Protein

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Genbank accession
XCH00510.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTITATLIGNASTAARLASTRQIQLSQDITASGVFDGSANLNLNAELTLVSTLPHYDGTGTPTGTYTSVTVDAKGRIINASNPSTLAAYNLDGNVEGSSAQPYDLDLAAISGLTTTGIISRTSGGSMATRTITGTATRIAINDGAGISGNPTIDLIVTAVTPGDYNTESLTSVSGVGGNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATATEGSKYATYNAGTSYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGSGAPAHTDGSDTGGWRFLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAQGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTSTTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDINVRSYFSDPDITLDGVVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGAGTSNIIVTAEDTVQISASDAAGKVHVEDARFQDNYIATANATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGVTTTVNSTTMTVDDVVLTLGGDTAPASDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLSGHEGGYRFLHAATNTSETFAGTDSGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGTGTVKSEIHTTSGNAEFGGILTITGATDLNSTLNVAGFTYLENTNEPQIALNGSTGLYEIQNSDYGAFRFDGGGYIEGDFMFNSDVYVNGQIVQKEDNTAVFNRQNYLLVRYKLYTGSSAAYTPSYATDSTTNLFVYGGAGITTSLHVGGTGAGEGLFVGKENSGDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGQVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTTIQGTLNSVGAVDFDSALNVDGNTTLVGTLTVTNTSEFNNTVDVDADFAVRTGAGVDKFTVASVSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIVGTLTVGDATQINDTLGVTGVTSITNSTGQTLTGTYGADGAVRITGGVGIGENLAVAGNMRVFGDFEITGSTTQSGNTGFSGRVSITNTQDVTSFADNNVAFTVDGGTRISKNAYIGGDFHVWDDVNSRDAFYVDVSTGDATLHNTLTVGGNLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSSDQYAFLVDATNNAEVHTGTDASVRAGSLRLTSAGTALDVDNNANIDGTLTVDGQITSNVATGSAPFVVASTTKVINLNADLLDGLTTATAATANTVVIRDASANFAANAITMATGTITGAATIGTTLGVTGATTLSSTLGVTGATTLSSTLGVTGVTTLTGLLNANGGIAVDTNNFTVDGVTGAVVTASTLSVGSTSSFTGAITATGGVIGNITGNLVAAISTGKNFNPETDSTYNLGASTLRWATAYVDSLNAGTSITTAGTLSVTGTSTFTGEISANGGIALQDTDKATFGNDDDMQIYWSGTQNRIDTEGPFQIRNSNASSGISFYDGDNTNFMFKALPLGAIELYHNGTKTFETTATGATLTGVLVATSLTGDVTGDVTGTVSDISNHTTDALAEGSTNLYYTDERVDDRIDALFVASTGITKVYDDAAGTYTLSVTQADINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADINTDNVTEGSTNIFYTEARFTTSLGTKTTTDLTEGTNLYYTDARADARIAAATTDDLSEGATNLYYTDARADARIAAATTDDLSEGATNLYYTDARAEASFDTKIAAATTDDLSEGATNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVTAGAVTEGGVGGFTAGTGVATTGGTGNGLTVDTTVVNGEITAVAVNAGGSDYLIDDTITITNPNAGGVASFNFGTLGGGTGYTTATNVPAVSVGGSGTNLTVDITASGGVITNVVVNNPGTGFTENELVFINQAGGSDGSIRVATVYGDATFALADITTMEVGATVTGATTGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTIQSFG
Physico‐chemical
properties
protein length:2177 AA
molecular weight: 223714,00300 Da
isoelectric point:4,09539
aromaticity:0,06936
hydropathy:-0,11576

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1617 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1617 DC_0029
XCH00510.1
1 2177
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 331-1440 | RBD 1855-2177
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage QB2
[NCBI] 		3159453 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales >
Host Synechococcus sp. MW02
[NCBI] 		1620844 Cyanobacteriota > Cyanophyceae > Synechococcales > Synechococcaceae > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XCH00510.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP861117 [NCBI]
CDS location
range 162307 -> 168840
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCTTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTTTCAAAATCGGTGACGGTGTTTCTGCTTGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTTGAGTCTACCTCTAACACGGCAAATACTCTTGTGCAGAGAGATGCTGACGGCAACTTCTCTGCAGGTACAATTACCGCAACTCTGATTGGTAATGCTTCTACTGCTGCACGTCTGGCATCTACCAGACAAATTCAGTTATCTCAAGACATCACTGCTTCTGGTGTTTTTGATGGTTCTGCAAACTTGAACCTCAATGCAGAACTCACGCTTGTGTCAACTCTGCCTCATTACGACGGTACAGGAACACCTACAGGAACATACACCTCTGTTACTGTAGATGCGAAAGGTAGAATTATTAATGCTTCAAATCCATCTACCCTTGCTGCATACAATCTTGACGGTAACGTAGAGGGTTCTTCTGCACAACCTTATGACCTCGACCTTGCTGCAATTTCTGGTCTGACTACTACTGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGTGGTAGCATGGCAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTGCTATTAACGATGGTGCTGGTATTTCTGGTAACCCAACAATTGACCTTATTGTTACAGCAGTAACACCTGGTGACTACAATACAGAATCCCTAACATCTGTAAGTGGTGTTGGTGGTAACAGCGAACCATTTGGTACAGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCTTATGGTCGCTTAACAAGTGCTACAAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTATGCTACATACAATGCTGGGACATCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAAGGTGGTAACGTCTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGTTCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATGGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTTCCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCACGTTACCATTGCCGCCCAAGGTGTAGATAATACTCAATTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTAGCACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTCAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATTTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGCGGAGCTGGGGAACTTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTGTTGTTGCTCAGACCCTGGACAAAACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCCAACAGAAACTTCAATATCCTGACAACCAATGCTGGTGCAGGAACTAGCAATATTATTGTTACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCTGATGCAGCAGGTAAAGTTCATGTAGAAGATGCACGTTTCCAAGATAATTACATCGCCACAGCGAATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGATCGTGCCGTAACTGGTCTGGTTCGTGTCTGGGGTGACCTCCAAGTTGATGGTGTAACAACAACTGTCAACTCAACAACCATGACAGTAGATGATGTTGTCCTTACTCTTGGTGGTGACACCGCTCCTGCATCTGATGACAACCTCGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTACGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTAAGTGGTCACGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTAGCGAAACTTTTGCTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAACCTTAAGTTAACAACTAACACCAACTCCACTTCAAATACGACTGGCGACTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGTGGTCTGCTAGATGTTGATGGCACCTTCCGTGCTAACAGCACTTCTCGCTTTGATGACACCATGGTTCTTCGTGGTGCATCTAAGTCACTTCAGTTCCAGAATGGTACTGGCACTGTTAAGTCTGAGATTCACACAACTTCTGGTAATGCTGAATTTGGTGGTATTCTTACTATAACTGGTGCTACCGACCTCAATAGCACACTGAATGTTGCTGGATTTACATATCTGGAAAATACCAACGAACCTCAGATTGCACTGAACGGGTCAACTGGTCTCTATGAGATTCAAAACAGCGACTACGGTGCATTCCGATTTGACGGTGGTGGATACATTGAAGGTGACTTCATGTTTAACTCCGATGTATACGTCAACGGTCAGATTGTTCAGAAAGAAGATAATACAGCAGTCTTCAACAGACAGAACTATTTGCTGGTTCGTTACAAACTGTATACTGGTTCTTCTGCTGCATACACACCATCTTATGCAACAGATAGCACCACCAACCTCTTTGTTTATGGTGGTGCTGGTATTACTACAAGTTTACATGTTGGTGGTACAGGTGCTGGCGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAAGAGAACTCTGGCGATACTGTTAAGTTCTCTGTCTTGGGTGCATCTGGCAACACTGACATTGAAGGTACTCTGAACGTTGAAGGTCAAGTAACTATTCAAGATAGTGTAATCATCAACGCTGCAAATGAAGTCTTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGCGTTGCAAAGTTTGATGTTGATACTGACAACGGCAATACTTTAATTGAAGGCACTCTGAATGTTAATGGTACAGTTGATGTTGATGCGGACTTCGCTGTTAGAAACGGCACAACTGATAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACTGGTAATACGACAATTCAAGGCACTCTCAACTCTGTTGGTGCAGTAGACTTTGATAGTGCCCTCAATGTTGATGGCAATACAACTCTGGTTGGCACTCTGACAGTTACCAATACTTCCGAGTTTAATAACACTGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCAGTTAGGACTGGCGCTGGTGTTGATAAGTTTACTGTTGCTTCTGTATCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCCATCAGAAATGGTTCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGATAACGGCAATACAAATATTGTCGGTACACTAACTGTTGGTGATGCAACTCAGATTAACGACACTCTGGGTGTTACTGGTGTTACTTCCATCACCAATTCTACTGGTCAAACTTTAACTGGAACTTATGGTGCTGACGGCGCAGTTCGTATTACTGGTGGTGTTGGTATTGGAGAAAATCTCGCTGTTGCTGGCAACATGCGTGTCTTTGGTGACTTTGAAATCACTGGTTCTACCACTCAGTCTGGTAACACTGGATTCAGCGGTCGTGTTTCGATTACTAATACACAGGATGTAACATCTTTTGCCGATAACAATGTTGCATTTACTGTAGATGGTGGTACTAGAATTAGCAAAAACGCATACATTGGTGGCGACTTCCATGTTTGGGATGATGTAAACTCTAGAGATGCATTCTATGTTGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTCTGCACAATACACTGACAGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCTCCGACCAATACGCATTCTTAGTTGATGCAACTAATAATGCTGAAGTTCATACTGGTACAGATGCTTCAGTTCGTGCTGGTTCTCTGAGACTCACTAGTGCTGGCACGGCACTTGACGTTGATAACAATGCCAACATCGATGGTACTCTGACCGTTGATGGTCAAATCACTTCTAACGTTGCTACAGGAAGTGCTCCCTTTGTAGTTGCTTCTACTACCAAGGTTATCAATCTAAACGCTGACCTTTTAGATGGTCTGACGACTGCAACAGCAGCAACTGCAAATACAGTTGTAATTCGTGATGCATCTGCTAACTTTGCTGCTAATGCCATTACTATGGCAACAGGCACAATCACTGGTGCGGCGACGATTGGTACAACTCTCGGTGTCACTGGTGCAACAACATTAAGCTCCACACTTGGTGTTACGGGTGCAACGACACTCAGCAGCACCTTAGGAGTTACTGGTGTTACTACACTTACTGGTCTTCTCAATGCTAATGGTGGCATCGCAGTTGATACAAATAACTTCACTGTTGATGGAGTAACTGGTGCAGTTGTAACAGCAAGCACATTGAGTGTTGGTAGCACGTCTTCCTTTACAGGTGCTATTACAGCAACTGGTGGAGTTATTGGTAATATTACTGGTAATTTGGTTGCTGCTATTTCTACTGGTAAGAACTTTAACCCAGAGACTGATAGCACATACAACTTGGGTGCTAGCACACTGAGATGGGCAACTGCATATGTTGATTCTCTTAACGCTGGTACATCCATTACAACTGCTGGCACTCTGTCTGTAACAGGCACTTCCACCTTTACTGGTGAGATTAGTGCTAATGGTGGCATTGCTCTTCAAGATACCGATAAAGCGACATTCGGTAATGACGATGACATGCAGATTTACTGGAGTGGAACTCAGAATAGAATTGATACTGAAGGTCCTTTCCAGATTAGAAATAGTAATGCCTCTTCTGGTATTTCCTTCTATGATGGTGACAATACTAACTTTATGTTCAAGGCGTTACCTCTGGGTGCGATTGAACTCTATCATAATGGTACAAAGACCTTTGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3f408b8396bafd2ba156e5ff32e6d4cc7cb21921b3dc78d0e386302073400e7c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5011
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50