Protein

Genbank accession
AEZ65686.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein and packaging [Cyanophage S-TIM5]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MPLTRIDSAFLDLDAIGGIDFDVQSGVPTFSVDAVNHRVGIGTDSPTTKLEVIGDITVSKQNAFIELKDPDTADANYRLRNQGGSFSIYDVTNNQVKIAATAGYVTIYPNLNANNGLDVMGTITGDGNLDIADGIRHYGDTNTSISFPAADTITAETGGTERLRITSGGNIGINNTTPDTVLDVNSDGTAGIIQLTGARPSDSNNAFFSGRSSRGTIASPTTLVTNDIIATFQGKAHDGSNYLQAGRVRFGVDSISTGNLSSNLQFMLSNNGEFEALRITSDGDVGIGVADPDVYSLGGNNRYAAIKASAGYTVLNLVDSNNSGSYLQFGNSSVRRGSLQFLSNSDFVITSNASNSGTTLTERLRIKSAGRIGIETDDPTERLTVHGTNNDTTPILGLRSGNSQTTINNGAQIAFGFNGTNHYQHFIHTRHNASNNNNAIDFYVCDGTQQNTVTSGSIHTLSMVSGKVGIGVTNPQGTVHISSGTSGDATLILEADTDNSNDADNPYIVFRQDGGVNASAIGHGVNSGVDGNVLTIANSISNGSITFATGATNGYANATERLRINSDGKINVGGSAGAVGTKFNILNGSDNQNILGITGADESSEYAAIGVSGGNAVFTGGGAGTTSTGIIFRTAASGAETERVRITSDGSVGIGTVSAEHQLTVFNNGYTGVTIKSSRTNATSNIGGLDFKTQNTTVARIQSFVDGSIRFRNTSSLLDRLRITPTGNVGIGVIDPECKLQVGGDLQVGDSNNPGTFINVVGAGVGQNFGIRFGGGSNNPESKFSILGNTNDGHMRFRFGGTEKFRIRSDGKFGFGTGGNIDERGHIETASGNCRLKLQTGNTAVAGFVLQTSAKRFDIQAQNNFFQLYDSTVGTDRIRIDSDGDVGVGIADPQERLHVARIVMITGNTPQIRLNANDSDASDGDRTMLGQATGNGNFVTTAVDNDTILRGTSTGNLLFGVGTSEKFRITSSGNVGIGTNNPASKLSNSATAVSDGTQSVGSNGLNWKTSNSNAYIAGFENQSTGNGALFRVGDDNSARKILHAMNGSGSTVFLARGDGNVGLGTNSPGGKLHVESAATTAGWQIRTDSVGLSNESGFYRDASDHYEVVIRNGLGGLSYVKNDGGASTANLRFNVQGGERLTILSSGNVGIGTNNPVYPLHVQESAYFRRGIQVAVLSSNELQSRSPINSGFYNVDNTTTANGWPFTGWAHLLANTHSNTTNYYSQQFASSFYNQELYFRNTNNGSTTTTQSWGQVMHTNSALKPVFAESSGVTDAYSRYWYPGGEYYVSVHGITAPGDANNMIEQGYYHIANNTSNNPTSAYGYLNVHRHAGSQYSLQHFIVSSDTGRQWMRASYPDGSQSSGRNWYQWYSYGALERENTFTNRQHIIGPSSTSTFTGLHPNTSNNRAQFVLHSNYSDLVISSSQNNNNHGSTLSFVTQNPSNTADYNKFVINKGNYGTRNQFLEFGFIDNEYTNPHDYVNSTNTAVTIDGNNKRLGIGPGARTPGYPLDVRFAGDSGIHASSSNSHCSLFLNASTGNGSYIRMSAGGNQKFWIATDGSGHLNFRPNAGGTTIRMQNGGKLDAFAGIYVSGASLTLANTELDFTTANHKYIDFYTNNGNTVNFRMPNNSNVFHTGIQMVKAGAVNLYHNNTVKFYTTSTGTFTNGIQGSSDARLKTNVITVPNALDKVRAMRGVKFNWIEDGRADYGVIAQEAETVVPELVGDHETKKLTQAGSLKKRPDDSDYITTTEKGFSYMSMVGILIEAIKEQQATIDSLTARIDALENP
Physico‐chemical
properties
protein length:1786 AA
molecular weight: 189574,88520 Da
isoelectric point:5,87592
aromaticity:0,08175
hydropathy:-0,39211

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-TIM5
[NCBI] 		1137745 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AEZ65686.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JQ245707.2 [NCBI]
CDS location
range 76754 -> 82114
strand +
CDS
ATGCCCTTAACCCGTATTGATTCTGCGTTCCTTGACCTAGATGCAATAGGTGGGATAGATTTTGATGTGCAGTCAGGAGTCCCGACGTTTAGTGTTGATGCTGTAAACCACCGAGTTGGTATTGGTACTGATAGTCCGACAACAAAATTAGAAGTCATTGGAGATATAACGGTATCAAAGCAAAATGCATTTATAGAATTAAAAGACCCAGACACGGCTGATGCAAACTACCGACTAAGAAACCAGGGCGGATCATTTAGTATTTACGACGTTACTAACAATCAAGTAAAAATCGCTGCTACAGCTGGGTATGTAACAATCTATCCCAATCTAAATGCCAATAACGGCCTAGATGTGATGGGAACAATTACCGGAGATGGCAATTTAGACATTGCTGATGGCATAAGACATTACGGAGATACTAATACTTCTATTAGTTTTCCTGCCGCTGATACAATTACGGCAGAAACAGGTGGTACTGAAAGACTTCGTATAACTTCTGGTGGTAATATTGGTATTAATAATACTACTCCAGATACAGTTTTAGACGTCAATAGCGACGGAACTGCTGGAATTATTCAACTCACTGGAGCAAGACCCTCTGATAGTAACAATGCTTTTTTCTCAGGTAGATCATCAAGAGGAACTATTGCTTCACCTACAACCCTTGTAACAAATGATATTATTGCAACTTTTCAGGGTAAGGCACATGATGGATCAAATTACTTACAAGCAGGAAGAGTAAGGTTTGGTGTTGATAGTATTTCTACTGGAAATTTAAGTTCAAACCTACAGTTCATGCTCTCCAATAATGGAGAATTTGAAGCACTTCGTATAACTTCTGATGGTGATGTAGGAATCGGAGTTGCTGACCCAGATGTGTATAGTCTTGGTGGCAATAATAGATATGCTGCTATAAAAGCATCTGCTGGATATACAGTATTGAATTTGGTTGATTCAAATAATTCTGGATCATACTTACAATTTGGAAACTCTTCAGTTAGAAGAGGATCTTTACAATTTTTGAGTAATTCTGACTTTGTTATTACCTCCAATGCAAGTAATAGTGGAACAACTCTCACAGAAAGACTTCGTATAAAATCTGCTGGTAGAATTGGTATCGAGACTGATGATCCAACTGAAAGACTAACTGTTCATGGAACTAACAATGACACCACTCCTATTTTAGGATTAAGATCAGGTAATAGTCAAACTACCATTAATAATGGAGCACAAATTGCCTTTGGATTTAATGGAACAAATCACTATCAGCATTTTATTCATACTAGACATAACGCATCAAATAATAATAATGCAATAGATTTTTATGTTTGTGACGGAACACAGCAAAATACTGTAACTTCTGGTTCTATCCATACATTAAGTATGGTATCTGGAAAAGTTGGTATCGGAGTCACAAATCCACAAGGAACTGTACACATTTCATCAGGAACTTCTGGAGATGCAACGTTAATTCTTGAAGCAGACACTGACAATAGTAACGATGCGGATAATCCATATATTGTGTTTAGGCAAGATGGTGGTGTTAATGCCTCTGCAATAGGACATGGTGTGAATTCTGGAGTTGATGGTAATGTGCTTACCATAGCAAATTCAATTAGTAATGGTTCTATAACTTTTGCAACAGGAGCTACTAATGGTTATGCAAACGCGACAGAAAGACTTCGTATAAATTCTGATGGTAAGATAAATGTAGGTGGATCAGCTGGGGCGGTTGGAACTAAATTTAACATTCTCAATGGAAGTGATAATCAAAATATACTTGGAATTACTGGTGCAGATGAATCTAGTGAATATGCAGCAATTGGAGTTAGTGGAGGTAATGCTGTATTTACTGGTGGAGGAGCTGGCACAACAAGTACAGGTATAATTTTTAGAACTGCTGCAAGTGGCGCAGAAACTGAAAGAGTTCGTATAACTTCTGATGGTTCAGTTGGTATCGGAACTGTAAGTGCCGAACATCAACTTACTGTTTTTAATAATGGATATACTGGAGTTACTATTAAATCAAGTAGAACAAATGCCACAAGTAACATTGGTGGACTTGATTTTAAAACTCAAAACACAACTGTTGCCCGTATTCAATCTTTTGTTGATGGATCAATTAGATTTAGAAATACCTCATCCTTACTAGACAGACTTCGTATAACTCCTACTGGTAATGTTGGCATTGGAGTTATTGATCCAGAATGTAAACTTCAAGTTGGGGGTGATTTACAAGTAGGAGATTCTAATAATCCAGGCACATTTATTAACGTGGTTGGTGCTGGTGTAGGTCAGAATTTTGGGATTAGATTTGGTGGTGGTTCTAATAACCCAGAATCAAAGTTTTCAATCTTGGGTAATACCAATGATGGTCATATGCGATTTAGATTTGGTGGAACAGAAAAGTTCCGTATCAGATCTGATGGTAAGTTTGGATTTGGAACTGGTGGGAATATAGATGAAAGGGGACACATAGAAACTGCTAGTGGAAATTGTAGATTAAAATTACAAACTGGAAATACTGCCGTTGCTGGTTTTGTTCTTCAAACTTCTGCTAAAAGATTTGATATCCAGGCACAAAATAATTTCTTCCAACTTTATGATAGTACTGTAGGTACAGATAGGATTCGTATAGATTCCGATGGTGATGTGGGTGTCGGAATTGCTGATCCACAAGAAAGGTTACATGTGGCAAGAATTGTCATGATAACCGGCAATACGCCACAAATCAGACTAAATGCTAATGATTCTGATGCATCTGATGGTGATAGAACGATGCTCGGGCAGGCAACAGGTAATGGTAATTTTGTAACCACTGCTGTTGATAATGATACCATTCTACGAGGAACTTCAACTGGTAATTTATTATTTGGTGTTGGTACATCAGAAAAATTCCGTATAACCTCTTCTGGTAATGTTGGCATTGGGACTAACAATCCTGCTTCAAAGCTTTCAAACTCCGCAACAGCAGTTAGTGATGGAACCCAGAGTGTAGGTTCAAATGGATTAAACTGGAAAACTTCGAACTCAAATGCGTATATCGCTGGCTTCGAAAACCAGTCTACTGGTAACGGGGCTCTGTTCCGGGTTGGTGATGATAATTCCGCCCGAAAGATCCTACATGCAATGAACGGATCTGGGTCTACTGTATTTCTAGCTAGAGGTGACGGCAACGTTGGCCTTGGTACAAACAGCCCAGGAGGAAAACTGCATGTCGAATCAGCGGCAACTACGGCCGGTTGGCAAATAAGAACAGATAGCGTTGGCTTAAGCAATGAAAGTGGATTCTATCGCGATGCCTCTGATCACTACGAGGTGGTAATCAGAAACGGCCTTGGTGGTCTTTCGTATGTTAAAAACGACGGCGGGGCTTCTACTGCAAATCTTAGATTCAACGTACAGGGAGGCGAGCGTCTTACCATACTTTCCAGTGGTAACGTTGGCATTGGTACTAACAACCCCGTCTATCCTCTTCATGTTCAAGAATCGGCTTATTTCCGCAGAGGTATACAAGTAGCAGTACTCTCTTCAAATGAACTTCAGAGTAGGTCTCCGATCAACTCTGGTTTTTATAACGTAGACAATACTACAACTGCAAACGGGTGGCCATTTACCGGTTGGGCACATCTCCTTGCAAACACACATAGCAACACCACCAACTACTACTCCCAGCAATTTGCCAGCAGCTTCTATAACCAAGAGCTATACTTCCGTAACACTAACAACGGTAGCACAACAACCACCCAGTCCTGGGGTCAGGTGATGCATACCAACTCCGCCCTAAAGCCTGTGTTTGCCGAATCTAGTGGTGTTACAGACGCATATAGCAGATATTGGTACCCTGGTGGTGAGTATTATGTTTCTGTTCATGGCATCACCGCCCCTGGCGATGCAAACAATATGATTGAGCAAGGCTACTATCACATTGCAAATAACACTTCCAACAACCCGACCTCCGCCTACGGATATTTAAATGTCCATCGGCATGCCGGATCTCAATACTCTCTCCAGCATTTTATTGTGAGCTCAGACACTGGTAGGCAGTGGATGAGAGCTTCGTATCCTGACGGCAGCCAATCAAGCGGAAGAAACTGGTACCAATGGTATAGCTACGGAGCCCTTGAAAGGGAAAACACATTCACAAACCGCCAGCACATCATCGGCCCCTCTTCTACATCTACATTTACAGGACTTCATCCCAATACAAGTAATAATAGGGCTCAGTTTGTTCTGCATAGCAACTACTCTGATTTGGTTATCTCGTCTTCACAAAACAATAATAACCACGGAAGTACCTTATCGTTTGTAACACAAAATCCTTCTAATACTGCAGATTATAATAAGTTTGTTATTAACAAAGGAAATTATGGCACAAGAAATCAATTCTTAGAATTTGGATTTATTGACAACGAGTACACCAACCCTCATGACTACGTTAATAGTACTAACACTGCGGTAACTATCGACGGTAATAACAAACGGTTGGGTATTGGGCCCGGTGCACGAACTCCGGGATATCCATTAGACGTTCGTTTTGCTGGAGACTCTGGAATCCACGCCTCTAGTAGCAACTCTCACTGTTCTTTATTTTTAAATGCTTCAACAGGAAACGGTAGCTACATTAGAATGTCGGCCGGTGGAAATCAAAAATTCTGGATTGCCACAGACGGCAGCGGCCATTTAAACTTCAGACCAAATGCCGGAGGTACAACTATAAGAATGCAAAACGGCGGAAAACTTGATGCATTCGCAGGGATTTATGTGTCCGGCGCGTCGCTAACGCTTGCAAATACTGAGCTAGACTTTACTACCGCAAACCATAAGTACATTGACTTCTACACCAATAACGGCAACACGGTGAACTTTAGAATGCCGAATAATTCTAACGTTTTCCACACTGGTATACAAATGGTTAAAGCCGGAGCAGTAAATCTTTACCATAATAACACCGTTAAATTCTACACCACTAGCACCGGAACTTTCACTAACGGCATACAGGGCAGTTCTGATGCTCGATTGAAAACAAATGTTATAACTGTACCTAATGCTCTAGATAAAGTTAGAGCAATGAGAGGAGTTAAGTTTAACTGGATAGAAGACGGCAGAGCAGATTACGGTGTTATTGCTCAAGAGGCAGAAACCGTTGTTCCTGAGCTGGTAGGAGACCACGAGACTAAGAAATTAACCCAAGCTGGGTCTCTCAAGAAACGCCCAGATGACTCTGATTATATTACCACAACAGAAAAAGGATTCTCTTATATGTCTATGGTAGGTATACTCATCGAGGCAATCAAAGAACAACAGGCCACTATCGACTCCTTAACGGCCCGCATAGATGCATTAGAAAACCCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.