Protein

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Genbank accession
QDK04379.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDKTIFTKDDLGSVIELGLKYGGTIDGSLTVNGNIIGNLTGNAATATKLKTARKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPVDANLDEYGPVEEYLGVWSKATSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTTRYGNVYIRSLTATWNGVNGPWSAWRNIQSGTRPLSTTIDLNDLGGAEHLGLWRNSSNSIATFDRNFPEEGSSAQGLLEVYEGGNYSRTQRYTTRFGVVYTRCLAAAWDASAPKWGPWQQVGNVTPATFYDGDLNDFKAPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPTVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGATTRDRIFERAYTGGVWGAWNEVYTSYSLPITLGMGGIKSNLAELDWQTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMDWGTIDGNLIMFSVGPSEHTSTGRTVQVWRGTVSQTNYRYFVVRVFGNSGNRTCTVRRVVLEDGRHKWTAQQDFNGAVNFGAPTNFNSTVNLNNTTTFKTEVKFRSLNAFRMYGGKFGTIFRNDGESLYILSTDEDDQDGNFNKNRPFRYQLKTGDVTLGGTSGANVLKLKRDSLTAFFGGDINMKGLMTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSKGVHFSTERTLATGAIKTKFFGETFTDGTLYLNQMNNSSERFSINNWGNSEVGRAAILEISDSQGYHFYTERRTDDSLVFDISGALTVRGPNGITVKNSTGARHIWFRDDSETEKAVIWVTDDGILHIRNNRGGSFSHHFQGAMIKAGERVPYAGDQGLIRGEVSGGAWVDWRDRPAGLLVDCQDSRSQAYNIWKATHWGEQHLAAMGVHAGGGNPHVVLHVGGSDYAFASNGDFTAGAAVYCNDVYIRSDRRLKNNVEDYEENAVDKVNKLKVKTYDKVKSLSDREVIGHEIGIIAQDLQEVLPEAVSTSSVGSQDNPEEILTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKISNYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:1027 AA
molecular weight: 112877,50430 Da
isoelectric point:6,40004
aromaticity:0,10321
hydropathy:-0,39912

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
137–205
cd19958 cd19958 cd19958 IPR048390 IPR030392
IPR030392
911–1013
IPR030392
QDK04379.1
1 1027
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage VEc20
[NCBI] 		2592190 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QDK04379.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN022785.1 [NCBI]
CDS location
range 154147 -> 157230
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAAAACAATTTTCACAAAAGATGACTTAGGTAGTGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACAATTGATGGTTCTTTAACTGTTAATGGAAACATAATTGGAAATTTAACAGGTAACGCTGCAACTGCAACGAAATTAAAAACAGCACGAAAAATTAATGGTATATCCTTTGATGGGTCAAAAGATATCACGCTAACTCCATCTGACATAAATGTCAATAGCACAACGTTTATAAAAAATAACGGCGAATTACCTGTTGATGCTAATTTAGATGAGTATGGGCCTGTTGAAGAATATCTTGGAGTTTGGTCGAAAGCAACTTCAACCAACGCTCAACCAGCAAATAAATTTCCAGAAGAAAATGCTGTAGGTGTTCTAGAAGTATTTGTGGCCGGTCAATTTGCTGGTACTCAGAGATATACAACTAGATACGGAAATGTTTATATTCGTTCCTTGACTGCTACATGGAACGGAGTAAACGGTCCGTGGAGTGCGTGGCGAAATATTCAATCTGGTACTCGTCCACTGTCAACAACGATTGATCTTAATGATCTAGGAGGCGCTGAACACCTTGGTTTGTGGCGAAATAGTTCAAATTCCATTGCTACCTTTGACAGAAATTTCCCAGAAGAAGGATCGTCAGCTCAAGGACTTTTAGAAGTATATGAAGGTGGAAACTATTCTCGCACACAGAGATATACGACCAGATTTGGTGTTGTTTATACTCGCTGTCTTGCTGCTGCATGGGATGCATCTGCACCTAAATGGGGACCGTGGCAACAAGTCGGTAATGTCACACCGGCGACTTTCTATGACGGAGACCTGAATGATTTTAAAGCTCCTGGGTTATATAACATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAACTGTCCTACCGGTGAAGGTTTGCCGACTGTTATTGTTGGTTTGCTGGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGCGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACGGGTGCAACTACTCGCGATCGTATTTTTGAGCGTGCATATACTGGTGGTGTGTGGGGTGCATGGAACGAAGTATATACATCTTATTCCCTGCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTATTAAATCTAACTTAGCAGAGTTAGACTGGCAAACATTTGATTTTGTTCCTGGTAGTATGTTTAGCGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAACATGCCAGCTAATATGGATTGGGGTACGATTGACGGAAACTTAATTATGTTTTCTGTTGGTCCTAGCGAGCACACCAGCACAGGACGTACTGTTCAGGTTTGGCGTGGTACTGTATCCCAGACAAACTACCGTTATTTTGTCGTTCGTGTATTCGGTAATTCAGGAAATAGAACTTGCACAGTTCGTCGCGTTGTTCTTGAAGATGGTCGCCACAAATGGACAGCGCAACAAGATTTTAATGGCGCAGTTAACTTCGGTGCTCCTACCAATTTTAACTCTACTGTTAACCTTAATAACACTACCACTTTTAAAACAGAAGTTAAATTTCGCTCATTGAATGCATTCCGTATGTATGGCGGAAAATTTGGTACAATTTTCCGTAATGATGGAGAGAGTCTTTATATTCTTTCCACCGACGAAGATGATCAAGATGGAAACTTTAATAAAAATAGACCTTTCCGCTATCAATTAAAAACTGGCGATGTTACTTTGGGTGGCACTAGTGGTGCTAACGTTTTAAAATTAAAACGTGATTCTCTCACCGCATTTTTTGGTGGTGATATTAACATGAAAGGCTTGATGACTTTTGACGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCGCGCGATAACATTATTCAGTTAGAAGACAGCAAAGGCGTTCATTTTTCCACTGAACGTACTTTAGCGACAGGTGCAATTAAAACTAAATTTTTTGGTGAAACCTTCACTGACGGTACATTATACCTAAATCAGATGAATAATAGCTCTGAACGATTCTCTATCAACAATTGGGGAAATTCAGAAGTTGGACGCGCGGCAATCTTAGAAATCAGCGATTCACAAGGTTATCACTTCTATACGGAACGTAGAACAGATGACAGTTTGGTGTTTGATATATCCGGTGCGTTGACCGTGCGTGGACCTAACGGAATAACCGTCAAAAACTCAACTGGTGCACGCCATATCTGGTTTAGAGATGATAGCGAAACAGAAAAGGCTGTTATTTGGGTGACCGATGATGGTATTTTACATATACGAAATAATCGTGGGGGTTCATTTAGTCATCACTTCCAAGGTGCAATGATTAAAGCGGGAGAGCGTGTTCCTTATGCCGGAGATCAAGGGCTTATTCGCGGTGAAGTTTCTGGTGGTGCATGGGTAGACTGGCGAGATCGTCCGGCTGGATTGTTGGTAGACTGTCAGGACTCACGAAGTCAAGCATATAACATTTGGAAAGCTACTCATTGGGGCGAACAGCACCTTGCGGCGATGGGTGTTCATGCTGGCGGTGGTAATCCTCATGTTGTATTGCATGTGGGTGGGAGTGATTATGCATTTGCATCTAACGGTGATTTTACTGCTGGTGCTGCTGTATATTGTAACGACGTTTATATTCGTTCTGACCGTCGTCTGAAAAATAATGTTGAAGACTACGAAGAGAATGCGGTGGATAAGGTAAATAAACTCAAAGTTAAAACCTATGATAAAGTTAAATCTCTTTCTGACCGCGAAGTTATCGGCCATGAGATTGGTATTATCGCACAGGATTTGCAAGAAGTATTACCGGAAGCTGTTAGCACTTCTAGTGTCGGATCTCAGGATAACCCAGAAGAAATTTTAACAATTTCTAACTCTGCTGTGAACGCGCTTTTAATTAAGGCTATCCAAGAAATGAGCGAAGAAATTAAAGAATTAAAAACGCCTTTCTTCACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAATTATTTTAAATTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
b7613fb25c713814c45c0a9554cbab7a1069d1ea67234820e67c671abcd68bb9
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6223
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Escherichia coli bacteriophage VEc20 Denisenko,E., Volozhantsev,N., Kislichkina,A., Verevkin,V., Myakinina,V. and Krasilnikova,V. 2025 — GenBank