Protein
- Genbank accession
- QYC52947.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9095
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6252
- Protein sequence
-
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGDFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEIQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQDTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMLTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQSGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEVQVRTSGTGFLVYDSIDKIWRIFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGADNNTVKTINVTLPTDVAVGDTVTIAMNYMRKGQTVVIKASDGDTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLGLAYIEDKASGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESNPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVNQSTTASYLDNVIVTPKKLNERSATETRRGLAEIATNAKMDAGTDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVIQLVKTGGAPNTTADRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPEALHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNDRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSTVMVNPKLLFDKFANTDRIQVNTSSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGTDAKKIVTAATLHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLSDRIVPPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWTFSQDTSFSNNISVQNIIYANGGEVKISPTADTGNVHVRFQNRDGSERGIIYAEPQTASAGTLKVRVKNGTGTTAASQTYTFGGNGTLEVPNEVSTKTLRSSGNAIVGGTVMVKDVQMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVKKAGDTMTGNLNISGSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPANPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1281 AA molecular weight: 138452,25710 Da isoelectric point: 6,85765 aromaticity: 0,07182 hydropathy: -0,33310
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Klebsiella phage vB_KpnM_TU02 [NCBI] |
2863278 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QYC52947.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ560702.1
[NCBI]
CDS location
range 137078 -> 140923
strand +
strand +
CDS
ATGAGCGATTTACTGAAACAACATTTCCGTGCAACGAACGGCTTGGACGCAGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTAGCTGACCGCAACGTTAAAACCGACGGCGTCTCCGTCGAGTACGTTATTCAAGAAAACACTATCCAAAAATATGACCCGACGCGTGGGTATCTCACCGATTTTGCTGTGACTTATGGACGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAGCCTGCTGGAGATTTTAACCAGGCGAATTGGACTTCTTTACGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACCGTCCGTAAAGGAGAGTTTGAAATTCAATCTGGTCAGTTCATCAACGTTGACTCTAACGCTGCAGGTAATGCTACATTACTGCTTCCGTTAGCACCAGATGAAGGCGATACCATCGTAGTTCGTGATATTGGCGGGCGTCCTGGCTATAACGGAATCTTAATTAAAGCACAAGATACTGGTGCGTCTATCGTATTTGGTGAATCGCGCCTGCGTGAGGTAAGACTTACACGTCCGTATTCACAAATTATGCTTACGTTTAGTAATGGTGCATGGCGTGCAAGTTTAACCGATTTTGGCGATACTGCTAAAATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCAACACAGGTACAGTCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTTATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGATGGTACATCGCCGATTAACCATATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCAATTGGGACTCCTGGACAAACAGAGGTTCAAGTACGTACTTCAGGCACCGGATTTTTGGTATATGACTCGATTGACAAAATCTGGCGTATTTTTGAAAATGATTTACGCACCCGAGTAAGAATAATTACTTCTGATGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGCGCAGATAACAATACCGTTAAAACAATTAACGTTACTTTGCCTACAGACGTAGCTGTTGGGGATACTGTCACAATCGCAATGAATTATATGCGCAAAGGACAGACTGTAGTAATTAAAGCTTCTGATGGTGATACCATTGCAAGTAATTTGAATTTACTACAATTTCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTGCAATCAAGCTCAATTACCTTTAACGGAACTACATCGTATGTTCCTGTTCTTGGGCTTGCATATATTGAAGATAAAGCATCCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACCGTAGAACGAGTTGATGCTAAAGACAATACAACCAGAGCCCGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACGCAGGCTCAAGCTAATGCGGAGTCAAATCCAGAAAAAGAATTAGCAATTACGCCAGAAACCTTAAATGGACGTCGTTCTACTGAAACCCAAACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCCAGCGAAGTTAATCAGTCAACAACTGCTTCTTACTTGGATAATGTAATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAACGAAAGGTCTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTTTAGCAGAGATTGCGACTAATGCTAAAATGGATGCAGGAACAGACGATTTTACAATTGTTACTCCTAAGAAGTTGCTTTATCGTACTACATCAGATTCACGATTAGGTGTTATTCAATTAGTAAAAACTGGTGGTGCTCCTAACACAACTGCTGATCGTTCTTCTGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCAGTTACTCCAAAAACTCTTCGCGAGTATAAAGCTACTGTAAATCAGTCAGGAATAGTTTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCGGCTTCTTCAAATATTCCTACAGTCGTTACACCAGAAGCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGACGGAGCAATTGGATTAATCCAAATAGCTACACAAACTGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACAGCAACTAACGATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTACAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACCGATCGTATCCAAGTTAATACTAGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACCACTCTTGCTACTGCTGCTGAGGTTAGAACCGGCACCGACGCCAAGAAAATAGTTACTGCTGCCACGCTACATGCTAAAACAGCAACTGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACACAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTAAGTGATAGAATTGTTCCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTGAGGCTATCTACAGGCGATGGAACTTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACCCCAGACAAATATGCTCGTCGCGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGACATTTAGTCAGGATACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTTCAGAATATTATATATGCTAATGGTGGCGAAGTTAAAATTTCTCCAACAGCTGATACTGGAAATGTGCATGTTCGTTTTCAAAATAGAGACGGAAGCGAGCGTGGTATAATTTATGCTGAGCCTCAAACAGCTTCAGCCGGAACTTTAAAAGTTCGCGTAAAAAACGGAACAGGAACTACTGCTGCAAGCCAGACCTACACATTTGGCGGTAACGGTACGTTAGAAGTTCCTAACGAAGTGTCAACTAAAACTCTGAGGTCTTCTGGAAATGCAATAGTTGGCGGAACTGTTATGGTTAAGGACGTTCAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTACGCAAGATTAGCTGATGGCCGTTATGTCAAGAAAGCTGGTGATACAATGACCGGCAATCTTAACATAAGCGGTTCTGCTATCGTTATCACAGGTTCTGAATCGTGGTATGTACCAACAAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATCAAAGACGCTACTAAATTGAAAGGTCTTCGCGGTTATATGGTTCCAATCAGAACACCGATTGACCCTGCTAATCCAAGCACATTAGTAGTAACTGGGTATGAAGAAAAAACTGCAGCTGGTGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAGCTTTGGACGCCTTATCCTCCAACAACCGAAACTGCTGATAAGCGTTTTGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGAGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCGAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTCCTGGAATGGATTAAGCTTGGCCCAGTTAAAATCTGGCCAGACCGTCCAAACCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.