Protein

Genbank accession
ABD63892.1 [GenBank]
Protein name
putative tape measure protein (endogenous virus) [Lactococcus phage phismq86]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 1,00
Protein sequence
MANDGAVVIDVLLDSAKAMTEYNKLGSVMSGTGSKIGSALKAGTAAAIAGTAAVGVAAVGIGKQVLSSYADYEQLVGGVDTLFGNASKTVQGFADNAYKTAGLSANAYMETVTGFSASMVASLKGDTAKAADYSNQAVVDMADNANKMGSNIGDIQNAYQGFAKQNYTMLDNLKLGYGGTQEEMKRLLSDAEKFSGQKYDISSFADVTQAIHVVQTQMGITGTTAKEAASTISGSIDSTKAAYENLITGLGSSNANIKQLVDNLMGSLTNVINNITPIIGNLITALPPVITGLLGAIAKLLPTVFSTVSSLFGTLLTTIVSLLPTVIPSFTAGIISLVNSIITIIPSIIQAGVNIIMSLMQGIVGATPQLTSALGQAVQSLIGTLAQSGPTLIMQGIAMIDGLVNGISQQIPTLIPLLTNALLEMVNAFVTGLPMLINTGLKLILAIVQGVSAALPQLIANFQAMIPQLINILMINIPQIIDTAVQIILALINGFVTALPQLMQMFTTLLPQIIQVIMTTLPLLVQAALQIIMALVEGITTALPMLIDSFTALMPQLVTIIIVNLPTIIQAAIKIILAIVDGIVQALPTLIPAIVQVILMIVQTIINNLPSIIIAAIQILIALANGILQAIPKVLGAIGKVIAALIGAIASSVGDFLSKGGQIIGSFVKGIISGKNPVDVFKNFIKDIAGLFGLDTLYKQGSAIISGFFNGLKDKFEDVKKWVGGIGKWISDHKGPISYDRRLLIPHGGSIMEGLDEGLQDKFKKVQANVSSMANKLADSLTGGLPSLDTALNASVSSSTSYSQAQLVNSNNATLSEKIDKMGDRIDEMNQRKISIKVNGREVAETIYDDFETVKTSRDTRDRMIGRKK
Physico‐chemical
properties
protein length:869 AA
molecular weight: 91015,49330 Da
isoelectric point:6,07958
aromaticity:0,04718
hydropathy:0,49563

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage phismq86
[NCBI]
444474 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABD63892.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ394810.1 [NCBI]
CDS location
range 23657 -> 26266
strand +
CDS
ATGGCCAATGATGGAGCAGTAGTAATTGACGTCTTATTAGATAGCGCAAAGGCAATGACTGAATATAATAAATTAGGGTCGGTCATGTCTGGAACTGGTAGCAAAATAGGCAGTGCTTTAAAAGCTGGAACAGCTGCAGCAATTGCTGGAACAGCAGCAGTTGGTGTTGCGGCTGTTGGAATTGGTAAGCAAGTTCTTTCCTCCTATGCTGATTATGAACAATTAGTAGGTGGTGTTGATACTCTTTTTGGCAATGCCTCTAAGACAGTACAAGGATTTGCTGATAATGCATATAAAACAGCAGGACTGTCAGCCAATGCCTACATGGAAACTGTAACAGGTTTTTCAGCCTCTATGGTTGCATCTCTTAAAGGGGATACAGCTAAAGCAGCAGATTATTCAAATCAAGCAGTTGTCGATATGGCAGATAATGCCAATAAAATGGGTTCAAATATCGGTGATATTCAGAATGCTTATCAAGGTTTTGCAAAACAAAACTACACCATGTTGGATAACTTAAAGCTTGGTTATGGTGGTACTCAAGAAGAAATGAAGCGCCTCTTATCTGACGCTGAAAAATTCTCTGGACAGAAGTATGATATTTCTAGTTTTGCTGATGTAACTCAAGCCATTCACGTTGTGCAAACGCAAATGGGTATCACTGGAACGACAGCAAAAGAAGCGGCTTCAACTATCAGTGGTTCAATTGATAGTACAAAAGCGGCTTATGAAAATCTGATTACTGGTCTGGGTAGTAGCAACGCTAATATCAAACAATTAGTCGATAACTTAATGGGTTCTTTGACTAATGTTATTAACAATATTACTCCTATTATCGGAAATCTGATAACTGCATTGCCTCCTGTTATTACAGGTTTATTGGGGGCAATTGCTAAACTTCTACCGACAGTATTCTCTACAGTTTCATCACTTTTTGGAACTTTGCTGACTACAATAGTTAGTCTTTTGCCAACAGTTATTCCTTCTTTTACAGCAGGAATAATTTCATTGGTAAATTCAATAATTACTATAATACCTAGTATTATTCAAGCTGGGGTTAATATCATCATGAGTTTGATGCAAGGTATTGTTGGAGCTACTCCTCAGCTGACCTCAGCACTTGGGCAAGCGGTTCAATCGCTTATTGGTACATTAGCTCAGAGTGGACCAACTTTAATAATGCAAGGAATAGCAATGATAGACGGATTGGTAAATGGTATTTCGCAGCAAATTCCAACACTGATACCATTATTAACAAATGCTCTTCTTGAAATGGTAAATGCTTTTGTGACAGGATTGCCTATGTTGATTAATACAGGGCTTAAATTAATTTTAGCAATTGTTCAAGGTGTAAGTGCGGCTTTACCTCAATTAATTGCTAACTTTCAAGCTATGATTCCTCAACTCATTAATATTTTGATGATAAACATTCCTCAAATTATTGATACAGCCGTTCAGATTATTTTAGCTTTAATAAATGGATTTGTAACTGCACTTCCTCAATTAATGCAAATGTTCACAACGTTATTACCTCAAATTATTCAGGTTATAATGACAACCTTACCTCTCTTGGTCCAAGCAGCACTTCAAATAATTATGGCTTTGGTTGAGGGAATTACAACAGCTTTACCAATGCTGATTGATTCATTTACAGCATTAATGCCACAGCTCGTTACTATTATCATTGTTAATTTACCTACTATTATTCAAGCGGCTATTAAAATAATTCTTGCGATTGTTGATGGTATTGTCCAAGCATTGCCAACGTTAATTCCAGCAATTGTTCAGGTTATATTGATGATTGTTCAAACGATTATTAATAACTTGCCATCAATTATTATTGCAGCTATTCAAATCCTCATCGCTTTAGCTAACGGTATACTTCAAGCAATTCCAAAAGTATTAGGTGCGATTGGAAAAGTGATAGCTGCTTTGATAGGAGCTATCGCTTCATCTGTGGGTGACTTCCTTAGCAAAGGTGGACAAATCATTGGAAGCTTTGTAAAAGGTATTATTAGCGGTAAAAATCCAGTTGATGTTTTTAAGAATTTTATAAAAGATATCGCTGGGTTATTTGGACTAGATACACTTTATAAACAAGGTTCCGCAATCATTAGCGGCTTTTTTAATGGTTTAAAAGACAAGTTTGAAGACGTTAAAAAATGGGTCGGTGGTATTGGTAAATGGATTTCAGACCATAAAGGTCCTATTTCATATGATAGACGCTTACTCATTCCTCATGGTGGTTCAATCATGGAAGGCTTGGATGAGGGGCTTCAAGACAAATTCAAAAAAGTTCAAGCTAACGTTTCATCTATGGCTAACAAGCTAGCTGATTCGCTCACAGGAGGATTACCTTCGCTTGACACAGCATTAAACGCCAGTGTCTCTAGTTCGACTTCTTATAGTCAAGCTCAGCTAGTTAACTCTAATAATGCGACACTGTCTGAAAAGATTGACAAAATGGGCGATAGAATCGATGAAATGAATCAACGAAAAATTTCTATAAAAGTTAATGGTAGAGAAGTTGCAGAAACTATCTATGATGATTTCGAAACTGTAAAAACTTCAAGAGATACCAGAGACAGAATGATTGGTAGAAAAAAATAG

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.