Protein

Genbank accession
AGO49141.1 [GenBank]
Protein name
pectate lyase [Cellulophaga phage phi39:1]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MKNFIYLVLLFFSVASYGQAKEVTIYTKRIVETPEQISNKINSLTGEQRIDASAIKNLPELADGSVNYGKLSEDVLGRLNPIDFTISENIKNLHTSSDPAGPNESNIINAWVDASNVSIASTSADSYLGDLSIIATKINSGSGVVYSPNYTVDTGKTYIFKCRVKVGGGFVSGSNMYLSDKTGAFVQSFINEADLGWQELTQTLSFSKTRTRVNISLSAQPVGATLLIDSFELYEVGEGIKAFPEAYGFGSVSTGGRGGTVRKVTNLNNSGTGSLRSAAELDNSIVIFETAGTIDLDTPISVGNNVTIYGQTAFRNGGQGITLKASATNEASLMIFSGKTNFLVQYVRFRRGVTPFATAATAGQTLALANGSTKIMIDHCSFGWDEDESLTIWDASEVTVQNSIVTNSLMVNDYGRQNTSKSLIVGNNADKVSIYKTLIGNADQRNALFGGSTSPIEQFEFKNNLIFNWGSIGTDFAGSQLPFKVNIIGNKWKAGHNSNISRHGLRATGNTGDLFYLEGNITISRPTDDLDEWLAIGNSATPSVALSSTFQQVTPFDYPLQYAPTYSIEELEGDVLKQMGVSLYVDYPDMLAKSHYTHGNGFIMNKPSDIGGYPVLEGFSKSIVDSNSDGIPDDFATANGITSSNQILPSFKFGTWNFDNSFRYTAIEVYAYYLTQK
Physico‐chemical
properties
protein length:677 AA
molecular weight: 73287,86020 Da
isoelectric point:4,97900
aromaticity:0,10340
hydropathy:-0,16573

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage phi39:1
[NCBI] 		1327993 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGO49141.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KC821626.1 [NCBI]
CDS location
range 18139 -> 20172
strand +
CDS
ATGAAAAATTTTATTTATTTAGTATTACTATTTTTTTCTGTAGCTTCATATGGCCAGGCTAAAGAGGTTACTATTTATACTAAACGTATAGTAGAAACGCCTGAACAAATAAGTAATAAAATTAATAGTTTAACGGGTGAACAACGTATAGACGCTTCTGCTATTAAAAATTTACCAGAATTAGCAGATGGATCTGTAAATTATGGTAAATTATCAGAAGATGTTTTAGGTAGATTAAATCCTATTGATTTTACTATATCTGAAAATATTAAAAATTTACATACTTCTAGTGATCCTGCAGGCCCTAATGAATCTAATATTATTAATGCATGGGTAGATGCTTCTAATGTTTCTATAGCTTCTACTTCTGCAGATAGTTATTTAGGTGATTTGTCTATAATTGCGACTAAAATTAATAGTGGTTCAGGTGTTGTTTATTCTCCTAATTATACTGTAGATACAGGTAAAACATACATTTTTAAATGTAGGGTTAAAGTAGGTGGTGGTTTTGTTTCAGGTAGTAATATGTATTTATCTGATAAAACAGGAGCTTTTGTGCAGTCATTTATTAATGAAGCTGATTTAGGTTGGCAGGAACTAACGCAAACCTTAAGCTTTAGCAAAACTAGAACTAGGGTTAATATATCATTAAGTGCGCAGCCTGTAGGGGCTACTTTGTTAATAGATTCTTTTGAATTATATGAAGTCGGTGAAGGTATTAAAGCTTTTCCTGAAGCTTACGGATTTGGATCTGTATCTACAGGTGGTAGAGGTGGTACAGTTAGGAAAGTTACTAATCTAAATAATAGCGGTACAGGTAGTTTACGATCCGCTGCTGAATTAGATAATTCTATAGTAATATTTGAAACTGCAGGTACAATAGATTTAGATACTCCTATTTCTGTAGGAAATAATGTAACTATATATGGACAAACTGCATTTAGAAACGGAGGACAAGGAATAACTTTAAAAGCTTCTGCAACTAATGAAGCTTCTTTAATGATATTTAGCGGTAAGACCAACTTCTTAGTTCAGTATGTAAGATTTAGGAGAGGTGTTACACCTTTTGCTACAGCTGCTACAGCAGGACAAACATTAGCTTTAGCAAATGGTTCAACTAAGATAATGATAGACCATTGTTCTTTTGGTTGGGATGAAGATGAAAGTTTAACTATTTGGGATGCATCAGAAGTTACTGTACAAAATTCTATTGTTACTAATTCTTTAATGGTTAATGACTATGGTAGACAAAATACAAGTAAGAGTTTGATAGTAGGTAATAATGCAGATAAGGTTTCTATATATAAAACACTGATAGGTAATGCTGATCAAAGGAACGCTTTATTTGGCGGTAGTACTTCGCCTATAGAACAATTTGAATTTAAGAATAATCTGATATTTAACTGGGGTTCTATTGGAACTGATTTTGCAGGTTCTCAATTACCTTTCAAGGTTAATATTATTGGGAATAAATGGAAAGCGGGTCATAACTCTAACATAAGTAGACATGGGTTAAGAGCTACAGGAAATACAGGTGATTTATTTTATTTAGAAGGTAATATTACCATATCAAGACCTACAGATGATTTAGATGAATGGTTAGCTATAGGAAACTCAGCTACTCCATCAGTTGCTTTGTCTAGTACTTTTCAACAAGTTACACCTTTTGATTATCCATTGCAATACGCACCTACTTATAGTATAGAAGAGTTAGAAGGTGATGTATTAAAGCAAATGGGAGTTAGCTTATATGTTGATTATCCTGATATGTTAGCTAAATCTCATTATACTCATGGTAATGGATTTATAATGAATAAACCTAGTGATATAGGAGGTTACCCAGTTTTAGAGGGTTTCTCTAAAAGTATTGTAGATTCTAATAGCGATGGAATACCTGATGATTTCGCAACAGCTAACGGAATAACATCTAGCAATCAGATTCTGCCTTCTTTTAAATTTGGTACATGGAATTTTGATAATTCATTTAGATATACAGCTATAGAGGTCTATGCTTATTACTTAACACAAAAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.