Protein

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Genbank accession
BDU11694.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRIKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSNMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITVGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYAKLGARNTFNSQQTIVVNGEQLTLINPTSGSGAFSAIVGRDSSNEKVWAMGNLISGSRDFLIESKQGSTITLGTSVEISKTLAVNGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAADNTFSGLNTFSNYVSVSSNAAAIMLKNKAVNESLFILAKDVENNKLWYIGKGDANDNITFYDYKGGTSIVLNSSGVALNKNVRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLSNLAKIDTKNTFTQGQVIMVDGEGLKLQGVTDSGGLFLQGYDSSNNKKWFMGHNGFGNFTIREMALGTELSLRANNIQFNKSITITGQVQPSDWTNIDDRYYNKSSADNRYLRVRSTDFNKNAGGKWAKIATVSMPQGTATAVIELFGGSGFNFGLIDQACKTEIVLRTGSGNPKGLNVVAWKNSPNGVVDQVGYVNTSGDNYDIYCNVGGYQNATTARVQSSDNATIQLFATPETSDSSPSGYVAGTIAHYYTSILKPSPSDIGAYTKGETDQKIAQAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVALDVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNITGGHAHYGSGSTSTNGEHTHYVEAWNGTGTGGNRTSSYAVSYRNGGHETYASGNHSHTFSFWTSGAGDHSHSVGIGAHNHTVSGDTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:844 AA
molecular weight: 90538,88730 Da
isoelectric point:6,63791
aromaticity:0,09123
hydropathy:-0,37547

Domains

Domains [InterPro]
DC_0026
STR
1–149
DC_0026 IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR053827 IPR005003 IPR005003
DC_1993
STR
115–362
DC_1993 DC_2005 DC_2042
IPR048388
ATT
277–361
IPR048388
BDU11694.1
1 844
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
ATT
STR
ATT
RBD
STR 1-175 | ATT 176-248 | STR 249-276 | ATT 277-362 | ATT 383-469 | STR 470-646 | ATT 647-785 | RBD 786-844
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage phiWec172
[NCBI] 		2992777 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BDU11694.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC739530.1 [NCBI]
CDS location
range 44374 -> 46908
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGAATTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCAATATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCTGTATTCGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTGTTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGTCCTAATGAACTTGGCATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAAGCTTGGTGCTAGAAACACATTTAACTCTCAGCAGACTATTGTAGTAAACGGAGAGCAGCTAACGCTAATAAACCCTACCAGTGGGAGTGGTGCATTCTCTGCTATCGTAGGTAGAGATTCAAGCAACGAAAAAGTTTGGGCTATGGGAAATCTAATTAGTGGTAGCCGTGATTTCCTAATCGAGAGTAAACAAGGTTCAACCATCACTCTAGGCACAAGTGTCGAGATTAGTAAAACCCTTGCTGTCAATGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCGGATAATACTTTCAGTGGTTTAAACACCTTCAGCAACTATGTTAGTGTTAGCTCTAATGCTGCTGCTATCATGCTAAAAAATAAAGCTGTTAATGAATCTTTGTTCATCCTAGCAAAAGACGTTGAAAACAATAAACTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATGCAAATGATAATATCACATTTTATGATTACAAGGGTGGCACTTCTATTGTCTTAAACTCGTCTGGCGTAGCATTAAATAAGAATGTAAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATTCCGGCAGGGACTTTGAGTAATCTTGCTAAGATTGACACCAAAAATACCTTCACACAAGGTCAGGTTATTATGGTTGATGGTGAAGGTCTTAAATTACAAGGGGTGACTGATAGTGGTGGACTATTCTTACAAGGTTATGACTCATCAAATAACAAAAAATGGTTTATGGGACATAACGGATTTGGAAACTTCACTATCCGTGAAATGGCATTAGGAACCGAACTCTCCCTAAGAGCAAATAATATTCAGTTTAACAAAAGCATCACAATTACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGATGACCGATACTATAACAAATCATCTGCTGATAATAGGTATCTGAGAGTCAGAAGTACTGACTTTAACAAGAATGCTGGTGGTAAATGGGCTAAGATTGCTACTGTCAGCATGCCGCAGGGTACAGCAACAGCAGTGATTGAACTGTTTGGGGGGTCTGGTTTTAACTTTGGCTTAATTGACCAAGCCTGTAAAACAGAAATTGTTCTTAGAACAGGGAGTGGTAATCCAAAAGGATTAAATGTTGTTGCATGGAAAAACTCACCAAATGGTGTTGTAGACCAAGTTGGTTATGTCAATACATCTGGTGATAATTATGACATTTATTGCAATGTTGGTGGTTATCAAAACGCTACGACAGCTAGGGTTCAGTCATCAGATAATGCAACAATCCAGTTGTTTGCGACACCAGAGACTTCTGATAGTTCTCCATCTGGCTATGTTGCTGGGACAATTGCTCACTATTATACTAGCATTTTGAAGCCAAGCCCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGGTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTTGGTAGGACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGATTCTGTGGCGTTAGATGTTGGTAATTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGAACTAACATTACGGGTGGTCACGCTCACTATGGTAGTGGTTCTACTAGCACAAATGGTGAGCATACTCACTACGTTGAGGCATGGAACGGTACTGGTACTGGTGGTAATAGGACTTCATCATATGCTGTATCATATAGGAATGGTGGGCATGAAACTTATGCGTCAGGGAACCACAGTCATACTTTCTCTTTTTGGACTAGCGGTGCTGGCGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAACCACACAGTCAGTGGTGACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3c3ea590531aba2399718ab1ca03e65ef7cf8ccd078bbc3823984dedc030a4f8
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6709
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Tailoring Effective Phage Cocktails for Long-Term Lysis of Escherichia coli Based on Physiological Properties of Constituent Phages Kaneko,T., Osaka,T. and Tsuneda,S. 2023 37841387 GenBank