Protein

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Genbank accession
CAB4154161.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,70
Protein sequence
MATYSVNNITIDNELHFSDHFTEGYFLTINAEGVTYWVEGGANGTSGTSGAAGADGDRYHTTSNTSLTIASSGTASLITNDLYLDYSIAQSIIIAHDANNHMHASVVSYNQSTGELVYEMKNKTGSGTYTSWEINLDGAVGQAGTAGTSGVNGENGTSGLDGTSGSSGESGTSGIDGSSGTSGIDGTSGLDGTSGSSGIDGTSGSSGESGTSGVDGTSGSSGESGTSGIDGSSGTSGADGFNGINGTDGSSGTSGESGTAGSSGIDGTSGTSFTFNYIGVWTPASYVANTVAISPLDGNTYVSNQVTTNVYDDPSIDTTEWDLFVNAGTSGSSGVSGTSGESGTSGESGTSGIDGTSGLDGTSGSSGESGTSGLDGTSGSSGIDGTAGTSGVSGSYTYITEDTEAYTLDIFVFDIDNDSQIFITPSTIDITSGIAETKYGRGVEGSKFISSKITDPADPTRYDEIRLEPTGFQSADFGTMIQSNDGTNGLNSALGLSPNSMAMGNSDGSTSMSGNVQIINGVPSMVANGALGETRISLNTGNEGAIELLALNGIVISNGGAGEFTIPTTNGSEGQVLVTHGDGIMTWETPLTNPTFGSYSVSGAVTQDLSTDIVVNLTLTDDVVFDYSSAVTNRPYFFMVDAGTHSFRLGTSSTFKVPTSQTLITYLASGVSGLFKMSAVYNGDYLAIDYIPAYIDGYTPGDADATAFLIAAGITDPTISDAITSLVVGLKAYGLWTKMKAIYPFVGGNATAHKFNLKDPRDLDAAFRLVFGGGWTHASTGATPNGSNAYADTRLSPASLLSLDSTHLSYYSRTDIAEFGVEMGTNGGTYLLYNYNGYAFKALNRSQSNVGSLFTPTVGLLIGSRPNSSTEDYYHQGVLIDTLSISSGSLPSGNMYLGCYNSGGAAEFSTKETAWASIGDGLDATDADNLYTLVQDFQTTLGREV
Physico‐chemical
properties
protein length:945 AA
molecular weight: 96223,45050 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,08466
hydropathy:-0,18317

Domains

Domains [InterPro]
DC_1245
STR
40–190
DC_1245 IPR008160 IPR008160
IPR008160
STR
138–194
IPR008160 PTHR24637
DC_1819
STR
235–420
DC_1819
CAB4154161.1
1 945
Architecture
STR
STR
STR 40-194 | STR 214-420 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > Peduoviridae > Maltschvirus maltsch >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4154161.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796607 [NCBI]
CDS location
range 28680 -> 31517
strand +
CDS
ATGGCAACTTATTCAGTAAATAACATTACAATAGACAACGAACTACACTTTTCGGACCACTTTACAGAGGGATACTTCTTAACAATTAATGCTGAGGGTGTAACCTATTGGGTTGAAGGTGGAGCAAATGGAACATCTGGAACATCAGGTGCTGCGGGAGCAGATGGTGATAGATATCACACCACATCAAACACCAGTTTAACAATAGCATCAAGCGGGACTGCTTCATTAATAACAAATGATTTATACCTTGACTATTCAATAGCGCAAAGTATTATAATAGCACACGATGCTAATAATCATATGCACGCTTCGGTTGTTTCATATAATCAATCTACTGGTGAGTTAGTGTATGAAATGAAGAATAAAACAGGTTCTGGAACATATACATCTTGGGAGATTAATTTAGATGGTGCGGTAGGACAAGCAGGAACTGCTGGAACATCGGGTGTTAATGGTGAGAATGGAACGTCAGGATTAGACGGCACATCAGGTTCATCAGGTGAAAGTGGAACATCGGGTATTGATGGTTCATCAGGAACATCTGGTATAGACGGAACCTCTGGTTTAGATGGCACAAGTGGTTCATCAGGTATAGACGGCACAAGTGGTTCATCAGGTGAAAGTGGAACGTCTGGTGTTGATGGAACTTCTGGTTCATCAGGTGAAAGTGGCACATCAGGTATTGATGGTTCAAGTGGAACTTCTGGTGCTGATGGTTTTAATGGTATTAATGGAACAGATGGTTCGTCAGGAACAAGTGGTGAGAGTGGAACTGCTGGTTCATCAGGTATAGATGGAACATCAGGAACATCATTTACTTTTAATTATATTGGAGTTTGGACTCCAGCATCATATGTTGCTAACACAGTTGCTATATCTCCATTAGATGGAAATACTTATGTAAGTAATCAAGTAACTACAAATGTATATGACGACCCTTCAATAGATACAACTGAATGGGATTTATTTGTAAATGCTGGGACTTCTGGTTCATCAGGTGTTAGTGGAACAAGTGGTGAGTCAGGAACAAGTGGTGAGTCAGGAACATCAGGTATAGATGGAACCTCTGGATTGGATGGCACATCAGGTTCGTCAGGTGAGTCAGGAACTTCTGGTTTAGATGGCACAAGTGGCTCATCTGGTATTGATGGAACTGCCGGAACTTCCGGTGTTAGCGGCTCATATACTTATATTACAGAGGATACAGAGGCTTATACACTTGATATATTTGTTTTTGATATAGACAATGACTCACAGATATTTATAACACCTTCAACAATTGATATAACATCTGGTATTGCTGAAACTAAATACGGAAGAGGAGTAGAAGGTAGTAAATTCATTAGTTCTAAAATAACAGACCCTGCTGACCCAACAAGATATGATGAGATAAGATTAGAACCAACTGGCTTTCAATCAGCTGACTTTGGAACTATGATACAGTCAAATGATGGGACCAATGGTCTAAATTCAGCACTTGGACTATCACCAAACTCAATGGCTATGGGTAATTCGGATGGTTCAACAAGTATGAGTGGAAATGTGCAGATAATTAATGGTGTTCCATCTATGGTCGCTAATGGTGCTCTTGGAGAGACAAGGATATCACTTAATACTGGTAATGAAGGAGCAATAGAACTATTGGCACTAAATGGGATTGTAATCAGTAATGGTGGTGCTGGTGAATTTACTATACCAACAACAAATGGTTCAGAGGGACAAGTATTAGTTACTCACGGCGATGGTATTATGACTTGGGAAACACCACTAACTAATCCAACTTTTGGTTCTTACTCTGTAAGTGGTGCAGTTACACAAGATTTATCAACAGATATAGTAGTTAATTTAACACTAACAGATGATGTTGTTTTTGATTACTCATCAGCAGTAACAAACAGACCTTATTTCTTTATGGTGGACGCTGGAACACACAGTTTTAGATTAGGAACATCTTCTACATTTAAGGTTCCAACATCACAAACGCTTATTACTTATTTAGCGTCTGGTGTATCTGGATTGTTTAAGATGAGTGCTGTTTATAATGGTGATTATTTAGCAATAGATTACATACCAGCTTATATAGATGGTTATACACCAGGTGATGCTGATGCAACAGCTTTCTTAATAGCAGCAGGAATAACCGACCCAACAATATCGGACGCAATAACTTCACTTGTTGTTGGATTAAAAGCTTATGGTTTATGGACTAAGATGAAAGCAATATATCCATTTGTTGGTGGTAATGCTACAGCTCATAAGTTTAACTTAAAAGACCCAAGAGATTTAGATGCTGCTTTTAGATTAGTATTTGGTGGTGGATGGACTCACGCATCAACGGGAGCAACTCCAAATGGTAGTAATGCTTATGCTGATACAAGACTAAGCCCAGCAAGTTTATTATCATTAGATAGCACACACTTATCATATTATTCACGAACAGACATTGCAGAGTTTGGCGTTGAGATGGGAACCAACGGTGGAACTTATCTATTATACAATTATAATGGATATGCATTCAAGGCATTAAACAGATCTCAATCAAATGTTGGTAGTTTATTTACACCAACTGTTGGTTTACTTATAGGAAGCAGACCAAATAGTTCAACAGAAGATTACTACCATCAGGGAGTATTAATTGATACTTTAAGTATCAGTAGTGGTTCTTTACCATCAGGTAATATGTATTTGGGTTGTTATAATTCTGGTGGTGCTGCTGAGTTCTCAACAAAAGAAACTGCTTGGGCTTCAATCGGTGATGGTTTAGATGCCACAGATGCTGATAATTTATACACATTAGTTCAAGACTTCCAAACAACTCTTGGTAGAGAAGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9b239a550b75b1949f74e090f237a949e05046d9bfd5c79417f8011fb66772a8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2878
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50