Protein

Genbank accession
QXV72337.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9304

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,8653

Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTAPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQQETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGTWNSQGDTLAPIFAEINSTPDAKFHPIVKQRLGQGTFSLGTVNDGTRDFKIHYLPSPGSLESFYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLSTTGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1349 AA
molecular weight: 146367,30340 Da
isoelectric point:5,65886
aromaticity:0,08154
hydropathy:-0,33462

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage PSD9
[NCBI] 		2861000 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV72337.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ561532.1 [NCBI]
CDS location
range 33815 -> 37864
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCGATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCGGGTTATTGGACTGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCTGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACTGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTCTCGGTGTTATTGCCCTTGCGTCGCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAGAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTAACACGGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCGCGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCGCTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGCCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCGGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACACCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACCAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAACTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTTAACTCAGGTACAGGCCTTTACGAGAACGATGATACTGTTCTGAATGCAGCGAACTATCCTAAAACAGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTTCAGTTCATTCGTAGAGACGTTGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACGTTGACAAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACCGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTGGAAGTAACCGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGCCCTCAGTCAGGCGCTGGTACTTGGAACTCTCAAGGTGATACTTTAGCTCCGATTTTTGCCGAGATAAATTCGACCCCAGATGCCAAGTTCCATCCTATTGTTAAACAACGTTTAGGGCAAGGTACGTTCTCTTTAGGCACTGTAAATGATGGAACTCGTGATTTTAAAATACATTATCTTCCATCGCCGGGTTCTTTAGAATCTTTCTACTGGACCTTTAATACGACTGGTGACTTTGCTGTTAATAGTGGTTCCATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACTACATTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCATTACAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGCTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCGCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATTCGGCTACATTTAACCTATTCCCAGGTTATTGGACGATGAAAACTAAACGTCAGGTTAATATTGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACGGAAACGGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCAGTACGACGGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCCACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.