Protein
- Genbank accession
- QPB08404.1 [GenBank]
- Protein name
- virion structural protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,7892
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9609
- Protein sequence
-
MADRFPLIVNATSRKIEELVAGDNLDLTGNGVIISGDVGDGKYLKSDGGFVVWDNPGDVYLNASQTLTNKIFESCTLSGSLNTITNISNSSLVNSGITINGTTVNLGNSITTPNDNTTYTLGVADGLTSSQKRIQLTDSGSTVDEIIFAVGTPQSIPQGTNALSLLVDRSGDTFTVSGYVVDNNTVTTIQSFTGGTPQSGNILFKGTGGATITQDSANRTIEINTRNDDTITQLRAGTGQVFSDGNFTFLAGNEVSLVQGVDGNSDPTITISSTDTITRVQGGGSGSLQSGDILIQGGSSGNVTVSQSGNTIDIDSQNDDTITKIGSVSSNGTFTVAPGDFRFTASGDAELTQTTNSGVTEIDISFTNTDTGAGLDAANGIILNGSDFELKNAGSLTDQKILKWDSANAQLVNSLLEDNGTTVTVAGNLNVTGTTTTLESTILQVADPIIELRKGASLVGANGGIQINRTSDANGVVQTWIGLQWYETGGYFRTLDNAGVARRFVTENENQTLTNKTLNNASFTGTTDIGVATATTLNGLTISPVISSTLDFADQKTLTVNNTMTLSSTDGAVINFANGGGAGSQVAYSSYNLGQFSTTTSVQLRGTVSDPTGSGQLVFNTTPVISTAITTQDASFSVFNTNATSINAFGAATALNLGATTGTTLVRNDLDVNGNVVLNTNDTDTFTVEGIPNFDKNDITIRGTATSPMTIGRGNGSVSSNTALGTEVLSANQSGSQNTGVGFEALASNVSGLGNTAVGDGALSFSDVGSNNVAVGKNAAGSSTSGDNNVAVGDNAMYGSSAGDDNVCIGAYAGYNMTGNGNVLIGSGRPIGDPAIPGATYQPPSSGGSVQLVIGSTTEVSGSRVSGTWIKGDNLFNVTMENDLSVGGELVVGGNLTVNGTTTTINTQNIQIDDNALELAAVQLAQFSGNVTNGSPFVTNVEVFTGVVVGMTVNVVSGTSLPAGTTTVTSVDPDNGTIGLSQNITGSGGTGVFEALGPTDEAANGGGLILKGTTTDKTILYDNTRADKYWKFSENLEIKANRHIAINGTELLSGTTLGTTVVNSSLTSVGTLTGLAVNGAASFGGKIKESNDNNFTTSLAPDGSGVLTINTATSNTICGTPTAAAITEWAFTNVNLNNGESLTITLILASNTTALYGDACSIDGNSVTNGVKWSGGSPPTPTNNTDILTFVMVKDGSGNIQVFGQGNTDFS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1211 AA molecular weight: 123379,34450 Da isoelectric point: 4,08254 aromaticity: 0,05285 hydropathy: -0,08159
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage S-H9-2 [NCBI] |
2783669 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Yushanluvirus satich > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPB08404.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW147367.1
[NCBI]
CDS location
range 117167 -> 120802
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATCGTTTTCCACTTATTGTTAATGCTACTTCAAGGAAGATCGAAGAACTTGTAGCAGGTGACAATTTAGATCTCACTGGCAATGGTGTTATCATCAGCGGAGACGTGGGTGATGGGAAATATCTAAAGAGTGATGGAGGATTTGTTGTCTGGGATAATCCTGGTGATGTTTACCTGAATGCATCACAGACATTAACTAATAAAATCTTTGAAAGTTGTACTTTATCAGGATCGCTTAATACCATAACCAATATCTCAAATAGTTCATTGGTTAACTCTGGTATTACAATCAATGGAACCACAGTAAATCTTGGCAATTCAATAACAACACCAAACGACAATACAACTTACACGTTGGGAGTTGCTGACGGTCTAACTTCCTCCCAAAAGAGGATTCAACTAACTGATAGTGGATCAACAGTAGATGAAATAATTTTTGCAGTAGGAACTCCACAATCTATTCCTCAAGGAACAAACGCTTTAAGTCTACTTGTAGATAGAAGTGGTGACACTTTCACAGTTTCTGGATACGTAGTAGATAATAATACTGTCACTACTATTCAATCATTTACTGGTGGTACTCCACAGTCTGGTAACATCCTTTTCAAAGGAACAGGTGGAGCAACTATTACTCAAGATTCTGCCAACAGAACTATTGAAATTAATACGAGAAACGATGACACTATAACTCAACTACGAGCTGGTACTGGTCAAGTATTTTCTGATGGAAACTTTACTTTCCTTGCTGGAAATGAAGTTTCTCTTGTACAAGGTGTTGATGGCAACAGTGATCCAACAATTACAATCAGTTCTACAGATACGATTACTCGTGTACAGGGCGGAGGTTCTGGATCTCTTCAATCAGGAGACATTTTAATTCAGGGTGGTTCTAGTGGAAATGTAACTGTCAGTCAGTCTGGAAATACCATCGATATTGATTCACAGAACGACGACACTATCACCAAAATTGGATCTGTATCTTCTAACGGTACGTTTACTGTAGCACCAGGAGACTTTAGATTCACAGCTTCAGGTGATGCTGAACTAACACAGACCACAAACTCAGGTGTCACTGAAATTGATATCAGTTTCACTAACACTGATACTGGTGCTGGTCTTGATGCTGCTAATGGTATCATTCTAAATGGATCTGATTTTGAACTTAAGAATGCTGGGTCATTAACCGACCAAAAGATTCTAAAGTGGGACTCTGCTAATGCTCAGTTAGTTAACAGTCTATTAGAAGACAACGGAACTACTGTTACAGTTGCTGGTAACTTAAATGTTACTGGTACTACCACCACATTAGAGAGTACGATCCTCCAAGTTGCTGATCCTATCATTGAATTAAGAAAAGGAGCAAGTCTCGTAGGTGCTAATGGCGGCATTCAAATTAATAGAACCAGTGATGCCAACGGTGTAGTTCAAACATGGATCGGTCTTCAATGGTATGAAACTGGCGGATACTTCAGAACACTTGACAATGCTGGTGTTGCCAGAAGATTTGTCACAGAAAATGAAAATCAAACTTTAACCAACAAAACTTTAAACAATGCTTCCTTTACAGGAACTACTGACATTGGTGTAGCAACTGCCACAACCCTCAATGGTCTAACTATTAGTCCAGTCATTAGTTCTACACTGGACTTTGCTGATCAAAAAACTTTGACAGTAAATAACACCATGACACTTAGCTCCACAGATGGAGCTGTCATTAACTTTGCTAACGGAGGAGGTGCTGGTAGTCAAGTAGCATACTCATCTTACAACTTGGGTCAGTTCTCTACTACAACTTCTGTTCAACTTAGAGGTACTGTTAGTGATCCAACTGGTAGCGGACAATTGGTATTCAACACCACTCCAGTTATTTCTACTGCTATTACTACACAGGATGCTTCTTTCTCAGTATTCAACACCAATGCCACTTCAATCAATGCTTTTGGTGCTGCTACTGCTCTAAATCTTGGTGCTACTACAGGTACAACTCTTGTTAGAAATGATTTAGATGTCAATGGTAACGTAGTATTGAACACTAACGATACAGATACATTTACTGTTGAAGGTATTCCAAACTTCGACAAGAATGACATTACTATTCGTGGAACTGCTACCTCGCCAATGACTATCGGCAGAGGTAATGGTTCTGTTTCAAGTAATACTGCTTTAGGTACTGAAGTTTTATCAGCAAACCAAAGTGGATCTCAAAACACTGGTGTTGGTTTTGAAGCATTAGCATCAAATGTTTCTGGTCTTGGTAACACTGCTGTTGGTGATGGAGCACTAAGTTTTTCTGATGTTGGTAGCAACAACGTAGCTGTCGGTAAGAATGCTGCTGGATCAAGCACCAGTGGAGACAATAACGTAGCGGTCGGTGACAATGCTATGTATGGATCTTCTGCTGGAGATGACAATGTTTGTATCGGTGCTTATGCTGGTTATAACATGACTGGTAATGGCAACGTTCTGATCGGTAGTGGTAGACCAATTGGCGATCCTGCTATTCCTGGTGCTACATATCAACCTCCTTCATCTGGTGGCAGTGTTCAGTTAGTTATCGGTAGCACCACAGAAGTTTCGGGATCAAGAGTATCTGGTACATGGATTAAGGGCGATAACCTATTCAATGTCACCATGGAAAACGACCTTTCTGTTGGTGGCGAATTGGTTGTTGGAGGTAACCTTACTGTTAATGGTACAACTACAACTATTAATACTCAAAATATTCAAATTGATGACAATGCTCTGGAGTTGGCAGCAGTACAACTTGCTCAGTTCTCTGGTAATGTCACAAACGGAAGTCCTTTTGTTACTAACGTCGAAGTATTCACTGGCGTTGTTGTTGGTATGACAGTCAACGTTGTTTCTGGTACGTCACTCCCAGCAGGAACAACAACTGTCACAAGCGTTGATCCAGACAATGGCACTATTGGATTATCTCAAAACATTACTGGTTCTGGTGGTACTGGTGTATTTGAAGCACTGGGTCCAACAGATGAGGCAGCTAACGGTGGTGGTTTGATTCTCAAGGGAACTACGACAGACAAAACCATTCTGTATGATAACACAAGAGCAGATAAGTATTGGAAGTTCTCAGAAAACCTTGAGATCAAAGCAAACAGACATATTGCTATCAACGGTACTGAACTACTTAGTGGTACTACGTTAGGTACAACTGTTGTCAACTCTTCACTAACATCTGTTGGTACACTGACTGGTCTTGCTGTTAATGGAGCAGCATCATTCGGCGGAAAGATCAAAGAGAGCAACGACAATAACTTCACCACTTCATTAGCACCCGATGGTTCTGGTGTTCTTACTATCAACACTGCTACATCTAACACGATCTGTGGTACACCAACAGCAGCAGCAATCACTGAGTGGGCATTCACTAATGTCAATCTAAATAATGGTGAATCTCTAACTATCACTTTGATCTTGGCATCTAACACCACTGCTCTCTATGGTGATGCTTGTAGTATCGATGGCAACTCAGTTACAAATGGTGTTAAGTGGTCTGGAGGTTCACCACCAACACCAACCAACAACACGGATATTTTAACATTCGTAATGGTGAAAGATGGATCTGGAAATATCCAGGTATTTGGACAAGGTAACACAGACTTCAGCTGA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.