Protein

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Genbank accession
AZB66739.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MIHVMNFKGEIVDFISQSDNAVFPAVHKRDINERMETFDFTILSERTTYMQERNRIIIQDNDKQYREFIIDRISADIDGYTEVETVASYLEDITKARPYAPGKLEKMTTKQALSDVLKDTGWEVSDATEYGGLRTTSWTSYNTRYDVLLQLCTTYDMMADFYIEVGSNRVDKRFVVLRKRNPLFKGKEITYGKDLTGLKRTVDFSEIKTALLCVGPEPEEGKKRVELVVKDDESQAKYGLPGRYNWGIYEPETEDQNMTEKRLRTLGTTELNKRKSEVITYEVTAIDIEKEYKHEIVNLGDMVRIKNRDFTPPLYVEAEVISEEYDLISKDVTYGFGTYKEFKESDLRSSFDRKLDAIRQKVNDNFSNVNTIVKESLQGELQYFERKILKGNTPPDNPVNDLLWLDTSNPKVSVLRRYWNGEWIKSSAENASDVGAVTQEQAMYSDLSNTFVNLTVQHSRLMHDASVALESEYLVDTDIKVEVNNKLNDTIGVFNEIKQNLDSMTSETATIGKLVDTQALFLQYREKMQALYNTIENAKIAIDERFKLLQSQYTDEKFNEALNNVASKLGLTVNEDNQLVGEVDVSKQINESVREMTNEMLRDYVTSTEYQSDKNGIIERLNSADTERQQLSNEISDRVTLSEYNSGIDSTKQYADEQVNNLTLGNVNLIKSYHSPEYLKTATVEDDYSLLFSTSGKNINFFFYDSNGYTNTPLEANTDYILKLHEADENVEMGVFYNKGRNTIKTYTKDRVIRFNTADKVDFRILLIARDANVHAGKLSLYKGTKELDWTPNPEDVNAKIDQAKASAEKSSKAYTDDKVQQVNQTLSTHETRLTQNGKDIALRATQEELNASKKTLSRVIADLTVNTTTGLTMTYDENGAIQSHTIGPDGIKLKGDRVDITVNKDFNVLVNDVANKADETNIINKINLSREGLDINVNKIGIRGGNDVSYVDIRNDQIELSGEYTRTFRGDTQKDFVYTRIKDGLLRFRNNTRNRSLYYSDFGISTYVDGGPNESSGTLQFFDYTYSKNARGVTLNSVTGVVALRSDNNSIVIESSLTTNIESNNYSVYIRPFKQSRAGLNEFQFYVKDADSSSNTDGCILFGNLTDPNGVHGSGIRFSKSRTDNILYVTNPNGDIGTGDISVRAAEIRDYIRTIGMLEIRQWSDSKAFNQIKVGAVNTTNSVVMASHSGGNAYYGVGGGSNEMRVTNNNGYNGGNTSYKPVRASAFNNASLAEYKKDIKVWDYDALSVIANELELYQYRYKGDTDDQMLHRGVVIGAGYSTPAEFVFGDGVNLYEMLTWSLRSIQQLNEKIKELEEQLNEQTTS
Physico‐chemical
properties
protein length:1326 AA
molecular weight: 150280,38170 Da
isoelectric point:5,02294
aromaticity:0,09050
hydropathy:-0,60830

Domains

Domains [InterPro]
DC_0109
STR
1–793
DC_0109 DC_0203
IPR007119
Unmapped
28–333
IPR007119 Coil DC_0899 Coil
AZB66739.1
1 1326
Architecture
STR
RBD
STR 1-1098 | RBD 1200-1325 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage phiSP119-1
[NCBI] 		2491316 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AZB66739.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK075004.1 [NCBI]
CDS location
range 42022 -> 46002
strand +
CDS
TTGATCCATGTAATGAACTTCAAAGGTGAAATAGTTGATTTTATATCACAATCAGACAATGCAGTATTTCCAGCGGTTCATAAACGTGACATTAACGAGCGTATGGAAACATTCGATTTTACAATATTGTCTGAGCGCACAACTTACATGCAAGAACGTAATCGCATCATCATTCAAGATAATGACAAACAGTACCGTGAATTTATTATCGATAGAATTTCAGCAGACATCGACGGATATACCGAAGTCGAGACGGTCGCATCTTACTTAGAAGATATAACCAAAGCGCGTCCATATGCACCTGGTAAACTAGAAAAGATGACGACAAAACAAGCGTTATCCGATGTATTAAAAGATACAGGTTGGGAAGTGTCTGACGCTACCGAATATGGCGGGTTACGAACAACTTCGTGGACATCATATAACACACGATATGATGTGTTGTTACAACTGTGTACGACATATGACATGATGGCCGACTTTTATATAGAAGTTGGTTCAAATCGTGTGGATAAACGCTTTGTAGTATTACGCAAGCGCAATCCACTTTTTAAAGGTAAAGAAATAACATACGGCAAAGACTTAACAGGTTTGAAGCGTACTGTTGACTTTTCAGAAATCAAGACAGCATTATTGTGTGTCGGTCCTGAGCCGGAAGAGGGTAAAAAACGTGTTGAGTTAGTCGTTAAAGATGACGAATCTCAAGCAAAATACGGGCTACCTGGTCGATATAATTGGGGTATTTACGAACCTGAAACAGAAGACCAGAACATGACTGAAAAACGTTTGCGAACTTTAGGTACAACAGAACTGAATAAACGTAAATCAGAGGTCATCACTTATGAAGTAACTGCAATCGATATCGAAAAAGAGTATAAACACGAAATCGTTAATCTCGGTGATATGGTACGTATTAAAAACCGAGATTTTACACCACCTCTATATGTAGAAGCTGAAGTTATTTCAGAAGAATATGACTTAATCAGTAAAGATGTAACTTATGGCTTTGGTACGTATAAAGAATTTAAAGAAAGTGACTTGAGAAGCTCATTTGACAGAAAATTAGACGCTATTCGACAAAAGGTAAATGATAATTTTTCAAACGTTAATACGATAGTCAAAGAGTCGTTACAGGGTGAATTGCAGTACTTTGAACGTAAAATTTTGAAAGGTAATACACCGCCGGACAATCCAGTTAACGATTTACTGTGGTTAGACACGAGCAACCCTAAAGTATCTGTATTACGTCGTTATTGGAACGGTGAATGGATTAAGTCATCAGCCGAAAACGCTTCTGATGTAGGCGCTGTCACGCAAGAACAAGCGATGTATAGTGATTTAAGCAATACTTTTGTTAATCTAACTGTTCAACATAGTAGATTAATGCATGATGCGTCCGTAGCGTTAGAATCTGAATATCTTGTTGATACTGATATTAAAGTAGAAGTGAATAACAAATTGAACGATACTATCGGCGTGTTTAACGAGATAAAGCAAAACTTAGACAGTATGACATCAGAAACTGCAACAATTGGAAAACTTGTCGATACACAAGCGTTATTTCTTCAATATCGTGAGAAAATGCAAGCATTATACAACACGATTGAAAATGCAAAAATCGCAATTGATGAGCGTTTTAAGTTGCTACAATCACAGTACACTGATGAAAAGTTTAATGAAGCATTAAATAATGTAGCGTCTAAATTAGGGTTAACTGTTAATGAAGATAATCAACTTGTTGGAGAAGTTGACGTTTCCAAACAAATTAACGAATCCGTGCGTGAAATGACAAACGAAATGTTAAGAGACTACGTTACTTCTACCGAATATCAGAGTGATAAAAACGGTATTATAGAACGGTTAAATTCGGCCGACACAGAACGACAACAATTAAGTAACGAGATTAGCGATAGAGTTACATTAAGCGAATACAACAGTGGTATTGATAGTACAAAACAATATGCTGACGAACAAGTTAACAATTTAACTTTAGGTAATGTTAATCTTATTAAAAGTTATCATTCTCCGGAATATTTAAAAACAGCAACGGTTGAAGATGATTATAGCTTACTTTTTTCGACATCAGGAAAAAATATCAACTTCTTTTTCTATGACTCGAACGGCTATACAAATACACCGCTCGAAGCAAATACTGACTACATTTTAAAATTACATGAAGCTGATGAAAATGTTGAAATGGGTGTCTTTTACAATAAGGGACGTAACACTATTAAAACATATACAAAAGACAGGGTAATACGCTTTAACACAGCTGATAAAGTAGATTTTAGAATTTTATTAATTGCACGTGACGCAAATGTGCATGCTGGTAAATTAAGTTTATACAAAGGAACAAAAGAATTGGATTGGACACCTAATCCAGAAGATGTTAACGCTAAAATCGATCAGGCAAAAGCAAGCGCTGAAAAATCATCAAAAGCGTATACAGATGACAAAGTGCAACAAGTGAACCAAACACTCTCAACTCACGAAACACGCCTAACTCAGAATGGTAAAGATATTGCGTTAAGAGCAACACAAGAAGAGCTCAATGCTAGTAAAAAAACATTATCACGTGTGATTGCTGATTTAACTGTAAACACAACGACTGGATTAACGATGACATATGACGAAAATGGTGCGATTCAATCTCACACTATCGGTCCGGACGGTATCAAGTTAAAAGGTGATAGAGTAGATATTACAGTTAACAAAGACTTTAATGTGTTAGTAAATGATGTTGCGAATAAAGCTGATGAAACAAACATTATTAACAAGATAAATCTATCTCGCGAGGGGCTAGACATCAACGTTAATAAAATCGGTATACGTGGTGGTAATGATGTTTCGTACGTCGATATTAGGAATGACCAAATTGAATTAAGCGGTGAATATACACGCACTTTTAGAGGAGATACACAAAAAGACTTTGTGTATACAAGAATAAAAGATGGTTTGCTTCGTTTTAGAAATAATACACGCAATCGCTCGCTTTATTATTCAGATTTTGGTATATCGACATATGTTGATGGTGGTCCTAATGAGTCTTCGGGGACATTACAATTTTTTGATTACACATATAGCAAAAATGCTAGAGGTGTTACCTTAAATAGTGTGACTGGTGTCGTTGCTTTACGGTCGGATAATAATAGTATTGTTATTGAATCATCACTAACAACTAATATTGAAAGCAATAATTATTCGGTTTATATAAGACCGTTTAAACAATCGCGTGCAGGTTTAAATGAATTTCAGTTTTATGTAAAAGACGCTGATTCTAGTAGTAATACTGACGGTTGTATTTTATTTGGAAACTTAACTGATCCAAACGGCGTACACGGTTCTGGCATTCGCTTTAGTAAGTCGCGAACTGACAACATCTTATATGTTACTAATCCTAATGGGGATATTGGAACGGGTGATATTTCTGTAAGAGCTGCAGAAATAAGAGATTATATTAGAACAATCGGCATGTTAGAAATACGACAATGGAGCGACTCGAAAGCTTTTAATCAAATTAAAGTTGGAGCAGTTAACACAACAAATAGCGTTGTAATGGCTTCGCATAGTGGTGGTAATGCGTATTATGGTGTTGGTGGCGGAAGTAATGAGATGCGAGTTACTAATAACAACGGCTACAACGGAGGTAATACCTCGTACAAACCAGTTCGAGCATCAGCTTTTAATAACGCTTCATTAGCCGAATATAAGAAAGATATTAAAGTGTGGGATTACGATGCTTTGAGCGTAATTGCTAACGAATTAGAATTGTATCAATATCGATATAAAGGTGATACAGATGACCAAATGCTACACAGAGGTGTTGTAATTGGTGCAGGTTATTCTACACCAGCTGAATTTGTTTTTGGTGACGGTGTTAATTTATATGAAATGCTGACATGGTCGCTCAGATCCATACAACAGTTAAACGAAAAAATCAAAGAACTGGAGGAACAATTAAATGAACAAACTACAAGCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f50c3a9dc8ed8cae52fe9a03477fd94dd247ed06a82e5b1bfe0e9113540d29a4
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6156
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Prophage of Staphylococcus pseudintermedius Wipf,J.R.K., Deutsch,D.R. and Fischetti,V.A. 2014-10 — GenBank