Protein

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UniProt accession
C7BVI2 [UniProt]
Protein name
Putative short tail fibre
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLISSKTGKYLYVSPDDFNATDSLSNRGNSPVTPFKSIQRAFLEIARYSYTPGPSNDRFDQFSIMLMPGIHYIDNRPGLVDTAGIDEFSFNQILNSWGDDPILDVGNPDNVLWKFNNTEGGAIIPRGSSLVGYDLRRTTVRPLYVPDPASVTVPRSAIFNVTGGCYFWQFTLKDGQTTAESPLFNPATGSGEVYYDPTDFTKKAAPNFSHHKLTVFEYADKEELQIYYRKVAKAFSQYQPTIDDVSPEGIPEFDFNIQENRIVGPLSDSRVIESLRFTDATTNPAIPASTTEIEVTTKVDHGYFAGQFVAISGTEVDDEIEGFWGIYDISDDPRKFTYRVPFVVSGIGQGLSSGIEVSVDTTPALGQNAQVLAEVDSVESASPYVFNVSIRSVWGICGIWANGLKATGFKSMVIAQYTGVSLQRDDRAFIRYDEYANTWNQASLVDAFATVPYHAKGDSYWKDDWRNFHVRASEDAFIQNVSIFAVGFADHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHAIGFKGFSFNQDKAGYITDIIPPQQVTESETNREKVLYYTIDVQGSIQDPNNTTKLYLGGTDLDNPLDRPAATIGGYRVGGKSNDKLYVKLDQKNGIDTFEASLQPTGFVKYIAKGSVLNPSDFTGSNLDYGGGITGDLNVSVDAANLIASNRRMIQEEVFGYILEKYPRLQNISYVNPGLDPAAGRYFDSRNLILNNRQEIVDTAYAQMLETFPNYDGNNGNTFGDKCKRDIGFVVDAIAEDLRDGGNANIIAATREYFDGNGDLIDNGLVGEEQPAVFAFNRARDLCKKAIANLLQVKATIYDPEDPSILTPYGVVAGSTGSAALGLNSEGVTVDDANKQDPAGRYKDARNRIVANREFILDAALAEVGVYHPDFYIPGDSQTNSDSRFADAYRLIRRNSKEISDRALASIAVEYPDFYFPGDAQTTADSRFYDSYRLIEQNKDQIVDTALAQIAVEYPDFYFPGDAQTTSTSRFADAYRLIQENRTEIVDGSWTNMVGANPSVAGTETKCKRDLGYFVDAISLDVFMGGNKYARKFISEYFDGNGQFITNGLDGEEAASKRAFEEARDFMRQAVANQLTERDLSVTADPDTGSNLDPASCADVQSAIDTLTAIAIDVLDSNSANYRSLAGLPAETPYTSETGELKCRRDIGYFVDAVALDIFTRGNEYSHRFATEYFDANGSPISNGLVGETAESITAFNKARDMMKLAVTNGLYEKDLTITADPNTAPDNQDPTSCADVQSAIDTLTSIAVIFIQNGNLNSMPIEVNKGSAPAGMTKCSRDIGYFIDAIGVDIFTGSNKHTRTFIKQYFDGNTPISNGIHSTQLEKDASETAFETAANFMRQAVSNQLYYRDLTITADPATGNNEDPASCANVQSQITTLATYVTDSLAASYNVASDLPAETPSNFLTGETKCRRDIGHIVDAVAQDLWFGGNEYTIAATKEYFNNNALISNGVDNEVGPSITAFKRAADLMNRAVNNQYYDRDLTLTLDAVGDPAFVADIHADAYNLVLDNKEFIAKEAYERMLTAYPTYTPQSGNTEQDCLDDVYDVLEEVMYDVKFGGNARTYDAAQVYVSNTLNGEAIETFIDAERDEAARVFSEAKTIAIQCLRNETVSVSANNPLTQKKDLTIVDDWDIEANLPTCGSAAGAVDTLMDLIIQAIGTDAGVGNLTGVVRTAPTQPTTYTLGNCSDVLATIDTLIGIVCDSLLAGDLESLPPLSTGNWDCANVRTSIENLFDILTDAISSGSLADLPTVNVGDFIVNAEESKCFRDVSYIVDAIVNDLRYGGNINSIQAGEAYFVGAQLDYIDGEAVETTDAWNYVGQMAIAAMRNFDFLAFNCVTTDSTSLVSIPTPDGGTRNVPAASIIDVGDTSGILIGMRLEAYPTGSYTNGLLNAGLTYEEDHVDTNIPADAYVKSIIDSNRIEIGVNNSRLETGNNVNCGQVSSSQSIYFTYPKGQWANTLPETVVVGPAGTGEDVIQDTTTSASQRECASTAAAILQLTDNITTIINTGLTKTVNGIEVPTIDRVEPSFNTALLASRATVFTIDTTGTGSTNAHDFETGTPVRLVPRPRFDVASGKYVDVDKRLVRLPKGFETNETYYVIAPGRATQPVDYSGTTYFNGSDQTKLMLATSKENAAAGIYIYAAETESIDPDVEIDIYQFVIDDKYDLHTYACNLVNTVVGGIETDISHIFDKPSPSTTPQKVFFRAIEGSDLPDLSTSYANDPTVAITSGVNAGKINPNVEFYVRYQTSKVFTIHKSLADAQANVTPIQFNNQNGPFRVFANKKRSPMRFDPYFNGADTDNGKWYLNCVDRITGESNTDIVYREIFYRINETDYASKPTTTDTWYERVNDEREANERTYKLRYVIPKYIENARDPINGFVIKTRTDDTRRLVPQKVLLKPVAGNVYGARFENPQQPGEFIGYTQVDFDADDTLNQENAYDPFRRPLTGENQDTDYRAIARFNSGIAATIQSGRYVQDDLDPAIEYLELTVFDHAVDTKNFPGLRNEIFTTVKISAPQGGDFVPNKTQKITTNSISFTGNSSGTAYIHAYYTVEGDHFLILKGISGAKGINSLEFSEFANTRFQQGNVFADMLEDQDMGKSLPLKTHIRKNFPEYYYKQNGANVYTITPGDRIQDDAGIEYYVYSVADAGVIEDTFYIFDSQELQKRIPGQQDGVYYLTALRGNISPYPTGAGVSTNFRKFKFSQPVGKIYPLNYRNDPLWFTKNGTTEQEKNYYSQLIDPPQSYSAADNYIHGKVTVNDTKNSVTRELMFDLTNQPAFVENTYTGSNEIKAQTGNATSGSEDRRIPIAGDSGVITDQRYYVELRRPSIARAGNHTFEYLGFGPGNYSTGLPARQEIVLEPEEDFYAQSKKQDAGIVFYTGINSQGDLYIGNRRINAITGEETFIDRAVLADDGDEDDVIGQLVTTFDTPVTFNQNITIVGGPDGELVNNVNSPLLINVPDQQLTNQNAPLVIYSLVSASDPVTGLPQDATLNRDSFFPNATGDIRIGKNRVDAAIFGFNSRGSGQGYKIQTSSPGGIGSNITPNQDEIVSAGGSRLNAEQYITYGGTVLPETGDITLKGGSIGKNGSLGWIYANIYTDIPNNIIAALEVIVDQSVNIAKFTFIDTSNNEVSIGSLNIKASSEIRINNLNYNGLVNGTWKVVNTPSYPYNPAENYVYFEINPRTGSPIGAFNLTWSDILNDAENPSPSAVVSFSVSNWKEVGVLGSEAIRTETETYGDFKLGINTIARATHSAYTNAFVETQNTDPRANLDVVGNAYISGRKMTDWLAEDNYNARERNRISDAFVVGWNDEASPNSNDIDAVVAAFRISTINSAILESGRGDNENKVGINITNAELDRALVVKGDARFTEDVRFERDIEVNGNGTIAEIRTSETVGTFNLLNDPTFVGGDDSAGLNLAGYAKTIRIGDFTTDNQWIYIGDKAAADQFVRIGSAANHSNIFIGNVDADAAISRTKIGGAYNRLSSLSTVDFETKQVTFAGDVTFGLNKQLGGDRLDAEQVVTLRTEAGVVSFFSGNTQTIDFALNASEVNIAGQGGTTTIRNSLEIDGATTFNASVRLCGGVSAFSFVGARAQLGSTAFAHDDGILGPTTFNQNVDLINVFALPESDPNYNRLDTAGSDPWGGTEYQALIPGGGPENADLPALTGDQYYLPLLNAPGDYFQEGDYLILDTVVDTLEQTHPEIVRVVPGGLVGAESAPYYLIVQRQPFGTFTALKTNHPDRSNRRTPIYKVNIAFDSTWTEQPIDGAGVNENIYLATFGGTLQTGRDYIIVDREDTNDDGVFDQGEVFKLVSSLDQVNKKFQILSGCPDGDVLFEVDSVTGETIIGNDGVDGENGKLTINGSFEFKGGCKTGSKTQFTGNAQQGLTTITAIPDTSGLEVGDYVQIFTGGGTVTLEQNRFPEDSGDTRFTDPQIVSIVGNVVTLNVPFTGAGSQEGITFEASTDEKFRITDRVRDIFTIDGCSGDTVIGNPSGQIYVNRARFNTTSAAHAAGDTVYVILKDPKVDNNIATTFVDTLTPITTTATQLTVDDISDFETGDFILVGYGSGGNEEFMQVSGTPVATAGTSGYLPVNRVGSIPQFAGAANIHQDGESVWRVLVRETTVLTDDVDAGVQTSIILGLENSDLVPFFLDREYFIVVNSEVFEVTNTTTNDGGTELVKTNYHHGRLTVYDDVKFVGSNFEITGTDNNVPILKLINNEEHHFEGGALDINAETDISGTLRIFPSRCVEDPEAIQFTNKSFTPTFRVEPEFGDTFVGRLLDVAGIQSTIASQSQKILDIRNLGNGGTKSFTIRQDSSIDAFGYTGWKNKNGGHITKFVNAQATLEVNINYIVAVAPSTGALVLTLPSDAVTGDTIRITEVGGQLTYNNSLVIRAPIVGGEPVAVQGDTEGTKLGGLSTPYSSGELVVQNRNASFGLVYVGQTDGDNFIPAAYQGWWLTEL
Physico‐chemical
properties
protein length:4482 AA
molecular weight: 488415,70950 Da
isoelectric point:4,45557
aromaticity:0,09772
hydropathy:-0,30250

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RSM4
[NCBI] 		555387 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Gibbetvirus > Gibbetvirus rsm4
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAR63411.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
FM207411 [NCBI]
CDS location
range 162121 -> 175569
strand -
CDS
ATGCCATTAACACGTTTAGATAACCTTATCAGCTCAAAAACTGGTAAGTATCTTTATGTTTCTCCAGACGATTTTAACGCTACAGATTCGTTATCTAATAGAGGTAATTCGCCTGTAACACCATTTAAGAGTATTCAACGTGCTTTCCTAGAGATTGCTCGTTATTCTTATACTCCTGGTCCATCTAACGATAGATTTGACCAGTTCAGCATCATGCTGATGCCTGGTATTCACTACATTGACAACCGCCCTGGTCTAGTAGATACTGCTGGTATTGATGAGTTCTCATTCAATCAGATCCTCAACTCATGGGGTGATGATCCTATTCTTGATGTAGGTAATCCTGATAACGTCCTTTGGAAGTTCAACAACACTGAGGGTGGTGCTATCATCCCTCGTGGTTCCTCACTCGTTGGTTATGACCTTCGTAGAACAACTGTTCGTCCTCTCTATGTTCCCGATCCTGCATCGGTAACAGTTCCTCGTTCTGCTATCTTTAACGTAACTGGTGGTTGCTACTTCTGGCAGTTCACTCTAAAGGATGGTCAAACAACTGCTGAATCTCCTCTGTTCAACCCTGCTACTGGTAGTGGTGAAGTTTACTATGATCCTACTGACTTCACCAAGAAAGCAGCACCTAACTTCTCTCACCACAAACTAACTGTATTTGAATACGCAGACAAAGAAGAACTGCAAATTTATTACAGAAAGGTTGCTAAGGCATTCTCCCAGTATCAACCAACTATTGATGATGTATCCCCCGAGGGTATTCCTGAGTTTGACTTTAACATTCAGGAAAACAGAATCGTTGGTCCTCTATCTGACTCTCGTGTTATTGAGTCGCTTAGGTTTACTGATGCTACAACCAATCCTGCTATCCCAGCATCTACAACTGAGATTGAAGTAACAACAAAGGTTGACCACGGATACTTTGCTGGTCAGTTTGTTGCTATCTCTGGTACAGAAGTTGATGATGAGATTGAAGGTTTCTGGGGAATCTATGACATCTCTGATGATCCTCGTAAGTTCACCTATCGTGTTCCTTTCGTTGTATCTGGTATCGGTCAGGGTCTATCCTCAGGTATTGAGGTTAGCGTAGATACTACTCCTGCACTAGGTCAGAACGCACAGGTTCTTGCTGAAGTTGACTCTGTTGAGTCTGCATCACCATATGTTTTCAACGTCTCAATCCGTTCGGTTTGGGGTATTTGTGGTATCTGGGCAAATGGTCTAAAAGCCACTGGATTCAAATCCATGGTTATCGCTCAGTACACGGGTGTTTCGCTCCAGAGAGACGACAGAGCATTCATCCGCTACGATGAGTATGCTAACACTTGGAACCAAGCATCGCTAGTAGACGCATTTGCTACGGTTCCTTATCACGCAAAGGGTGATTCTTACTGGAAGGATGACTGGAGAAACTTCCACGTTCGTGCTTCGGAAGATGCATTCATCCAGAACGTTTCTATCTTCGCTGTTGGTTTCGCAGATCACTTCCTGATGGAGTCGGGTGGTGATATGTCCATCACCAACTCTAACTCAAACTTCGGTAATACCTCACTACACGCTATTGGTTTCAAAGGATTCTCCTTCAACCAAGATAAGGCAGGTTATATTACCGACATCATTCCACCTCAGCAAGTTACTGAGAGTGAGACAAACAGAGAGAAAGTTCTCTACTATACTATTGATGTTCAAGGATCTATCCAAGATCCAAACAATACAACCAAACTATATCTTGGCGGTACAGATCTAGACAATCCTCTTGATCGTCCTGCTGCTACTATCGGTGGATATAGAGTTGGTGGTAAGTCAAATGATAAACTCTATGTTAAACTAGATCAGAAGAATGGTATTGATACCTTTGAGGCATCACTACAACCAACTGGTTTCGTTAAGTATATTGCAAAGGGTTCTGTACTAAACCCATCTGATTTCACGGGTAGCAACCTAGATTACGGCGGTGGTATCACTGGCGATCTTAATGTTAGCGTAGATGCTGCTAACTTGATTGCTAGCAACCGTCGCATGATTCAGGAGGAAGTCTTCGGTTATATCCTAGAGAAGTATCCAAGACTCCAGAACATTTCATATGTTAATCCTGGTCTAGATCCTGCTGCTGGTCGTTATTTTGATTCACGCAACCTAATCCTCAACAACCGTCAGGAGATTGTTGACACAGCATACGCTCAGATGCTGGAAACATTCCCCAACTATGATGGCAACAATGGTAATACATTTGGTGATAAGTGCAAGCGTGATATCGGATTCGTTGTTGATGCTATTGCAGAAGACCTTAGAGATGGTGGCAACGCTAACATCATTGCTGCAACCAGAGAATACTTTGATGGTAATGGCGATCTAATTGACAACGGTCTAGTTGGCGAAGAGCAACCTGCTGTATTTGCATTTAACAGAGCAAGAGATCTCTGTAAAAAAGCAATTGCTAACTTACTACAAGTTAAGGCAACCATCTATGATCCAGAAGATCCCAGCATTCTAACTCCTTATGGTGTTGTCGCTGGTAGCACTGGTTCTGCTGCTCTAGGACTCAACAGCGAAGGTGTTACTGTTGATGATGCTAACAAGCAAGATCCTGCTGGTCGTTATAAGGATGCTCGCAATCGTATTGTTGCTAACCGCGAGTTTATCCTTGACGCAGCACTAGCAGAAGTTGGTGTATATCATCCTGATTTCTACATTCCTGGTGATTCACAGACTAATTCAGATTCACGTTTTGCTGATGCTTACAGACTAATCCGTCGCAACAGCAAGGAGATTTCGGATAGAGCACTTGCTTCTATTGCTGTAGAGTATCCTGATTTCTACTTCCCAGGTGATGCTCAGACAACTGCTGATTCACGTTTCTACGATTCATATCGTTTGATTGAGCAGAATAAGGATCAGATTGTTGACACTGCCCTAGCACAGATTGCTGTAGAGTATCCTGATTTCTACTTCCCAGGTGATGCACAAACAACTTCTACTTCTAGATTTGCTGATGCATATCGTCTAATCCAAGAAAACAGAACAGAGATTGTTGATGGATCATGGACTAACATGGTCGGTGCAAACCCTTCTGTTGCTGGAACTGAAACCAAGTGTAAGAGAGACTTGGGATACTTTGTTGATGCTATCTCCCTTGACGTATTCATGGGTGGCAACAAGTATGCTCGTAAGTTTATCTCTGAATACTTTGACGGCAATGGTCAGTTCATCACCAACGGACTAGATGGTGAGGAAGCAGCAAGTAAGCGTGCTTTCGAAGAAGCAAGAGACTTCATGCGTCAAGCAGTTGCTAACCAGTTGACTGAAAGGGATCTTAGTGTAACTGCTGATCCTGATACTGGTTCCAACTTAGATCCAGCATCTTGTGCTGATGTTCAGTCTGCAATTGATACCCTAACTGCAATTGCAATTGATGTTCTAGATTCTAATTCAGCTAACTACAGAAGTCTTGCTGGTCTACCTGCAGAAACTCCTTACACAAGTGAGACAGGAGAACTCAAGTGCCGCAGAGATATTGGATACTTTGTTGATGCAGTTGCACTTGACATCTTCACCCGTGGCAATGAGTATTCACACAGATTTGCTACTGAATACTTTGATGCAAACGGAAGTCCAATCAGCAACGGTCTTGTAGGTGAGACTGCAGAAAGTATTACTGCTTTCAACAAGGCAAGAGACATGATGAAACTTGCCGTCACCAACGGACTTTATGAGAAGGATCTAACTATCACTGCTGATCCTAACACTGCTCCTGACAATCAAGATCCTACATCTTGTGCTGATGTTCAGTCTGCAATTGACACACTAACCAGTATTGCTGTAATATTCATCCAGAATGGAAACCTTAACTCAATGCCTATTGAGGTCAATAAGGGATCTGCTCCTGCTGGAATGACGAAGTGTAGTCGTGATATTGGATACTTCATTGATGCTATTGGTGTTGACATCTTCACTGGAAGCAATAAGCACACAAGAACATTCATCAAGCAATACTTTGATGGAAATACCCCAATTTCAAATGGTATTCATTCCACTCAACTAGAGAAAGATGCTAGCGAAACTGCATTTGAAACCGCTGCAAACTTTATGCGTCAGGCAGTTTCAAACCAACTGTACTACAGAGATCTAACTATCACTGCTGACCCAGCAACTGGAAACAATGAAGATCCAGCATCTTGTGCTAACGTACAATCGCAGATTACAACTCTAGCGACTTACGTAACTGATTCTCTGGCTGCTAGTTATAATGTCGCTAGCGATCTACCTGCTGAGACTCCTTCTAACTTCCTAACAGGTGAGACTAAGTGCCGCAGAGACATCGGACATATTGTTGATGCTGTTGCACAGGATCTCTGGTTTGGTGGTAATGAGTATACCATCGCTGCAACTAAGGAATACTTCAACAACAATGCTCTAATCAGCAACGGTGTTGACAACGAAGTTGGTCCTTCCATCACTGCATTCAAACGTGCTGCCGATCTAATGAATCGTGCAGTTAACAACCAATACTATGATCGTGATCTAACTCTAACGTTAGATGCAGTTGGAGATCCTGCATTTGTCGCTGACATTCATGCTGACGCATATAACCTTGTCTTAGATAACAAAGAGTTCATTGCTAAGGAAGCATATGAGCGTATGCTTACTGCATATCCTACATATACTCCACAGTCTGGAAATACTGAGCAAGACTGCCTAGATGACGTTTATGACGTTCTAGAAGAGGTAATGTATGATGTTAAGTTTGGTGGAAATGCCAGAACTTATGATGCTGCTCAGGTCTATGTATCTAATACACTTAACGGAGAAGCAATTGAAACTTTCATTGACGCTGAGCGTGATGAAGCAGCAAGAGTATTCTCTGAAGCAAAGACAATTGCTATCCAGTGTTTAAGAAATGAGACTGTAAGCGTATCTGCTAACAACCCACTAACCCAGAAGAAGGATCTAACAATTGTAGACGACTGGGATATTGAAGCTAACCTTCCTAC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Genome Context

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Tertiary structure

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