Protein
- Genbank accession
- UIU27502.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9301
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9471
- Protein sequence
-
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTIVLADIGGRTGAVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVLRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDKLNPLYHTIIKTFDDTTSIGEVGTHIVEGRTSSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRTDSNIRPNEEVLIFGTNNATAETINLTLPTGILTGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTNSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATESRRGIAKIATTAQVNQNSTAEFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQTETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTETATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPININASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIHNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGSKTADLYTRAPTADTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVSGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1291 AA molecular weight: 139542,86330 Da isoelectric point: 5,35039 aromaticity: 0,07359 hydropathy: -0,29295
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_SA35RD [NCBI] |
2909740 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UIU27502.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL960577.1
[NCBI]
CDS location
range 151400 -> 155275
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTAGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGACACTATTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGGCGGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGTCCGCGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCTACACCATATCAAGCGCAAGCAAACGATTTTATTGTTCTTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACGATTATTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGCGAAGTCGGGACTCATATCGTCGAAGGTAGAACTTCTTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCACGTCTTCGTATTATCCGTACAGATTCAAATATTCGCCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGTACAAATAACGCTACAGCAGAAACTATTAACCTTACGCTTCCTACAGGAATTTTGACCGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTTTCTGTTACTGAATTGGAATTCAATGGTACTAATTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCATATATTGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACAGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAATCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACGGCACAAGTTAATCAGAATTCCACAGCAGAATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCGGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAGGCAACTTATGCACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCACAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTGCATAAGAAAACTTCTACTGATGGGCGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAACAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACGCGGGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACTCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCATAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGAAACAAACTAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGGTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGAAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAATCCAGCACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAACATTAATGCTTCTGGTTTGATGAATGTTAATGGCGTTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCATTAGTAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCATAATGACGCTGCTAATACCTATTTTATGCTCACTGCATCAGGCGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAGGTTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCTGGCGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTTCTAAAACTGCTGATTTATACACTCGTGCTCCTACTGCTGATACAGTCGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGTCTGGACTTCCATACTTAGAACGCGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACCCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACTCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.