Protein

Genbank accession
AGO49696.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase [Cellulophaga phage phi13:2]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MKKTIYILSILLLTISGVSAQTVIKIKQPNPQQITIADDSIKLNGSTSVPLSDIIKPITLAEYNAMDAATKLKNAGRQIIDPTGVPTAISIVDGSVSTAKIANSAVSGIKILDEAITESKIADASITDAKINADTYNKLYYAVPDGYISPRDYGAVLDGVTDDRAAFVATLAAANTLGKRIRIDADKMFLDVEETGTKSIFIPDNTWIEGSNKDVQIVVNNILSPAFYLALVDNVTIKDITFTYDQTYDPTYGEDATNFAADFTINQQQVRDYLRDNKAIDFSGVFPVDNGFVSYYYMFLLEAAENVTFDNVTFKSKGETADTFITGVIKMKEQYQPSQTVSNTSAPRTQCKNISLSNIVIDGALMGIQGLVDGFTVNNLKSYRYSDMQDASGNYLGGFDGVDYDFPPPHLFYLNNSSSSTFNTKNVNINDVYDYGKYVGTASVRGTSGINIGYCNSLKLVETQDNVHVSNYKSFRRDGMADIGILSNSSFSNMYSESTTDIFSSTSSYPALRFLGNLTNVVFDNIIIKDNSTTSAIYPIDYGEGNFVTWNNVHVFVKTLNTIDVGTFGIWGSNNKITNSSFNIENHTSTQTLRGIVLNNSTTRDSGANNYYDVTLNGWRDISSDPLNRKSRMLFATAVNTNNNYARVHDTRNNFVIEQVNEIETDTWTRTETVSLGSGTQQALTMTIPSGFAVKKATAIVTSALDAGVTASIGTVSGVATNLIASISNTANSINSNDLNEISNGSLRQIFIRTSTGTFASTGTVKVTLVLTRTSLN
Physico‐chemical
properties
protein length:777 AA
molecular weight: 84546,32630 Da
isoelectric point:4,89761
aromaticity:0,09138
hydropathy:-0,15624

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage phi13:2
[NCBI] 		1328030 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGO49696.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC821633.1 [NCBI]
CDS location
range 33529 -> 35862
strand +
CDS
ATGAAAAAAACAATTTACATATTATCGATTTTATTGCTCACTATTTCAGGAGTAAGCGCACAGACTGTTATTAAAATAAAACAGCCTAATCCGCAACAGATAACAATAGCAGACGATTCAATAAAACTGAATGGTTCAACTTCTGTTCCTTTGTCTGATATAATTAAGCCTATCACATTAGCGGAGTACAACGCAATGGATGCGGCTACTAAATTAAAGAATGCAGGACGTCAAATTATAGACCCTACAGGAGTTCCTACAGCTATAAGTATTGTTGATGGTAGTGTTAGTACTGCTAAGATTGCAAATAGCGCTGTGAGTGGAATTAAAATACTTGATGAAGCGATAACAGAAAGTAAAATAGCTGATGCAAGTATAACGGATGCAAAAATAAACGCTGATACATATAATAAATTATATTATGCTGTTCCTGATGGATACATTTCGCCAAGAGATTACGGAGCAGTTTTAGATGGAGTAACCGATGACCGTGCGGCTTTTGTTGCTACATTAGCGGCTGCTAATACTTTAGGTAAGAGAATTAGGATTGATGCTGATAAAATGTTTTTAGATGTTGAAGAAACTGGAACTAAATCGATATTCATACCAGATAACACATGGATAGAAGGTAGCAATAAGGATGTTCAAATCGTAGTTAACAACATATTAAGTCCTGCTTTTTACTTGGCTCTAGTTGATAATGTAACTATAAAAGATATCACTTTCACTTATGACCAAACATATGATCCTACATATGGAGAAGACGCAACTAATTTTGCGGCAGACTTTACTATTAATCAGCAACAAGTAAGAGACTACTTAAGAGATAATAAAGCGATTGATTTTTCAGGTGTTTTTCCTGTAGATAACGGCTTTGTTAGTTACTATTATATGTTTTTATTAGAGGCTGCCGAAAACGTAACTTTTGATAATGTAACATTTAAGTCTAAAGGTGAAACGGCTGATACTTTCATTACCGGAGTTATAAAAATGAAAGAACAATACCAACCAAGTCAAACAGTTTCAAATACTTCGGCTCCAAGAACTCAATGTAAAAACATATCATTAAGCAATATAGTTATAGATGGTGCTTTAATGGGAATACAAGGATTAGTTGATGGTTTTACTGTTAACAATCTAAAATCATATCGTTATTCAGATATGCAAGATGCAAGCGGCAACTATCTAGGTGGTTTTGATGGTGTTGATTATGATTTTCCTCCACCTCATTTATTCTATTTAAACAATAGCTCATCATCTACATTCAACACAAAAAACGTTAACATAAATGATGTTTACGATTATGGTAAGTATGTAGGAACAGCAAGTGTGAGAGGAACAAGCGGTATCAATATAGGATATTGTAATTCTCTTAAATTAGTTGAGACACAAGATAACGTTCATGTTAGCAATTATAAATCTTTTCGCAGGGATGGAATGGCGGATATAGGAATACTTTCTAATAGCTCTTTTTCTAATATGTATTCAGAGTCTACTACGGATATTTTTAGTTCAACATCTAGTTATCCTGCTTTAAGGTTTTTAGGGAACTTAACAAATGTTGTTTTTGATAATATCATAATAAAAGACAACTCAACTACATCGGCAATATACCCAATAGATTACGGTGAGGGTAATTTCGTCACATGGAACAATGTACATGTATTTGTAAAGACACTTAACACTATAGACGTAGGTACTTTTGGAATTTGGGGTTCAAATAACAAGATAACAAACTCTAGCTTTAATATAGAAAATCATACGTCTACACAAACTTTAAGAGGTATAGTTTTAAATAATTCAACAACTAGAGACTCTGGAGCAAACAATTACTACGATGTAACATTAAACGGTTGGAGAGATATATCTAGTGATCCTTTAAATAGGAAATCAAGAATGCTTTTTGCTACGGCTGTTAATACAAATAACAACTATGCTAGAGTTCATGACACTAGAAATAATTTTGTAATTGAGCAAGTAAACGAGATAGAAACAGATACATGGACTAGAACAGAAACAGTATCACTAGGTAGCGGAACACAGCAAGCGTTGACAATGACAATACCTAGTGGATTTGCCGTAAAAAAAGCAACTGCAATAGTGACAAGTGCTTTAGATGCAGGTGTTACAGCTTCAATAGGAACAGTTTCGGGTGTTGCGACTAACTTAATAGCGTCAATATCTAACACAGCGAACTCAATAAACTCTAATGATTTAAACGAGATTTCTAATGGTAGTTTGAGGCAGATATTTATAAGAACAAGTACAGGAACTTTCGCAAGTACAGGAACGGTTAAGGTGACTTTAGTATTAACACGTACATCATTAAATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.