Protein

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Genbank accession
AXY85081.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSVDGEAGAVVLTSKYLQISKYNLDKQELNTRLTGIDSSIQSNVEAIGNINTAIGSINSTLNTKAAKGANNDITELNALTKAITVAQGGTGASTAENARVNLELNRFKQFPGETLVYSPYATNYFTVSEGTTWGVYSAASGTFIPLPIQSGGTGASTPAEALTKLLDGKPLALAADGQAPYDAVTVRQLANISGGGGANMSGVMNNRIGAVEWFNGNRTNLPAGYIPADGQLVSRTDSKTSDLWTAVNKGLYNKVSDALWINSGDSTRPYAWRASYSTGDGSTTFRVPDLNGAQLNSIKHLFLSGSSGGTNEPSANQVWIESLPNLVGSFPTAIASQFETGMNKYAERFGLPAVFGAENNLVVAPDGTFKSQSVQGDNPYGVTFNAAFSSRTYGRGVAYQKEDGSSNISYDARSIGATYPSHATGIWIIRANGAFEAANTDFSSVNADASAPVVSTTVLGGKLTSQYRVGAKDTYRMRMYAQGAYAQTLAGVIAVENQLASGIDGAYFNFGLDGAIRLGRATGGASTSLAYGYTPFRAQDWWNTSPYGAFVPIVGGGTGGPGGGWRSYTALGTLTMGSDINTHPNAMITQCWDYDLSTGASPSGNAVRNTIFDGTSYDITFGDNAGTVNYIFSKSPVSDRNKKKDIESLSTSIALENIKQMEYTSFKYIYDKGNQVRRGFIAQQLEEIDSQYVRKYESSDGSTSLALDENVLLLDALAAIQNLSNQVEELKLQIAELRAK
Physico‐chemical
properties
protein length:767 AA
molecular weight: 81288,20290 Da
isoelectric point:5,38262
aromaticity:0,09387
hydropathy:-0,23937

Domains

Domains [InterPro]
DC_0017
STR
1–767
DC_0017
IPR030392
CHP
665–761
IPR030392
IPR030392
CHP
665–720
IPR030392 Coil
AXY85081.1
1 767
Architecture
STR
STR 1-767
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage Sw2
[NCBI] 		2316014 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Epseptimavirus > Epseptimavirus Sw2
Host Salmonella enterica subsp. enterica serovar Kentucky
[NCBI] 		192955 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales > Enterobacteriaceae > Salmonella > Salmonella enterica

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXY85081.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH631454 [NCBI]
CDS location
range 84597 -> 86900
strand -
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCAAAAAGTGGGGCTATGGCCCCCTATGTTGTAGTTAACAGAGACGCTGCAGTTGCTGGCGTCTTCTCTGTTGATGGTGAGGCTGGTGCTGTTGTATTGACCTCTAAATACTTACAAATATCTAAATATAATTTAGATAAACAAGAATTAAATACTCGTCTTACTGGTATAGATAGTTCCATTCAGAGCAATGTAGAGGCTATTGGCAATATTAATACTGCAATTGGTAGTATTAATAGTACTCTCAACACTAAAGCTGCTAAAGGTGCTAATAACGATATTACTGAACTAAACGCACTTACTAAGGCTATTACGGTTGCTCAAGGTGGTACAGGGGCTAGCACTGCGGAAAACGCTAGGGTTAACTTAGAGCTTAATAGGTTTAAGCAGTTCCCCGGCGAAACTCTAGTATATAGTCCTTATGCGACAAACTATTTTACTGTTAGTGAAGGTACTACATGGGGAGTTTATAGCGCAGCTTCTGGTACGTTTATACCTTTACCTATTCAATCTGGTGGTACAGGTGCTAGTACTCCTGCGGAGGCCTTAACTAAGCTGCTAGACGGTAAACCTCTAGCATTAGCCGCTGATGGTCAAGCACCTTATGATGCTGTTACTGTTCGTCAGCTAGCTAATATCTCAGGTGGAGGTGGCGCTAACATGAGTGGGGTTATGAATAACCGTATTGGTGCTGTTGAATGGTTCAATGGTAACCGTACTAACCTGCCTGCTGGGTACATTCCTGCGGACGGTCAACTAGTTAGTCGTACTGATTCAAAAACTTCCGATCTTTGGACTGCTGTTAATAAAGGATTATATAATAAAGTATCCGATGCCTTATGGATTAATAGTGGTGATTCTACTAGGCCTTATGCATGGCGGGCCTCTTATTCTACAGGAGATGGATCTACTACTTTTAGAGTACCTGACCTTAATGGTGCGCAGTTAAATAGTATAAAACATCTATTCTTATCTGGTAGTTCAGGAGGAACTAATGAACCTTCTGCTAACCAAGTTTGGATAGAGTCTTTACCTAATTTAGTTGGTAGTTTCCCTACTGCTATAGCTTCCCAGTTTGAAACAGGCATGAATAAGTATGCTGAAAGATTTGGTCTGCCTGCTGTATTTGGTGCAGAAAATAATTTAGTTGTAGCACCAGATGGTACATTTAAATCTCAATCGGTCCAAGGGGATAACCCTTATGGTGTAACATTTAATGCTGCATTCTCTAGTAGAACGTATGGCAGAGGTGTGGCTTATCAAAAAGAGGATGGTAGTTCTAATATCTCATATGACGCCAGAAGTATTGGGGCCACATACCCTAGCCATGCTACAGGTATTTGGATCATTCGTGCTAATGGTGCTTTTGAAGCTGCTAATACAGACTTTTCTTCTGTTAATGCTGATGCCTCGGCTCCTGTAGTTAGTACAACTGTATTAGGAGGTAAGCTAACCTCTCAGTACAGAGTGGGTGCAAAGGATACATATAGAATGCGTATGTATGCACAAGGTGCCTATGCGCAAACCTTAGCGGGCGTTATAGCTGTAGAAAACCAATTAGCAAGTGGGATAGATGGGGCCTACTTTAACTTCGGATTAGATGGTGCAATTAGATTGGGAAGAGCTACAGGAGGTGCTTCAACTTCTTTAGCTTATGGATACACTCCTTTTAGAGCACAAGATTGGTGGAATACCTCCCCCTATGGGGCTTTTGTCCCTATTGTTGGTGGGGGTACTGGAGGACCTGGGGGCGGTTGGAGAAGTTATACTGCTCTAGGTACACTTACTATGGGTAGTGATATTAACACTCACCCAAATGCAATGATTACGCAATGCTGGGATTACGATCTTAGTACGGGGGCATCCCCTAGTGGTAATGCTGTTAGAAATACTATCTTTGATGGTACTAGTTATGATATTACTTTTGGTGATAATGCAGGTACTGTTAACTATATATTTAGTAAGTCTCCAGTTTCAGATCGTAACAAGAAAAAGGATATTGAATCCTTAAGTACTTCCATTGCTCTGGAGAATATTAAGCAGATGGAGTATACCTCCTTTAAGTACATCTATGATAAGGGGAATCAGGTACGTAGAGGTTTTATCGCGCAACAACTAGAGGAGATTGATAGTCAGTACGTAAGAAAATACGAATCTTCCGACGGTTCTACTTCTCTGGCCCTAGATGAGAATGTACTTCTATTAGATGCTTTAGCGGCAATTCAAAATCTAAGCAATCAGGTAGAAGAGCTAAAACTTCAGATAGCTGAGTTAAGAGCTAAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4800d2e9fe97be48e761c32c9e2a591949db0d70876e3dfc18f5d3904d3fdc49
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5928
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of Salmonella siphophage Sw2 Nguyen,Q.X., Xie,Y., Liu,M. and Gill,J. 2019-10-10 — GenBank