Protein
- Genbank accession
- UIU28189.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9262
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9075
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGTFNSGRWRALRTDANWITVSYGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEDGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTAIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPVQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1289 AA molecular weight: 140107,56650 Da isoelectric point: 5,36403 aromaticity: 0,07525 hydropathy: -0,32607
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_SA20RB [NCBI] |
2909738 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UIU28189.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL960581.1
[NCBI]
CDS location
range 146814 -> 150683
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACCTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAACTTTTAATAGTGGACGCTGGAGAGCATTGCGTACTGATGCTAACTGGATTACAGTTTCATATGGTTCATATCAATTAAAATCCGGTGAAGCTATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGTAATGATATTACGTTTACTTTACCATCTTCCCCAATTGACGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTCAGAGGTGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTAGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCACAATCCAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCGATAAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCACGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTGGATAAATTAAACCCTCTTTATCATACAATTGTTACTACATATGATGAAACGACATCAGTACAAGAAGATGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTATGGAGATTGTTTGACGGGGACAGTAAAGCACGTTTACGTATCATAACAACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAACAACTCAAACGATTGAGCTTCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACGGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTCCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTGATTGCTTTAGCTACACAAGCGCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACCACTGCTCAAGTAAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTGCAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAGGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTCTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAGCAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGCGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACACCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTAACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTACAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGCTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCAACGCAGGACTTAGAGTTATATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACTGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGCGGATCAGTTTCGGCAAACAGCACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGTACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTTAATGCTTCGGGTTCTTTGAATGCGAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGCTCAGTTACAGCAAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATAAACGGTGATTATGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGACCTATACACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTAACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCGCGCACCACTCGCTGGACACGCACATGGCAGAAAACCAAAAACTCCTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGATATTGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.