Protein

Genbank accession
AFI55337.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein TSMG0054 [Halocynthia phage JM-2012]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,55
Protein sequence
MNDLTNEVSKVLEAATLQTEASRKLTDDIDAKINDIDAKTQEVMGTIESQRTLVAAEVSATVTETITAETNRVVSAADAAALNAGIFQTTTLGLAGTTEGDYFSTPSTTDIEYLILYRHDAGSVATEIKRYPSTDGVLTPENVGGKINCTALAMGYPGTLVMNIKDKTLELTRGLVVLTTSEITVNVPAQVIDFSLIPDSQLGYALYVYLREGSTTINVGTFNSNKPYHKDIVLGVVFYDVAHGPNANIFSITDKYGNRLGTVGARTNPTASYGYSGHLVECNWVTRTLKFTGTVNVMSNGQNVGLPSLTLNFDDYDTVTADDTYLVLTYSRLATNAVNRTESTLRLYSWASLGTTSQIIPASESIVAIFTDGGQVWSNFQLPPINISSRSNNPKGLNTNGSTFETRHSHLLTPDRIIVDLHTKKLTVLTNCYLSAEPNDLTAHKGYKYINSGTVDFSDNDLSVFQTLWYDYRTNKLHVTPATEIISPAYGLIFGTITDGDFIWLGNSKHKPTVIDTEGNVIDYLNGEVTSGLEFDAYENRLLMPDNLFFVEGEELPIFRNSIIANDKPDELDNLNIFITPSTNAKLTRNVRPYQTLDGELYFKPEDLGADGEVASIRMTHILEPDNRYNTPFTIHSVDKTLVSGKVKKALLIGDSLTEVGMASDFKNKMSTKYNCTMEIVGTYASSYTDNIASEGRGYWQYRSFIGKCNRTGATHTLPEPGTTTTSKWQNPFLRLATASDRLNTPELCFTFTGSIKEVSFAEDNSADKYYIFDFAHYLSTHNVDVPDIVTIALSTNDINLQRDSYTADERLEFMELALRHMIGSIRAVSTNIDIGVIPAPVTSHTTNGLVRWGEETTIWIDKCHQVCTDLAVDFIPCYLHVPRDYSNAWNSNVSVPNTMMNKATVTDWVHFDEFGRDMYCNATTAWAVNKLS
Physico‐chemical
properties
protein length:933 AA
molecular weight: 103069,22810 Da
isoelectric point:4,91176
aromaticity:0,09218
hydropathy:-0,22058

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Halocynthia phage JM-2012
[NCBI]
1173297 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFI55337.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ340088.1 [NCBI]
CDS location
range 53169 -> 55970
strand -
CDS
ATGAACGATTTAACCAATGAAGTATCTAAGGTTCTGGAAGCGGCTACGCTCCAAACTGAGGCGAGTCGTAAACTTACCGATGATATAGATGCTAAAATTAATGATATAGATGCTAAAACCCAAGAGGTTATGGGTACTATAGAATCTCAACGTACTTTGGTGGCGGCTGAAGTTAGTGCTACGGTTACAGAAACCATTACAGCTGAAACCAATAGAGTGGTATCGGCGGCAGATGCAGCAGCTCTTAATGCTGGTATCTTCCAAACGACTACATTAGGTCTAGCTGGAACTACTGAAGGGGATTATTTTTCTACTCCAAGTACGACAGATATAGAATATTTAATTTTATACCGTCATGATGCTGGTTCAGTAGCAACTGAAATTAAACGTTACCCTTCTACTGATGGTGTGTTAACTCCTGAAAACGTAGGCGGTAAAATAAACTGTACCGCTTTAGCGATGGGTTATCCAGGTACGTTAGTTATGAACATTAAAGATAAAACTCTAGAATTAACTAGAGGACTTGTCGTCTTAACTACTAGCGAGATAACCGTTAATGTTCCAGCTCAAGTTATTGATTTTAGCCTTATACCTGATTCACAATTAGGTTACGCCTTATACGTTTACTTAAGAGAGGGTTCAACAACAATTAATGTTGGTACGTTTAACAGTAATAAACCGTATCATAAAGATATAGTATTGGGTGTTGTATTCTATGATGTAGCACATGGTCCTAATGCTAACATATTCTCTATAACTGATAAGTATGGTAATCGTTTAGGTACAGTTGGTGCCCGAACCAATCCAACGGCATCATATGGTTATTCTGGTCATCTGGTAGAATGTAATTGGGTAACACGTACTTTAAAATTCACAGGTACCGTGAACGTAATGAGTAATGGTCAGAATGTCGGTTTACCAAGTCTGACTTTAAACTTTGATGATTACGATACAGTTACCGCCGATGATACTTACTTAGTACTAACTTATAGTCGCTTAGCTACTAATGCTGTAAATAGAACAGAGTCTACGCTGAGGTTGTATAGTTGGGCTTCATTAGGTACTACATCACAAATTATACCTGCATCAGAATCTATAGTTGCAATTTTTACAGATGGCGGGCAAGTATGGTCTAACTTCCAACTTCCACCAATAAATATCTCTAGCAGATCAAATAATCCTAAAGGTTTAAATACTAACGGATCTACTTTTGAAACTAGACATAGTCACTTATTGACTCCAGATCGTATCATTGTGGATTTACACACTAAAAAATTAACCGTTTTAACTAACTGCTATCTTAGTGCGGAGCCAAACGACTTAACAGCACATAAAGGCTATAAGTATATAAACTCTGGTACTGTTGATTTTTCAGATAATGACTTATCTGTGTTTCAAACATTATGGTATGATTATCGTACTAATAAGTTACATGTTACCCCTGCAACAGAAATAATTTCTCCGGCCTACGGATTAATATTTGGTACTATAACAGATGGTGATTTTATATGGTTAGGTAATTCTAAACATAAACCTACAGTTATAGATACCGAGGGTAATGTTATAGATTATCTTAATGGTGAGGTTACTAGCGGACTTGAGTTTGATGCGTACGAGAATAGACTTTTAATGCCTGATAATCTGTTCTTTGTGGAAGGTGAAGAGTTGCCTATTTTCAGAAATAGTATTATTGCCAACGATAAACCTGATGAGTTAGATAATCTTAATATTTTCATAACACCATCAACCAATGCTAAGTTAACTCGTAATGTCAGACCATATCAAACATTAGACGGTGAATTATACTTTAAACCAGAAGACTTAGGGGCAGATGGTGAAGTAGCATCTATTCGTATGACACATATCTTAGAACCAGATAATCGTTACAATACACCATTCACTATCCATTCGGTAGATAAGACTTTAGTTTCCGGCAAAGTTAAGAAGGCATTACTTATAGGAGATAGTCTGACTGAAGTTGGTATGGCTAGCGATTTTAAGAATAAGATGTCTACTAAGTATAACTGTACTATGGAAATTGTTGGTACATACGCAAGTTCTTACACAGATAACATTGCGTCTGAAGGTCGTGGTTACTGGCAGTACCGATCGTTTATTGGGAAGTGTAATAGAACTGGTGCAACCCATACGTTACCTGAACCTGGTACAACTACTACTTCTAAGTGGCAAAACCCATTCTTACGTTTAGCGACTGCATCAGATCGTCTGAATACTCCTGAATTATGCTTTACATTTACAGGTAGTATTAAAGAAGTTAGTTTTGCAGAAGACAATTCAGCAGATAAATATTATATCTTCGACTTTGCACATTATCTAAGTACTCATAATGTGGATGTTCCGGATATAGTTACCATTGCATTATCTACTAATGATATAAATTTACAACGTGACTCTTATACGGCAGATGAGCGTTTAGAATTTATGGAATTGGCACTTAGACATATGATAGGTTCTATTAGAGCGGTATCAACTAATATCGACATTGGTGTTATTCCAGCGCCGGTTACGAGTCATACTACTAATGGATTAGTTCGTTGGGGCGAAGAAACTACTATCTGGATTGATAAGTGTCATCAAGTATGTACCGATCTAGCAGTAGACTTCATACCGTGCTATCTGCATGTACCTAGAGATTACTCTAATGCATGGAATAGTAATGTCTCTGTACCAAATACCATGATGAATAAAGCTACGGTTACAGACTGGGTTCATTTTGATGAATTCGGAAGAGACATGTACTGTAATGCTACTACTGCATGGGCAGTCAATAAGCTTTCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.