Protein

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Genbank accession
XEO41143.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,77
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEASDLSGALVRHITGKCANNDGWYIGAGGASDQGFLEIGTYDNGNEPIYFVQRTGGTTQAEVRRLALLDGFGDTSIPGDLRLTNKTVKISNGSTLVLEMGVGSNDAYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTNNLDNWVEWRRIGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATTPSGSILVSMKQVFDSISKPDFSDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRDVGEGAGNVLENGAYGLGGNGGKSINDIVSNADMLTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSGLAAGNVNYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGTGTASVYVNAGSGNAHVWFRTNANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGGVSAGDFSFRSDGRFDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSLFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGATVAMLKVTPEGYVQFGYQTAVSTPAPTKYLLVKSNGLEVEGDLVFNQTYRGTEDAVDITDKTNDLNNMVIKGSDLGTRQLYKCVSSGGGSNIANKPTSDGNFVLEVLSLRKISDSDWTCKQTFTTKNGNVEGVYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVSFGNLVTNDLTVNGNARLVGRLNLGSTSATGVLRANETGAVVLGSASGQNIHIRAGSPDTSSGETRFEPNGNVLVGGAITVSGSLQVNGEAAMSRSLIVSQNIKNTNDNSFILMGKDSDLGFVKKSNSGAKLVFASGKSFIVAKSSATVIANPASETYTDVFKVDADGNQTVYGNSAVSRALTVSSTATVNGVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGNLDVTGTRLKTWKLEVDGGGAVLGGTIDVVGKANFSNELTANTSINVMNDGNSHLFFRKANGTEKGLLWADDPGNVSIRAGGASGPVWNFWASGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPNGTYNNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNFHQAIINVNGFGRDDSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1481 AA
molecular weight: 155691,69860 Da
isoelectric point:6,00915
aromaticity:0,07157
hydropathy:-0,29392

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–621
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_0468
STR
485–1007
DC_0468 IPR030392
IPR030392
CHP
1381–1436
IPR030392 Coil
XEO41143.1
1 1481
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-621 | STR 622-1007 | RBD 1082-1481
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XEO41143.1
1 1481
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 1059 1059 0,1198
Central domain 1060 1258 200 0,4001
C-terminal 1259 1481 222 0,8881
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-1059
Central
1060-1258
C-terminal
1259-1481

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Raoultella phage vB_Ro_M12a
[NCBI] 		3243423 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XEO41143.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ181262.1 [NCBI]
CDS location
range 9036 -> 13481
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGTGTTGAATACACATGGGCGTACTCTTGCCATTTACACTAAAGATGAAGCCGATAACGTTGTTCAGCTTGCAGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACTGCAGGTAATCTTAATGTTGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAATTTTGAAGCTTCGGATTTAAGCGGAGCATTAGTACGTCATATCACCGGTAAGTGTGCTAATAATGATGGCTGGTACATTGGAGCTGGTGGTGCATCTGACCAGGGATTTCTTGAAATCGGTACGTATGATAACGGAAATGAACCTATCTATTTTGTTCAAAGAACCGGTGGAACGACTCAAGCTGAAGTTCGTCGTTTAGCATTATTAGATGGGTTTGGCGATACCTCTATACCTGGGGACCTTCGTTTAACTAATAAAACGGTAAAAATTTCAAACGGAAGCACACTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGCTTACATTAAAAACCAACGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGTAATCTGACATTCAGAAATTCACAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACCGCTGGAACTCCACGTTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGAGATGCATCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGCATTGATTCTGGACACGGAAGGCATTATGTTGATTTTATCACGTTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACCAACAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGAAATGGACTTTATGTTACAGTGCTAAACACTGCTGGATACAACGGCCAAGATAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACTGGCCAAGATACTGGTGCTACTACACCATCTGGAAGCATTCTTGTTTCAATGAAACAGGTTTTTGATAGTATCTCAAAACCAGATTTCAGCGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAACCGTGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCTAGAAATAACCTAGGTCTTGGTACTGCGGCTGTTCGCGATGTTGGTGAAGGTGCTGGTAATGTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGTGGCAACGGTGGTAAATCCATCAATGACATTGTCTCTAACGCTGATATGTTGACTCGTTTAAAAGCATACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGCGTTAGTGTTCAAAACGGTCTTTATAGTCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCGGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCGACAAAGGCTGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAACGATACCCAAGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTGATTTAGCTGCACCTAATTTACATGCTTCCGGCACCGGTACTGCATCAGTGTATGTTAATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACAGCGGATTTAGGACAAATTAATATTCGCGCAAAAACTACTGGAGGTGTTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGACGGTCGATTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTCGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGAAACATTACCTCAGGTTCATTGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACCTCTATTAAAAATGACATTGTTGCTGGTGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGTGACACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACGATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCGGATAAGTATAGCAGATTAACCCTTGCTCGTAAAGTTGGTAGCGGTGCTACCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAACCGCAGTTTCTACTCCAGCTCCTACCAAGTATCTCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGGGATTTGGTTTTTAATCAGACATATCGCGGTACTGAAGACGCAGTTGATATTACTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGCGTATCATCTGGTGGTGGTTCTAATATAGCTAATAAACCCACATCTGATGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGATAGTGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAATGGTAATGTTGAAGGCGTATATGTTCGATACTGCCAAAACGGTACATGGTCTGCATGGAAAGAAGTTGTTGCTGGTGTTCAACCAATTAATTTAGGCGGTACCGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGACAAACCGTATCATTCGGTAATTTAGTTACAAACGATTTAACCGTAAATGGAAATGCTAGATTAGTTGGAAGACTGAACCTTGGTTCTACTTCTGCGACTGGCGTATTACGAGCCAATGAAACCGGCGCAGTTGTTTTAGGTTCTGCTAGTGGTCAAAACATCCACATCAGAGCAGGAAGCCCAGATACTTCTTCTGGTGAAACCCGCTTTGAGCCAAATGGAAACGTTTTAGTTGGTGGTGCGATTACAGTCTCAGGAAGCTTGCAAGTAAATGGCGAAGCCGCGATGAGCAGAAGCCTGATCGTTTCTCAAAATATAAAGAATACCAACGATAATAGTTTTATTCTGATGGGAAAAGATTCGGATTTAGGTTTCGTTAAAAAATCTAACTCTGGCGCTAAACTGGTATTTGCTTCAGGAAAATCGTTTATTGTCGCTAAATCGTCGGCAACTGTGATAGCTAATCCGGCTTCGGAAACTTACACTGATGTGTTTAAAGTTGATGCAGACGGAAACCAAACTGTTTACGGAAATTCAGCAGTTTCTAGAGCTTTGACTGTATCAAGTACAGCTACAGTTAATGGTGTTATTAATGCCAATGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTACAAATTGCTGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTCCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGTAACTTAGATGTTACAGGAACTCGACTCAAAACTTGGAAGCTAGAGGTTGACGGTGGAGGCGCAGTACTCGGCGGAACTATTGATGTTGTTGGTAAAGCTAATTTTTCTAATGAGCTTACGGCTAATACTTCTATTAACGTCATGAATGATGGAAATAGTCATTTGTTCTTCCGTAAAGCAAATGGTACAGAAAAAGGACTTCTTTGGGCTGATGACCCTGGTAATGTTAGTATAAGAGCCGGCGGTGCTTCTGGACCAGTATGGAATTTCTGGGCAAGTGGTTCATGCCAATTCCCTGGAGCCATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAACCCAATGGCACATATAACAATACCGCTGGGTTAGTAAGCAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCCTCTCTGTATTTCCAAGAATATGTTGGTAACTTCCACCAAGCTATCATTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAGTTTCTATTTCAGAGCTGGCGGTGACTTCATCTGTACTCGCAATGGTTCATTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAGACCTTAAGCGGTAATACTTATGAGCTTCATAATACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACTCAGGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCTCTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAACTTTCAGCTGAGGTCAAAGGTCTTAAAGCCGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fe008c299ca82eeadace2ac178d1ff8fd2191182b66381e663be67acc7b6df38
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4932
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50