Protein

Genbank accession
QTZ59847.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein [Shigella phage TB004]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHKNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIQYINESGDSKYWTFNRNGSFIVDNGSIEVRAGNISASGNINSATGFVSAPRVNTKNINLSSKTFIPNNDTGYDIVSLPTWVYNPPADGSDNTTNGLNYLRKLRASSASSIFHEIVDCRSGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDTTGRITAGKSISVGLPDSGTNGRYPLDSAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLMANGISTATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDIDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGRGRMSVSMAEGLIVEPGILDIKTGSNTLSLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKSIVWEGGTRPGQNKSYVTVKAWGNAFNASGDRNRETVFEVADGQGYHFYSQRVAPAPGSTVGPIQLRVNGGLLTSGSIVASGSITTESSLSVNNGMSVNGELKVGGTADNFRIWNAKYGAIFRRSEDSLYIIPTPINQGESGGITDIRPFSINLGTGSVVMGNHAQAGKNLFTVDNVSKLVQTDVRFRVNMDSDGIVLNASSQAASNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRLHNYTYSHGIALNSDSVDITKPLKVGNAQLRTDGNITNGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQSTSTVFFKIVGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPSDLNAVLYTRTTGMYSAAFRNIAVNNVSGNTYDIYVYAGTYCNQLVCEWSCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVNGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINSQTGIRIRSNGDKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVMMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKTPGGANRFVVNNATVGGVTQINSFGINTSNSLGGNSITFGDNDTGIKQNGDGLLDIYANSAQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSARVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1254 AA
molecular weight: 134612,08240 Da
isoelectric point:8,46581
aromaticity:0,08612
hydropathy:-0,31372

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage TB004
[NCBI] 		2829145 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QTZ59847.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW822011.1 [NCBI]
CDS location
range 24034 -> 27798
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACACTTTTTACTAAAGATGATTCGGGAAATATCATTGACTTAAGCATTTCCGCTGGCGGTAATATCAGTGGTAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCTGGTAATGGTGCTTGGGCAAACCAACATAAAAATAAAGCTCCTATCTTTACCGATTTGAGTTCAACGACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAAATTCAATATATCAATGAATCTGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAATCGTAACGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAGTATTGAAGTCCGTGCAGGTAATATTTCTGCATCAGGCAATATTAACTCGGCAACTGGATTTGTTTCTGCACCGCGCGTCAATACAAAAAATATTAACCTGAGTTCTAAAACCTTTATACCGAATAATGACACGGGTTATGACATTGTTTCTTTACCTACCTGGGTTTATAACCCACCGGCAGATGGTTCCGACAATACTACAAATGGATTGAACTATTTGCGTAAATTACGTGCATCAAGTGCATCAAGTATTTTCCATGAAATTGTTGATTGTCGTTCGGGAAAACCACAAGAAATTTCTTGGTGGACCGGCGTAGGACCTTCGTCTTTCCAGTGGGCATTTGATACCACTGGACGTATTACCGCAGGTAAATCTATTTCAGTAGGTCTTCCTGATAGTGGTACAAATGGCCGTTATCCACTTGATTCTGCAATTTCTATTGGTATTGCGATTGGCGATAACGATACCGGTATTAAATGGGTCCGCGATGGCGTTATTGACTTAATGGCTAACGGTATTTCAACCGCTACCATTTTGAATAATGGTATTAATAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCACGCACCGATATTGATGGTAATAATAACGGCGATGGTCAAACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGCCGGGGCCGTATGTCAGTTAGTATGGCAGAAGGTTTAATTGTTGAGCCAGGTATTTTAGACATTAAAACTGGCTCAAACACATTATCTTTACGAGCCGACGGTACAATCGCTTCTGTTCAAACATTAAAACTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGACGGCACTAAATCTATAGTGTGGGAAGGCGGTACCCGCCCAGGTCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATGCATTTAACGCATCTGGTGATCGTAATCGTGAAACCGTTTTTGAAGTAGCTGATGGGCAAGGTTACCATTTTTATTCTCAACGCGTAGCTCCTGCACCTGGTTCGACTGTCGGCCCTATTCAACTCCGAGTTAATGGTGGTTTATTGACTTCAGGCAGTATTGTTGCTTCTGGTTCTATTACAACCGAATCTTCTTTGAGTGTTAATAATGGCATGTCAGTAAACGGCGAATTAAAGGTCGGTGGCACCGCAGATAACTTCCGTATTTGGAACGCTAAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGATTCCTTGTATATAATTCCTACACCCATTAACCAAGGCGAAAGCGGTGGAATAACCGATATAAGACCATTCAGTATTAACCTTGGAACTGGCTCCGTTGTAATGGGTAACCATGCTCAAGCGGGTAAAAACCTTTTCACGGTTGATAACGTTTCTAAATTAGTACAAACTGATGTTCGTTTTCGTGTTAACATGGATTCCGACGGTATTGTTTTGAATGCTTCTTCTCAAGCAGCGTCTAACTTTATCCAAGGACGTAAGGCTGATGTGCCTAAATGGTATTTGGGTATTGGTGACGGTGGTAACGTTGTTCGTTTACATAACTATACCTATTCCCACGGTATTGCATTAAACTCTGATTCTGTCGATATTACTAAGCCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAAGAACTGACGGTAATATTACCAATGGTTCAGGAAACTTTGCCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACTGCTGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCAACAGTCTTCTTTAAAATAGTTGGAGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACCCAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTTCTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAACTGGAATGTATAGCGCAGCATTTAGAAATATTGCAGTTAACAATGTCTCTGGAAATACATATGACATTTATGTTTATGCTGGAACATATTGTAATCAACTAGTTTGTGAATGGTCATGTACCGAAAATGCTACTGTTAGCGTTATTGGTATTAACTCATCTACGCAGTCGCCTGTAGATGCTCTCCCAGATACAGCAGTTAACGGTCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGTGGTAAAGTTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAGCCAAACCGGTATTCGTATCAGAAGCAATGGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCGGCAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACTGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTTGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGATGATGAATAATGGCATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAACGGTTCTATTAACTTTGATAAATCAGGTGCTAACCCGAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGCGGTAACCGCATTGAAATTGCAGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAGACTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTGGGTGGTGTTACTCAAATAAATTCATTTGGTATTAACACATCAAACTCTCTTGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATAATGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAGCGCACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATACAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAACCTATCGAAAACGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTGCAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTGCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.