Protein

Genbank accession
AER41421.1 [GenBank]
Protein name
minor capsid protein
RBP type
TSP

evidence: RBPdetect

probability: 0,7496

Protein sequence
MLRSITNTFLALLLFITLFLSLFPFNANAEIECQIGISSGSVNWSGELFGDKPYTCVRTCRYNLATVSLCFVNNATCHGEFISTGQNCFLENGQIDPSDGLRFGGNTVIADPSADPNKPWDPNEPSTMPNKVQNVLNQMPRDTSSGVDQAKALKSVAHIEGMGVIALDELVKKNSEILDVTKGFSSQISSMTSAINSMSNWSQHIEANTLISSQQSQLTTNTLANILNKLNESGGGSGGGSGLPDSQFNSFMTSMSTTRSMISSNANNIVSAVRDVREAVRPVEFGINAVNEKLQLVNENLAGLSEGLFYTMEDNTNKIVSAINANGGGSGGGDTDLSGLQSGIDSIKTGIDNLNGLLGGNGLDKPSVGSGVDFAQLPLYGDDALTSLNTQITDLQKEYSDKIKEFKKLFSFDISKLEGGQYKDHSLNFQFANGSANSFTSGVFPALVDNAGLISSVILFLAVFAGIRTIMGERE
Physico‐chemical
properties
protein length:475 AA
molecular weight: 50625,09710 Da
isoelectric point:4,69993
aromaticity:0,07158
hydropathy:-0,12105

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage VCY
[NCBI] 		1105327 Viruses > Monodnaviria > Loebvirae > Hofneiviricota > Faserviricetes
Host Vibrio cholerae
[NCBI] 		666 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Vibrionales > Vibrionaceae > Vibrio

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AER41421.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN848801.1 [NCBI]
CDS location
range 2437 -> 3864
strand +
CDS
ATGCTGCGTTCAATCACTAATACCTTTCTTGCTTTACTTTTGTTTATTACCCTTTTTTTATCTCTTTTTCCTTTCAACGCTAATGCTGAAATTGAGTGCCAGATTGGCATCTCTTCCGGTTCTGTCAATTGGTCGGGTGAATTGTTTGGTGATAAGCCTTACACTTGCGTTCGCACTTGTCGTTATAACTTAGCTACTGTCTCCCTTTGCTTTGTTAACAATGCTACTTGTCACGGTGAATTTATTTCAACTGGACAAAATTGTTTTTTGGAAAACGGCCAAATTGACCCTAGCGACGGTTTACGCTTTGGTGGTAATACTGTTATTGCAGACCCAAGCGCTGACCCTAACAAGCCTTGGGATCCAAACGAACCCTCTACCATGCCTAATAAAGTTCAGAACGTTCTGAACCAAATGCCTAGAGACACCTCCAGCGGTGTTGACCAAGCCAAAGCTCTAAAAAGTGTTGCTCATATAGAGGGCATGGGTGTTATTGCACTTGATGAGCTTGTAAAGAAAAATTCTGAAATACTCGATGTAACCAAGGGCTTTTCTAGTCAGATTTCCTCTATGACTAGCGCCATTAATTCTATGAGTAATTGGTCACAACATATTGAGGCCAATACCCTAATCTCTTCACAGCAATCCCAATTAACCACTAATACTCTTGCCAACATTCTTAATAAATTAAATGAGTCTGGCGGCGGCTCTGGTGGCGGCTCTGGTCTTCCTGATTCGCAATTCAATTCTTTTATGACTTCCATGTCTACGACTCGTAGCATGATTAGTTCTAACGCTAATAACATCGTTAGCGCTGTTCGAGACGTTCGCGAGGCGGTTCGACCTGTTGAGTTTGGTATTAATGCCGTAAATGAAAAGCTTCAACTTGTTAACGAAAACCTAGCAGGTTTAAGTGAGGGCTTGTTTTATACCATGGAAGACAACACGAACAAGATTGTCTCTGCTATTAACGCCAATGGTGGCGGCTCTGGTGGTGGTGACACTGATTTATCTGGTCTCCAATCCGGTATTGATTCTATTAAGACGGGTATTGATAACTTAAATGGTCTCTTGGGTGGTAATGGCTTAGATAAGCCTTCTGTTGGTTCCGGTGTTGATTTTGCTCAGCTTCCTCTCTATGGTGATGACGCTTTAACTTCTCTAAATACTCAAATTACAGATTTACAGAAAGAATATTCAGATAAAATTAAGGAATTTAAAAAGCTCTTTTCATTTGATATTTCTAAGCTTGAAGGGGGTCAATATAAAGACCACTCCCTAAATTTTCAATTTGCTAATGGTTCTGCTAATTCTTTTACATCAGGTGTCTTTCCTGCTCTTGTCGATAATGCCGGATTAATTTCATCTGTTATTTTATTCTTGGCGGTTTTTGCAGGGATTAGAACGATTATGGGGGAGCGTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 117038

Method: ESMFold

Resolution: 0,5530

Evidence: 0,5468

Literature

No literature entries available.