Protein

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Genbank accession
QDF13883.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MYSIKTDLDITGAGTVGKDLLVKGNAVFNNNLTVNGTVTFANATFTAIESSTANITSTLDVGGKATLSGGLGVEGNTTIGSAVVGSDTATINSNATFNGTVSVGSDFTQTAGTTTLQATKVKNLEVAETTAFKGNITADVGTTAAFDKITANTAEITNVSTTDISSTGTATFNDVTISGTLGGEFNLSDLNAVTLNVTGASNQQGAVTFGANVTGINSTATFKDIRIGSNSESQTFRLSFPYTAPGKRPTVILQNEIQSELMSPANLTVLTSASFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNNTQSPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGLLGGTFQLDDINAVSLNVTGVTSLVGGVTLGSNITGYNSTASFKAISLGQNSQDAAVKLGFGYTAPGQRPTVILPNEVQSEVVSPSTLNVLKTATFGNASLSTYGITGNGLNKLDYLTITGNETQAPGTPFLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVVAAANIKGATLESTGNTTVGAKLTVTGDIAGTTATLSGALSAGSVSSGSITGTTSVSAPTISASTEVTAPTITASGTVSGQTINGTNISATTLTAPTISGNTNFTENVDITGSLTVGSLDLSTTDINAKSITTTAGATIGGDLVVQGSFDLSAADLNVKSLTTSGIVKSNDLVNANVLPVLNSTTITATTVNADDITVTGSANLGTIYSSSSVLVGSTLTVTGETTTASLVTPTISNASGVTISNNTNVTGDLTVTGAVIPGSIDLATTDVNAKSITTTAGATIGGNLTVNGTVDLTTADVTVKSLTSTGAIVSNESTISSVLPKLQSTDATIATLGSTTANITNLNVTGASTVADVTSSGKVKAVSVETPTISNVDGVSISNNTSITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVSGTVDLSGADVSVKSLTSTGIITVSSAEGINVLPKVQSTEVTVSALNATNAVVSGDVSAATASISGAITGGSATLSGVGTALNVTNNATVGGVLTVGSITSAAENVSITKNTAITGNLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKTLTSLGDATVQGNLTVDGTINLSSANIVGVTLESTGSTTVGTDLILTTGNITGSPSISGNLGVTGTTTLTGATTVSNTLNTAGKLTVNAGGIQVVAGGIQVDSGTITASSANISGSSTLNSATVTTTLGVTGAASMNGGLTASTLDVTGDSTVQKLTVKGVFVPEGGLDLSGADLSVNSVTAATTLSVTGASTLTGGVSTSTVTASGKVTAQELSTGTLDVTTNGTVGGTLGVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTLDVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLASTDVVANSLSVATTLHSDGNATIGGTLGVTGAVSAPSIALNGEGAALAVTNNATIGGTLGVTGATTLGSLTTSGAVKTGADVIIGTKIGDQPETVQIFPNTYIAGSLRVDGGINADIDVSGQTIEPYAVVAADTISAAGNITSGAELISKSATIGDVGSQNNNLTINGNVVNNGNFTVTGLLNATLNQANSDVAVKSLTATNSVAAGTSITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITSGNLTVGGDISATGTATLAATSVTTITTSGAATLASASVTGAATIGGTLTVTGLMTANGSVVLGDAAADTLTVNATSSFKENAVFDKDVTVTGQLTTTNADLTTTTVTTKKYDVIPNQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKASSVYIYVKQDATGNRNFTTDGTYAVVDGTLNKTANSVTIYQVIYDGVSPVTDMFIAQRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:1841 AA
molecular weight: 180375,94810 Da
isoelectric point:4,14859
aromaticity:0,02933
hydropathy:0,24264

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
123–331
DC_0092 DC_0092 DC_0062 DC_0092 IPR058970
DC_0092
STR
307–595
DC_0092 DC_0092 DC_0931
QDF13883.1
1 1841
Architecture
STR
STR
STR
RBD
STR 123-857 | STR 876-1195 | STR 1263-1511 | RBD 1512-1841
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_phAPEC6
[NCBI] 		2588085 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QDF13883.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK817115 [NCBI]
CDS location
range 189072 -> 194597
strand +
CDS
ATGTACTCAATAAAAACTGACTTAGATATTACTGGTGCTGGTACGGTTGGTAAGGATCTTTTAGTCAAAGGAAATGCTGTTTTCAACAATAACCTAACTGTAAATGGTACTGTAACTTTTGCAAATGCAACTTTTACTGCCATTGAATCATCAACTGCCAACATTACATCTACTTTAGATGTAGGTGGCAAAGCAACACTTTCTGGTGGTCTTGGTGTTGAGGGTAATACTACAATCGGTAGTGCAGTTGTTGGGTCTGATACAGCAACAATTAATTCAAACGCTACCTTTAACGGTACTGTATCAGTTGGTTCTGATTTTACACAAACTGCTGGTACAACCACTCTACAAGCAACTAAAGTTAAAAACTTAGAAGTTGCTGAAACAACAGCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGATGTTGGGACTACTGCTGCATTTGATAAAATTACTGCTAATACCGCAGAAATTACTAATGTAAGTACAACAGATATTAGTAGTACTGGTACTGCTACATTTAACGATGTGACAATTAGTGGTACACTTGGTGGTGAGTTTAATCTATCTGACTTAAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGTGCATCTAACCAACAAGGTGCAGTAACTTTCGGTGCTAACGTAACTGGTATTAACAGTACTGCTACTTTTAAAGACATTCGTATTGGTTCTAACTCTGAATCACAAACCTTCAGATTAAGCTTCCCTTACACTGCTCCTGGTAAACGCCCAACTGTTATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGCTAATGTCACCTGCAAACTTGACAGTATTGACCTCTGCTTCTTTTGGTAATGCGTCATTATCTTCTTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACAATACACAATCACCAGACACACCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACTAAAGTTGCTGACTTTGAAGTAACCGGAACTGCAACTATTCCAAATATCGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATTAATGTTTCTGGTCTTCTTGGTGGAACGTTCCAACTAGACGATATTAATGCAGTATCTTTGAACGTTACTGGTGTAACTTCATTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAACAGTACTGCATCCTTTAAAGCTATCAGCTTAGGTCAAAATAGTCAAGATGCGGCAGTGAAACTAGGTTTTGGATATACTGCACCAGGTCAACGCCCAACAGTTATTCTACCTAACGAAGTTCAATCAGAAGTCGTTTCTCCTTCTACATTGAACGTTCTTAAAACAGCAACTTTCGGTAACGCTTCTCTTTCCACTTATGGTATTACTGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACTATTACTGGTAACGAAACACAAGCTCCAGGTACACCATTCCTACAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACTGGAACAGTAACTGGACTAACTGTTGATGTTAGTGGGCAGGATCTAACACCTAATTCTGTTGTCGCGGCAGCAAATATTAAAGGTGCAACACTTGAAAGTACTGGTAACACTACCGTGGGTGCTAAACTAACTGTTACTGGTGATATTGCTGGTACAACTGCAACTCTTTCTGGTGCATTATCCGCTGGTTCAGTAAGTTCTGGTTCTATTACTGGTACAACTTCTGTATCTGCACCAACAATTAGTGCATCTACTGAAGTAACGGCCCCTACTATCACTGCGAGTGGAACTGTAAGTGGGCAAACAATTAACGGTACTAATATTAGTGCAACAACTCTGACTGCACCAACTATTAGTGGTAATACTAACTTTACAGAAAATGTTGATATTACTGGTAGCTTAACTGTTGGTTCTCTAGACTTGAGCACTACCGATATTAATGCTAAATCAATCACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTGATTTAGTAGTTCAAGGCTCTTTTGATTTATCAGCAGCCGACCTTAATGTTAAATCATTAACTACTTCTGGTATTGTTAAAAGTAATGATCTTGTTAATGCTAACGTACTTCCAGTACTTAATAGTACTACCATAACGGCAACTACTGTTAATGCTGATGATATAACTGTTACCGGATCTGCTAATTTGGGTACAATTTACTCAAGCTCATCTGTTCTAGTTGGGTCAACTTTAACTGTAACTGGTGAAACTACAACTGCATCGTTGGTTACCCCAACCATTTCAAATGCAAGTGGTGTCACTATTTCCAATAATACAAATGTAACTGGTGACCTAACTGTTACTGGTGCAGTTATTCCAGGCTCTATCGATCTAGCAACAACTGATGTTAATGCTAAATCCATTACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTAACCTAACTGTTAATGGTACAGTAGATCTTACTACGGCTGATGTTACTGTCAAATCTTTAACTAGTACTGGTGCAATTGTTAGTAATGAATCCACAATTAGTAGTGTTCTACCTAAACTTCAAAGTACTGATGCAACTATTGCAACCCTTGGTTCAACAACTGCAAATATTACTAATTTGAATGTTACTGGTGCATCTACCGTAGCTGACGTAACTTCTTCAGGTAAAGTTAAAGCAGTTTCTGTAGAAACCCCAACAATTAGTAACGTTGATGGTGTATCTATTTCCAATAATACATCTATTACTGGTGACCTAACAGTTTCTGGTACAGTAACACCAGGTGCAATTGATTTGAGCACAACTGATGTAAGTGCAAAATCCATTACTACTACCGCTGGAGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTTGTTTCTGGTACAGTTGATTTAAGTGGTGCTGATGTATCTGTTAAATCTCTAACAAGTACTGGTATTATTACAGTTAGTAGTGCAGAAGGTATCAACGTTCTACCTAAAGTTCAAAGTACTGAAGTTACAGTGTCTGCTCTAAATGCAACAAATGCAGTAGTTTCTGGTGATGTTTCAGCAGCAACAGCTTCAATCTCAGGTGCAATTACTGGTGGGTCAGCAACACTATCTGGTGTTGGAACTGCTCTAAATGTAACTAATAACGCAACTGTTGGTGGTGTACTTACTGTTGGTTCTATTACTTCAGCGGCAGAAAATGTATCCATTACTAAAAATACCGCGATTACTGGTAATTTAGCAGTATCTGGAACACTAACTGCGGGTGTTATTGATCTTAGCACAACTGATGTGTCTGTGAAGACATTAACTTCTCTAGGTGATGCAACCGTTCAAGGTAACTTAACTGTTGATGGTACTATTAACCTAAGTTCTGCAAACATCGTCGGTGTAACACTAGAAAGTACTGGCTCCACTACCGTAGGTACTGATTTGATACTAACTACTGGTAACATTACAGGTAGTCCATCTATTTCTGGTAACTTAGGTGTAACTGGCACTACAACTTTAACTGGTGCAACAACAGTTTCAAATACATTGAATACTGCTGGTAAACTAACAGTTAATGCTGGTGGAATTCAGGTTGTTGCTGGTGGTATACAAGTTGATTCTGGAACTATTACTGCTTCTAGTGCTAATATTTCTGGTAGCTCAACACTTAATAGTGCTACTGTAACCACTACACTAGGTGTTACTGGTGCAGCAAGTATGAATGGTGGTTTAACTGCTTCTACATTGGATGTAACAGGTGATAGTACAGTACAAAAACTAACTGTTAAGGGTGTATTTGTTCCTGAAGGTGGTTTGGACTTATCCGGTGCTGATCTTAGTGTGAATAGCGTAACTGCGGCAACCACATTAAGTGTTACTGGTGCTAGTACTCTAACTGGTGGTGTTTCCACTTCAACTGTTACTGCATCCGGTAAGGTAACCGCACAAGAACTAAGTACTGGTACATTGGATGTAACCACAAATGGAACTGTTGGTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACTGTTGGATCACTAGATTCAGGTGCAATCTCTGCAACATCTGGTACATTTAGTACTACACTAGATGTGACTGGTGCAGCAACCTTTGGTAATAATGTTAACATTACTGGTACATTAACCCCAGGTGCATTGGATTTAGCTAGTACTGATGTAGTTGCTAACAGTCTTTCTGTAGCTACAACTCTACATTCAGATGGCAACGCAACAATTGGTGGCACATTAGGCGTAACTGGTGCAGTATCTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGTGCTGCGTTAGCAGTTACTAATAACGCAACAATTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCTACAACTTTAGGTTCTCTAACAACCTCTGGTGCAGTTAAAACTGGTGCTGATGTTATTATCGGTACTAAAATTGGCGATCAACCAGAGACAGTTCAGATTTTCCCTAATACTTACATTGCTGGCTCCTTGCGTGTAGATGGTGGTATCAACGCTGATATTGACGTTAGTGGTCAAACAATTGAACCTTATGCAGTTGTTGCGGCGGACACTATTAGTGCAGCGGGTAATATTACTTCTGGTGCAGAGTTGATTTCCAAATCAGCAACTATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACTTAACAATCAATGGTAACGTAGTTAACAACGGTAACTTTACAGTAACTGGTCTACTTAACGCAACACTAAACCAAGCAAACTCTGACGTGGCTGTTAAATCATTAACTGCAACCAACAGTGTTGCTGCTGGTACTAGTATTACCGCAGGTACAAGTATTACTGCAACTGGTCTACTAAAAGGGAACACCCTTGAAGTAACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACAATGTCAAGTGGTGCTAACATTACTGGAACCGTTGGAATTACTTCTGGTAACCTAACTGTTGGTGGTGATATTTCTGCAACAGGTACTGCAACCCTAGCAGCAACTTCAGTAACTACCATTACTACTTCTGGTGCAGCAACACTTGCTAGTGCATCTGTTACTGGAGCAGCAACAATCGGTGGTACTTTAACTGTTACTGGTTTAATGACTGCAAATGGTAGTGTTGTTTTAGGTGACGCTGCTGCTGATACATTAACTGTCAATGCAACATCTTCTTTCAAAGAAAATGCAGTATTTGATAAAGATGTAACTGTAACTGGTCAATTAACAACTACTAATGCTGACCTAACTACTACAACAGTAACTACTAAAAAATATGATGTTATTCCTAATCAAGTAACTTCTTCTGTTATCGCACCAACTGGTACTTGGACCCCAGACGGTACTAGCAACGTATACTTTATCACTCTAGATCAAGATACCACTCTAGCACCAATCACTGGTCTAATCGGTGGTGGTAAAGCATCTTCAGTATACATTTATGTGAAACAAGATGCAACAGGTAATAGAAACTTTACTACTGATGGTACTTATGCGGTTGTTGATGGCACACTGAACAAAACTGCAAACTCTGTAACTATCTACCAAGTCATTTATGACGGTGTGAGTCCAGTAACAGATATGTTTATTGCACAACGTACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
dfe2ffdaeda48d8ada6dbc37e02023c54476cbf0f52c17c5ffd23d229edbb924
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5210
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The 3D structure of jumbo coliphage phAPEC6 reveals an unusually high T = 28 triangulation number Tsonos,J., Wagemans,J., Holtappels,D., Hernalsteens,J.-P., De Greve,H., Estrozi,L., Bacia,M., Moriscot,C., Noben,J.-P., Schoehn,G. and Lavigne,R. 2020-04-28 — GenBank