Protein

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Genbank accession
XGU05712.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSIQEVGTHSIEGRTTIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQQGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNAGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMNIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDASNTYFLLTASGDQTGGFNGLRPLFINNQSGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDNVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1290 AA
molecular weight: 140190,77240 Da
isoelectric point:5,54751
aromaticity:0,07519
hydropathy:-0,32535

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
XGU05712.1
1 1290
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Pu-Krd-SF3
[NCBI] 		3328528 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XGU05712.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ249397 [NCBI]
CDS location
range 15411 -> 19283
strand -
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCTGGTGAAGCAATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGAAATGACATCACGTTTACTTTACCGTCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCGCAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCCAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAATACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCGCGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAGCTCAGACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATGATTCGACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATTACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACGCCTACTCAACAGGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGGCAAAGTCAGCAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAGGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACACTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTTGAAGCTGCTGCAGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAGTGGATTGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTCGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAACCGTTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTGACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAACGCTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAGACTGGAACTAACCCAGCACAGACGATGAATATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGCGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGTAATATAACGTTTAGTATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAATGTTAACGCTTCCGGTTCATTAAATGCGAATGGCGTTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTATGGATTCTTTATTCGTAATGATGCCTCTAATACCTATTTTTTGCTCACTGCATCTGGTGATCAGACTGGTGGTTTTAATGGATTACGCCCATTATTCATTAATAATCAATCCGGTCAGGTTACGATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGCGGTTTGACTGTTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCACCAACATCTGATAATGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACTACCCCAGAAGCACGCACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACAAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGAAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
e2b5227d9bd5a041d4064ab94cc5601d88897e103effac57421ddbf4f53855e1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7972
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50