Protein

Genbank accession
AFQ22285.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing protein [Pectobacterium phage My1]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MATKIIVQQVLPYEDSLTVSKYPKYTIQLATSIGGLTAAEMAGYVEQAQTAAEQADSSANTAQGFANSASTSATQAASSASTAAVNAVDAASAASSASDARDEVVAIKDDAIAAVNDAAEDIIEQVGESVTVAQNAAASALASATTATTKAAEASSSAISASNSRTIAQNSATSAQTSATTATTGANTATTKASEATTAATTATTAATTATTKAGEALASATTASTGATTATTKAAEASTSATTASTAATTATTASTSASASATSAQSAATTATTGATTATTKANEASASATTASTGAATATTKATEATTAATTATGRATAAANSATAALASQNAATEAATSAQTAAASVATAAEDVEEYATQAAASEVNSKASELAAHTSELNAKASELAAKTSETSAAVSAASADEDATTAAESATSAQTSATAATTAATTATTKAAEALASATSATESATTASDAATTATTGASEATNSATAAKESEDNAKDSEEAAVAASTTASSASTAAVNASTNATAKATEATEAATSATASSQQAANSATSAQTSATTATTKATEASASAVTATTGATTATTKATEASSSASNALASANAAQASATSASTSATAATNSATAAAAASNVATEAAADSLEYSNNSSDSATSAQTSADTATTKAAEALASANTATLGAQASDSSKVAAQAAQEAAEEAAASAANSAIIAGTRYPISQILDVSTFEAPTAATDSGVASGYGAKVTGNTGVAFGYKSISLQGTAIGYQASVTGTGITIGRGSVTSTGVTIGNTSSAGAGTSIGNNAKSVGGVSLGDTAESTDTGVAIGNNAKSGGTSLAFGTSSVSTGNGVAMGDGANAVDTGVSIGAGTYADEANTTVVGAYSGAYVPNSIIIGNNSFTNNAPDGIIIGSGSNSYGGTAIGNNVRAYGPKGIVIGANQHGYGQSISIGNQANVTYKNNEDGTDPSGGLQDYISYGIAIGASGSDYATADYPFDYGETVAYHNSIAIGTNSHARTKKVDYNAQAIALGFCANAYGNYSVAIGSYSTAGTYASGDNYDDAPVVSFGGGVGTTKVPTRRLINVTDPINPNDAATKAYVDANISGGGFEPISVLDFLEESSDTVELPFSMVGGGLTLSLKWVVTKSTDTVTCSLQRVGSSPAPSAPASMDIIYTRQSTPSSEGSISTIGRSIAGAMITVDTPSFEVFNIEGANVDSHVCTMHIKEGITQNNCMQFTMTITPYGSDNYRVLIWGIPTRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:1238 AA
molecular weight: 119823,04610 Da
isoelectric point:4,32035
aromaticity:0,03958
hydropathy:-0,06866

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pectobacterium phage My1
[NCBI] 		1204539 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFQ22285.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JX195166.1 [NCBI]
CDS location
range 79982 -> 83698
strand -
CDS
ATGGCAACTAAGATAATTGTTCAACAAGTTTTACCTTACGAAGATTCCCTAACAGTATCTAAGTATCCTAAATATACTATTCAGCTAGCTACTAGTATTGGAGGTTTAACCGCTGCTGAAATGGCAGGATACGTAGAGCAAGCCCAAACAGCGGCAGAACAAGCTGATAGCTCAGCTAATACTGCCCAAGGATTTGCTAACAGTGCCTCTACTAGCGCTACACAAGCAGCTTCCAGTGCAAGTACAGCGGCGGTTAATGCTGTTGATGCAGCTTCGGCGGCTTCTTCAGCATCAGATGCTAGAGACGAAGTTGTTGCGATCAAAGATGATGCTATAGCAGCAGTTAACGATGCTGCTGAAGATATCATTGAACAGGTAGGGGAATCAGTAACTGTAGCCCAGAACGCTGCTGCATCAGCATTAGCTAGTGCAACTACAGCAACTACTAAAGCTGCTGAAGCTAGCTCCTCTGCTATATCTGCATCAAATAGTAGAACAATAGCGCAGAATAGTGCTACAAGTGCTCAGACTTCCGCAACTACAGCAACTACAGGTGCTAACACTGCGACTACTAAAGCCAGCGAAGCAACTACAGCTGCAACTACTGCAACTACAGCTGCAACTACTGCAACTACTAAAGCAGGAGAAGCCTTAGCCAGTGCTACTACAGCCTCAACAGGTGCAACTACTGCAACCACTAAAGCTGCAGAAGCAAGTACATCTGCAACAACAGCTAGTACTGCTGCAACTACTGCAACTACAGCTTCTACCTCTGCTTCAGCAAGTGCTACTAGTGCTCAGTCTGCAGCTACTACAGCTACAACCGGTGCAACTACAGCTACTACTAAAGCTAATGAGGCTTCAGCAAGTGCTACTACTGCGTCAACAGGTGCAGCTACGGCTACTACTAAAGCTACAGAAGCTACTACGGCAGCTACTACAGCCACTGGTAGAGCTACAGCAGCGGCTAACTCTGCAACAGCTGCCCTAGCTTCTCAAAATGCAGCTACAGAGGCAGCAACTTCTGCACAAACAGCGGCAGCAAGCGTCGCTACAGCAGCGGAAGATGTAGAAGAATACGCAACACAAGCAGCAGCTTCGGAAGTAAACTCTAAGGCTAGTGAGTTAGCAGCGCATACATCAGAGTTAAATGCTAAAGCTAGTGAATTAGCAGCCAAAACTAGTGAAACTTCAGCTGCAGTATCAGCTGCCAGTGCTGATGAAGATGCTACTACTGCTGCTGAAAGTGCCACTAGTGCACAGACTTCAGCTACTGCTGCAACTACTGCTGCAACTACAGCAACTACTAAAGCTGCTGAGGCTTTAGCTAGTGCAACAAGTGCTACAGAGTCTGCTACTACCGCGTCTGATGCTGCTACAACTGCTACTACAGGAGCATCTGAGGCCACTAATTCTGCAACAGCAGCTAAAGAGTCCGAAGATAACGCTAAGGATAGTGAAGAAGCAGCCGTGGCTGCATCAACAACAGCTTCCAGTGCAAGTACAGCGGCGGTTAATGCTTCTACTAACGCAACAGCAAAAGCAACAGAAGCAACAGAAGCTGCAACATCTGCTACTGCAAGTAGTCAACAAGCAGCTAATAGTGCAACATCAGCACAAACGTCTGCAACTACAGCAACCACTAAAGCTACAGAGGCAAGTGCTAGCGCTGTGACAGCTACAACTGGAGCAACTACTGCTACTACTAAAGCTACAGAGGCTAGCTCTAGTGCATCAAATGCCTTAGCTTCTGCTAACGCTGCTCAAGCCTCTGCAACTTCAGCTTCTACTAGTGCTACAGCAGCTACTAACTCCGCAACAGCGGCAGCGGCAGCATCAAATGTGGCTACAGAAGCAGCAGCAGACTCTCTAGAGTACTCCAACAACTCTAGTGACAGTGCTACTAGTGCTCAGACTTCTGCAGATACTGCAACCACCAAAGCTGCAGAAGCGTTAGCTAGTGCCAATACTGCTACTCTAGGAGCTCAAGCATCAGACTCTAGTAAAGTGGCAGCTCAGGCGGCGCAAGAGGCTGCGGAAGAAGCGGCAGCTAGTGCAGCTAACAGTGCTATTATTGCTGGGACAAGATACCCTATTAGTCAGATTCTAGATGTATCTACATTCGAAGCTCCTACAGCAGCTACAGATAGTGGGGTAGCTTCCGGATACGGTGCTAAAGTTACGGGTAATACTGGTGTAGCATTTGGTTACAAGTCAATATCCCTACAAGGTACTGCTATTGGTTACCAAGCTTCTGTTACAGGAACAGGTATTACAATAGGTAGAGGATCTGTTACAAGTACGGGGGTTACTATTGGTAACACAAGCAGCGCGGGAGCAGGTACATCAATAGGTAATAACGCTAAGTCTGTTGGAGGCGTGTCCCTAGGAGATACTGCGGAATCTACAGATACAGGAGTTGCCATAGGTAACAATGCTAAGTCAGGTGGTACTAGCCTAGCATTCGGTACTTCCTCAGTTTCAACAGGTAATGGTGTTGCTATGGGGGATGGTGCTAATGCAGTAGATACAGGAGTTTCTATAGGAGCTGGAACATACGCTGATGAAGCTAATACAACTGTAGTAGGTGCATATTCTGGGGCCTACGTACCTAACAGCATCATTATAGGTAATAACTCTTTTACTAACAATGCTCCTGACGGTATTATTATAGGTTCTGGAAGTAACAGCTACGGTGGTACAGCTATAGGTAATAATGTTAGAGCTTACGGACCTAAAGGTATTGTTATAGGTGCTAACCAACACGGGTATGGTCAGTCTATATCTATTGGTAATCAGGCTAACGTGACATATAAGAATAATGAGGATGGTACAGACCCTAGTGGTGGACTACAAGACTATATTTCTTATGGTATCGCTATAGGTGCCTCTGGTAGCGACTATGCTACTGCAGATTACCCATTTGATTACGGAGAGACTGTAGCTTACCATAATAGTATTGCTATAGGGACTAATTCCCACGCTAGAACCAAAAAGGTTGACTACAATGCACAGGCTATAGCACTAGGATTTTGTGCAAATGCGTATGGTAATTATTCTGTAGCTATAGGTAGTTACTCCACAGCAGGTACTTATGCTTCTGGAGACAACTATGATGACGCTCCTGTTGTTTCATTTGGTGGGGGTGTAGGTACTACTAAGGTGCCTACTAGACGCCTAATAAATGTTACAGATCCTATTAATCCTAATGATGCAGCTACTAAAGCATACGTAGATGCTAATATAAGCGGTGGTGGGTTCGAACCTATTTCTGTGCTAGATTTCTTAGAAGAGTCTAGTGATACGGTAGAACTACCGTTTTCTATGGTAGGGGGAGGTTTAACTCTCAGTTTAAAATGGGTTGTTACAAAATCTACGGATACTGTGACGTGTTCTCTACAGAGAGTAGGTTCTTCCCCTGCTCCTAGTGCTCCAGCTAGTATGGATATTATATATACTAGACAGAGTACTCCGTCATCAGAAGGATCTATATCCACTATTGGTAGAAGTATAGCTGGAGCAATGATTACGGTAGATACCCCATCCTTTGAAGTATTTAATATAGAAGGTGCTAATGTGGACTCTCACGTTTGTACTATGCATATTAAGGAAGGTATAACCCAAAATAACTGCATGCAATTTACTATGACTATTACTCCGTATGGTAGTGACAACTATCGTGTTTTAATATGGGGTATTCCTACAAGAACTGCGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.