Protein

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Genbank accession
AIX28430.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MPAINVARTDTFEQQRNKINDIGSQVFNIAAGGSDLSTGNLKLGDGSKNIPSLSFISDNSLGLFKSDLNILSFVSGSRKIFEYSSSQVSAYNDLYVIKNELDTTGTQISTAGSGYGAGSYTEVPLSGGSGSGSESTIVVEAFLGSVTTNASGLTSGQYFGATLTGGSAPENSTSINFTVPNIEGSVSNAGSGYEENSYDDVSLTGGNGSGAVATVVVDSSGSVTEITISQSGSGYLNGDVLSPDNSTMSYIDENDITQTSGGSGATFVISNNPSSIDTSTLVFDSKGSGYLVGETLSLKTEVTGVSLTIATEEGEPSTIIVITEAQYNQFVGGSTITKTGGTAVLAANTTISLSIDGDSGDYILTLSDTPTTAGSITVTITPPYGQPSPNLVYTISSLGSVSSVTITDGGVGYAVGDILSTNPANLIQNISYTATSVSVESLTFNPAISLGALTTSDQVQIQGGVIGDTEVTTASTGGTADSSLSNISPTSTSGNGVGGLFDISFDENGEVISATITPDDGGYNYQANDTVTFSGASIGASGNTVATVTSVSSDGTLVDVLSVIDDGSNITSIVVADGGQFQSTSLVKDGSNAYPISAATSENRYQIGGVTTPNLTFYVGDTIVISYPSDHPFTLSAFRDGIYSPSLVSAVTGSVTAASPVMTLNSTTGILAGMLVTTEGAGSIPDSLIVVSVDGPTQITLSGNATVTGAISATFTGGEYTEGVTRVGTDLTISVTENTPSPLYYYCTNHQNMGGVDNQEASITIDANNPRTFGSGLLLNVISVTSSNIFNTDVENSTVSIPTLVSSQVNTVDQTLTGTLTADSIIATDINVPEITSATDVTITAIDSLIITSTDIAFKDKITIDTDGNIDSAGYFKTSSYAEFNEKLHLEEDTISSKAGFDINIIPAVDQVVKIPTTTSLNIPFGTTAERPTLLAENGSIRFNTESQQYEGYNATTTAWSSLGGVRDQDGNTYIKAEETVGANDNTLYFINDDINTINVTPNSLEFVNVKKQSSVNTSAPNFVNWNANTPVVAGDYLKWKNNLYEVIVDGTTGGPGSPPVDISGSNFLNGNATLVYSQLAVAPIVFEDIEEVRIDPTGSSPIVINNDLKLSENIISSVISDILIAPNSGKKVKIDTNTTLVLPSGADADRGSPDQGSVRFNTSALQFEGYDGVNWGSLGGVKDVDQNTYIIPELSPGSNENILYFYNDNNNTLRLTATALDFDTVDTIRSVTSNEFELTSSLLTLDNASTTIDNTDTTKTFIHSNKPALELGLSSGLNVDPILRFQDTGDIFYNIGFGTGVYDGVKIFDSELKEFELADYIISTKKITLVKGSSEIGSAVLYSTVTANGCRCTILSKNTATGNKSMMEYGIINKSTTDIYNNEYGGLNSSQDGFTTTFDFTDENEVRATVTLTNDHLVGSSVEFTVVTHALK
Physico‐chemical
properties
protein length:1433 AA
molecular weight: 149203,59230 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,07048
hydropathy:-0,05799

Domains

Domains [InterPro]
DC_0692
RBD
1–739
DC_0692 DC_0326
DC_0692
RBD
1077–1431
DC_0692
AIX28430.1
1 1433
Architecture
RBD
STR
RBD
RBD 1-739 | STR 769-1081 | RBD 1082-1431 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014j
[NCBI] 		1493514 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Potamoivirus > Potamoivirus tusconj
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX28430.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019089 [NCBI]
CDS location
range 86727 -> 91028
strand +
CDS
ATGCCAGCAATTAATGTCGCTAGAACAGATACCTTTGAACAACAAAGGAATAAAATTAATGATATTGGATCTCAAGTATTCAACATTGCCGCTGGTGGTTCCGATTTATCCACAGGAAATTTAAAACTTGGAGATGGATCTAAAAATATACCATCATTATCTTTTATAAGCGATAATTCTCTTGGTTTATTTAAGTCAGATTTAAATATTCTTTCTTTTGTTTCTGGATCAAGAAAGATCTTTGAATATTCAAGTTCTCAAGTTAGTGCGTATAATGACTTATATGTCATTAAAAATGAATTAGATACTACAGGAACTCAAATTTCTACTGCAGGAAGTGGGTACGGAGCAGGATCATATACAGAAGTTCCTCTTTCTGGTGGCAGTGGTAGTGGATCAGAATCTACAATTGTAGTAGAAGCATTTTTGGGTTCAGTAACTACAAACGCTTCGGGATTAACATCTGGTCAGTATTTTGGTGCTACACTTACTGGTGGGTCTGCTCCAGAAAACTCTACATCAATTAATTTCACAGTTCCAAATATTGAAGGATCTGTAAGTAATGCCGGAAGCGGATATGAAGAAAATAGTTATGATGATGTAAGTCTTACTGGAGGAAATGGTTCAGGAGCTGTAGCAACCGTAGTTGTAGACAGTTCAGGATCTGTCACGGAAATTACAATTTCACAATCTGGTTCTGGATATTTAAATGGAGATGTGCTCTCTCCAGATAACAGCACGATGTCATATATTGATGAAAATGACATCACTCAAACAAGTGGAGGAAGTGGAGCAACATTTGTTATTTCAAATAATCCGAGTAGTATTGACACAAGTACTCTAGTTTTCGATTCTAAAGGAAGTGGATATCTGGTAGGAGAAACTCTCAGTCTTAAGACAGAAGTAACTGGGGTTTCATTAACAATTGCTACCGAAGAAGGAGAACCATCTACTATAATTGTTATAACAGAAGCACAATATAATCAATTTGTTGGCGGTTCTACTATAACAAAAACTGGTGGAACTGCTGTTCTTGCTGCTAATACAACAATTAGCTTAAGTATTGATGGAGACAGTGGAGATTACATTTTAACTTTATCTGATACTCCAACAACTGCTGGATCCATTACAGTAACTATAACTCCCCCGTATGGACAACCATCACCAAATCTTGTATATACGATTTCATCGTTAGGATCTGTTAGCTCAGTTACTATAACAGATGGTGGAGTTGGATATGCTGTAGGTGATATTTTATCTACAAATCCAGCAAACTTAATTCAAAATATTAGTTATACTGCAACTAGTGTTTCGGTAGAATCATTAACTTTCAATCCAGCAATTTCTCTCGGTGCGTTAACTACATCAGATCAAGTTCAAATACAAGGAGGAGTAATTGGAGATACAGAAGTTACAACTGCTTCTACTGGAGGAACTGCTGATAGTTCACTATCAAATATATCACCAACTTCAACATCAGGAAATGGTGTTGGAGGATTATTTGATATTTCTTTTGACGAAAATGGTGAAGTAATCTCTGCTACTATAACCCCAGATGATGGAGGATACAATTACCAGGCAAATGATACGGTAACATTTAGTGGCGCTTCTATTGGTGCCAGTGGAAATACTGTAGCAACTGTAACAAGTGTATCAAGTGACGGAACATTAGTTGATGTATTGTCAGTTATTGACGATGGTTCAAATATTACTTCTATAGTTGTTGCTGATGGTGGACAATTTCAATCCACAAGTTTGGTAAAAGATGGTTCAAATGCGTATCCAATCAGTGCTGCCACTTCTGAAAATAGATATCAAATTGGTGGAGTTACAACACCAAATCTAACTTTTTATGTTGGAGATACGATTGTAATTTCATATCCATCTGATCACCCATTTACATTAAGTGCATTTAGAGATGGAATATATTCCCCAAGTTTAGTATCTGCGGTAACTGGGTCAGTAACTGCAGCATCTCCAGTTATGACGCTAAATTCCACTACAGGTATTTTAGCAGGAATGCTAGTGACTACTGAAGGTGCTGGATCTATTCCAGATTCTTTAATTGTTGTTAGTGTAGATGGACCAACTCAAATTACATTATCGGGAAATGCCACAGTTACTGGAGCAATTAGCGCAACCTTTACAGGCGGTGAATATACAGAAGGTGTAACTAGAGTAGGAACAGATTTAACTATTAGTGTTACAGAAAATACCCCTAGTCCATTATATTATTATTGTACTAACCACCAAAACATGGGTGGGGTAGATAACCAAGAAGCATCAATTACTATTGATGCTAACAATCCAAGAACATTTGGTTCTGGTTTATTACTTAATGTAATTAGCGTAACATCATCAAATATTTTCAACACAGATGTAGAAAATTCAACTGTATCAATTCCTACACTAGTAAGTTCTCAAGTTAATACAGTAGATCAAACTCTCACCGGAACTTTAACTGCCGATAGCATCATAGCAACAGATATTAATGTACCAGAAATTACTTCTGCTACAGATGTTACAATTACTGCTATAGATTCTTTAATTATAACTTCCACAGATATTGCGTTTAAAGATAAAATTACTATCGATACTGATGGTAACATCGATAGTGCTGGATATTTTAAAACATCTTCTTACGCAGAATTTAACGAAAAATTACATTTAGAAGAAGATACGATTTCATCAAAAGCTGGTTTTGATATTAATATTATACCAGCAGTAGATCAAGTAGTAAAAATTCCAACAACTACATCTTTAAATATTCCTTTTGGTACTACAGCAGAGAGACCAACATTATTAGCTGAAAATGGATCGATCCGATTCAATACAGAAAGTCAGCAATATGAAGGTTATAACGCAACAACAACTGCATGGTCTTCTCTTGGAGGTGTTAGAGACCAAGACGGTAACACCTATATTAAAGCAGAAGAAACTGTTGGCGCAAACGACAATACTTTATATTTTATTAATGATGATATTAACACTATAAACGTTACACCAAATTCTTTAGAATTTGTGAATGTGAAGAAGCAAAGTTCTGTTAATACGTCAGCGCCAAATTTTGTTAACTGGAATGCAAATACTCCTGTTGTTGCTGGAGATTATTTAAAGTGGAAGAACAACTTATACGAAGTTATTGTAGACGGTACTACAGGCGGACCAGGATCACCTCCAGTTGATATATCAGGAAGCAATTTTTTAAATGGCAATGCCACACTAGTTTATAGTCAATTAGCTGTAGCACCTATTGTATTTGAAGATATTGAAGAGGTTAGAATTGATCCAACAGGTTCTAGTCCTATTGTCATTAACAATGACTTAAAACTTTCAGAAAATATAATCTCTTCTGTTATCAGTGATATTTTAATAGCGCCAAACAGTGGCAAAAAAGTAAAAATTGATACTAATACAACACTGGTTCTTCCATCTGGAGCGGATGCTGATAGGGGATCACCTGATCAGGGTTCTGTTCGTTTCAATACATCTGCTCTTCAGTTTGAAGGTTATGATGGAGTCAACTGGGGTTCTCTTGGTGGCGTCAAAGACGTTGATCAGAATACTTATATTATACCAGAACTTTCTCCAGGATCAAATGAAAATATTTTATATTTTTATAATGACAATAACAATACGTTAAGACTCACAGCAACAGCACTTGATTTTGACACAGTTGATACTATCAGATCTGTAACCAGTAATGAGTTTGAACTAACTTCATCTCTTCTAACACTTGATAATGCATCAACAACTATTGATAACACTGATACGACAAAAACATTTATTCATAGTAATAAACCAGCATTAGAGTTAGGTCTATCATCTGGATTAAATGTCGATCCAATTTTAAGATTCCAAGACACTGGTGATATTTTTTATAATATTGGATTTGGTACTGGAGTGTATGATGGTGTTAAAATTTTTGATTCTGAACTAAAAGAATTTGAATTAGCAGATTATATAATTTCAACTAAAAAAATTACTTTAGTCAAAGGTTCATCTGAAATTGGAAGTGCTGTTCTTTACAGTACAGTTACTGCTAATGGTTGCCGTTGTACAATTCTTTCAAAGAATACTGCAACAGGAAATAAGTCGATGATGGAATATGGAATTATCAATAAAAGCACTACCGACATTTACAATAACGAATACGGTGGTCTAAATAGTTCTCAGGATGGTTTCACAACTACATTTGATTTTACTGATGAAAATGAAGTACGTGCAACTGTAACTTTAACCAATGATCATTTAGTTGGTAGTTCCGTAGAATTTACTGTAGTCACACACGCCCTCAAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4f622fca19df3090c83590720dc939a84bf47619dbc9b08f133a587b3ac68181
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8307
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank