Protein

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Genbank accession
YP_010096467.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MVDIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQNYDETRAYTKDFIVLYDNRFYQALSDIPAPAGPFSLAKWKATRTDAEWITVQGGDFQLSVGNSIAVDTSAGTDINFTLPQNPLDGDTVILSDIGGRVGYVKVQITAAAQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSKMVFIFSNRLWQMYVSDYERNAVTVTPATPYQAQPNDFIIRRFTSAAPINITLPRNANNGDIINLVVLDKLNPLYHTIVKTYDDTTSIREAGVHVAEGRNTAEAFFVYDSANSLWRVWEGDQKSRLRIVRNDTDLRPNEEVLVFGTNNDTISTVNLTLPTDILSGDTVKISLNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSISLLQFPKRSEYPPDAQWVSVSELEFNGDTSYVPVLELAYIEDYSSETKYWVVQQNTVTVERVDASSNTTRARLGVIALASQAQANVDLENAPGKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTDFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEVATQAETNAGTDDTTIITPKKLDGRQGSEVLSGIVKYTSTTGTTAATIRGNAGTNVYNKAVDNLTISPKALDQYKATPTQQGAVILAIESEVIAGESQAGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSLQFIRRDIDQTVNGSLSLTKQTNLSAPLVSTSTASFGSEASVTRRLTLNDSSGSEIIFTKGTQSLSNKENFVVRAWGNSATDGARDTVFEAGDETGYHFYSQRAADNRVSFNINGTLYSTGIVSTNGLNVTGVSTFTGPISATGEIVSSSPIAFRAINGNYGVMLYNAGNSSYIALTNSGDQTGTFNNLRPITINNATGLVRLDNGVQITCGATITTGGLTVNSRIISNGVKTATVYTDKPTASTVGFWSIDINDSAVYSQFPGYWTRDNKGNRDQEIKYPGTLTQFGNSLDSLYQDWICYPTGANGGSIRYTRTWQKNKDAWTSFAMVFDSGNPPSPSDVGAIPSDNAVIGNLTIRDFLQLGNVRIVPDPVNKTVKFIWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1277 AA
molecular weight: 138427,22480 Da
isoelectric point:5,14372
aromaticity:0,07596
hydropathy:-0,31441

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–128
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
969–1089
IPR048390 IPR048391
YP_010096467.1
1 1277
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-128 | STR 343-968 | ATT 969-1089 | STR 1090-1135 | ATT 1136-1225 | STR 1226-1259 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage SF
[NCBI] 		2234080 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Mosigvirus
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010096467.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055749 [NCBI]
CDS location
range 136739 -> 140572
strand -
CDS
ATGGTTGACATCAAACGTAAGTTCAGGGCCGAAGATGGTCTTGACGCAGGCGGTGATAAGATAGTTAACGTTGCGCTTGCTGACCGCACAGTTGGCACCGATGGCGTGAACGTTGACTTTTTGGTGCAAGAAAACACCGTACAGAATTATGACGAGACGCGCGCGTATACAAAAGATTTTATTGTTCTTTATGATAATCGTTTTTATCAAGCTTTAAGCGATATTCCAGCTCCGGCAGGCCCTTTCTCTTTGGCTAAATGGAAGGCAACTCGTACAGATGCAGAATGGATTACAGTTCAAGGCGGAGATTTCCAATTATCAGTAGGTAACTCTATTGCGGTTGATACTTCAGCTGGCACTGATATTAATTTCACTTTGCCTCAAAATCCTTTAGATGGCGATACAGTTATTTTATCTGATATTGGCGGTAGAGTAGGCTATGTAAAAGTTCAAATTACTGCAGCGGCTCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGACAACAGGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCACCCAAAATCTAAAATGGTCTTCATTTTTAGCAACCGCCTATGGCAAATGTATGTTTCTGATTACGAACGTAATGCAGTCACAGTAACTCCTGCTACGCCATATCAAGCGCAACCTAATGATTTTATCATTCGACGTTTTACATCAGCCGCTCCTATTAATATTACATTGCCTCGTAATGCTAATAATGGCGATATTATTAATTTAGTGGTTTTAGACAAATTAAACCCATTATATCACACAATTGTCAAAACTTACGATGATACAACTTCTATACGAGAAGCTGGTGTTCATGTAGCAGAAGGACGTAATACTGCGGAAGCATTCTTTGTTTATGATTCTGCCAATAGTTTATGGCGTGTTTGGGAAGGTGACCAGAAATCTCGTTTACGTATAGTTCGTAATGATACTGATTTACGCCCTAATGAAGAAGTTCTTGTTTTTGGAACTAATAATGATACAATCTCGACGGTAAATCTTACTTTGCCTACAGATATTTTGTCTGGCGATACTGTTAAAATATCGTTGAATTATATGCGTAAAGGGCAAACTGTAAAAATTAAAGCTGCTGAAGGCGATACAATTGCTAGCAGTATTTCTTTATTACAGTTCCCAAAACGTTCGGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTTTCTGTTAGTGAGCTAGAATTTAATGGTGATACTTCGTATGTACCTGTACTTGAGTTAGCTTATATAGAAGATTATTCATCTGAAACAAAATATTGGGTAGTTCAACAAAACACCGTAACCGTCGAACGAGTCGATGCATCGAGCAATACCACTCGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTTCTCAAGCGCAAGCAAATGTCGATTTAGAAAATGCTCCTGGTAAAGAACTGGCTATTACTCCGGAAACATTAGCAAATCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCAACAACTGCACAAGTTAACCAGAATACCGATTTTGCATTCCAAGACGACTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTGAACGAACGTACAGCAACTGAAACCCGTAGAGGTGTTGCTGAAGTTGCAACTCAGGCTGAAACTAATGCCGGAACAGATGACACCACTATTATTACTCCTAAGAAATTGGATGGCCGTCAAGGTTCTGAAGTTTTATCTGGTATTGTAAAATACACATCTACGACTGGTACTACAGCTGCTACTATTCGTGGTAATGCTGGGACTAACGTTTATAACAAAGCCGTAGATAATTTAACTATTTCTCCAAAGGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCCTACTCAGCAGGGTGCAGTAATTCTTGCTATTGAAAGTGAAGTTATCGCTGGCGAATCACAAGCCGGTTGGGCTAATGCTGTAGTTACCCCTGAAACTCTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAACACTGGAACTGATTATACTAGAGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCTGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTGATTAAGGTCGCTACGCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCACCTAAGAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAGAACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGTTATGCTATTTCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTACTTACCGTTGAAAGCTAAAGCAGCTGATAGTAATTTGTTAGATGGTCTAGATTCTCTTCAGTTCATCCGTAGAGACATCGACCAGACGGTTAATGGTTCTTTAAGCCTTACTAAACAGACCAACCTGAGTGCTCCTTTAGTATCTACAAGCACTGCTTCTTTTGGTTCCGAAGCATCTGTTACTCGTAGATTAACTCTTAATGACTCTAGCGGTTCCGAAATAATTTTCACTAAAGGAACCCAATCTCTTAGTAATAAAGAGAATTTCGTTGTTAGAGCATGGGGTAATAGCGCTACAGATGGTGCCCGTGATACAGTATTTGAAGCGGGTGACGAAACCGGATACCATTTCTATTCTCAGCGCGCTGCTGATAATAGAGTATCATTTAATATTAATGGAACACTTTATTCAACAGGTATTGTTTCTACGAATGGGTTAAATGTTACAGGTGTTTCTACCTTTACTGGGCCTATTAGTGCTACAGGCGAAATTGTTTCTAGTTCTCCTATTGCATTCAGAGCTATTAACGGTAACTATGGTGTTATGCTTTATAATGCTGGTAACAGTTCTTATATTGCATTAACTAACTCAGGTGACCAGACCGGGACGTTTAATAACTTACGCCCGATCACGATTAACAATGCCACAGGATTAGTTCGTCTTGACAACGGTGTTCAAATCACATGTGGTGCAACAATAACTACCGGTGGGCTAACTGTAAATAGCAGAATTATTTCTAACGGCGTTAAAACTGCCACTGTTTATACCGATAAACCAACAGCTTCTACTGTAGGTTTTTGGTCTATTGACATTAACGATTCTGCTGTATATAGCCAATTCCCTGGATACTGGACGCGTGATAACAAAGGTAACCGTGACCAAGAAATTAAATATCCTGGTACTTTGACTCAATTCGGCAATAGCTTAGATTCGCTTTATCAGGATTGGATTTGTTATCCTACAGGTGCAAATGGTGGTAGCATTCGATATACTCGTACCTGGCAGAAAAATAAAGATGCTTGGACTTCATTTGCAATGGTATTTGATAGTGGCAACCCACCTTCACCTAGCGATGTCGGTGCTATCCCATCTGATAATGCTGTTATTGGAAACCTTACTATTCGAGACTTCTTACAATTAGGAAATGTGAGAATTGTTCCAGACCCGGTTAACAAAACAGTTAAATTTATATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d26890f3013cf4c90e986d5bc8aaec69164a6cee0d9960077c3c27a66f7265f5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5409
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of bacteriophage from raw sewage specific for Eschericia coli 0157:H7 Juharul Zaman,S.F., Mat Arip,Y. and Mohamad Zawawi,N.A. 1962-07 — GenBank
Genome Assembly Of Bacteriophage Specific To Escherichia coli 0157:H7 Mohd Tawfid,M.H.A., Mohamad Zawawi,N.A. and Mat Arip,Y. — — GenBank