Protein

Genbank accession
AFU63552.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein [Salmonella phage SPT-1]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDILKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSGTQNIQGDVNLLRLRNQNANNAQYIEGVDLDGSARWLVGISKNGSDAVQLYNNKYDSALTIASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLAVNNTFTGANTFTNLVVKKNANAITLQNTDAGTALYILGKKSDGTNKWYVGTDSDETRLNIYNYITGSQVSLGTTVGINKTLQINGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNTLNTFSVRQVINSDGEALALKAKTETTLFIRGWAADGTAKWYVGNGDADNNNNLRLFNYKTGKVLTIGSTFEMNATLAITGQVQPSDWSNIDARYYNKSSADNRYLRVRSTDFNTSGAGKWAKIATVNMPQGASTAVIELFGGAGFNFGLIDQACKTEIVLRTGDGNPKGLNVVAWKNSPNNDVSRIGYVNTSGDNYDIYCAVGNYLVATTARVQSTSNATVQLFEAPETSDNAPSGYVDGTIAHYYTSLLKPTPSDIGAYTKSETDQKIAQAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRVAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGRYGGDSIGGKPRVQVFGTEQVSSYDGAHSHTVSGTAASNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:839 AA
molecular weight: 89875,23880 Da
isoelectric point:8,13283
aromaticity:0,08343
hydropathy:-0,36257

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage SPT-1
[NCBI]
1198117 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFU63552.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JX181822.1 [NCBI]
CDS location
range 25784 -> 28303
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCGTCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATATTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGTCTTAAATTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGACGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACACATTCTCTGGGACTCAGAACATTCAAGGTGATGTTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATTGAAGGTGTAGACCTAGATGGCTCGGCTAGATGGTTGGTTGGTATTAGCAAAAATGGTTCTGATGCAGTGCAGTTGTACAATAACAAATATGACTCAGCTTTGACTATTGCAAGCAATATCTCTGTGAATAAGTCTCTAGCAATCACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGTTAATAACACTTTTACAGGTGCTAATACTTTCACTAACCTTGTTGTTAAGAAGAATGCTAATGCTATTACTTTGCAGAATACTGATGCAGGTACAGCACTTTATATTCTTGGTAAGAAGTCTGATGGAACAAATAAATGGTATGTTGGTACAGATTCTGATGAGACACGTCTGAATATTTATAACTACATTACAGGTTCACAGGTTTCACTAGGTACTACTGTTGGTATTAATAAAACCTTGCAAATCAATGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACAATTGCAAGAACTAATACTCTCAATACATTTTCTGTACGACAAGTTATCAACTCTGATGGTGAAGCTCTTGCGTTAAAAGCAAAAACTGAAACGACATTGTTCATTAGGGGGTGGGCTGCTGATGGGACAGCTAAGTGGTATGTTGGTAATGGTGATGCCGATAACAATAATAACTTAAGGCTGTTTAACTACAAAACAGGTAAAGTGCTTACCATTGGCTCAACATTCGAAATGAATGCAACTTTAGCAATCACTGGGCAGGTTCAACCTTCAGATTGGTCTAACATTGATGCGAGATACTACAACAAATCATCTGCTGATAACAGATATCTGAGAGTAAGAAGCACAGATTTCAATACTAGTGGTGCTGGTAAATGGGCTAAGATTGCAACTGTGAATATGCCACAAGGCGCATCAACAGCAGTGATTGAACTGTTTGGTGGGGCTGGATTTAACTTTGGCCTAATTGACCAAGCCTGTAAGACAGAAATTGTTCTTAGGACAGGGGATGGTAACCCAAAAGGCTTAAATGTTGTTGCATGGAAAAACTCACCGAATAATGATGTAAGTAGAATTGGGTATGTTAATACCTCTGGTGATAACTATGACATTTATTGCGCAGTTGGTAACTATCTAGTCGCTACAACAGCTAGGGTTCAGTCAACATCTAATGCAACAGTACAACTGTTTGAGGCTCCAGAGACATCTGACAACGCTCCATCTGGCTATGTTGATGGGACAATTGCTCACTATTACACTAGTCTCTTGAAGCCAACACCTTCAGATATTGGTGCATATACTAAATCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACCGCACTTCCTGGATTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTAGGTAGGACAATCAGGGTTGCAGCAGCTAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGCTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCTACTAACAACACTGGTGCTCATACACATACAGTTGGTGGTCGTTATGGTGGTGACTCTATCGGTGGTAAACCTCGTGTTCAGGTATTTGGTACAGAACAGGTATCTAGCTATGATGGTGCTCACTCTCACACTGTATCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAAACCATGCTCACACAGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.