Protein

Genbank accession
YP_009614899.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLGIAKGGQIDGNVTIDGTLRVNGPINNFGNFSTSGTITASNIVSATVFRSTSGSFYTRAINDTANAHLWFENTNGSERGVLYSKPQSENEGVITMRVRQGTAAGAQNSEFHFISTDGGIFQARKLTALTSISTPTISVNLINHDSKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGVNYLRKVRAKSGGTIYHEICTAQTGLADEVSWWTGNIPLFKLYGIRNDGRMIIRNSLAIGTVTEGFPSSDYGNTGVMGDRYLALGDNASGLKWVRTGVIDLMANGISAASIINNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTVASTQEVKLNNGLFFNSSSSNAGLKFGASSSINGTKTIQWNAGTRPGQNKSYVTMKAWGNAFEDNTNKNRETVFELGDGQGWHFYSQRVAPAAGSTAGSVEFAMAGSLLTSGSITTRSSLNADNGLSVNGQAKFGGTADVLRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKDAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGTRSWYVGLGGAGNDLSLYSQSYGHGLVISDNFTSITKPLKVGNAQLGTDGNITNGSGNFVNLNTTLNRKVNSGFITYGATSGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIVGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPSDLNAVLYTRTTGMYSAAFRNIAVNNVSGNTYDIYVYAGTYCNQLVCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVDGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINSQTGIRIRSNADKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVMMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDGTRGNRIEIADETNYIAYFQKLPGGQNQVSFNSATLSGLTQCNQFGVNTTNALGGNSITFGDTDTGIKQNGDGLLDIYANNVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1229 AA
molecular weight: 131546,85480 Da
isoelectric point:8,14141
aromaticity:0,08218
hydropathy:-0,28910

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage Sf22
[NCBI]
2024320 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009614899.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_042039 [NCBI]
CDS location
range 98688 -> 102377
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGAGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATCTAGGTATTGCTAAAGGCGGTCAAATTGATGGAAATGTAACTATTGATGGAACTTTACGCGTCAATGGACCAATAAACAACTTTGGAAATTTTTCTACAAGTGGTACTATTACGGCAAGTAATATTGTTTCTGCTACAGTATTCAGATCAACATCCGGTTCATTTTATACAAGAGCAATAAATGATACTGCAAATGCCCATCTTTGGTTTGAAAATACGAATGGATCGGAGAGAGGGGTTTTATATTCAAAACCACAGTCTGAAAATGAAGGCGTAATTACAATGCGCGTTCGCCAAGGAACCGCAGCAGGGGCTCAAAATTCAGAATTTCATTTCATTTCTACTGATGGCGGTATCTTCCAGGCACGCAAATTAACTGCTTTAACTTCTATTAGTACACCAACTATTAGTGTTAATTTAATTAATCATGATTCTAAAGCCTTTGGACAATACGATTCACAATCATTAGTTCAGTATGTTTATCCTGGAACCGGTGAAACAAATGGTGTAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACTATTTACCATGAAATTTGTACAGCTCAGACTGGGCTAGCTGATGAAGTTTCTTGGTGGACTGGTAATATACCGTTATTTAAACTATACGGTATTCGTAACGACGGTAGAATGATTATTCGCAATAGCTTGGCCATTGGTACTGTGACGGAAGGGTTTCCGTCAAGCGATTATGGAAATACTGGGGTAATGGGAGATAGGTATTTAGCTCTTGGCGATAATGCTTCTGGACTTAAATGGGTTCGTACTGGCGTTATTGACTTAATGGCTAACGGTATTTCTGCGGCGTCTATTATTAATAATGGTATTAACAGTACTAAAAAATTAATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGATGGTCAAACTCATATCGGTTATAGCAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCTGGCATTTTAGATATTAAAACTGGTTCAAATTCATTAAATTTGCGTGCTGATGGTACTGTTGCATCTACTCAAGAAGTTAAGCTTAATAATGGGTTATTCTTTAATAGTAGTTCTTCTAACGCCGGTCTTAAATTTGGCGCTTCTTCTTCTATAAATGGAACTAAGACAATACAATGGAACGCAGGCACCCGCCCGGGTCAGAACAAAAGCTATGTGACCATGAAAGCATGGGGCAATGCATTTGAGGATAATACTAATAAAAACAGAGAAACTGTATTTGAATTAGGCGATGGACAGGGTTGGCATTTTTATTCACAGCGCGTTGCTCCTGCAGCAGGTTCTACTGCCGGTTCTGTTGAATTTGCGATGGCCGGTAGTTTATTAACTTCTGGTTCTATTACAACAAGATCTTCCCTGAATGCTGATAATGGATTGTCTGTAAATGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACGGCTGATGTATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAAGTAATCTTTATATTATACCGACTCCTAAAGATGCTGGAGAATCGGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACTGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGACTTTTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGCAATGCAGCGCTTACCCTGGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTACAGGGTTCTAAAGCTGGAACTAGATCATGGTACGTTGGTCTTGGCGGCGCTGGAAATGATTTATCTCTTTATAGCCAATCTTATGGACATGGTCTTGTTATAAGTGATAATTTCACGTCAATCACTAAGCCTCTTAAAGTCGGCAATGCCCAATTAGGAACTGACGGTAATATTACCAATGGTTCAGGAAACTTTGTCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACCTCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCGACGGTCTTCTTTAAAATAGTTGGAGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACACAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTTCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAACTGGAATGTATAGCGCAGCATTTAGAAATATTGCAGTTAACAATGTCTCTGGAAATACATATGACATTTATGTTTATGCTGGAACATATTGTAATCAACTAGTTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACCCAATCACCTGTGGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTGATGGGCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGTGGTAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAGCCAAACCGGTATTCGTATCAGAAGCAATGCCGATAAAACTGGTTCTGTGGCTACAATGTTACGAAATGACGGTGGCAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACTGATGGCGCAGCAACTGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAACGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGATGATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCCGGCGCTAACCCGAGAAACATGCGTATATTCCATGCAGGTGATGGCACTCGTGGTAATCGCATTGAAATTGCTGATGAAACAAACTATATTGCTTACTTCCAAAAATTACCTGGTGGTCAAAATCAGGTTTCATTCAATAGTGCTACACTTTCTGGATTAACACAGTGTAATCAATTTGGTGTTAACACAACAAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATACTGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAACGTGCAAGTGTTCCGTTTCCAAAATGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCTAACTTCAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTCAATGGTGTCATTTATGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTAGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACGCTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.