Protein

View in Explore
Genbank accession
QUL77484.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,58
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVDFFIEENTVQQYDATRGYKKNFVVINDNRIWVAQRDIAAPAGEFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLSSGEFIAVDSAASFTTFTLPANPVDGDTIVIKDIGGNTGYNEIKIQSSNVPGAGNQKIVRFGNQYPEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRVEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYDAAEKLWHVWDGDFKTRLRVIRDSVKLLPNESIIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVMVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDEVSGTSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGATPADSRELNGTNVYNKNTVNLVVSPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSGWANAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQVETDAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLTGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKTRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNTEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWEASETLRGFVRLSSGTATSAATTTTGAGFTYANGVYTPDPSKLVSYSKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDNLDSTQFIRRDIAQTVEGVLTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSTGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNAAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLALGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLITQAPTTDTVGFWSVDINDEPTYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRNDDGTLGDEVLGSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTVLDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 143206,29020 Da
isoelectric point:5,14452
aromaticity:0,07891
hydropathy:-0,29765

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–212
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1112–1145
IPR048391 IPR048391
QUL77484.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-212 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1299 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage UPEC07
[NCBI] 		2811510 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QUL77484.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW250787 [NCBI]
CDS location
range 21504 -> 25460
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGATTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACACGCGGATACAAAAAGAACTTTGTAGTTATTAACGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATCGCGGCTCCTGCCGGAGAATTTACCCCTCAGTATTGGTTAGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACTCGTCAGCTTAGCTCGGGTGAATTTATCGCAGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTGCAAACCCGGTTGATGGTGATACCATCGTTATTAAAGATATCGGCGGCAATACCGGTTACAATGAAATTAAAATCCAGTCAAGCAACGTACCAGGGGCAGGTAACCAAAAGATTGTTCGTTTCGGTAATCAGTATCCGGAAGTTTTAATTACCAAACCATTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCTGGCAACGAAGAACGTGGCATCAGAGTAGAACCATCGACAGGTCGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGTATGGGACCAACGTTCCACCTAATGGTTGAAACTTTTGACACCAGTTCCAGTCTTGGGAAAGCTGGCCAGCATCAAATGGAATTCCGTACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATGATGCTGCCGAAAAACTCTGGCATGTTTGGGACGGTGATTTTAAAACTCGTCTTCGTGTTATTCGCGACAGCGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGCATCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCAGCAACGATTAATATCGATTTACCAACGGATGTTTTGCAAGGCGACATTGTTAAAATTGCATTGAACTATCTCCGTAAATCACAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGCGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTGCTGCAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCGGATACAACTTGGGTGATGGTTGATTCATTGACCTTTAATGGCAACATCAGTTATACTCCAGTTATTGAATTGTCATATGCAGAAGATGAAGTGTCTGGAACAAGTTATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCGACTGTTGAACGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTGCGCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAGAAAGAACTCGCAATTACCCCTCAGACTTTGGCTAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGTATTGCCAGAATCGCAACGACTGCTCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACCGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATCACTCCGAAGAAACTGCAAGCGCGCCAGGGCTCGGAATCGCTATCTGGTATTGTAACTTACGTTTCAACAACCGGTGCAACTCCTGCTGATTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTTGTTTCTCCGAAAGCTCTTGACCAGTACAAAGCTACTTACACTCAACAAGGTGCGGTTATTCTTGCGGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGTACTTCTCAATCTGGCTGGGCAAACGCAGTCGTTACTCCAGAAATGTTGCATCGCAAAACTGCTCTTGATTCCCGTATCGGTTTAATCGAGATTGCAACTCAAGTAGAAACGGATGCAGGAACCGATTATACCAGAGCTGTGACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACGTTAACCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACCGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAATACTGCTCGCACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACGGCAAGATTAGCGACTCAGGGTGAAGTCAATACCGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACTCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCCACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATCGCGACAAACACAGAAGCAACAGCAGGCACATCAAAAGTCTTGGCCATCAGTCCGTCGGCGCTGAAATATATTGCCCAAACGGAAACAACCTGGGAAGCATCTGAAACCCTACGTGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGTACAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACTGGTGCAGGATTTACATATGCAAATGGTGTGTATACTCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATTCAAAATCTGGTTATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTGGATAACCTTGATTCGACCCAGTTTATTCGTCGTGATATTGCTCAGACTGTTGAAGGTGTGTTAACTCTTACCAAACAGACAAATATATCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGAACTGTGAACGTTGTTAACGGAACTAACAAGTGGAAAATCACCGCTCCTTCCACCGGAACGACAATGACTATTGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGCTGCTGTATTGAACAACCTTAGCGCCGGAAATGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATCGCAACCACAACGGGTGAAGCTTCTGGTGCAACTCTGGCTCTGGGTGATAACTCGCAGAATTTAGTGCTTAAAACTCTTGATGCTGGTAATATCATAGCAAATGGTGGCGGCGCATTTAAAGTCCTGACCGAGAAAAACGCTGTTGAGATTGTAGATAGAAACTTTGTTAACCAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGTGCTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTCGGTACGAAACCAAGTCTTATCACACAAGCTCCGACTACAGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATGAACCGACTTATAGCCAGTTCCCTGGTTATTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAGGTAAACATTGATACAGTTCAAACTAAACCTGCCGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAATGGAACTTTCGCCTCGCCTGCTATTCGTTATCGTAATGACGATGGTACACTCGGTGATGAAGTATTAGGTAGCTCTGGCCAAAAACTGCGCGGAACCTGGTTTGACTATTCGGTTCGTGATAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACGCTGGATTCGTGCTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGTACGTGGCAGAAAAATAAATCTGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCCGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCGTTCTCGATTGGTTACGTATCGGTAACGTGCGCATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8b42f93ce1bae4a8c0b2e2e3066e9e8d30998b2ad7a2564da086ca518a4c45fe
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5492
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequences of avian pathogenic Escherichia coli bacteriophages UPEC01, UPEC03, UPEC06 and UPEC07 Kazibwe,G., Hinkley,T.C., Le Ny,A.-L.M. and Nakavuma,J.L. 2022-03-17 — GenBank