Protein
View in Explore- Genbank accession
- BEH87970.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTSPTSP
- Protein sequence
-
MAFKFKGSLSAVDASLKGGVIFDNEKLSDSKIMPKGKFTINEIDESTTDLASNTLVTNFGKHDNIAGMFSFNTGDWKDTDSAPVKLMMRVVNDVNDSDWVTIFDSSKTTVTWSSIAFAGQTQFTVPNLDFKKAIIYVNGVLQYPGLSYQTFGGTVTFNSKLSTGDTIYVVVGEDTTNTDNEEFTATATEDQTVIVLPFTKKTNFVFINGILQYPDSYTVSGSTITLGDKLYLNDDILVLGNETDLVSFTALASQDQTDFTLPGEFDDGLVYINGVLQYDNAYSVSGTTLSFISSLDENDNVFVTLNDPKFIDSVNASYTSTITDESNNKLNIPYFNFSELQVFINGVLQNPDSGAYILNGTEITLSSPLQLGDDIHVIVYNSPVQNSNLVTKADLTSYATAEELQELKNSLKNEGINLKWQPHLPSIEVAFGLPRRSLKMWTVGSTSTVNQYWLYPVDGTVWTGTGTLGTVPGVPFYKLDSNKDVITWTYTATSDNVTRIFVPYNFGSITIFINGVLQSINLNHYTLDGQYVNLNGALQTGDNLIAILGKLVFNTNPYLTYDDATSQFVSKSTLSSTVGTSIIGTPDGSDLQQTLNNKVNTTILSSTAGASLIGTENNKTVQEKLNSLTRRVNVLDFMTDEEREGVLNYTGTADNSNAFIQAFATGAKLIDVPAGRYLVQNVTIPTRTRLFGDSGYKPYNVTSDASFYDTGTLIRKINGAANMFLWNTACGAQDIMFDGYDRASPAINSATGGKITVGFQRCGFYRWDRVGNRLGAYLGCTFQFCNFNQNNIGIYNTVDGNHISCTINANKSDGVRLETGADSNTFTNCRNEWNEGNNWNFYGCVSIQVINELCDRAFLYGFRISNSNVQIQNVDVRRSGRTASSDATSAHFYIENSIVKMIGVKTSAGPDDTGGSVVVSSPAYIFRMEGANSGSLTLTSNRMTGSTIGIYSGSARPETMRYSDNDGIEDFCNVGLYRKNGGKQYRSFQTASGVPGSSPINLTFTTSSVATYNNDLFNIDLTWRNSSNGGSNGAQLTVISSREGGNASYNIINIVSKNGVLAETDVNTSPGANQLYQVTITPVEADGSIFTLSFIAKSTNTSTFSLKGYLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1111 AA molecular weight: 120988,86700 Da isoelectric point: 4,68537 aromaticity: 0,10441 hydropathy: -0,20684
Domains
Domains [InterPro]
DC_0116
ATT
41–185
ATT
41–185
DC_0116
ATT
175–257
ATT
175–257
IPR011050
STR
650–953
STR
650–953
1
1111
Architecture
ATT 41-257 | STR 258-999 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1111
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 653 | 653 | 0,9924 |
| Central domain | 654 | 973 | 321 | 0,9885 |
| C-terminal | 974 | 1111 | 137 | 0,9752 |
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-653
1-653
Central
654-973
654-973
C-terminal
974-1111
974-1111
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage phiKp_21 [NCBI] |
2979978 | No lineage information |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BEH87970.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC768484.1
[NCBI]
CDS location
range 7009 -> 10344
strand -
strand -
CDS
ATGGCATTTAAATTTAAAGGATCACTATCAGCAGTTGATGCATCCCTTAAAGGTGGAGTGATATTTGATAATGAAAAGTTATCAGATTCTAAAATTATGCCTAAAGGAAAATTCACAATAAATGAAATTGATGAAAGCACTACAGATTTAGCAAGTAATACTTTAGTAACAAATTTTGGTAAACACGATAATATCGCTGGTATGTTTTCTTTTAATACTGGCGATTGGAAAGACACTGATTCAGCACCAGTGAAATTGATGATGAGAGTTGTTAACGATGTTAATGATTCAGATTGGGTTACAATCTTTGATTCATCCAAAACTACTGTAACATGGAGTTCCATCGCCTTCGCAGGACAAACTCAATTTACTGTTCCTAATCTAGATTTCAAAAAAGCAATTATCTATGTTAATGGTGTACTACAGTATCCAGGTTTGTCATATCAAACCTTTGGTGGTACTGTAACTTTTAATTCCAAATTAAGTACAGGTGATACCATTTATGTTGTTGTTGGTGAAGACACAACCAACACTGATAATGAAGAATTTACTGCAACTGCAACCGAAGATCAAACTGTTATTGTGTTACCATTTACCAAAAAAACTAATTTTGTTTTTATTAATGGTATTTTGCAATATCCAGATTCGTATACTGTTTCTGGTAGTACTATCACTCTTGGTGATAAATTGTATTTAAATGATGATATTCTTGTTCTTGGTAATGAGACTGACTTGGTTTCATTTACTGCTCTTGCATCTCAAGATCAAACCGATTTTACTTTACCTGGCGAATTTGATGATGGTCTTGTTTATATCAATGGTGTTTTACAATACGATAATGCATATAGTGTATCAGGCACAACTTTATCATTTATTTCGTCTTTGGATGAAAATGATAATGTTTTTGTTACATTGAATGATCCAAAATTCATTGATAGTGTTAATGCCAGTTATACCAGTACTATAACAGATGAATCTAATAATAAACTAAATATACCTTATTTTAATTTTAGTGAATTGCAAGTTTTTATCAATGGTGTTTTGCAAAATCCAGACAGCGGTGCTTATATATTAAACGGTACTGAAATTACGTTAAGTTCTCCTTTACAATTAGGAGACGATATTCATGTTATTGTTTATAACTCTCCAGTACAGAACAGTAATTTAGTAACCAAAGCAGATTTAACTTCCTATGCAACCGCAGAAGAACTACAGGAATTAAAAAATTCATTAAAAAATGAAGGTATAAATTTAAAATGGCAGCCTCATTTACCGAGTATTGAAGTAGCTTTTGGATTGCCACGAAGATCACTGAAAATGTGGACAGTTGGTAGTACATCAACTGTGAACCAGTACTGGTTATATCCTGTGGACGGTACTGTCTGGACTGGTACAGGAACGCTTGGTACAGTACCAGGTGTACCATTTTATAAATTAGATTCAAACAAAGACGTTATTACATGGACTTATACTGCAACCTCTGATAATGTAACTAGAATCTTCGTTCCGTATAATTTTGGTAGTATTACTATTTTTATTAATGGTGTTTTACAAAGTATTAATTTAAATCACTACACACTTGATGGACAGTACGTTAATTTAAATGGTGCATTACAAACTGGGGATAATTTAATTGCAATTCTTGGTAAATTGGTTTTCAATACAAATCCATATTTGACTTATGATGATGCAACTTCTCAATTTGTTAGTAAATCAACTCTATCATCCACTGTTGGTACATCTATAATAGGGACTCCTGATGGTAGTGATCTACAACAAACACTTAATAACAAAGTTAATACCACTATATTGTCATCCACTGCTGGAGCATCATTGATTGGTACCGAAAACAATAAAACTGTTCAAGAAAAATTAAATTCATTAACACGTAGAGTAAATGTTTTGGATTTCATGACTGACGAAGAGAGGGAAGGTGTATTAAATTATACAGGAACTGCTGACAACTCTAATGCATTTATTCAAGCATTTGCTACTGGAGCAAAACTCATTGATGTTCCAGCAGGAAGATATTTGGTTCAAAATGTAACTATACCTACAAGAACCAGACTATTTGGTGATTCTGGATATAAACCATATAATGTAACCAGTGATGCATCTTTTTATGACACAGGTACTTTGATTAGGAAGATCAATGGTGCAGCTAACATGTTCTTATGGAACACTGCATGTGGTGCTCAAGATATAATGTTTGATGGGTATGATAGAGCATCTCCTGCAATAAATTCAGCAACTGGTGGAAAAATAACAGTTGGTTTTCAACGTTGTGGGTTCTATCGTTGGGACAGAGTTGGTAATCGCCTTGGTGCATATTTAGGATGTACTTTTCAATTTTGTAATTTTAATCAAAACAATATAGGAATATATAATACTGTTGATGGAAATCATATTAGCTGTACTATAAATGCAAATAAAAGCGATGGTGTTAGATTAGAAACTGGTGCTGATAGTAATACTTTCACCAACTGTAGGAATGAATGGAATGAGGGAAATAACTGGAATTTTTATGGCTGTGTATCTATACAAGTAATTAATGAATTATGTGATAGAGCATTTCTTTATGGATTTAGAATTTCGAATTCAAACGTCCAAATACAAAACGTGGATGTTAGAAGAAGTGGTAGGACAGCAAGTTCTGATGCAACAAGTGCTCATTTTTACATTGAAAATTCTATTGTTAAAATGATTGGTGTTAAAACATCAGCAGGTCCAGATGATACTGGGGGTAGTGTAGTTGTATCTTCACCCGCTTATATTTTTAGAATGGAGGGGGCTAATTCAGGATCTTTAACATTAACGTCTAATAGAATGACAGGTAGTACAATTGGAATCTATTCTGGCTCAGCTAGACCAGAAACTATGCGATATAGTGATAATGATGGTATAGAAGATTTTTGTAATGTTGGATTGTATAGAAAAAATGGTGGTAAACAATATCGTAGTTTTCAAACAGCGTCTGGTGTTCCTGGTTCCTCTCCTATTAATTTAACATTTACAACATCAAGTGTGGCTACATATAATAATGATTTGTTCAATATTGATTTAACATGGCGAAATAGCTCGAATGGTGGATCTAATGGTGCACAATTAACAGTTATTTCTTCACGTGAAGGTGGTAATGCATCATACAACATTATAAATATAGTTTCAAAAAATGGAGTTTTGGCTGAGACTGATGTTAATACTTCACCCGGAGCTAATCAATTATACCAAGTTACTATCACCCCAGTAGAAGCTGATGGTAGCATTTTTACTTTATCATTCATAGCAAAATCAACTAATACTAGTACATTTTCTTTGAAGGGATATTTAAGATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
c5af33e097507200153634f3a3992fdc284497731133082176c8715f9419b546
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Genome of Klebsiella phage phiKp_21 | Kondo,K., Nakano,S., Hisatsune,J., Sugawara,Y., Kataoka,M., Kayama,S., Sugai,M. and Kawano,M. | 1959 | — | GenBank |