Protein

Genbank accession
AFE88072.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure protein [Lactococcus phage ASCC532]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MSLDNFKNRTIIWDTVNKDFPQPIQIMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTETGVIEANLILLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVSDLAQEVNNNIDDFTKLLLENMPQVMRSELNDLHIKTDSNTSNIERKANLADVTNLRNTVNSQGIEISTLENKVSALSSGVPKEVSLVSSMTDKTKNYVYTGTEPGYTPGNWYYWNGTIWAPGGTYQATAIDLDVDGIRSFTPSKTTGAINPFNGTITTTEGVVYYTVDVSNGAEKLTFYSESFGSNYGYAFYNGSGEFIPGTGQLEKFEGYQTIDVPVSATTFRVTSRLETNQNVTLFKANSSVQKNAKNINDNFVKSYGNKKLLKSKDYQHAPLLISSTTGRWVKVNNSSAVLIPISDVGKAVKIMSNALNSSSYTFLKTATGNSGDLADFATSYKGIKKLSVGEYATLQVPSDAGFLYVTNSFDDGSIHDVYPKVTPMLDTIVTVAASNSSALDKSRADYVATGANDQDVINQAITSLVYGGTIKLFDGDYNIDAFGDTKTAIYFPNNGYARTINFEGSTENKSFLSENGVTIHVTKTAFDSLPTTGDYNVFAGDGTTLPIGVWQGFANNVNFKNFYLKLYTSQRQMVGINGQNFGSMYIEQVGVYSESYFTDRFNRYKPVTPVINSIGIISVGGANDEMARIGMDTVNVGGLGTGIIIARAEHLIVKNSTVSRSVIGYKFSGNADKPLTLINNADEGNTHLPVFAGTGLITSIDFSIERLDPGVFPNDPSGDTNPLAKELTPGGWKGTFDYNIQGSGAGINHFWQSGSGRNIKTKKISSEISGTVNPSNPEYLQEFFRTDLNKKLTFNGNSWVDSIGNIV
Physico‐chemical
properties
protein length:888 AA
molecular weight: 96727,67620 Da
isoelectric point:5,06676
aromaticity:0,09910
hydropathy:-0,28446

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage ASCC532
[NCBI] 		2892351 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFE88072.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ740813.1 [NCBI]
CDS location
range 7263 -> 9929
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAAAAATAGAACGATTATATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAATAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGTTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAGGGAGAGTTTATTTTAGTAATTCCTACCGAAATGACAGAAACTGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAGGTTATCGTCAGCAAGAACCTTACGTTTATATCAGATAATTCGACAGTTTCTGATTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAATATTGATGATTTTACAAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTAATGCGTAGTGAGTTGAATGATTTACATATTAAAACTGATTCAAATACGAGCAATATTGAGCGTAAAGCAAATTTAGCTGATGTGACTAACTTACGAAATACCGTTAACAGTCAAGGTATTGAAATTTCAACGCTTGAAAATAAAGTATCCGCTCTTTCGAGTGGTGTACCAAAGGAAGTTTCTCTAGTTTCTAGTATGACCGATAAAACCAAAAATTATGTTTATACTGGTACTGAACCTGGATACACTCCTGGAAATTGGTACTACTGGAATGGTACAATTTGGGCACCAGGAGGTACATATCAAGCCACTGCGATTGATTTAGATGTTGATGGAATTCGGAGCTTCACTCCATCTAAAACTACTGGGGCTATTAACCCATTCAATGGAACAATTACAACAACGGAAGGTGTCGTCTATTACACGGTGGATGTTTCAAACGGGGCTGAAAAATTGACTTTTTACTCAGAAAGTTTTGGATCGAACTATGGATACGCATTTTATAACGGCAGTGGGGAGTTCATTCCCGGTACCGGACAGTTAGAAAAGTTTGAGGGCTATCAAACGATTGACGTTCCTGTTTCAGCCACTACATTCAGAGTTACGAGTCGACTTGAAACTAACCAAAATGTGACGCTATTTAAAGCTAATTCTTCAGTTCAAAAAAATGCTAAAAATATTAATGATAATTTTGTGAAAAGTTATGGTAACAAAAAATTACTAAAATCAAAAGACTATCAGCATGCCCCATTGCTAATTTCTTCAACAACGGGTAGATGGGTGAAAGTAAACAATTCAAGCGCAGTGCTTATTCCAATTTCAGATGTTGGGAAAGCTGTGAAAATCATGTCAAACGCGTTAAATTCGTCATCTTACACTTTTTTGAAAACTGCAACTGGAAATTCTGGTGATCTTGCTGACTTTGCGACCAGTTATAAGGGCATCAAGAAGTTAAGTGTTGGCGAATATGCCACATTGCAAGTACCAAGTGATGCCGGTTTCTTGTATGTTACAAATAGTTTTGATGACGGCTCAATCCATGATGTCTACCCCAAAGTTACACCAATGTTAGACACCATTGTTACGGTCGCTGCCTCAAACTCATCGGCGCTGGATAAGTCAAGAGCTGACTATGTGGCGACCGGTGCGAATGACCAAGACGTGATTAATCAAGCAATTACATCCTTGGTATATGGTGGAACTATTAAATTATTTGATGGAGATTACAACATAGATGCATTTGGCGACACAAAAACTGCTATTTATTTCCCTAACAATGGCTATGCACGAACCATCAACTTTGAAGGCTCAACTGAAAACAAGAGCTTCCTTTCAGAAAATGGGGTCACCATTCATGTTACTAAGACGGCATTCGACAGTTTGCCAACGACTGGCGACTACAATGTGTTTGCTGGCGACGGCACTACACTTCCAATCGGTGTTTGGCAAGGATTTGCTAATAATGTTAATTTCAAGAATTTCTATCTGAAATTGTACACCTCCCAACGGCAGATGGTTGGAATTAATGGTCAAAACTTCGGATCAATGTACATCGAACAAGTTGGTGTCTATTCCGAAAGTTATTTCACTGATCGCTTCAATCGCTATAAGCCAGTTACCCCTGTTATTAATTCAATCGGCATCATCTCTGTCGGTGGCGCAAACGATGAGATGGCACGAATTGGAATGGACACGGTGAATGTTGGTGGTCTTGGTACAGGTATCATCATCGCACGAGCTGAGCATTTGATTGTTAAGAATTCAACAGTATCACGCTCTGTGATTGGCTATAAATTCTCCGGCAATGCTGATAAGCCGTTAACATTGATTAATAATGCTGACGAAGGCAACACGCATTTGCCAGTATTTGCGGGTACTGGATTAATCACATCAATTGACTTTTCAATCGAGCGACTTGATCCAGGAGTGTTCCCCAATGATCCTTCTGGTGATACTAATCCATTAGCCAAAGAGTTAACTCCTGGCGGTTGGAAAGGGACGTTTGATTATAATATTCAAGGTTCGGGGGCTGGAATTAATCACTTTTGGCAGTCTGGCAGTGGACGCAACATTAAAACTAAAAAAATTAGTTCGGAAATTTCTGGCACGGTTAATCCATCTAATCCGGAATATTTACAAGAATTCTTTAGAACAGATTTGAACAAGAAACTAACATTCAATGGGAATAGTTGGGTTGATTCAATTGGTAATATAGTTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.