Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D7SWT2 [UniProt]
- Protein name
- Structural protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MDINKVSHVSSYQTPQFIESEYPLFNKFIEYYYQSQEKTGLGQNIINNFLQYLDIDKLDIGILDGVTKVVDPVNVTDTTITVETVDPFLEKNGSILIGDEVIYYEETVSSPNIALTPGISYTQVQLKWVLLANNISLFDGVRRVFPLVSQDNPIGPSSPQHIIVKVYGKTLTPVVDYTVSGTNIVYTIAPRTATAADDTSTTSVTYLNGFSENTIVQIDDISSAFGDNKTTFELTVNSEKYEPIADEFLLAVYDDRLLVPKVDYFIDGSIFIFNVAPLNGRSLSLYSIEAPIPSFGSGAVGYSRVNDLGNISSVIPSTNGFGYRFDYPPKVSVNSSVGSGASVKTLVDGIKSVSLLSGGAGYSESNPPTVKVQFPTKEGYVEPTLKATVTNGAVSAIDIISSGSGYTFTPRITFEQPGGAVLAPPTIVGGSVSGAITITNGGQGYTTPPLVYIDEPTGLDGIKASFTTTLTDGEITAVNILNAGQGYETVPRISVIDPVGAQVLETVVDGDGRVISVELLFGGSGYTDVPSVYIVDNRQNDVGTYIGGTGATAVAAIFNGQITDINITNFGTGYSADNPPQIVIQKPVDAKASATVGLQEITGFSVLKAGKEYTKAQFLGCARAASGITDYTQDGNAVFSNSTTAAEASTDTSVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPTLDYSKIDVRTSIKTIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVTVSYPKDQIIKPSAATWSVDTVLRATLVSGLPENIQDGLLEQVADISDPNILAATALIENFISIQTAQDTIYELALSEETIEGTFVVPYKTKLAEPLNTTEGIITVDSTIGWPERNGEFVISSGVGSEVVQYKEKSLNQFIECTRSVNGVVEDWDSATQVSSNFNVFINRGTAQEVVLNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLLISKLGGTGTGPELTTWLYNVKKLIEVESIAFGGINNQSATVTCSNPHGLLVGDQVTIYGANPIIYNGSFLVTSRDSTTVFQYQLPQPANVVPQGNILVSIDLNKGKSDSSAVNNAISPYTTNVQNTFFNTTNTYIASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPITPVTISTKNLIVPGPIGTWVNGVSIWSYKSDVTKIFGAVTSIAINNAGNGYDAALPPAITISGGGGTGAAATATVNGSISEVTVTEGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGVVSSILVNSGGTGYTSQPSITVVGGGGSGAEGTAAVRGPIQSVAITNGGASYTSNPSIILSSGAGAVAQAIINDGRIISIAIISAGSGYTTAPEVTIQGDGFGAVARATIDVDGENAGKVTGIEIVNRGIGYSQGTTIINLNSVGQGASFLANVFQWTYNLQETTTVDSAKGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFANVNDQILEQDDQLGHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTNQSSSISRLRTSYRLKANLVYDEVTNPTPVRTDGPLLSEEIAGKFVEDYEYSFSLGDLDQYNGRFCKTPEYPTGRYCYFVTIDATEQGNPVFPYILGPSFNSVVDTWNLSTTAVQQNIPIGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNGLTLENGDILTFDVEDENRDGVISAEETADPDQIFEESPLQLFDYFPTVKLDSKVDIEVETITKFEDASITGFVVENAGINYQVDDRLIFDNTDTGGDGASARISRIKGETVSAYTFENVSGNNFGVLTTSVPHNLQVTDTVFVDYTPIMDNTNKTFVVRQFKGIENITIAQSGSGYNEDIPPTLVIDGDGVSGKLEAVVTSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVIISHPQVFKKAEYIVSKIENNENVKVNDIFVNNNKEIFICGKTLDSSGNSVAFVSKLSTTGVKEWEKTLELSTGTNYAEFQKLYVDGDDIWVVGVNRPNILVLDAYNPDIILVKYTQSDNGLSASLQFQKGYSGISGATRADNITCIKKYSDTRYVIGGFTNTNSGSPFDAFIALIDTAGSFAIKRKIASVNDSEKLTDIVVDEGNIYFTLETSNTNTDNNVNVAFGKATVGTNSIQVEYVNEYSNAGYSFLDSSLAIDEFKELYINATLRAKSDNVTRDSVWVGKVDTTGEFVWNYRYLAPGRDVNAVGKCAIDIFGDLNIAFNRVDNTTGLKTVDTVKIGYDGVLKNHTTNEFNEYRIEGITAHSIDVDNSGDVYVFGQTSWNRNEFLLEFTGGATTDTFGNYTPTFVGADATQSLHLDGGVAKIYGRDVATPANWENAYIEFPNSTLGNTLNENWTLEFMLYQNSASTDTHSQDQQTLVAIGDATDATGGLWLYYDRTAAGPSGYLELIVTNNTTSINSAGGAVQSSLTTMFADDTWQFIGLKKEDNLFTVYVNGISVITATVADTSFTSKKLYIGNIAGRNGTTGNWRSDEQGQYFVDNLKLRNRAITPTVPSDVSALPTSSAFGLSYSWTDTSWFDTYNNLHDYIDYSGWGVKVDKNADATRIGDQGIQLNTQLGYVRTAVTPVTGSALTIGSTGFALGSLGLQSLDFDDATTTMSEDTETLTYTKDIWSSRTATIPSPGSQKLIINAVVKDRYYFKVTDTVKIDNIQILTINQAFRFTVGTKLVLNDDSGSFINSGYITKVDNANNKVYLAINNNSWTNDLNTGQLSTSQFDEQSTYGIVGPIPLDINQIDSYTFAEVDNTTPGTFTIDLDKYNLDGTYNAAGSQNLDSFAKFKPYSDDDYSVRIDEISGSSTFIVGSVVTINGGDISYNAAYSTATITNLTGVLKITLVANLTKILRVTAVSNSDEVYVITDTRHYLTPGSMLNVDGNPSETVNTVVYDEYDGSFPVDTVISPLEFTYKLPQAAITSPATSASNVSIYIKSPVLKMYYGHQYLFDLSHSSMVGGNLSFSKDPLYKLEYSFNSIERVGTPGVTGEGATTPTVKFKVDEDVVTNISYYFDPSRVGDNDSPIIQGSYLDVVSSPYRGTFQVSGVAGATITRGADQIKFPLQNEPEGNADVSRASYSTSSRRAVGSIDNIRIVNPGGFYTRLPIVDSIQSTRQIERVTINEPGTEYAVGQYTGVSIAGDGEGGFVTITVADGTDAEGGAIPGQVQSVIVTSPGKGYTTATVDIDSVPGILGAGLTGSGAEVTVVIPPFGTAASIFTVGSSVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSVTVTDPGSGYSQAPAVIITGGGGTGAIAQSTIKNGRLDRIEVKDPGLGYSSTPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFSFPHGIAQGSAITLAVVDTGDGAEFPIAAGAVGRLNGVTTYYAISGAANSLEDDQLKFAITPANAALGDALSFTNAGTGRQQVLTTSFGGAATANVITSTFLEGEQVYQGSSFENATAFGFVSTNNGWQVGPRIVKIVDYTGEFNIGESVTGVISKSSGTISSLNIATGVLDVGSITETSGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINDWKDILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFVPNKETFFQLTKSVELARQATVPNIQSFALVEPVYTAFDNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGERISFPLQIDGSNVVANANQLMIILNGVVQTPDTSFEVQNDSIVFAEPPQPPASVKYVNVTIQPIQVYRFTVTNNSGIFPSTNNTVLGTQSGSRLTVTSVVGDDIFGFVAEGNVGIVTALDNATLTSGAGYTDGTYTEVATTSSGVGTGLTVNITVAAGAVTQVSINGAGVGYASSEVITIAGGTTSATIAVSTISGFNINELISVGATGFTATLTQITPIVNLNLFSFNEQIKNLTGKIAVVEEVNLETGDSVPLADLRYTVGAGTSSIELIDSDALTDTAVPASTFTVGANYQLGAEIVTVSAITVGPNSTTLTVTRGQLGTTATSHQEDLPLYGTDISVTNELALSKTVGTYQSKPGLFDIQLDDVIIGSQSGVVARITSTSAYQDPTTNEFIEQVNISDGSSFFGLLFNRLTSASYPNIILDNIAESQVNIVDFTDNTTNFDSKFPGTEFISNLVIPYDNTTGTFQENEIIRNYKLGYGNVTGVFNSSEDMVTKKLAFDSRVGSGFFQLGQVIRTQDTKGEVIGYNQALSTIYLGKVGRTLSTGEDYHKVTFNNNAQLDTDQSHYGLSSLLLDGTGDYLSIPTSTEFGFGTGAFTIECWIRPSSVTGTQQIFDFRTTAVEVSSELLLVGTNLNYRVNNSTTITGTATLAVDTWYHVAISRNASTTKLFVNGTQDGGDYSDGSNYGTTKPIIIGASYAFGDGFAGHIDEFRVSNTSRYQTTFTAPTGIFQGDANTKLLLHFEGDDTQTYIEDWSGGESFTDNEDFNNDAILKNWNENSTNLPAGFAGKSQRYYDAANLIESNKNFVAKEAVYLLTQQYPSLIIPGGNVNCEDDIRDILTAMIEDLRNGCNSHIWDASALYVDRTANPITISHVDTEVTETVWAYDKVKDILQYIINNTLWSVSGSHGVRQITDTTITDSSTSSFTTLQPSAISYNAATGDMVMTSNGHGLTTSNTIAIAAESLTFTCTSDGNERELIHPRKSDTRAYNQVLAITAADTNTFTVNVGASPAEQQYVHTFVSATSGAVTVLNYTTGDCADVYSTIGNLLDILTDTLEQANLGTPVDHLATITKVTTEYEFVGATVNAYLEVPFSTTYHSAASDILYTNRIDVAGRGRFRDASNLINANASVIVDKAAFDMLARYPDLAVDMPRNADGSSTDGTLRCKTDLGLILGAIAKDIYDGGNFFTVQAAKFYIGENDELRHIRLQVWQSVYAHDRLAYYAKQAVTGDLTYDNTDNIIVGDWGVTNDAGNCANVQSAIDTLVTTINDIIAPTSEDFNIAGDRLYFNREYIAEEITGLTAAYLTYQVDNTNQVAYTYDVAKCERDIKLLITAIISDLQTGGNNSTVDNMNLYLTANGELNYIEEELLPTVFAFEQIRSLGEKAIRNLLYDSGSTVSGQQYAAIFSDNTAYRD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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6376 AA molecular weight: 683638,44860 Da isoelectric point: 4,35912 aromaticity: 0,09818 hydropathy: -0,08904
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–435
ATT
1–435
DC_0832
ATT
417–548
ATT
417–548
IPR013320
STR
2258–2432
STR
2258–2432
G3DSA:2.60.120.200
STR
4161–4358
STR
4161–4358
PF13385
LEC
4162–4305
LEC
4162–4305
IPR006558
LEC
4181–4308
LEC
4181–4308
1
6376
Architecture
ATT 1-548 | ATT 709-1522 | STR 1523-1534 | STR 1637-2938 | ATT 3124-3690 | STR 3777-4066 | STR 4137-4623 | RBD 4624-4998 | STR 5044-5504 | RBD 5579-6375 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM12 [NCBI] |
1278402 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Brizovirus syn33 |
| Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO18150.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349321
[NCBI]
CDS location
range 53965 -> 73095
strand +
strand +
CDS
ATGGATATCAATAAGGTTTCACACGTCTCCTCTTATCAAACTCCTCAGTTTATAGAGAGTGAGTATCCCCTATTCAATAAATTTATTGAATACTATTATCAGTCCCAAGAAAAGACTGGATTGGGTCAAAATATCATTAATAATTTTCTTCAATATCTTGATATTGATAAATTGGATATTGGTATTCTTGACGGTGTTACTAAAGTTGTTGATCCTGTTAATGTAACTGATACCACAATCACTGTTGAGACTGTAGACCCCTTTCTTGAGAAAAATGGTTCTATTCTAATTGGTGATGAAGTAATTTATTATGAAGAGACTGTATCTTCTCCAAATATTGCATTAACTCCTGGTATTTCTTATACTCAGGTTCAACTTAAGTGGGTTCTGCTTGCCAACAATATTAGTCTCTTTGACGGTGTACGAAGAGTCTTTCCCTTAGTTTCTCAAGATAATCCTATCGGACCTTCTTCACCACAACACATTATTGTTAAAGTTTATGGAAAAACTTTAACTCCAGTAGTAGATTACACTGTTAGTGGAACTAACATTGTTTATACAATTGCTCCTAGAACGGCGACAGCGGCTGATGATACTAGTACTACTAGTGTTACATACTTAAATGGTTTTAGTGAGAATACCATTGTACAAATTGATGATATTTCTAGTGCTTTTGGTGATAATAAAACTACTTTTGAACTGACTGTTAATAGTGAGAAGTATGAACCTATTGCAGATGAGTTTTTACTTGCTGTTTATGATGATAGACTACTTGTTCCTAAGGTAGATTATTTTATTGACGGATCTATCTTTATATTCAATGTAGCACCATTGAATGGTAGATCTCTGTCCTTATATTCCATTGAAGCACCTATTCCATCTTTTGGTTCTGGTGCCGTTGGATATTCCAGAGTAAATGATCTTGGAAATATTAGTTCTGTAATTCCAAGTACAAACGGTTTTGGGTATAGATTTGATTATCCTCCCAAGGTTAGTGTAAATTCTAGTGTAGGTTCTGGTGCTTCTGTAAAGACCCTAGTAGATGGAATCAAGTCAGTTTCATTACTTAGTGGTGGTGCTGGATATAGCGAAAGTAATCCCCCTACTGTAAAAGTACAATTTCCTACAAAAGAAGGATATGTAGAACCTACTTTAAAGGCAACAGTAACTAATGGTGCAGTTAGTGCTATTGACATCATTAGTTCGGGTAGTGGATATACATTTACTCCTAGAATCACTTTTGAACAACCTGGAGGCGCTGTGCTTGCTCCCCCAACCATTGTTGGAGGATCGGTTAGTGGTGCTATTACTATTACTAATGGTGGTCAAGGATATACTACTCCTCCTTTGGTATACATTGATGAACCCACTGGACTTGATGGTATTAAAGCATCATTTACAACTACCTTGACAGATGGTGAAATTACTGCTGTTAATATTTTAAATGCTGGTCAGGGTTATGAAACAGTCCCTAGAATTTCTGTTATTGATCCTGTTGGAGCACAAGTTCTTGAAACTGTAGTTGATGGAGATGGTAGAGTTATTTCTGTCGAACTTCTGTTTGGTGGCAGCGGTTACACAGACGTTCCATCTGTTTATATTGTAGATAATCGTCAGAATGATGTTGGTACTTATATTGGAGGAACGGGTGCTACTGCAGTAGCAGCAATCTTTAATGGACAAATCACTGATATTAACATTACTAACTTTGGTACTGGTTATAGTGCAGATAATCCTCCTCAAATTGTAATCCAAAAACCTGTTGATGCTAAAGCATCTGCAACAGTTGGTTTGCAGGAAATTACAGGTTTTTCTGTTCTTAAAGCAGGAAAGGAATATACTAAAGCACAATTCCTTGGTTGTGCCAGAGCTGCTTCGGGTATTACTGATTATACGCAAGATGGTAATGCAGTATTCTCTAACAGCACTACAGCAGCAGAGGCATCAACAGATACCTCTGTAAAGTGTCTGGATGCATTGTTTATTAAAAGACTACTCGATAAGTATACTGAGCAGTTCTTACCTGATGTTCCTACACTTGATTATAGTAAGATTGATGTTCGTACATCTATTAAGACTATTAAAGACTTCTATTCTGCAAAGGGTACATCTTTCAGTATTGCATATTTGTTTAAACTTCTTTATGGAGAAACTGTTACAGTTTCATATCCTAAAGATCAAATTATCAAACCATCTGCAGCAACCTGGTCTGTTGATACGGTTTTACGTGCAACATTAGTTAGTGGTCTTCCAGAAAATATTCAAGATGGTCTTCTTGAGCAAGTTGCTGATATTTCAGATCCAAATATTTTAGCAGCAACAGCATTGATTGAAAACTTTATTTCAATTCAAACTGCCCAAGATACAATATATGAACTAGCACTTTCAGAAGAAACAATTGAAGGCACATTTGTAGTTCCATACAAAACAAAACTTGCTGAACCTCTTAATACTACAGAAGGTATCATCACTGTTGACTCTACTATTGGATGGCCAGAAAGAAATGGTGAATTTGTAATTTCGTCAGGTGTTGGTTCTGAAGTTGTTCAGTACAAAGAAAAATCACTAAACCAGTTTATTGAGTGTACTCGTTCTGTTAATGGTGTTGTAGAAGATTGGGATTCTGCCACTCAGGTATCGTCTAATTTTAATGTATTCATTAATAGAGGAACTGCTCAAGAAGTAGTATTGAATATTGTTGGTATTGTTGATGCTCAACAAACAACACTCACCGATACAGGTTCTTATTACTTACCAGGAGATAAACTGTTAATCTCTAAACTGGGTGGTACTGGAACAGGTCCAGAACTCACAACTTGGTTGTATAATGTTAAAAAGTTGATTGAAGTTGAATCAATCGCTTTTGGTGGAATTAATAATCAATCTGCTACTGTAACTTGCAGCAATCCTCATGGTCTATTGGTCGGAGATCAAGTTACAATTTATGGTGCAAATCCAATCATCTACAACGGATCTTTCCTTGTAACCTCTAGAGACAGTACTACTGTATTTCAGTATCAACTTCCTCAACCTGCAAATGTAGTTCCTCAAGGAAATATCCTTGTTTCCATTGACTTGAACAAAGGTAAGTCGGATAGTTCTGCAGTTAATAATGCAATTAGTCCTTACACAACTAATGTTCAAAATACTTTCTTCAATACTACAAACACTTATATTGCGTCTACAGGTATTCCAAACTACAATATTGGACCTTTCCCTGGATCGGCATTATTACCTGGCAACCAACGTAAATTGAATAGGTTTCCAATCACTCCTGTTACAATCTCAACTAAAAATCTGATTGTACCTGGTCCTATTGGAACATGGGTAAATGGTGTCTCTATTTGGTCCTATAAGTCTGATGTCACTAAAATCTTTGGTGCCGTAACGTCAATTGCTATCAATAATGCAGGAAATGGATATGATGCTGCACTCCCACCAGCAATTACGATTAGTGGTGGTGGGGGAACTGGAGCAGCAGCAACTGCGACTGTTAATGGTTCTATTAGTGAGGTTACAGTAACTGAAGGCGGTTCTGGGTACACTTCTTCTCCATTGGTATCTATTGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCAGCAACAGCAATTATTACAAAGGGTGTAGTTTCTAGTATTCTTGTCAATTCTGGAGGAACTGGATATACTTCCCAACCATCTATCACTGTTGTTGGTGGTGGAGGATCTGGTGCTGAAGGTACTGCAGCGGTTCGAGGGCCAATTCAATCAGTCGCCATCACTAATGGTGGGGCATCTTATACATCTAATCCTAGTATTATTCTTAGTTCTGGTGCTGGTGCTGTTGCACAGGCAATTATTAATGATGGACGTATTATTTCAATTGCTATCATTTCGGCAGGTTCTGGATATACTACAGCACCAGAGGTAACTATCCAGGGAGATGGTTTTGGTGCTGTTGCTAGAGCAACTATTGATGTTGATGGTGAAAATGCTGGTAAAGTTACTGGAATTGAAATTGTTAATAGAGGTATTGGATATAGTCAAGGTACGACTATTATTAACTTAAACTCTGTTGGTCAAGGTGCTTCTTTCTTAGCAAATGTATTCCAATGGACTTATAATTTGCAAGAGACAACAACCGTTGATAGTGCTAAGGGATCTGTATTTGAAGGATTTAATAATCAGTACGGTGGAGAATATGCACACCTTTCCAATCCTCAAAGACTTAGATACATTCTAGGCGACAATCTATTTGCTAATGTAAATGATCAAATTCTTGAACAGGATGATCAATTAGGACATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCTTATGGATATTCAGACCCTACCAATCAGTCTTCTTCAATCTCTAGATTGAGAACTTCTTATAGATTAAAGGCAAATTTAGTTTATGATGAGGTTACTAATCCAACTCCTGTTAGAACTGATGGACCTCTGCTATCAGAGGAGATTGCAGGTAAGTTTGTAGAAGATTATGAGTATTCCTTCAGTTTAGGAGATCTTGATCAATATAATGGTAGGTTCTGTAAGACTCCAGAATATCCCACTGGTAGGTATTGCTATTTTGTAACTATTGATGCTACAGAGCAAGGTAATCCAGTATTTCCATATATTCTTGGACCAAGTTTTAACTCGGTTGTTGATACCTGGAATCTTTCTACGACTGCTGTTCAACAAAATATTCCTATTGGTGTTGTTCGTTATCGCGATCCTTATGAAAATGTAGATATTGATGTTGAAAGAGCACCAAATGCATCTACTAATGGATTGACATTGGAAAATGGAGATATTCTAACTTTCGATGTAGAAGATGAAAATAGAGATGGTGTTATTAGTGCAGAAGAAACTGCAGATCCAGATCAAATATTTGAAGAGTCTCCATTACAACTATTCGATTACTTCCCGACAGTAAAATTAGACTCTAAGGTTGATATTGAAGTAGAAACTATCACTAAATTTGAAGATGCTTCAATTACGGGATT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