Protein
View in Explore- Genbank accession
- YAA50745.1 [GenBank]
- Protein name
- capsid and scaffold protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MILEGVYPSFLKGVSQQTPQERNDGQLGAQLNLLSDAVTGLRRRGGVKFQTKLAGIPNSSYIRLIDINGVNYIMIVDTVTGTLKIYNFDGYLLKAHQTDYLKASNGKASIRSTVSRNNCFILNTEQVITKTPTGGTNPTPNPSTMGYISIRSGQFSKMYSVDIKSGSYTLSFGVGTSGREAWQATPEWVATKIESRIKADATLNARYDVVREGSTVALKAKSATDTNLLVIESGTGSTYIQTSNSSRVQGKQDIIANLPNILDKYIIAVGTVGNSAYYQYNADSSTWKECGVYEEPYKFTNEPIYWYFDDTATIQVKSLDIQPRAAGDDDNNPLPKFVDFGITGISAYQSRLVLLSGSYVNMSATADFNVYMRTTVEELQDDDPIEVSSTALSAAQFEYAVPYNKDLVLLAQNQQAVIPANSTVLTPKTAVIYPSSKANISMASEPQVVSRSLYYTYQRGTDYYQVGEMIPNAYADAQYYAQNLADHIPLYATGVCTSITGSTTDNMAVFSSDQKELLVHQYLWAGEDRPLMSFHKWELPYDVLHVQFLQEYLVLFMDVGDDLVVGTINVQLNQLDNKPIPFLDIYQYVDIIDGEGTLPEFLPEGELVAAVYSSETMRHAKVQYEIEGTKIKCQFNGRIYLGVPYESSLTLTPPFVKDDKGRVVAGSNSTVVDLNMTFKSTGEFEYHVSDTYGDVFDGETSAQAWSETQLGYTRVNTVSDVKFPCGTLLSSTEFSIRTKGTTELNIISASYNIRVPNRGRRRL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 763 AA molecular weight: 84483,81670 Da isoelectric point: 4,99668 aromaticity: 0,10354 hydropathy: -0,25662
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
7–761
7–761
1
763
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAA50745.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX097700
[NCBI]
CDS location
range 991 -> 3282
strand +
strand +
CDS
ATGATTCTTGAGGGAGTGTACCCGTCATTCTTGAAAGGTGTATCACAGCAAACACCTCAAGAGCGTAATGACGGACAATTAGGCGCACAGCTTAATTTATTATCTGATGCTGTAACAGGTTTACGTAGACGTGGTGGGGTTAAATTCCAAACCAAGTTAGCAGGTATTCCTAATAGTAGTTATATACGCTTGATTGACATCAACGGTGTTAATTATATTATGATCGTAGATACTGTTACAGGCACTTTAAAGATTTATAATTTTGATGGTTACTTACTTAAAGCACATCAAACAGATTATCTTAAAGCCTCCAACGGTAAGGCTAGTATCCGCAGTACAGTCTCACGTAATAATTGTTTTATATTAAACACTGAACAAGTTATTACTAAGACACCTACAGGCGGTACTAACCCAACACCTAATCCAAGTACAATGGGTTATATCAGTATTCGTTCTGGTCAGTTCTCTAAGATGTATTCAGTAGACATCAAATCAGGTTCTTATACCTTAAGTTTTGGTGTAGGTACATCCGGTCGCGAGGCATGGCAGGCTACTCCTGAATGGGTAGCTACTAAGATAGAGAGTAGGATTAAAGCAGACGCTACTCTTAACGCACGTTATGACGTTGTACGAGAAGGTAGCACAGTTGCACTTAAAGCTAAATCTGCTACAGATACTAACTTATTAGTAATAGAATCTGGTACAGGTAGTACTTATATTCAAACTAGTAATTCTAGTCGTGTACAGGGTAAGCAAGACATTATTGCTAATCTACCTAATATCTTAGATAAGTATATTATTGCAGTAGGTACAGTAGGTAATTCAGCTTACTATCAATATAATGCGGACTCTAGCACTTGGAAAGAGTGTGGTGTATATGAAGAACCATATAAGTTCACTAACGAACCTATTTACTGGTACTTTGATGATACTGCTACTATCCAAGTTAAAAGCCTAGATATTCAACCACGTGCAGCAGGTGATGATGATAATAACCCATTACCTAAGTTTGTGGATTTTGGTATTACAGGTATTAGTGCATACCAATCACGTTTAGTACTACTTAGTGGTTCCTATGTTAATATGAGTGCTACAGCAGACTTCAACGTATATATGCGTACTACTGTAGAGGAATTACAGGATGATGATCCAATTGAGGTATCTAGTACCGCTTTGAGTGCTGCACAATTTGAATATGCTGTTCCGTATAATAAAGATTTAGTTTTATTAGCCCAGAACCAACAAGCTGTTATCCCAGCCAATAGTACCGTACTTACACCTAAGACGGCTGTTATCTACCCAAGTTCAAAAGCTAATATTAGTATGGCTAGTGAGCCACAGGTAGTGTCTCGTAGTTTGTATTATACATATCAACGAGGTACAGATTATTATCAAGTTGGTGAGATGATTCCTAATGCTTATGCAGATGCTCAGTACTATGCACAGAACTTAGCAGACCATATTCCGTTATATGCTACGGGTGTTTGTACTTCAATCACAGGTAGTACTACAGATAATATGGCGGTATTTAGTTCGGACCAGAAAGAGTTACTTGTACATCAGTACTTATGGGCAGGTGAGGACCGCCCGTTAATGAGCTTCCACAAGTGGGAGTTACCGTATGATGTACTACATGTGCAATTTCTACAAGAGTATTTAGTATTGTTTATGGATGTGGGTGATGATTTAGTGGTTGGTACTATTAACGTACAGTTAAACCAGCTAGACAATAAACCTATCCCATTCTTAGATATTTACCAATACGTAGATATTATAGACGGGGAAGGTACATTACCTGAGTTCCTACCAGAAGGTGAGTTAGTAGCTGCGGTATACAGTTCTGAGACTATGCGTCATGCTAAGGTTCAATATGAAATTGAAGGTACTAAGATTAAATGTCAATTCAATGGGCGTATTTATCTAGGTGTACCTTACGAAAGTTCACTCACACTAACACCGCCTTTTGTTAAAGACGATAAAGGTCGAGTAGTTGCTGGAAGTAATAGTACAGTAGTTGATCTTAATATGACATTCAAAAGTACAGGTGAGTTTGAGTACCATGTTTCTGATACCTATGGTGATGTATTCGATGGTGAAACATCTGCACAAGCTTGGTCAGAAACACAACTAGGGTATACGCGAGTAAATACAGTTAGTGATGTTAAGTTCCCTTGTGGTACGTTATTGAGTTCGACTGAGTTCAGTATCCGTACTAAAGGTACAACTGAGTTAAACATCATTAGTGCTAGTTACAATATCCGTGTACCGAACAGAGGACGGAGACGTTTATAA
Tertiary structure
PDB ID
53df230d87680eda08caffb74034a4a4acdc5d1e589d714983dbbbc9653e9a09
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50