGGTATATCGTTTAAAGCTTCTAGCAGTATAGATGGAACTAAAACTCTTAATTGGGATGCTGGTACTCGTGCAGGTCAAAACAAAAATACAGTAATTTTAAAAGCATGGGGAAATTCATTTAATACAAGTGGTGGAACTGATAGACATACTGTATTTGAAGTTTCTGATTCACAAGGATACTACTTTTATGCTCAACGTACTACCCCTGCATCCGGTCAAACAGTAGGTCCTATTAATTTTAAATTTAATGGTACTGTAGAAACCGGTCATATCAATGGATTAGGTAATATTACTTTATCTGGGGCAGTTATAGCAGATTCTGCTAATATTAAAGGACCGCTAAAAATATCTAATGCTAATACAGCTGATGCTTTTAGAATATGGAACGCTGAATATGGAGCCATTTTCCGTCGTTCAGAAACATCATTGCATATTATTCCTACACTTAAAGATGCAGGGGAAAATGGTGGAATAAGTAATCTTCGCCCATTAAGTATTGATCTTTCAAACGGATTTGTGCAAATGCATCATTCTCTTTCTGTGGGGAATACAGTAAGAACGAATGGATTGTTTGCTGTGGATACTTCAGCTGCTCTTGTTGCAATTAACAGTCACTCTCGTGTTAATGCTAATTTCAGAATGCAATTAGGACAATCATCTTATATTGATGCTGAATGTACTGACGCTGTGCGCCCTGCTGGAGCCGGTTCTTTTGCTTCGCAAAATAACGAAAACGTCCGTGCCCCATTCTATATGAATATAGATAGAACTGATACAAGCACTTATGTTCCTATTGTGAAACAAAGATACGTGCAAAATAATAGTTGCTATTCTATTGGTACTTTAATTAATGGTGGTAACTTTAGAGTTCATTATCATGAAGGTGGCGATGGTAGTTCTACAGGCGTAGTTATAAAAGATTTAGGATGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTATTCTCCTGGTAAATTAGGCGCTGGAAATATTAGAATAGGTACTGATGGTAATATCACGGGTGGTTCTGGTAACTTTGCTAACTTGAATACAACTTTAAACCGTAAAGTTAATTCTGGTTTTATTACTTATGGAGCAACTGCAGGTTGGTACAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCTCAAGCTACATCAACCGTTTCAATTACAGTCACTGGCGGAAATGGATTTAATTCTGGATCATTTAATCAGTGCGCAATTTCTGAAATTGTTCTTCGTACAGGAAACAATAATCCTAAAGGATTAAATGCTGTTCTATATAGAAGAGGACTAAATTCATTTAGAGATATTGCTTGGGTTAATACATCTGGTGATACATATGACATTTATGTTAATATGGGAACATATGCTAATCAGTTGATATTTAACTATAGTTCTGTTGATAATGCCACAGTTCAAATTATTGGCGCATTCAGTTCAGCTCAAAATCCTGTTGATGCATTGCCAGAAACATATGTTAAAGGTCAGGTAGCAGATGTATTGACTAACTTAGTTGATTCTGGAAAAACGAAGCGTTTTGTTGCTGAATCTGAAATAGCTATTAATAATCAAACTGGATTACGTATTACGAGTAATGGTGATAAATCTGGTTCAAATTCAGTATTATTCAGAAATGATGGATCAGCGTTTTATATTCTTTTAACAGATAAAAACGCAGCAGATGGAAATACGACTGCCACAGAAGGAGATTGGAATGGTAAACGTCCTTTCCAAATTAATATGACTTCTGGTGAAGTAACATTCGGAAATAATATTAATATTTATGGAAACGGAAGCATTACTTGGACAAAAGCCGGAGCAAACCCTAGAAATATGAGAATATTTCATGCAGGTGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAAATCGCAGATGATACTAATTATATTGCTTACTTTGAAAAAACTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTTAATGGTGCTACTGTAGCTGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAACATCAATAACGCGCTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAATGACACGGGTATTAAGCAAAACGGCGATGGATTATTAGACATTTATGCGAATGGTGTGCAAACGTTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCCCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGCTTAAAATCTAATTTCAAACCTATCGAAAATGCGCTTGATAAAGTTGAAAAACTTACTGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACGCTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.