Protein

Genbank accession
AFE86636.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure protein [Lactococcus phage ASCC473]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MSLDNFKNRTIIWDTVNKDFPQPIQIMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTETGVIEANLILLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVSDLAQEVNNNIDDFTKLLLENMPQVMRSELNDLHIKTDSNTSNIERKANLADVTNLRNTVNSQGIEISTLENKVSALSSGVPKEVSLVSSMTDKTKSYVYTGTEPGYTPGNWYYWNGTIWAPGGTYQATAIDLDVDGIRIFTPSKTTGAINPFNGTITTTEGVVYYTVDVSNGAEKLTFYSESFGSNYGYAFYNGSGAFIPGTGQLEKFEGYQTIDVPVSATTFRVTSRLETNQNVTLFKANSSVQKNAKNINDNFVKSYGNKKLLKSKDYQHVPLLISSTTGRWVKVNNSSAVLIPISDVGKAVKIMSNALNSSSYTFLKTATGNSGDLADFATSYKGIKKLSVGEYATLQVPSDAGFLYVTNSFDDGSIHDVYPKVTPMLDTIVTVAASNSSALDKSRADYVATGANDQDVINQAITSLVYGGTIKLFDGDYNIDAFGDTKTAIYFPNNGYARTINFEGSTENKSFLSEYGVTIHVTKTAFDSLPTTGDYNVFAGDGTTLPIGVWQGFANNVNFKNFYLKLYTSQRQMVGINGQNFGSMYIEQVGVYSESYFTDRFNRYKPVTPAINSIGIISVGGANDEMARIGMDTVNVGGLGTGIIIARAEHLIVKNSTVSRSVIGYKFSGNADKPLTLINNADEGNTHLPVFKGTGLITSIDFSIERLDPGVFPNDPSGDTNPFAKELTPGGWKGTFDFNIQGSGAGINHFWQSGSGRNIKTKKISSAISGTVNPSNPEYLQEFFRTDLNKKLTFNGNSWVDSIGNIV
Physico‐chemical
properties
protein length:888 AA
molecular weight: 96734,84080 Da
isoelectric point:5,18311
aromaticity:0,10135
hydropathy:-0,26396

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactococcus phage ASCC473
[NCBI] 		1165152 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFE86636.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ740805.1 [NCBI]
CDS location
range 7264 -> 9930
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAAAAATAGAACGATTATATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAATAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGTTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAGGGAGAGTTTATTTTAGTAATTCCTACCGAAATGACAGAAACTGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAGGTTATCGTCAGCAAGAACCTTACGTTTATATCAGATAATTCGACAGTTTCTGATTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAATATTGATGATTTTACAAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTAATGCGTAGTGAGTTGAATGATTTACATATTAAAACTGATTCAAATACGAGCAATATTGAGCGTAAAGCAAATTTAGCTGATGTGACTAACTTACGAAATACCGTTAACAGTCAAGGTATTGAAATTTCAACGCTTGAAAATAAAGTATCCGCTCTTTCGAGTGGCGTACCAAAGGAAGTTTCTCTAGTTTCTAGTATGACCGATAAAACCAAAAGTTATGTTTATACTGGTACTGAACCTGGATACACTCCTGGAAATTGGTACTACTGGAATGGTACAATTTGGGCACCAGGAGGTACATATCAAGCCACTGCGATTGATTTAGATGTTGATGGAATTCGGATCTTCACTCCATCTAAAACTACTGGGGCTATTAACCCATTCAATGGAACAATTACAACAACGGAAGGTGTCGTCTATTACACGGTGGATGTTTCAAACGGGGCTGAAAAATTGACTTTTTACTCAGAAAGTTTTGGATCGAACTATGGATACGCATTTTATAACGGCAGTGGGGCATTCATTCCCGGTACCGGACAGTTAGAAAAGTTTGAGGGCTATCAAACGATTGACGTTCCTGTTTCAGCCACTACATTCAGAGTTACGAGTCGACTTGAAACTAACCAAAATGTGACGCTATTTAAAGCTAATTCTTCAGTTCAAAAAAATGCTAAAAATATTAATGATAATTTTGTGAAAAGTTATGGTAACAAAAAATTACTAAAATCAAAAGACTATCAGCATGTCCCATTGCTAATTTCTTCAACAACGGGTAGATGGGTGAAAGTAAACAATTCAAGCGCAGTGCTTATTCCAATTTCAGATGTTGGGAAAGCTGTGAAAATCATGTCAAACGCGTTAAATTCGTCATCTTACACTTTTTTGAAAACTGCAACTGGAAATTCTGGTGATCTTGCTGACTTTGCGACCAGTTATAAGGGCATCAAGAAGTTAAGTGTTGGCGAATATGCCACATTGCAAGTACCAAGTGATGCCGGTTTCTTGTATGTTACAAATAGTTTTGATGACGGCTCAATCCATGATGTCTACCCCAAAGTTACACCAATGTTAGACACCATTGTTACGGTCGCTGCCTCAAACTCATCGGCGCTGGATAAGTCAAGAGCTGACTATGTGGCGACCGGTGCGAATGACCAAGACGTGATTAATCAAGCAATTACATCCTTGGTATATGGTGGAACTATTAAATTATTTGATGGAGATTACAACATAGATGCATTTGGCGACACAAAAACTGCTATTTATTTCCCTAACAATGGCTATGCACGAACCATCAACTTTGAAGGCTCAACTGAAAACAAGAGCTTCCTTTCAGAATATGGGGTCACCATTCATGTTACTAAGACAGCGTTCGACAGTTTGCCAACGACTGGCGACTACAATGTGTTTGCTGGCGACGGCACTACACTTCCAATCGGTGTTTGGCAAGGATTTGCTAATAATGTTAATTTCAAGAATTTCTATCTGAAATTGTACACCTCCCAACGGCAGATGGTTGGAATTAATGGTCAAAACTTCGGATCAATGTACATCGAACAAGTTGGTGTCTATTCCGAAAGTTATTTCACTGATCGCTTCAATCGCTATAAGCCAGTTACCCCTGCTATTAATTCAATCGGCATCATCTCTGTCGGTGGCGCAAACGATGAGATGGCACGAATTGGAATGGACACGGTGAATGTTGGTGGTCTTGGTACAGGTATCATCATCGCACGAGCTGAGCATTTGATTGTTAAGAATTCAACAGTATCACGCTCTGTGATTGGCTATAAATTCTCCGGCAATGCTGATAAGCCGTTAACATTGATTAATAATGCTGACGAAGGCAACACGCATTTGCCAGTATTTAAGGGTACTGGATTAATCACATCAATTGACTTTTCAATCGAGCGACTTGATCCAGGAGTGTTCCCCAATGATCCTTCTGGTGATACTAATCCATTCGCCAAAGAGTTAACTCCTGGCGGTTGGAAAGGGACGTTTGATTTTAATATTCAAGGTTCGGGGGCTGGAATTAATCACTTTTGGCAGTCTGGCAGTGGACGCAACATTAAAACTAAAAAAATTAGTTCGGCAATTTCTGGCACGGTTAATCCATCTAATCCGGAATATTTACAAGAATTCTTTAGAACAGATTTGAACAAGAAACTAACATTCAATGGGAATAGTTGGGTTGATTCAATTGGTAATATAGTTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.