Protein

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Genbank accession
YP_010100200.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,78
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIHFMNESGYSKYWTFHRDGGFTVDGGGLAVSGGSITTSGNIAALGNITSPQINTKNIILDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNTLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITTDENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKGIFGRSEDQGTTWIMPGTNVAFLSVQTQADENTAGDGQTHIGYNSGGKMNHYFRGKGKTNINTQEGMEVNPGILKLTTGGESISFNAATGSINSTLAFRLNKGIIIDGPDNQGFQFNAPTAADGTRSIYWNSGTRAGQNKSPVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRVAPTGSETTGPVVTQFNGQVNARGSLITDGSLRVNGLSTLVGNVTMNNGLFVQGGASITGQVKIGGTADAFRIYDAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNVGESGGISNLRPFYITLSTGKVSMDHDVDIGGGRFKVETSGTTSGQRITVNTASDAIRINAPTQEYSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNIVRMHSYTYSHGIALNSDTVDIAKPLKVGNAQLGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDVDLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASSTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQVQGGIPTSVFYDGYNSAGPNGNAKFTATVSGATASSNMAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHSVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1032 AA
molecular weight: 109164,15130 Da
isoelectric point:8,67933
aromaticity:0,08527
hydropathy:-0,41260

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
683–742
G3DSA:6.20.80.10 SSF88874 SSF88874
IPR048388
685–759
IPR048388 IPR037053
IPR051934
732–1032
IPR051934
IPR011083
785–832
IPR011083
YP_010100200.1
1 1032
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage p000v
[NCBI] 		2479933 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010100200.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055781 [NCBI]
CDS location
range 159839 -> 162937
strand -
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTGGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGTGATTATTTACAAAACGGCACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAGTATATTGAATTCTTGCCAAAAACTGCTGGAAATGGCGCTTGGGCAAATCAACATCTAAATAAAGCTCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATATCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAACGAAGGAAGTTTTAAAATTCATTTTATGAATGAATCTGGTTATTCGAAATATTGGACGTTTCACCGTGACGGTGGATTTACTGTTGATGGTGGAGGTTTAGCAGTATCAGGAGGTAGTATAACTACATCTGGAAATATTGCAGCTCTCGGAAATATTACTTCGCCTCAGATTAATACTAAAAATATTATTTTAGATACAAAAGCATTTGGACAATATGATTCGCAATCATTAGTTCAGTATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGTGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACTGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACCGGAAATACACTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCACTGATGAAAATACCAATAACTACGGCTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGTGATGCTGCCACTGGTTTAAAATACATTAAGCAGGGTGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCTTCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACTCGTAAAGGTATATTTGGTCGTTCAGAAGACCAAGGCACTACATGGATTATGCCTGGAACGAATGTTGCATTTTTATCAGTTCAAACACAAGCTGATGAAAACACTGCTGGAGACGGTCAAACCCATATTGGATATAATTCTGGCGGAAAAATGAACCACTATTTCCGTGGTAAAGGCAAAACTAATATTAATACTCAAGAAGGCATGGAAGTTAACCCAGGTATATTGAAGTTAACCACCGGCGGTGAAAGTATTAGCTTTAATGCCGCAACTGGAAGTATTAATTCTACATTAGCTTTTCGTCTTAATAAAGGCATAATTATTGATGGACCTGATAATCAGGGATTCCAGTTTAACGCTCCGACGGCTGCAGATGGTACTAGAAGTATATACTGGAACAGTGGTACTCGCGCAGGTCAAAACAAAAGCCCTGTTACAGTTAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCTACTGGTGATAAAGCTCGAGAAACCGTATTTGAGGTTTCTGATGGCCAAGGTTATTATTTCTATTCTCAACGCGTAGCTCCGACCGGTTCTGAAACTACAGGCCCTGTTGTAACTCAGTTCAATGGACAGGTTAATGCTAGAGGAAGCTTAATAACCGACGGAAGTCTTAGAGTTAACGGATTAAGCACTCTAGTTGGCAACGTTACAATGAATAATGGATTGTTTGTTCAAGGTGGTGCCTCAATTACCGGACAGGTTAAAATTGGCGGGACTGCTGATGCTTTCCGTATTTACGATGCTGAATACGGGGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCACAGAATGTTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTACTGGTAAAGTCAGCATGGATCATGATGTTGATATCGGTGGTGGAAGATTTAAAGTAGAAACTAGTGGAACAACATCAGGGCAACGTATTACAGTTAATACTGCCTCCGATGCTATTAGAATAAATGCCCCAACACAAGAATATTCTAACTTCATCCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGTGGTAACATCGTTCGTATGCACAGTTACACCTACTCCCATGGTATTGCATTAAACTCTGATACGGTTGATATAGCTAAACCTCTTAAAGTCGGTAATGCTCAATTAGGTACTGATGGTAACATCACAGGTGGTTCTGGTAACTTTGCCAACTTGAACACCACAATAAATAACCTTAAGACGGATATCGTCTCAAGTTATCCAATTGGCGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGTCGACTTGTATCCTAAGTTAGCTGCAGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGTGGGCAAACGATTAAAGGTAAACCATCCGGACGTGCAGTATTAAGTACAGAAGCAGATGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAGCACAGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGAAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCTGGTGCGCACCAACACGCGCGTTCAGGTCCTCAGGTACAAGGCGGCATACCCACTAGCGTATTCTATGATGGATACAATAGTGCGGGTCCAAACGGTAACGCTAAATTCACTGCAACCGTGAGTGGTGCCACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACTTCTTCAGATGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCTGGAACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACCCATTCGGTAGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
a7070ce29bd86c255f4c396bb3f0c7c1b7ddeb98383db09fcfafc5f391f7e161
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5361
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Whole-genome sequence of phages p000v and p000y infecting the bacterial pathogen Shigatoxigenic Escherichia coli Howard-Varona,C., Vik,D.R., Solonenko,N.E., Li,Y.-F., Gazitua,M.C., Hobbs,Z., Honaker,R.W., Kinkhabwala,A.A. and Sullivan,M.B. 2018-11-21 — GenBank