Genbank accession
AXC40035.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,78
Protein sequence
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMIGITKSMDSIGAKLDDLAIAMIEVSDKLESGFTHVGKSVKAMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRVLSGTTRGFNDTTTSAGRASRALGNTSGSARGATRDFAAMAKVGGSLPLMYAAIASNVFVLQSAFEQLKMGDQLNRLEKFGTIVGTQTGTPVQTLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNVNSLSTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDDVLRATPWEQFAANADAALRKVQQAAAKYLGPVIDSINAVFYTSQASISASAARAQEETNRQIDPANVGAVALSLSASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKTEFDKRMSQADASTAAAIRLVGEGMPVGLAAGGFEVGGVRIGSSEANKKFVEETAAMGLQVARLGKEVDDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKTNPEFQKQINLQKDMNDPDAVYDFNSATLKGLTEQQKAYDQAKKTASDLANDIQNIAQNTNTAAKTSASLSDTIKTIESLSAGTGKNADEYVKSLNLGYNTLSEMKTASQALAGYVKLTGNETKNQLEVQQKIAEVYNQTKDKEKAQEAGRRLEIQQLEEQEAALKRVLETNKGNKAIENEIAKIQLERIKVTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMTDTQYRLAQLNLELTVEKEKYTWYTKQADKQKAAEQSRRAQAQIEREIWKFRQDQQMEMASGRERALNISQTSRNVTGESQRLTEQQALYQSLLEITKGNAQAQEEYKRKIQETSAALAQLKMQRDAQMQQQVTSSVGGVYTPTTGLEGDDKANMDMQNRMASYDQAISKLSELNSEATAVAQSMGNLTNAMIQFSQGSLDTTSLVAAGMQTVSSMIQYSVGQQVSAIDAAIAAEQKRDGKSEQSKAKIKKLEAEKLKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPFSIPLMVAAGLAGAMALAQASSASGMSSIGDSGAETAGYLTLGERQKNVDVSMSANAGELSYIRGDQGIGNANSFVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVITPMVPMKATPTDELKGSSKGTSGRPIVLNISTMDAASFRDFASSNSAAFRDAVEQALNENGTTLKSLGNS
Physico‐chemical
properties
protein length:1235 AA
molecular weight: 132991,91640 Da
isoelectric point:6,11681
aromaticity:0,05182
hydropathy:-0,43498

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
586–613
AXC40035.1
1 1235
Architecture
TAS
STR
TAS
TAS 1-81 | STR 82-1197 | TAS 1198-1233 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage S113
[NCBI]
2231342 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Epseptimavirus > Epseptimavirus S113
Host Salmonella typhimurium
[NCBI]
90371 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXC40035.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH370366 [NCBI]
CDS location
range 11719 -> 15426
strand +
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAACTACTTATAGATGTAAAGCAGAAAGGGGCAACCCGTACTGCAAAATCTATTGAGAACGTTTCCGATGCGTTAGAAAATGCTGCTGCCGCTTCCGAACTGACTAATGAGCAGTTAGGAAAAATGCCCAAAACTCTTTACTCCATTGAGAGGGCAGCGGATAGAGCAGCTAAAAGTCTAACTAAAATGCAGGCTAGCAGAGGTATGATAGGTATCACCAAATCTATGGATAGTATTGGTGCTAAGTTAGATGACCTTGCTATTGCTATGATTGAGGTATCCGATAAGCTAGAGTCTGGATTTACACATGTTGGTAAATCTGTTAAGGCGATGGGTAACGATGTAGCTGCTGCAACTGAAAAAGTTCAAGATAGATTATACGATACAAACCGTGTTTTGTCGGGTACTACTAGAGGCTTCAATGATACTACCACATCCGCAGGTCGTGCTAGTCGTGCTCTAGGTAATACCTCTGGTTCTGCACGGGGTGCAACTCGTGACTTCGCAGCAATGGCTAAAGTTGGTGGTTCTCTACCTCTTATGTATGCTGCTATCGCATCTAACGTGTTCGTTCTACAATCTGCATTCGAACAACTTAAGATGGGTGACCAGTTAAACCGTCTGGAGAAGTTCGGTACTATTGTAGGTACTCAAACAGGTACTCCGGTACAAACTCTAGCTAGATCTCTACAAGAGGCTGCTGGTTATGCAATCTCCTTCGAAGAAGCAATGAGACAGGCATCCTCTGCTTCTGCATATGGATTCGATGCTGAACAACTTAATAAATTTGGTCTAGTAGCCCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGTGTTGATATGACTGATGCACTTAACCGTGTAATCAAAGGTGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTGGACGAACTTGGTGTTACTATTCGTCTTAATGATGCTTACGCTGACTACGTTAAACAGTTAAATGCTGCTAACACAGGTATCACATATAACGTCAATAGTCTTTCCACTTTCCAAAAGCAACAAGCATATGCTAACGCAGTTATTGCTGAATCTACTAAACGTTTCGGCTACTTGGATGACGTACTCCGTGCAACTCCATGGGAACAGTTTGCTGCTAACGCTGATGCTGCACTAAGAAAGGTTCAACAGGCTGCTGCTAAGTATTTAGGGCCAGTAATTGATTCTATCAACGCAGTGTTCTATACTTCTCAAGCATCTATCTCGGCCTCTGCTGCTAGAGCACAGGAAGAAACTAACCGCCAGATTGACCCAGCTAACGTTGGTGCTGTAGCTTTAAGTCTTTCCGCTTCTGAGGAGGGATATAATAAAGCTCTTGATATGTATAAAGAGTCTCTGGATAAGCGTAATAAACTAAAGACTGAGTTTGATAAACGTATGTCCCAAGCAGATGCTAGTACTGCTGCCGCTATTAGATTAGTGGGTGAGGGAATGCCTGTTGGATTAGCTGCTGGGGGGTTTGAAGTAGGGGGAGTGCGCATAGGTTCTTCCGAAGCTAACAAAAAGTTTGTAGAAGAAACCGCAGCTATGGGACTACAGGTAGCAAGGTTAGGTAAAGAAGTTGATGATTCTACTGAAAACCTTAATGCTTGGAAATCTGCGTATCAAGCTGCTGGTGCTGCGGCTGCTAAGACTAATCCAGAATTTCAGAAGCAGATTAATCTGCAGAAGGATATGAATGACCCTGATGCGGTTTATGACTTTAACTCCGCAACTCTGAAAGGACTGACGGAACAGCAGAAAGCATATGATCAGGCTAAGAAAACTGCTAGTGATTTAGCTAACGATATCCAGAACATCGCTCAGAATACTAATACTGCTGCTAAAACTAGTGCATCCCTATCAGATACGATTAAAACTATTGAGTCTCTTTCTGCTGGTACTGGTAAAAATGCTGATGAGTATGTTAAGAGTCTGAACTTAGGATATAATACTCTTAGTGAGATGAAGACTGCTTCACAAGCTCTTGCTGGTTACGTAAAATTAACTGGTAATGAGACTAAGAATCAGTTAGAAGTTCAGCAGAAGATTGCAGAAGTATACAACCAGACTAAGGACAAAGAGAAAGCACAGGAAGCTGGTAGACGTCTGGAAATCCAACAGTTAGAAGAACAGGAAGCAGCTCTTAAACGTGTCCTAGAAACTAACAAGGGTAATAAAGCAATCGAGAATGAAATAGCTAAGATTCAGTTAGAACGTATCAAAGTTACTAACCAGGGTATGGAAGCCCAGAAGAAGGTTAAGGACTATACGGATAAGATTCTTGGTGTTGATCGTGAAATTGCTCTCCTGAATAACCGTACTATGACAGATACTCAGTATCGTTTAGCTCAGTTGAACCTTGAACTGACTGTCGAGAAAGAGAAATACACATGGTATACTAAGCAAGCAGATAAGCAGAAAGCAGCAGAACAGTCAAGACGTGCTCAGGCACAGATTGAACGTGAAATCTGGAAATTCCGTCAAGATCAGCAGATGGAAATGGCTTCTGGACGCGAAAGAGCTCTTAATATTTCACAGACTAGCAGAAACGTTACTGGGGAATCTCAGAGACTAACTGAACAGCAAGCTCTGTACCAAAGTTTACTGGAAATTACAAAAGGAAATGCACAAGCTCAGGAAGAGTATAAGCGTAAAATCCAAGAAACTTCGGCAGCTCTAGCACAGCTTAAGATGCAACGCGATGCTCAGATGCAGCAGCAAGTCACTTCTTCTGTTGGTGGTGTTTACACTCCAACAACTGGACTGGAAGGAGATGATAAAGCAAATATGGATATGCAGAATAGAATGGCATCCTATGACCAGGCTATCTCTAAACTATCCGAGCTGAACTCTGAAGCAACTGCAGTGGCACAAAGTATGGGTAACCTAACTAATGCTATGATTCAGTTCTCTCAGGGATCTCTGGATACTACATCTTTAGTTGCTGCTGGTATGCAAACTGTGTCTTCAATGATTCAGTATAGTGTTGGTCAACAGGTAAGTGCTATTGATGCAGCTATTGCAGCAGAACAGAAACGTGATGGTAAATCTGAGCAATCCAAAGCTAAGATCAAGAAGTTAGAGGCTGAAAAGCTCAAGATCCAGCAAGATGCAGCTAAGAAGCAAATCATTATCCAGACGGCAGTAGCGGTGATGCAAGCAGCAACAGCTGTTCCATACCCATTTTCTATTCCTCTGATGGTTGCGGCTGGTTTAGCAGGTGCTATGGCTCTTGCTCAAGCATCCTCTGCATCTGGTATGTCTTCTATTGGGGACTCTGGTGCTGAGACAGCTGGTTACTTAACTCTTGGAGAGCGCCAGAAGAACGTAGACGTTTCTATGTCGGCTAACGCAGGAGAACTTTCTTATATTCGAGGGGACCAAGGGATTGGTAATGCTAACTCTTTCGTACCTCGTGCAGAAGGTGGTAATATGTATCCTGGAGTTAGTTACCAGATGGGTGAGCATGGTACCGAAGTAATCACTCCTATGGTTCCGATGAAGGCTACTCCTACTGATGAACTCAAAGGATCTTCAAAGGGTACATCGGGTAGACCTATTGTGCTGAACATCAGTACGATGGATGCGGCTAGCTTCCGAGACTTTGCTTCGAGCAACAGTGCTGCTTTCAGGGATGCCGTGGAACAGGCTCTTAATGAGAATGGAACCACCCTGAAATCACTTGGTAATTCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
58179fec7f478243535ab048f07c69af0a828a89cffa63fb88de7ac82a023cb8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4199
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50