Protein

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Genbank accession
XRL28996.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPHLKAYDKYGNILAIGYNVELHEEVGSVIIPNLAPHTHYPQGEFYVSWEAEKYETDKVVVPGFTTLESSFKEITLYFKDHILVNAKSAYDVAVDNGFVGSEEEWVKSIKGEKGEEGEQGKQGLSAYEVAVNNGFTGSATDWLKTGKSPYVYSNEYIKQKDDTSDVQRLRRAIKDTSEGNTIHIPSSESPIKIDDTLIIDKNINIVSDAKIVYNGSKDKPAIKLDSLSYSNVTIKGIYDDSSYPTYGGGYHGFKSQNYIGLELVNCRNVNTNINEIIGFTVGNKHKATGGKGHWFNNTIINFFINNETHIELNTDGIGSNGEQSWMNSNYFYKSAFSYSGTEFNKHPNTYYNIKQTLTNGNTYGGNSNIFDSLKFETASTTSENYVMVYLKKAVGFIFKNYRFEFNNKATFAVVDLETQDMTKSYVTHSKDIKFIPEFVLGNGHKLTFTNINTAKIPRSSIAKIVDEYKTTLLYKNNDFSKDYRRLGGNYHTVKNVFRKPLQSTSLTDEVSYDYSTIPSLVDDKGLLTFTGSYPMALYVNNVSVGDELIINKLSFIGNSSGIFIKCFDKDGNILDKVSNNYDTILLDGYYNDKYKAFTFNNTQKDTFTVNSEDVKSIVILISGTMQGLLVASTNPSNIIKSSKDSSKNKTDVFYSHVKPSSVEDFKYDEKVYNNGTTQAYGWVLKGNDWKELGKDTNSKSKVIVNIEDYPRINDEDNDYPRFQRALDYLTSTKGGTLIVPKGNEDYLFKTKTPTIQNPSRVKVTGSNIYIKGEGNPTFIMSGITKNYLDSIDDVSSSGRDMFTGFSFINCDNILVEGLTFKGEWDGKGEFRYASPRSIGIAFKGSRNCKAYNVHGYNIMGNVVNAVNTMQAVDGVYGYSDNITIDSCSATQCLENGFNFMGGTKNGYYVNNISTGNGSSGFESGTENVIISNNIHTNNKYSGLSISGTNYTITSNVIYGNSNKGELSNKPSNGIAITGGSKGIISNNNLSGNEGYELYLYPGVNNIDIQNNVLKQDTTSLKTSIIYVSGTTSKPVSEINFKNNTLRSTNTSLDKAIFLNFVMDSTITNNDIKTDKGNDSLSVQGSCSNLFVLNNNMNKNLSISSNAFNVISKDNIAYNLPKVLNGTAIPTTGSWRLGDIVVNTSRTLTSGSPEKWRCTSDGVATNMKWTSNTDYTQGQIVYNGNYVYKAVASGTSGGTQPTHNNGVISDGSILWEFISTKANFEVVSQIGVTESINSTPLYKGQIAVVGSSVYIAKGTSSNTDWIILN
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 140103,10390 Da
isoelectric point:6,13414
aromaticity:0,10962
hydropathy:-0,45244

Domains

Domains [InterPro]
DC_0876
STR
6–1067
DC_0876 DC_0276
IPR006626
Unmapped
545–566
IPR006626 IPR011050 G3DSA:2.10.10.20
IPR012334
STR
704–1052
IPR012334 IPR006626
IPR006626
Unmapped
810–844
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626
IPR039448
ENZ
925–1048
IPR039448
XRL28996.1
1 1268
Architecture
STR
RBD
ATT
RBD
STR 6-1099 | RBD 1100-1165 | ATT 1166-1224 | RBD 1225-1268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XRL28996.1
1 1268
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 166 166 0,9851
Central domain 167 486 321 0,9755
C-terminal 487 1268 781 0,2611
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-166
Central
167-486
C-terminal
487-1268

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage CIFT_MFB_MRSA13
[NCBI] 		3411576 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XRL28996.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV295866 [NCBI]
CDS location
range 123832 -> 127638
strand -
CDS
ATGCCTCATTTAAAAGCATATGATAAATACGGTAATATATTGGCAATAGGTTACAATGTAGAGTTACATGAAGAAGTAGGGTCTGTAATCATACCTAACTTAGCTCCTCACACACATTACCCTCAAGGTGAGTTCTATGTATCATGGGAAGCTGAAAAATATGAAACCGATAAAGTAGTAGTTCCTGGTTTTACAACCCTAGAATCATCGTTCAAAGAAATAACATTATATTTTAAAGACCATATACTTGTAAATGCTAAATCTGCTTATGATGTAGCGGTAGATAATGGTTTTGTCGGTTCTGAAGAAGAATGGGTTAAGTCTATTAAAGGAGAAAAAGGGGAGGAAGGGGAACAAGGTAAGCAAGGTTTAAGTGCTTATGAAGTAGCTGTAAATAACGGTTTTACAGGTTCAGCTACAGATTGGCTTAAAACAGGTAAAAGTCCTTATGTATACTCTAACGAGTATATAAAGCAAAAAGATGATACTTCGGATGTTCAAAGGTTAAGACGTGCTATTAAAGATACAAGTGAAGGTAATACCATACACATTCCTTCTAGTGAATCACCTATTAAAATAGATGATACTTTGATAATAGATAAGAATATTAATATTGTATCTGATGCTAAGATTGTTTATAATGGTAGTAAGGATAAACCAGCTATTAAACTAGATAGTTTATCATATTCTAATGTTACAATTAAAGGTATTTATGATGATAGTTCTTATCCAACTTATGGTGGAGGCTATCATGGTTTTAAGAGTCAAAACTATATAGGACTAGAATTAGTTAACTGTAGAAATGTTAATACTAATATTAATGAAATTATTGGTTTTACAGTCGGTAATAAACATAAAGCTACTGGTGGTAAAGGTCATTGGTTTAATAATACTATTATTAATTTCTTTATTAATAATGAAACACATATAGAATTAAATACAGATGGTATAGGTTCTAATGGTGAGCAATCTTGGATGAATAGTAATTACTTCTATAAATCAGCTTTTTCATATAGTGGCACCGAGTTTAATAAACACCCTAACACATACTATAACATCAAACAAACTCTAACAAATGGTAATACCTATGGAGGAAATAGCAATATATTCGATTCACTTAAATTTGAAACTGCTTCCACAACATCTGAAAATTATGTTATGGTTTATCTTAAGAAAGCAGTAGGATTTATATTTAAGAATTACAGATTTGAATTTAATAACAAAGCTACTTTTGCGGTTGTTGATTTAGAAACTCAAGATATGACAAAATCTTATGTAACACATAGTAAAGATATTAAGTTTATTCCTGAATTTGTTTTAGGTAATGGACATAAACTAACGTTTACAAATATTAATACTGCTAAAATACCTAGAAGTAGTATTGCTAAAATAGTAGACGAATACAAAACAACATTATTGTATAAAAATAATGATTTTAGCAAAGACTATAGAAGATTAGGGGGTAACTATCACACAGTCAAAAATGTATTTAGAAAACCATTACAGTCAACTTCTCTGACAGATGAAGTATCTTATGACTATAGTACTATACCTAGTTTAGTAGATGATAAAGGACTACTTACCTTTACAGGCTCGTACCCTATGGCTTTATATGTTAATAATGTTAGTGTTGGTGACGAGCTAATTATTAACAAGTTATCATTTATAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGTTTTGATAAAGACGGTAATATATTAGACAAAGTATCTAATAATTATGATACAATATTACTAGATGGTTATTATAATGATAAATATAAAGCGTTCACTTTCAATAACACCCAAAAAGATACTTTTACTGTTAATAGTGAAGATGTTAAGTCTATCGTTATTTTAATATCTGGAACTATGCAAGGTTTACTTGTAGCTTCAACTAATCCATCTAATATTATTAAGTCTTCAAAAGATAGTAGCAAGAATAAAACTGATGTTTTTTATTCTCATGTTAAACCTTCTAGTGTTGAAGATTTTAAATATGATGAAAAGGTATATAACAATGGTACAACACAAGCATATGGTTGGGTACTAAAAGGTAATGATTGGAAAGAACTAGGTAAAGATACTAATTCTAAGAGTAAAGTAATAGTTAATATAGAAGACTACCCAAGAATTAATGATGAAGATAATGACTACCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATTATTTAACAAGTACTAAAGGTGGTACTCTTATAGTACCTAAAGGAAATGAAGATTATTTATTCAAAACTAAGACACCTACTATACAAAACCCATCACGTGTAAAAGTAACAGGAAGTAATATATACATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACATTTATTATGTCAGGAATCACTAAAAACTATCTAGACTCTATAGATGATGTTTCTTCTAGTGGTAGAGATATGTTTACAGGATTCTCATTTATCAACTGTGATAACATTCTTGTAGAAGGATTAACATTTAAAGGGGAATGGGATGGTAAAGGTGAATTTAGATATGCGTCACCTCGTTCTATTGGAATAGCATTTAAAGGAAGTAGAAACTGTAAAGCATATAATGTACATGGTTATAATATTATGGGTAACGTTGTAAATGCAGTAAACACTATGCAAGCGGTAGATGGTGTTTATGGTTACTCAGATAACATTACTATAGACAGTTGCTCAGCTACACAATGTTTAGAGAATGGTTTTAACTTTATGGGTGGTACTAAAAATGGATATTATGTTAATAATATATCTACAGGAAATGGTTCAAGTGGATTCGAATCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAACATACACACAAATAATAAGTACTCAGGACTGAGCATATCAGGTACTAATTATACAATTACTAGTAACGTAATTTATGGTAATAGTAATAAAGGAGAGTTAAGTAATAAACCATCTAATGGTATTGCTATTACAGGAGGCAGTAAAGGTATTATAAGTAATAATAACTTATCAGGTAATGAGGGTTACGAGTTGTACCTTTATCCAGGAGTTAATAACATAGATATACAAAATAATGTATTAAAACAAGATACAACAAGTTTAAAAACAAGTATTATTTATGTTTCAGGAACAACTAGTAAACCTGTGTCAGAAATTAACTTTAAAAATAATACATTAAGAAGTACAAATACTTCTTTGGATAAAGCTATATTCTTAAATTTTGTTATGGATAGTACAATTACTAATAATGATATAAAAACAGATAAAGGTAATGATTCATTAAGTGTTCAAGGTTCTTGTAGTAATTTATTCGTATTAAATAACAATATGAATAAAAACTTAAGTATTTCTAGTAATGCATTTAATGTTATAAGTAAGGATAACATAGCTTATAATTTACCTAAAGTACTGAACGGTACTGCAATACCAACGACAGGAAGTTGGAGACTGGGAGATATTGTTGTTAATACTAGTAGAACCCTAACATCAGGTAGTCCTGAGAAATGGAGATGTACTAGTGATGGAGTTGCTACTAATATGAAGTGGACATCTAACACGGATTATACACAAGGTCAAATTGTTTATAATGGGAATTATGTATATAAAGCAGTAGCTTCAGGTACAAGTGGTGGAACACAACCTACTCATAATAACGGTGTTATATCAGATGGTTCTATACTTTGGGAATTTATATCTACAAAAGCTAATTTTGAAGTTGTAAGTCAAATAGGAGTAACAGAAAGTATTAACAGCACACCTTTATATAAAGGTCAAATTGCTGTAGTAGGCTCATCTGTATATATAGCTAAAGGTACATCAAGCAATACTGATTGGATAATTTTAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
69e533f1c30954504a0778a433477820e385f7e2fff390ff5b11635988792684
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2661
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50